Strategies for highly sensitive biomarker detection by Rolling Circle Amplification of signals from nucleic acid composed sensors

Integrative Biology

Volumn 3, Issue 10, 2011, Pages 982-992

  Stougaard, Magnus ^a   Juul, Sissel ^b   Andersen, Felicie F ^b   Knudsen, Birgitta R ^b  

^a AARHUS UNIVERSITY HOSPITAL   (Denmark)

^b AARHUS UNIVERSITY   (Denmark)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL MARKER; NUCLEIC ACID; SINGLE STRANDED DNA;

BIOSENSOR; ENZYME ACTIVITY; HUMAN; NONHUMAN; NUCLEIC ACID ANALYSIS; NUCLEIC ACID SYNTHESIS; NUCLEOTIDE SEQUENCE; POLYMERASE CHAIN REACTION; PRIORITY JOURNAL; REVIEW;

BIOLOGICAL MARKERS; BIOSENSING TECHNIQUES; DNA, CIRCULAR; HUMANS; MICROSCOPY, FLUORESCENCE; NUCLEIC ACID AMPLIFICATION TECHNIQUES;

EID: 80053633351     PISSN: 17579694     EISSN: 17579708     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1ib00049g     Document Type: Review

References (206)

1. A. Stadler C. Chi D. van der Lelie O. Gang Nanomedicine 2010 5 319 334
2. N. C. Seeman Annu. Rev. Biochem. 2010 79 65 87
3. A. Kuzuya M. Komiyama Nanoscale 2010 2 310 322
4. N. C. Seeman Nano Lett. 2010 10 1971 1978
5. P. W. Rothemund Nature 2006 440 297 302
6. T. Torring N. V. Voigt J. Nangreave H. Yan K. V. Gothelf Chem. Soc. Rev. 2011 10.1039/C1CS15057J
7. N. V. Voigt T. Torring A. Rotaru M. F. Jacobsen J. B. Ravnsbaek R. Subramani W. Mamdouh J. Kjems A. Mokhir F. Besenbacher K. V. Gothelf Nat. Nanotechnol. 2010 5 200 203
8. H. Yan T. H. LaBean L. Feng J. H. Reif Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 8103 8108
9. J. H. Chen N. C. Seeman Nature 1991 350 631 633
10. W. M. Shih J. D. Quispe G. F. Joyce Nature 2004 427 618 621
11. F. F. Andersen B. Knudsen C. L. Oliveira R. F. Frohlich D. Kruger J. Bungert M. Agbandje-McKenna R. McKenna S. Juul C. Veigaard J. Koch J. L. Rubinstein B. Guldbrandtsen M. S. Hede G. Karlsson A. H. Andersen J. S. Pedersen B. R. Knudsen Nucleic Acids Res. 2008 36 1113 1119
12. F. A. Aldaye H. F. Sleiman J. Am. Chem. Soc. 2007 129 13376 13377
13. R. P. Goodman I. A. Schaap C. F. Tardin C. M. Erben R. M. Berry C. F. Schmidt A. J. Turberfield Science 2005 310 1661 1665
14. A. M. Hung H. Noh J. N. Cha Nanoscale 2010 2 2530 2537
15. E. S. Andersen New Biotechnol. 2010 27 184 193
16. F. A. Aldaye A. L. Palmer H. F. Sleiman Science 2008 321 1795 1799
17. A. Kuzuya M. Komiyama Chem. Commun. 2009 4182 4184
18. M. Endo T. Sugita Y. Katsuda K. Hidaka H. Sugiyama Chem.-Eur. J. 2010 16 5362 5368
19. D. Bhatia S. Mehtab R. Krishnan S. S. Indi A. Basu Y. Krishnan Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 4134 4137
20. E. S. Andersen M. Dong M. M. Nielsen K. Jahn R. Subramani W. Mamdouh M. M. Golas B. Sander H. Stark C. L. Oliveira J. S. Pedersen V. Birkedal F. Besenbacher K. V. Gothelf J. Kjems Nature 2009 459 73 76
