Enhancing protein backbone binding-A fruitful concept for combating drug-resistant HIV

Angewandte Chemie - International Edition

Volumn 51, Issue 8, 2012, Pages 1778-1802

  Ghosh, Arun K ^a   Anderson, David D ^a   Weber, Irene T ^b   Mitsuya, Hiroaki ^c,d  

^a PURDUE UNIVERSITY   (United States)

^b GEORGIA STATE UNIVERSITY   (United States)

^c KUMAMOTO UNIVERSITY   (Japan)

^d NATIONAL CANCER INSTITUTE   (United States)

Author keywords

antiviral agents; backbone binding; drug resistance; enzymes; proteins

Indexed keywords

ACTIVE SITE; ANTIRETROVIRAL TREATMENT; ANTIRETROVIRALS; ANTIVIRAL AGENTS; ATTRACTIVE STRATEGIES; BACKBONE BINDING; CATALYTIC SITES; DRUG EFFICACY; DRUG RESISTANCE; ENZYME STRUCTURES; ESSENTIAL COMPONENT; FUNDAMENTAL PROBLEM; HIV-1 PROTEASE INHIBITORS; HIV-PROTEASE INHIBITORS; HIV/AIDS; HYDROGEN BONDING INTERACTIONS; PROTEASE INHIBITOR; PROTEIN BACKBONE; STRUCTURE-BASED; UNDERLYING PRINCIPLES;

DISEASES; ENZYMES; HYDROGEN BONDS; PROTEINS; VIRUSES;

ENZYME INHIBITION;

EID: 84863393712     PISSN: 14337851     EISSN: 15213773     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/anie.201102762     Document Type: Review

References (137)