21. H. Liu Z. Zhu H. Kang Y. Wu K. Sefan W. Tan Chem.-Eur. J. 2010 16 3791 3797
22. K. Wang M. You Y. Chen D. Han Z. Zhu J. Huang K. Williams C. J. Yang W. Tan Angew. Chem., Int. Ed. 2011 10.1002/anie.201008053
23. M. Nishikawa S. Rattanakiat Y. Takakura Adv. Drug Delivery Rev. 2010 62 626 632
24. A. Kuzyk K. T. Laitinen P. Torma Nanotechnology 2009 20 235305
25. A. Kuzuya M. Kimura K. Numajiri N. Koshi T. Ohnishi F. Okada M. Komiyama ChemBioChem 2009 10 1811 1815
26. N. Stephanopoulos M. Liu G. J. Tong Z. Li Y. Liu H. Yan M. B. Francis Nano Lett. 2010 10 2714 2720
27. R. Subramani S. Juul A. Rotaru F. F. Andersen K. V. Gothelf W. Mamdouh F. Besenbacher M. Dong B. R. Knudsen ACS Nano 2010 4 5969 5977
28. F. Diezmann O. Seitz Chem. Soc. Rev. 2011 10.1039/C1CS15054E
29. B. A. Rosenzweig N. T. Ross D. M. Tagore J. Jayawickramarajah I. Saraogi A. D. Hamilton J. Am. Chem. Soc. 2009 131 5020 5021
30. K. Numajiri T. Yamazaki M. Kimura A. Kuzuya M. Komiyama J. Am. Chem. Soc. 2010 132 9937 9939
31. Z. S. Wu P. Hu H. Zhou G. Shen R. Yu Biomaterials 2010 31 1918 1924
32. S. J. Scharf G. T. Horn H. A. Erlich Science 1986 233 1076 1078
33. J. Kim C. J. Easley Bioanalysis 2011 3 227 239
34. D. Liu S. L. Daubendiek M. A. Zillman K. Ryan E. T. Kool J. Am. Chem. Soc. 1996 118 1587 1594
35. P. M. Lizardi X. Huang Z. Zhu P. Bray-Ward D. C. Thomas D. C. Ward Nat. Genet. 1998 19 225 232
36. G. Nallur C. Luo L. Fang S. Cooley V. Dave J. Lambert K. Kukanskis S. Kingsmore R. Lasken B. Schweitzer Nucleic Acids Res. 2001 29 E118
37. C. Larsson J. Koch A. Nygren G. Janssen A. K. Raap U. Landegren M. Nilsson Nat. Methods 2004 1 227 232
38. G. A. Blab T. Schmidt M. Nilsson Anal. Chem. 2004 76 495 498
39. M. Stougaard J. S. Lohmann M. Zajac S. Hamilton-Dutoit J. Koch BMC Biotechnol. 2007 7 69
40. M. Stougaard J. S. Lohmann A. Mancino S. Celik F. F. Andersen J. Koch B. R. Knudsen ACS Nano 2009 3 223 233
41. F. F. Andersen M. Stougaard H. L. Jorgensen S. Bendsen S. Juul K. Hald A. H. Andersen J. Koch B. R. Knudsen ACS Nano 2009 3 4043 4054
42. I. Smolina C. Lee M. Frank-Kamenetskii Appl. Environ. Microbiol. 2007 73 2324 2328
43. I. Smolina N. S. Miller M. Frank-Kamenetskii Artificial DNA: PNA & XNA 2010 1 1 7
44. A. T. Christian M. S. Pattee C. M. Attix B. E. Reed K. J. Sorensen J. D. Tucker Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 14238 14243
45. E. J. Cho L. Yang M. Levy A. D. Ellington J. Am. Chem. Soc. 2005 127 2022 2023
46. T. Konry I. Smolina J. M. Yarmush D. Irimia M. L. Yarmush Small 2011 7 395 400
47. X. B. Zhong P. M. Lizardi X. H. Huang P. L. Bray-Ward D. C. Ward Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 3940 3945
48. F. Maruyama T. Kenzaka N. Yamaguchi K. Tani M. Nasu Appl. Environ. Microbiol. 2005 71 7933 7940
49. R. S. Jahangir Tafrechi F. M. van de Rijke A. Allallou C. Larsson W. C. Sloos M. van de Sande C. Wahlby G. M. Janssen A. K. Raap J. Histochem. Cytochem. 2007 55 1159 1166
50. E. Merkiene E. Gaidamaviciute L. Riauba A. Janulaitis A. Lagunavicius RNA 2010 16 1508 1515
51. F. Maruyama K. Tani T. Kenzaka N. Yamaguchi M. Nasu Appl. Environ. Microbiol. 2006 72 6248 6256
52. C. Larsson I. Grundberg O. Soderberg M. Nilsson Nat. Methods 2010 7 395 397
53. S. Henriksson S. Shaposhnikov M. Nilsson A. Collins Toxicol. Lett. 2011 202 142 147
54. T. Hoshino A. Schramm Environ. Microbiol. 2010 12 2508 2517
55. S. Henriksson A. L. Blomstrom L. Fuxler C. Fossum M. Berg M. Nilsson Virol. J. 2011 8 37
56. A. Lagunavicius E. Merkiene Z. Kiveryte A. Savaneviciute V. Zimbaite-Ruskuliene T. Radzvilavicius A. Janulaitis RNA 2009 15 765 771
57. Y. Zhou M. Calciano S. Hamann J. H. Leamon T. Strugnell M. W. Christian P. M. Lizardi Exp. Mol. Pathol. 2001 70 281 288
58. M. H. Vermeer R. van Doorn R. Dijkman X. Mao S. Whittaker P. C. van Voorst Vader M. J. Gerritsen M. L. Geerts S. Gellrich O. Soderberg K. J. Leuchowius U. Landegren J. J. Out-Luiting J. Knijnenburg M. Ijszenga K. Szuhai R. Willemze C. P. Tensen Cancer Res. 2008 68 2689 2698
59. L. McNeill R. J. Salmond J. C. Cooper C. K. Carret R. L. Cassady-Cain M. Roche-Molina P. Tandon N. Holmes D. R. Alexander Immunity 2007 27 425 437
60. T. Szado V. Vanderheyden J. B. Parys H. De Smedt K. Rietdorf L. Kotelevets E. Chastre F. Khan U. Landegren O. Soderberg M. D. Bootman H. L. Roderick Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 2427 2432
61. O. Soderberg M. Gullberg M. Jarvius K. Ridderstrale K. J. Leuchowius J. Jarvius K. Wester P. Hydbring F. Bahram L. G. Larsson U. Landegren Nat. Methods 2006 3 995 1000
62. A. Zieba C. Wahlby F. Hjelm L. Jordan J. Berg U. Landegren K. Pardali Clin. Chem. (Washington, D. C.) 2010 56 99 110
63. M. Aubele M. Spears N. Ludyga H. Braselmann A. Feuchtinger K. J. Taylor K. Lindner G. Auer K. Stering H. Hofler M. Schmitt J. M. Bartlett Br. J. Cancer 2010 103 663 667
64. H. L. Wamsley A. F. Barbet J. Clin. Microbiol. 2008 46 2314 2319
65. J. Melin J. Jarvius C. Larsson O. Soderberg U. Landegren M. Nilsson New Biotechnol. 2008 25 42 48
66. A. Hatch T. Sano J. Misasi C. L. Smith Genet. Anal. Biomol. Eng. 1999 15 35 40
67. B. Schweitzer S. Wiltshire J. Lambert S. O'Malley K. Kukanskis Z. Zhu S. F. Kingsmore P. M. Lizardi D. C. Ward Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 10113 10119
68. J. Melin H. Johansson O. Soderberg F. Nikolajeff U. Landegren M. Nilsson J. Jarvius Anal. Chem. 2005 77 7122 7130
69. J. Jarvius J. Melin J. Goransson J. Stenberg S. Fredriksson C. Gonzalez-Rey S. Bertilsson M. Nilsson Nat. Methods 2006 3 725 727