1. E. Domingo, C. K. Biebricher, M. Eigen, J. J. Holland, in Quasispecies and RNA Virus Evolution: Principles and Consequences, Eurekah, Georgetown, 2001, preface.
2. M. Burnet, D. O. White, in Natural History of Infectious Disease, Cambridge University Press, London, 1972.
3. J. Needham, L. Gwei-djen, in Science and Civilization in China, Vol. 6 (Ed.:, N. Sivin,), Cambridge University Press, Cambridge, 1999, p. 134.
4. A. Waterson, L. Wilkinson, in An Introduction to the History of Virology, Cambridge University Press, Cambridge, 1978, pp. 23-34.
5. F. Fenner, F. M. Burnett, in Portraits of Viruses: A History of Virology (Eds.:, F. Fenner, A. Gibbs,), S. Karger AG, Basel, 1988, pp. 1-37.
6. J. B. Brooksby, in Portraits of Viruses: A History of Virology (Eds.:, F. Fenner, A. Gibbs,), S. Karger AG, Basel, 1988, pp. 124-146.
7. WHO, Summary of SARS Cases, 2003.
8. WHO, Cumulative Number of Confirmed Human Cases of Avian Influenza A/(H5N1) Reported to WHO, 2011.
9. UNAIDS Report on the global HIV/AIDS epidemic, 2010.
10. F. Barre-Sinoussi, J. Chermann, F. Rey, M. Nugeyre, S. Chamaret, J. Gruest, C. Dauguet, C. Axler-Blin, et al., Science 1983, 220, 868-871.
11. R. C. Gallo, P. S. Sarin, E. P. Gelmann, M. Robert-Guroff, E. Richardson, V. S. Kalyanaraman, D. Mann, G. D. Sidhu, R. E. Stahl, S. Zolla-Pazner, J. Leibowitch, M. Popovic, Science 1983, 220, 865-867.
12. T. Lyle, in Comprehensive Medicinal Chemistry II, Vol. 7 (Eds.:, J. Taylor, D. Triggle,), Elsevier Science Maryland Heights, 2007, pp. 329-371.
13. Y. Mehellou, E. De Clercq, J. Med. Chem. 2010, 53, 521-538.
14. L. Menéndez-Arias, Antiviral Res. 2010, 85, 210-231.
15. C. Flexner, Nat. Rev. Drug Discovery 2007, 6, 959-966.
16. H. Mitsuya, S. Broder, Nature 1987, 325, 773-778.
17. N. E. Kohl, E. A. Emini, W. A. Schleif, L. J. Davis, J. C. Heimbach, R. A. F. Dixon, E. M. Scolnick, I. S. Sigal, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1988, 85, 4686-4690.
18. S. Virgil, in Methods and Principles in Medicinal Chemistry, Vol. 45 (Ed.:, A. K. Ghosh,), Wiley-VCH, Weinheim, 2010, pp. 139-168.
19. H. Mitsuya, J. Erickson, in Textbook of AIDS Medicine (Eds.:, T. Merigan, J. Bartlett, D. Bolgnesi,), Williams & Wilkis, Baltimore, 1999, pp. 751-780.
20. M. Glesby, in Protease Inhibitors in AIDS Therapy, (Eds.:, R. Ogden, C. Flexner,), Marcel Dekker, New York, 2001, pp. 237-256.
21. A. Wensing, N. M. van Maarseveen, M. Nijhuis, Antiviral Res. 2010, 85, 59-74.
22. S. Grabar, C. Pradier, E. Le Corfec, R. Lancar, C. Allavena, M. Bentata, P. Berlureau, C. Dupont, P. Fabbro-Peray, I. Poizot-Martin, D. Costagliola, AIDS 2000, 14, 141-149.
23. M. Wainberg, G. Friedland, JAMA J. Am. Med. Assoc. 1998, 279, 1977-1983.
24. L. Mansky, H. Temin, J. Virol. 1995, 69, 5087-5094.
25. J. Drake, J. Holland, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 13910-13913.
26. A. Perelson, A. Neumann, M. Markowitz, J. Leonard, D. Ho, Science 1996, 271, 1582-1586.
27. D. Robertson, B. Hahn, P. Sharp, J. Mol. Evol. 1995, 40, 249-259.
28. A. Leigh Brown, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1997, 94, 1862-1865.
29. R. Steigbigel, D. Cooper, P. Kumar, et al., N. Engl. J. Med. 2008, 359, 339-354.
30. J. Stephenson, J. Am. Med. Assoc. 2007, 297, 1535-1536.
31. P. Cane, J. Antimicro, Chemoth 2009, Suppl. 1, i 37 -i 40.
32. B. Dau, M. Holodniy, Drugs 2009, 69, 31-50.
33. C. Stoddart, P. Joshi, B. Sloan, J. Bare, P. Smith, G. Allaway, C. Wild, D. Martin, PLoS ONE 2007, 2, e 1251.
34. J. Tazi, N. Bakkour, V. Marchand, L. Ayadi, A. Aboufirassi, C. Branlant, FEBS J. 2010, 277, 867-876.
35. H. Mitsuya, A. Ghosh, in Aspartic Acid Proteases as Therapeutic Targets (Ed.:, A. Ghosh,), Wiley-VCH, Weinheim, 2010, pp. 245-262.
36. E. Domingo, R. Webster, J. Holland, in Origins and Evolution of Viruses, Academic Press, London, 1999, pp. 197-224.
37. A. Ali, R. Bandaranayake, Y. Cai, N. King, M. Kolli, S. Mittal, J. Murzycki, M. Nalam, E. Nalivaika, A. Ozen, M. Prabu-Jeyabalan, K. Thayer, C. Schiffer, Viruses 2010, 2, 2509-2535.
38. L. Menéndez-Arias, Antiviral Res. 2010, 85, 210-231.
39. A. Wensing, N. Maarseveen, M. Nijhuis, Antiviral Res. 2010, 59-74.
40. S. V. Gulnik, L. I. Suvorov, B. Liu, B. Yu, B. Anderson, H. Mitsuya, J. W. Erickson, Biochemistry 1995, 34, 9282-9287.
41. R. Kantor, W. J. Fessel, A. R. Zolopa, D. Israelski, N. Shulman, J. G. Montoya, M. Harbour, J. M. Schapiro, R. W. Shafer, Antimicrob. Agents Chemother. 2002, 46, 1086-1092.
42. K. Yusa, W. Song, M. Bartelmann, S. Harada, J. Virol. 2002, 76, 3031-3037.
43. G. Croteau, L. Doyon, D. Thibeault, G. McKercher, L. Pilote, D. Lamarre, J. Virol. 1997, 71, 1089-1096.
44. J. Martinez-Picado, A. V. Savara, L. Sutton, R. T. D'Aquila, J. Virol. 1999, 73, 3744-3752.
45. J. Condra, W. Schleif, O. Blahy, L. Gabryelski, D. J. Graham, J. C. Quintero, A. Rhodes, H. L. Robbins, E. Roth, M. Shivaprakash, D. Titus, T. Yang, H. Tepplert, K. E. Squires, P. J. Deutsch, E. A. Emini, Nature 1995, 374, 569-571.
46. S. Tamiya, S. Mardy, M. Kavlick, K. Yoshimura, H. Mitsuya, J. Virol. 2004, 78, 12030-12040.
47. F. Mammano, C. Petit, F. Clavel, J. Virol. 1998, 72, 7632-7637.
48. L. Hong, X. Zhang, J. A. Hartsuck, J. Tang, Protein Sci. 2000, 9, 1898-1904.
49. G. S. Laco, C. Schalk-Hihi, J. Lubkowski, G. Morris, A. Zdanov, A. Olson, J. H. Elder, A. Wlodawer, A. Gustchina, Biochemistry 1997, 36, 10696-10708.
50. A. K. Ghosh, B. Chapsal, I. Weber, H. Mitsuya, Acc. Chem. Res. 2008, 41, 78-86.
51. A. K. Ghosh, P. R. Sridhar, S. Leshchenko, A. K. Hussain, J. Li, A. Y. Kovalevsky, D. E. Walters, J. Wedekind, V. Grum-Tokars, D. Das, Y. Koh, K. Maeda, H. Gatanaga, I. T. Weber, H. Mitsuya, J. Med. Chem. 2006, 49, 5252-5261.
52. J. Agniswamy, I. T. Weber, Viruses 2009, 1, 1110-1136.
53. A. Wlodawer, J. Vondrasek, Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1998, 27, 249-284.
54. C. Chothia, A. Lesk, Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1987, 52, 399-405.
55. C. Worth, S. Gong, T. Blundell, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2009, 10, 709-720.