70. R. Mizuta M. Mizuta D. Kitamura Arch. Histol. Cytol. 2003 66 175 181
71. S. Beyer P. Nickels F. C. Simmel Nano Lett. 2005 5 719 722
72. J. Yan S. Song B. Li Q. Zhang Q. Huang H. Zhang C. Fan Small 2010 6 2520 2525
73. Z. Cheglakov Y. Weizmann B. Basnar I. Willner Org. Biomol. Chem. 2007 5 223 225
74. S. Akhtar M. Stromberg T. Zardan Gomez de la Torre C. Russell K. Gunnarsson M. Nilsson P. Svedlindh M. Stromme K. Leifer J. Phys. Chem. B 2010 114 13255 13262
75. W. Cheng F. Yan L. Ding H. Ju Y. Yin Anal. Chem. 2010 82 3337 3342
76. L. Linck U. Resch-Genger Eur. J. Med. Chem. 2010 45 5561 5566
77. S. C. Johnson C. B. Sherrill D. J. Marshall M. J. Moser J. R. Prudent Nucleic Acids Res. 2004 32 1937 1941
78. C. B. Sherrill D. J. Marshall M. J. Moser C. A. Larsen L. Daude-Snow S. Jurczyk G. Shapiro J. R. Prudent J. Am. Chem. Soc. 2004 126 4550 4556
79. F. S. Nolte D. J. Marshall C. Rasberry S. Schievelbein G. G. Banks G. A. Storch M. Q. Arens R. S. Buller J. R. Prudent J. Clin. Microbiol. 2007 45 2779 2786
80. K. D. Barbee M. Chandrangsu X. Huang Macromol. Biosci. 2011 11 607 617
81. L. Zhou L. J. Ou X. Chu G. L. Shen R. Q. Yu Anal. Chem. 2007 79 7492 7500
82. B. Schweitzer S. Roberts B. Grimwade W. Shao M. Wang Q. Fu Q. Shu I. Laroche Z. Zhou V. T. Tchernev J. Christiansen M. Velleca S. F. Kingsmore Nat. Biotechnol. 2002 20 359 365
83. Z. S. Wu H. Zhou S. Zhang G. Shen R. Yu Anal. Chem. 2010 82 2282 2289
84. L. Yang C. W. Fung E. J. Cho A. D. Ellington Anal. Chem. 2007 79 3320 3329
85. Y. L. Zhang Y. Huang J. H. Jiang G. L. Shen R. Q. Yu J. Am. Chem. Soc. 2007 129 15448 15449
86. S. Wiltshire S. O'Malley J. Lambert K. Kukanskis D. Edgar S. F. Kingsmore B. Schweitzer Clin. Chem. (Washington, D. C.) 2000 46 1990 1993
87. H. Zhou K. Bouwman M. Schotanus C. Verweij J. A. Marrero D. Dillon J. Costa P. Lizardi B. B. Haab GenomeBiology 2004 5 R28
88. F. Dahl J. Baner M. Gullberg M. Mendel-Hartvig U. Landegren M. Nilsson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 4548 4553
89. L. Perlee J. Christiansen R. Dondero B. Grimwade S. Lejnine M. Mullenix W. Shao M. Sorette V. Tchernev D. Patel S. Kingsmore Proteome Sci. 2004 2 9
90. T. Conze A. Shetye Y. Tanaka J. Gu C. Larsson J. Goransson G. Tavoosidana O. Soderberg M. Nilsson U. Landegren Annu. Rev. Anal. Chem. 2009 2 215 239
91. U. Landegren E. Schallmeiner M. Nilsson S. Fredriksson J. Baner M. Gullberg J. Jarvius S. Gustafsdottir F. Dahl O. Soderberg O. Ericsson J. Stenberg J. Mol. Recognit. 2004 17 194 197
92. U. Landegren M. Nilsson M. Gullberg O. Soderberg M. Jarvius C. Larsson J. Jarvius Methods Cell Biol. 2004 75 787 797
93. M. Nilsson Histochem. Cell Biol. 2006 126 159 164
94. C. K. Tsui B. Wang L. Khadempour S. M. Alamouti J. Bohlmann B. W. Murray R. C. Hamelin J. Microbiol. Methods 2010 83 26 33