56. A. Todd, C. Orengo, J. Thornton, Curr. Opin. Chem. Biol. 1999, 3, 548-556.
57. J. Liang, H. Edelsbrunner, C. Woodward, Protein Sci. 1998, 7, 1884-1897.
58. R. Wolfenden, M. J. Snider, Acc. Chem. Res. 2001, 34, 938-945.
59. S. J. Benkovic, S. Hammes-Schiffer, Science 2003, 301, 1196-1202.
60. M. Garcia-Viloca, J. Gao, M. Karplus, D. G. Truhlar, Science 2004, 303, 186-195.
61. A. Wlodawer, M. Miller, M. Jaskolski, B. K. Sathyanarayana, E. Baldwin, I. T. Weber, L. M. Selk, L. Clawson, J. Schneider, S. B. Kent, Science 1989, 245, 616-621.
62. A. Gustchina, I. T. Weber, FEBS Lett. 1990, 269, 269-272.
63. A. Gustchina, C. Sansom, M. Prevost, J. Richelle, S. Y. Wodak, A. Wlodawer, I. T. Weber, Protein Eng. 1994, 7, 309-317.
64. Y. Tie, P. I. Boross, Y. F. Wang, L. Gaddis, F. Liu, X. Chen, J. Tozser, R. W. Harrison, I. T. Weber, FEBS J. 2005, 272, 5265-5277.
65. A. Wlodawer, A. Gustchina, Biochim. Biophys. Acta Protein Struct. Mol. Enzymol. 2000, 1477, 16-34.
66. W. Wang, P. A. Kollman, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 14937-14942.
67. A. K. Ghosh, P. R. Sridhar, N. Kumaragurubaran, Y. Koh, I. T. Weber, H. Mitsuya, ChemMedChem 2006, 1, 939-950.
68. A. K. Ghosh, J. Med. Chem. 2009, 52, 2163-2176.
69. A. Y. Kovalevsky, F. Liu, S. Leshchenko, A. K. Ghosh, J. M. Louis, R. W. Harrison, I. T. Weber, J. Mol. Biol. 2006, 363, 161-173.
70. F. Liu, P. I. Boross, Y. F. Wang, J. Tozser, J. M. Louis, R. W. Harrison, I. T. Weber, J. Mol. Biol. 2005, 354, 789-800.
71. A. Y. Kovalevsky, Y. Tie, F. Liu, P. I. Boross, Y. F. Wang, S. Leshchenko, A. K. Ghosh, R. W. Harrison, I. T. Weber, J. Med. Chem. 2006, 49, 1379-1387.
72. F. Liu, A. Y. Kovalevsky, J. M. Louis, P. I. Boross, Y. F. Wang, R. W. Harrison, I. T. Weber, J. Mol. Biol. 2006, 358, 1191-1199.
73. B. Mahalingam, Y. F. Wang, P. I. Boross, J. Tozser, J. M. Louis, R. W. Harrison, I. T. Weber, Eur. J. Biochem. 2004, 271, 1516-1524.
74. Y. Tie, A. Y. Kovalevsky, P. Boross, Y. F. Wang, A. K. Ghosh, J. Tozser, R. W. Harrison, I. T. Weber, Proteins Struct. Funct. Bioinf. 2007, 67, 232-242.
75. P. Martin, J. F. Vickrey, G. Proteasa, Y. L. Jimenez, Z. Wawrzak, M. A. Winters, T. C. Merigan, L. C. Kovari, Structure 2005, 13, 1887-1895.
76. C. H. Shen, Y. F. Wang, A. Y. Kovalevsky, R. W. Harrison, I. T. Weber, FEBS J. 2010, 277, 3699-3714.
77. J. F. Miller, C. W. Andrews, M. Brieger, E. S. Furfine, M. R. Hale, M. H. Hanlon, R. J. Hazen, I. Kaldor, et al., Bioorg. Med. Chem. Lett. 2006, 16, 1788-1794.
78. J. C. Clemente, R. E. Moose, R. Hemrajani, L. R. Whitford, L. Govindasamy, R. Reutzel, R. McKenna, M. Agbandje-McKenna, M. M. Goodenow, B. M. Dunn, Biochemistry 2004, 43, 12141-12151.
79. Z. Chen, Y. Li, E. Chen, D. L. Hall, P. L. Darke, C. Culberson, J. A. Shafer, L. C. Kuo, J. Biol. Chem. 1994, 269, 26344-26348.
80. A. K. Ghosh, S. Gemma, E. Simoni, A. Baldridge, D. E. Waters, K. Ide, Y. Tojo, Y. Koh, H. Mitsuya, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2010, 20, 1241-1246.
81. A. K. Ghosh, J. F. Kincaid, W. Cho, D. E. Walters, K. Krishnan, K. A. Hussain, Y. Koo, H. Cho, C. Rudall, L. Holland, J. Buthod, Bioorg. Med. Chem. Lett. 1998, 8, 687-690.
82. K. Yoshimura, R. Kato, M. F. Kavlck, A. Nguyen, V. Maroun, K. Maeda, K. A. Hussain, A. K. Ghosh, S. V. Gulnik, J. W. Erickson, H. Mistuya, J. Virol. 2002, 76, 1349-1358.
83. A. K. Ghosh, Z. L. Dawson, H. Mitsuya, Bioorg. Med. Chem. 2007, 15, 7576-7580.
84. A. K. Ghosh, B. D. Chapsal, H. Mitsuaya, in Aspartic Acid Proteases as Therapeutic Targets (Ed.:, A. K. Ghosh,), Wiley-VCH, Weinheim, 2010, pp. 205-235.
85. N. A. Roberts, J. A. Martin, D. Kinchington, A. V. Broadhurst, J. C. Craig, I. B. Duncan, S. A. Galpin, B. K. Handa, J. Kay, A. Krohn, R. W. Lambert, J. H. Merrett, J. S. Mills, K. E. B. Parkes, S. Redshaw, A. J. Ritchie, D. L. Taylor, G. J. Thomas, P. J. Machin, Science 1990, 248, 358-361.
86. A. Krohn, S. Redshaw, J. C. Ritchie, B. J. Graves, M. H. Hatada, J. Med. Chem. 1991, 34, 3340-3342.
87. K. Nakanishi, Bioorg. Med. Chem. 2005, 13, 4987-5000.
88. A. L. Donoho, J. Anim. Sci. 1984, 58, 1528-1539.
89. A. K. Ghosh, W. J. Thompson, M. K. Holloway, S. P. McKee, T. T. Duong, H. Y. Lee, P. M. Munson, A. M. Smith, J. M. Wai, P. L. Darke, et al., J. Med. Chem. 1993, 36, 2300-2310.
90. A. K. Ghosh, W. J. Thompson, S. P. McKee, T. T. Duong, T. A. Lyle, J. C. Chen, P. L. Darke, J. A. Zugay, E. A. Emini, W. A. Schleif, et al., J. Med. Chem. 1993, 36, 292-294.
91. M. L. Vazquez, M. L. Bryant, M. Clare, G. A. DeCrescenzo, E. M. Doherty, J. N. Freskos, D. P. Getman, K. A. Houseman, J. A. Julien, G. P. Kocan, J. Med. Chem. 1995, 38, 581-584.
92. R. D. Tung, D. J. Livingston, B. G. Rao, E. E. Kim, C. T. Baker, J. S. Boger, S. P. Chambers, D. D. Deininger, M. Dwyer, L. Elsayed, J. Fulghum, B. Li, M. A. Murcko, M. A. Navia, P. Novak, S. Pazhanisamy, C. Stuver, J. A. Thomson, in Protease Inhibitors in AIDS Therapy (Eds.:, R. C. Ogden, C. W. Flexner,), Marcel Dekker, New York, 2001, pp. 101-137.
93. E. E. Kim, C. T. Baker, M. D. Dwyer, M. A. Murcko, B. G. Rao, R. D. Tung, M. A. Navia, J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 1181-1182.
94. A. K. Ghosh, J. F. Kincaid, D. E. Walters, Y. Chen, N. C. Chaudhuri, W. J. Thompson, C. Culberson, P. M. Fitzgerald, H. Y. Lee, S. P. McKee, P. M. Munson, T. T. Duong, P. L. Darke, J. A. Zugay, W. A. Schleif, M. G. Axel, J. Lin, J. R. Huff, J. Med. Chem. 1996, 39, 3278-3290.
95. A. K. Ghosh, S. Kulkarni, D. D. Anderson, L. Hong, A. Baldridge, Y.-F. Wang, A. A. Chumanevich, A. Y. Kovalevsky, Y. Tojo, M. Amano, Y. Koh, J. Tang, I. T. Weber, H. Mitsuya, J. Med. Chem. 2009, 52, 7689-7705.
96. J. W. Erickson, S. V. Gulnik, H. Mitsuya, A. K. Ghosh, (Fitness Assay and Associated Methods), US Patent 7470506B1, 2008.
97. S. De Meyer, M. Peters, Abstracts 533 and 620, 11th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections (CROI), February 8-11 2004, San Francisco, CA (USA).