95. E. L. McCarthy T. J. Egeler L. E. Bickerstaff M. Pereira da Cunha P. J. Millard Anal. Bioanal. Chem. 2006 386 1975 1984
96. J. S. Lohmann M. Stougaard J. Koch Mol. Biol. 2007 8 103
97. Y. Long X. Zhou D. Xing Biosens. Bioelectron. 2011 26 2897 2904
98. Z. Li W. Li Y. Cheng L. Hao Analyst 2008 133 1164 1168
99. F. Kong Z. Tong X. Chen T. Sorrell B. Wang Q. Wu D. Ellis S. Chen J. Clin. Microbiol. 2008 46 1192 1199
100. H. Wang F. Kong T. C. Sorrell B. Wang P. McNicholas N. Pantarat D. Ellis M. Xiao F. Widmer S. C. Chen BMC Microbiol. 2009 9 167
101. Q. Su D. Xing X. Zhou Biosens. Bioelectron. 2010 25 1615 1621
102. I. V. Smolina H. Kuhn C. Lee M. D. Frank-Kamenetskii Bioorg. Med. Chem. 2008 16 84 93
103. S. Bi L. Li S. Zhang Anal. Chem. 2010 82 9447 9454
104. K. Sato A. Tachihara B. Renberg K. Mawatari Y. Tanaka J. Jarvius M. Nilsson T. Kitamori Lab Chip 2010 10 1262 1266
105. D. Y. Zhang W. Zhang X. Li Y. Konomi Gene 2001 274 209 216
106. A. F. Faruqi S. Hosono M. D. Driscoll F. B. Dean O. Alsmadi R. Bandaru G. Kumar B. Grimwade Q. Zong Z. Sun Y. Du S. Kingsmore T. Knott R. S. Lasken BMC Genomics 2001 2 4
107. J. Pickering A. Bamford V. Godbole J. Briggs G. Scozzafava P. Roe C. Wheeler F. Ghouze S. Cuss Nucleic Acids Res. 2002 30 e60
108. O. A. Alsmadi C. J. Bornarth W. Song M. Wisniewski J. Du J. P. Brockman A. F. Faruqi S. Hosono Z. Sun Y. Du X. Wu M. Egholm P. Abarzua R. S. Lasken M. D. Driscoll BMC Genomics 2003 4 21
109. L. Mahmoudian N. Kaji M. Tokeshi M. Nilsson Y. Baba Anal. Chem. 2008 80 2483 2490
110. L. Mahmoudian J. Melin M. R. Mohamadi K. Yamada M. Ohta N. Kaji M. Tokeshi M. Nilsson Y. Baba Anal. Sci. 2008 24 327 332
111. S. Zhang Z. Wu G. Shen R. Yu Biosens. Bioelectron. 2009 24 3201 3207
112. M. Nilsson H. Malmgren M. Samiotaki M. Kwiatkowski B. P. Chowdhary U. Landegren Science 1994 265 2085 2088
113. V. V. Demidov M. D. Frank-Kamenetskii Trends Biochem. Sci. 2004 29 62 71
114. H. Kuhn V. V. Demidov M. D. Frank-Kamenetskii Angew. Chem., Int. Ed. 1999 38 1446 1449
115. U. Landegren R. Kaiser J. Sanders L. Hood Science 1988 241 1077 1080
116. M. Nilsson K. Krejci J. Koch M. Kwiatkowski P. Gustavsson U. Landegren Nat. Genet. 1997 16 252 255
117. J. Lu J. Tong H. Feng J. Huang C. L. Afonso D. L. Rock F. Barany W. Cao Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 2004 1701 37 48
118. M. Nilsson G. Barbany D. O. Antson K. Gertow U. Landegren Nat. Biotechnol. 2000 18 791 793
119. M. Nilsson D. O. Antson G. Barbany U. Landegren Nucleic Acids Res. 2001 29 578 581
120. K. Kleppe J. H. Van de Sande H. G. Khorana Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1970 67 68 73
121. G. C. Fareed E. M. Wilt C. C. Richardson J. Biol. Chem. 1971 246 925 932
122. S. P. Jonstrup J. Koch J. Kjems RNA 2006 12 1747 1752
123. P. J. Millard L. E. Bickerstaff S. E. LaPatra C. H. Kim J. Fish Dis. 2006 29 201 213
124. Y. Zhou Q. Huang J. Gao J. Lu X. Shen C. Fan Nucleic Acids Res. 2010 38 e156
125. Y. Cheng X. Zhang Z. Li X. Jiao Y. Wang Y. Zhang Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 3268 3272
126. Y. Mashimo M. Mie S. Suzuki E. Kobatake Anal. Bioanal. Chem. 2011 401 221 227
127. H. Takahashi A. Matsumoto S. Sugiyama T. Kobori Anal. Biochem. 2010 401 242 249
128. N. Li C. Jablonowski H. Jin W. Zhong Anal. Chem. 2009 81 4906 4913
129. N. Masuda T. Ohnishi S. Kawamoto M. Monden K. Okubo Nucleic Acids Res. 1999 27 4436 4443
130. M. Srinivasan D. Sedmak S. Jewell Am. J. Pathol. 2002 161 1961 1971
131. W. T. Hu J. Q. Trojanowski L. M. Shaw Prog. Neurobiol. 2011 10.1016/j.pneurobio.2011.04.012
132. S. A. Lari H. M. Kuerer J. Cancer 2011 2 232 261
133. T. M. Doherty R. S. Wallis A. Zumla Clin. Chest Med. 2009 30 783 796
134. F. Vitzthum F. Behrens N. L. Anderson J. H. Shaw J. Proteome Res. 2005 4 1086 1097
135. A. D. Ellington J. W. Szostak Nature 1990 346 818 822
136. T. Hermann D. J. Patel Science 2000 287 820 825
137. K. Sefah J. A. Phillips X. Xiong L. Meng D. Van Simaeys H. Chen J. Martin W. Tan Analyst 2009 134 1765 1775
138. N. O. Fischer T. M. Tarasow J. B. Tok Anal. Biochem. 2008 373 121 128
139. Y. Huang X. M. Nie S. L. Gan J. H. Jiang G. L. Shen R. Q. Yu Anal. Biochem. 2008 382 16 22
140. D. A. Di Giusto W. A. Wlassoff J. J. Gooding B. A. Messerle G. C. King Nucleic Acids Res. 2005 33 e64
141. Z. S. Wu S. Zhang H. Zhou G. L. Shen R. Yu Anal. Chem. 2010 82 2221 2227
142. W. Cheng L. Ding Y. Chen F. Yan H. Ju Y. Yin Chem. Commun. 2010 46 6720 6722
143. C. Ma W. Wang Q. Yang C. Shi L. Cao Biosens. Bioelectron. 2011 26 3309 3312
144. W. Zhao M. M. Ali M. A. Brook Y. Li Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 6330 6337
145. M. M. Ali Y. Li Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 3512 3515
146. Y. Gusev J. Sparkowski A. Raghunathan H. Ferguson, Jr. J. Montano N. Bogdan B. Schweitzer S. Wiltshire S. F. Kingsmore W. Maltzman V. Wheeler Am. J. Pathol. 2001 159 63 69
147. W. Van Dessel F. Vandenbussche M. Staes N. Goris K. De Clercq J. Virol. Methods 2008 147 151 156
148. B. G. Fuller M. A. Lampson E. A. Foley S. Rosasco-Nitcher K. V. Le P. Tobelmann D. L. Brautigan P. T. Stukenberg T. M. Kapoor Nature 2008 453 1132 1136
149. S. Fredriksson M. Gullberg J. Jarvius C. Olsson K. Pietras S. M. Gustafsdottir A. Ostman U. Landegren Nat. Biotechnol. 2002 20 473 477
150. M. Gullberg S. M. Gustafsdottir E. Schallmeiner J. Jarvius M. Bjarnegard C. Betsholtz U. Landegren S. Fredriksson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 8420 8424