98. R. Hoetelmans, I. van der Sandt, M. De Pauw, K. Struble, M. Peeters, R. van der Geest, Abstract 549, 10th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections (CROI), February 2003, Boston, MA (USA).
99. D. L. Surleraux, A. Tahri, W. G. Verschueren, G. M. Pille, H. A. De Kock, T. H. Jonckers, A. Peeters, S. De Meyer, H. Azjin, R. Pauwels, M. P. de Bethune, N. M. King, M. Prabu-Jeyabalan, C. A. Schiffer, P. B. Wigerinck, J. Med. Chem. 2005, 48, 1813-1822.
100. Y. Tie, P. Boross, Y. Wang, L. Gaddis, A. Hussain, S. Leshchenko, A. Ghosh, J. Louis, R. Harrison, I. Weber, J. Mol. Biol. 2004, 338, 341-352.
101. N. King, M. Prabu-Jeyabalan, E. Nalivaika, P. Wigerinck, M. de Bethune, C. Schiffer, J. Virol. 2004, 78, 12012-12021.
102. I. Dierynck, I. Keuleers, M. De Wit, A. Tahri, D. Surleraux, D. A. Peeters, K. Hertogs, Antiviral Res. 2005, 10, S 71.
103. E. Lefebvre, C. Schiffer, AIDS Rev. 2008, 10, 131-142.
104. A. Kovalevsky, A. K. Ghosh, I. T. Weber, J. Med. Chem. 2008, 51, 6599-6603.
105. Y. Koh, H. Nakata, K. Maeda, H. Ogata, H. G. Bilcer, T. Devasamudram, J. F. Kincaid, P. Boross, Y. F. Wang, Y. Tie, P. Volarath, L. Gaddis, R. W. Harrison, I. T. Weber, A. K. Ghosh, H. Mitsuya, Antimicrob. Agents Chemother. 2003, 47, 3123-3129.
106. S. De Meyer, H. Azijn, D. Surleraux, D. Jochmans, A. Tahri, R. Pauwels, P. Wigerinck, M. de Bethune, Antimicrob. Agents Chemother. 2005, 49, 2314-2321.
107. Y. Koh, M. Amano, T. Towata, M. Danish, S. Leshchenko-Yashchuk, D. Das, M. Nakayama, Y. Tojo, A. K. Ghosh, H. Mitsuya, J. Virol. 2010, 84, 11961-11969.
108. S. De Meyer, A. Hill, I. De Baere, I. Rimsky, H. Azijin, B. Van Baelen, E. De Paepe, T. Vangeneugden, et al., Antiviral Ther. 2006, 11, S 73.
109. C. Wolfe, C. Hicks, HIV/AIDS 2009, 1, 13-21.
110. K. Saskova, M. Kozisek, P. Rezacova, J. Brynda, T. Yashina, R. Kagan, J. Konvalinka, J. Virol. 2009, 83, 8810-8818.
111. A. Wlodwaer, M. Miller, M. Jaskolski, B. Sathyanarayana, E. Baldwin, I. Weber, L. Selk, L. Clawson, Science 1989, 245, 616-621.
112. Y. Koh, S. Matsumi, D. Das, M. Amano, D. Davis, J. Li, S. Leschenko, A. Baldridge, et al., J. Biol. Chem. 2007, 282, 28709-28720.
113. M. Amano, Y. Koh, D. Das, J. Li, S. Leschenko, Y. F. Wang, P. I. Boross, I. T. Weber, A. K. Ghosh, H. Mitsuya, Antimicrob. Agents Chemother. 2007, 51, 2143-2155.
114. Y. F. Wang, Y. Tie, P. I. Boross, J. Tozser, A. K. Ghosh, R. W. Harrison, I. T. Weber, J. Med. Chem. 2007, 50, 4509-4515.
115. J. F. Miller, E. S. Furfine, M. H. Hanlon, R. J. Hazen, J. A. Ray, L. Robinson, V. Samano, A. Spaltenstein, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2004, 14, 959-963.
116. R. Hazen, R. Harvey, R. Ferris, C. Craig, P. Yates, P. Griffin, J. Miller, I. Kaldor, J. Ray, V. Samano, E. Furfine, A. Spaltenstein, M. Hale, R. Tung, M. St. Clair, M. Hanlon, L. Boone, Antimicrob. Agents Chemother. 2007, 51, 3147-3154.
117. S. L. Ford, Y. S. Reddy, M. T. Anderson, S. C. Murray, P. Fernandez, D. S. Stein, M. A. Johnson, Antimicrob. Agents Chemother. 2006, 50, 2201-2206.
118. J. R. Lalezari, D. J. Ward, S. A. Tomkin, H. R. Garges, J. Antimicrob. Chemother. 2007, 60, 170-174.
119. Corresponding press release online: "GlaxoSmithKline Discontinues Clinical Development of Investigational Protease Inhibitor Brecanavir (640 385)".
120. A. K. Ghosh, J. Li, H. Mitsuya, unpublished work, Purdue University and National Cancer Institute.
121. T. Cihlar, G. X. He, X. Liu, J. M. Chen, M. Hatada, S. Swaminathan, M. J. McDermott, Z. Y. Yang, et al., J. Mol. Biol. 2006, 363, 635-647.
122. C. Callebaut, K. Stray, L. Tsai, L. H. Xu, G. X. He, A. Mulato, T. Priskich, N. Parkin, et al., 20th International Conference on Antiviral Research; Palm Spring, CA, April 29 to May 3, 2007, p. 2.
123. C. Callebaut, K. Stray, L. Tsai, M. Williams, Z. Yang, C. Cannizzaro, S. A. Leavitt, X. Liu, K. Wang, B. P. Murray, A. Mulato, M. Hatada, T. Priskich, N. Parkin, S. Swaminathan, W. Lee, G. He, L. Xu, T. Cihlar, Antimicrob. Agents Chemother. 2011, 55, 1366-1376.
124. A. Gustchina, I. T. Weber, FEBS Lett. 1990, 269, 269-272.
125. A. K. Ghosh, C. D. Martyr, M. Steffey, Y.-F. Wang, J. Agniswamy, M. Amano, I. T. Weber, H. Mitsuya, ACS Med. Chem. Lett. 2011, 2, 298-302.
126. D. J. Kempf, K. C. Marsh, D. A. Paul, M. F. Knige, D. W. Norbeck, W. E. Kohlbrenner, L. Codacovi, S. Vasavanonda, P. Bryant, X. C. Wang, N. E. Wideburg, J. J. Clement, J. J. Plattner, J. Erickson, Antimicrob. Agents Chemother. 1991, 35, 2209-2214.
127. E. T. Baldwin, T. N. Bhat, B. Liu, N. Pattabriaman, J. W. Erickson, Struct. Biol. 1995, 2, 244-249.
128. Y. Tojo, Y. Koh, M. Amano, M. Aoki, D. Das, A. K. Ghosh, H. Mitsuya, Antimicrob. Agents Chemother. 2010, 54, 3460-3470.
129. A. K. Ghosh, S. Gemma, J. Takayama, A. Baldridge, S. Leshchenko-Yashchuk, H. B. Miller, Y.-F. Wang, A. Y. Kovalevsky, Y. Koh, I. T. Weber, H. Mitsuya, Org. Biomol. Chem. 2008, 6, 3703-3713.
130. A. K. Ghosh, B. Chapsal, G. L. Parham, M. P. Steffey, J. Agniswamy, Y.-F. Wang, M. Amano, I. T. Weber, H. Mitsuya, J. Med. Chem. 2011, 54, 5890-5901.
131. A. K. Ghosh, S. Leshchenko-Yashchuk, D. D. Anderson, A. Baldridge, M. Noetzel, H. B. Miller, Y. Tie, Y.-F. Wang, Y. Koh, I. T. Weber, H. Mitsuya, J. Med. Chem. 2009, 52, 3902-3914.
132. Y. Koh, D. Das, S. Leshchenko, H. Nakata, H. Ogata-Aoki, M. Amano, M. Nakayama, A. K. Ghosh, H. Mitsuya, Antimicrob. Agents Chemother. 2009, 53, 997-1006.
133. A. K. Ghosh, S. Gemma, A. Baldridge, Y. F. Wang, A. Y. Kovalevsky, Y. Koh, I. T. Weber, H. Mitsuya, J. Med. Chem. 2008, 51, 6021-6033.
134. A. K. Ghosh, B. Chapsal, A. Baldridge, M. P. Steffey, D. E. Walters, Y. Koh, M. Amano, H. Mitsuya, J. Med. Chem. 2011, 54, 622-634.
135. K. Ide, M. Aoki, M. Amano, Y. Koh, R. S. Yedidi, D. Das, S. Leschenko, B. Chapsal, A. K. Ghosh, H. Mitsuya, Antimicrob. Agents Chemother. 2011, 55, 1717-1727.
136. T. A. Halgren, J. Comput. Chem. 1999, 20, 730-748.
137. A. K. Ghosh, C. X. Xu, K. V. Rao, A. Baldridge, J. Agniswamy, Y. F. Wang, I. T. Weber, M. Aoki, S. G. P. Miguel, M. Amano, H. Mitsuya, ChemMedChem 2010, 5, 1850-1854.