151. M. Lundberg S. B. Thorsen E. Assarsson A. Villablanca B. Tran N. Gee M. Knowles B. S. Nielsen E. Gonzalez Couto R. Martin O. Nilsson C. Fermer J. Schlingemann I. J. Christensen H. J. Nielsen B. Ekstrom C. Andersson M. Gustafsson N. Brunner J. Stenvang S. Fredriksson Mol. Cell. Proteomics 2011 10 M110 004978
152. J. C. Wang Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2002 3 430 440
153. J. B. Leppard J. J. Champoux Chromosoma 2005 114 75 85
154. Y. Pommier Nat. Rev. Cancer 2006 6 789 802
155. C. Postma M. Koopman T. E. Buffart P. P. Eijk B. Carvalho G. J. Peters B. Ylstra J. H. van Krieken C. J. Punt G. A. Meijer Ann. Oncol. 2009 20 1048 1056
156. A. Boonsong S. Marsh P. H. Rooney D. A. Stevenson J. Cassidy H. L. McLeod Cancer Genet. Cytogenet. 2000 121 56 60
157. R. J. Karnes J. C. Cheville C. M. Ida T. J. Sebo A. A. Nair H. Tang J. M. Munz F. Kosari G. Vasmatzis Cancer Res. 2010 70 8994 9002
158. N. Goasguen C. de Chaisemartin A. Brouquet C. Julie G. P. Prevost P. Laurent-Puig C. Penna Int. J. Cancer 2010 127 1028 1037
159. Y. Pommier P. Pourquier Y. Fan D. Strumberg Biochim. Biophys. Acta, Gene Struct. Expression 1998 1400 83 105
160. T. C. Lai K. C. Chow H. Y. Fang H. C. Cho C. Y. Chen T. Y. Lin I. P. Chiang S. P. Ho Oncol. Rep. 2011 25 1243 1251
161. J. M. Lee P. W. Yang S. Y. Yang T. H. Chuang E. C. Tung J. S. Chen P. M. Huang Y. C. Lee Ann. Surg. 2011 253 918 927
162. F. A. Sinicrope Z. J. Yang Future Oncol. 2011 7 467 474
163. A. M. Diegelman E. T. Kool Nucleic Acids Res. 1998 26 3235 3241
164. E. Schopf N. O. Fischer Y. Chen J. B. Tok Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008 18 5871 5874
165. L. Blanco A. Bernad J. M. Lazaro G. Martin C. Garmendia M. Salas J. Biol. Chem. 1989 264 8935 8940
166. J. Baner M. Nilsson M. Mendel-Hartvig U. Landegren Nucleic Acids Res. 1998 26 5073 5078
167. M. D. Abramoff P. J. Magelhaes S. J. Ram Biophotonics Int. 2004 11 36 42
168. A. Allalou C. Wahlby Comput. Methods Programs Biomed. 2009 94 58 65
169. Y. Tanaka H. Xi K. Sato K. Mawatari B. Renberg M. Nilsson T. Kitamori Anal. Chem. 2011 83 3352 3357
170. M. Stromberg J. Goransson K. Gunnarsson M. Nilsson P. Svedlindh M. Stromme Nano Lett. 2008 8 816 821
171. M. Stromberg T. Zardan Gomez de la Torre J. Goransson K. Gunnarsson M. Nilsson M. Stromme P. Svedlindh Biosens. Bioelectron. 2008 24 696 703
172. M. Stromberg T. Zardan Gomez de la Torre J. Goransson K. Gunnarsson M. Nilsson P. Svedlindh M. Stromme Anal. Chem. 2009 81 3398 3406
173. E. Schopf Y. Chen Anal. Biochem. 2010 397 115 117
174. T. Konry M. Dominguez-Villar C. Baecher-Allan D. A. Hafler M. L. Yarmush Biosens. Bioelectron. 2011 26 2707 2710
175. Y. S. Shin F. Remacle R. Fan K. Hwang W. Wei H. Ahmad R. D. Levine J. R. Heath Biophys. J. 2011 100 2378 2386
176. D. Ryan K. Ren H. Wu Biomicrofluidics 2011 5 21501
177. T. Kalisky S. R. Quake Nat. Methods 2011 8 311 314
178. D. C. Thomas G. A. Nardone S. K. Randall Arch. Pathol. Lab. Med. 1999 123 1170 1176
179. J. S. Lohmann M. Stougaard J. Koch BMC Biotechnol. 2007 7 49
180. Y. Tian Y. He C. Mao ChemBioChem 2006 7 1862 1864
181. J. Li T. Deng X. Chu R. Yang J. Jiang G. Shen R. Yu Anal. Chem. 2010 82 2811 2816
182. J. Hu C. Y. Zhang Anal. Chem. 2010 82 8991 8997
183. Y. Y. Huang H. Y. Hsu C. J. Huang Biosens. Bioelectron. 2007 22 980 985
184. M. J. Espy J. R. Uhl L. M. Sloan S. P. Buckwalter M. F. Jones E. A. Vetter J. D. Yao N. L. Wengenack J. E. Rosenblatt F. R. Cockerill, 3rd T. F. Smith Clin. Microbiol. Rev. 2006 19 165 256
185. R. E. Gallagher B. Y. Yeap W. Bi K. J. Livak N. Beaubier S. Rao C. D. Bloomfield F. R. Appelbaum M. S. Tallman J. L. Slack C. L. Willman Blood 2003 101 2521 2528
186. V. P. Gopinath G. D. Raj A. Raja K. Kumanan S. Elankumaran J. Virol. Methods 2011 171 98 101
187. F. R. Mangone F. Walder S. Maistro F. S. Pasini C. N. Lehn M. B. Carvalho M. M. Brentani I. Snitcovsky M. H. Federico Mol. Cancer 2010 9 106
188. C. Mainali M. E. McFall R. K. King Poult. Sci. 2011 90 660 664
189. J. Barletta Mol. Aspects Med. 2006 27 224 253
190. M. Nilsson M. Gullberg F. Dahl K. Szuhai A. K. Raap Nucleic Acids Res. 2002 30 e66
191. T. Conze J. Goransson H. R. Razzaghian O. Ericsson D. Oberg G. Akusjarvi U. Landegren M. Nilsson Nucleic Acids Res. 2010 38 e163
192. M. Schvartzman M. Palma J. Sable J. Abramson X. Hu M. P. Sheetz S. J. Wind Nano Lett. 2011 11 1306 1312
193. Y. Gong A. O. Ogunniyi J. C. Love Lab Chip 2010 10 2334 2337
194. J. E. Visvader Nature 2011 469 314 322
195. Y. Iwasa F. Michor PLoS One 2011 6 e17866
196. N. Haraguchi M. Ohkuma H. Sakashita S. Matsuzaki F. Tanaka K. Mimori Y. Kamohara H. Inoue M. Mori Ann. Surg. Oncol. 2008 15 2927 2933
197. T. Tian S. Olson J. M. Whitacre A. Harding Integr. Biol. 2011 3 17 30
198. C. A. Gilbert A. H. Ross J. Cell. Biochem. 2009 108 1031 1038
199. J. Qin R. C. Jones R. Ramakrishnan Nucleic Acids Res. 2008 36 e116
200. M. Palma J. J. Abramson A. A. Gorodetsky E. Penzo R. L. Gonzalez M. P. Sheetz C. Nuckolls J. Hone S. J. Wind J. Am. Chem. Soc. 2011 133 7656 7659
201. P. J. Asiello A. J. Baeumner Lab Chip 2011 11 1420 1430
202. Z. Cheglakov Y. Weizmann M. K. Beissenhirtz I. Willner Chem. Commun. 2006 3205 3207
203. R. McNerney P. Daley Nat. Rev. Microbiol. 2011 9 204 213
204. F. S. Rodrigues Ribeiro Teles L. A. Pires de Tavora Tavira L. J. Pina da Fonseca Crit. Rev. Clin. Lab. Sci. 2010 47 139 169
205. S. A. Soper K. Brown A. Ellington B. Frazier G. Garcia-Manero V. Gau S. I. Gutman D. F. Hayes B. Korte J. L. Landers D. Larson F. Ligler A. Majumdar M. Mascini D. Nolte Z. Rosenzweig J. Wang D. Wilson Biosens. Bioelectron. 2006 21 1932 1942
206. V. V. Demidov Expert Rev. Mol. Diagn. 2002 2 542 548