Integrated computational model of cell cycle and checkpoint reveals different essential roles of Aurora-A and Plk1 in mitotic entry

Molecular BioSystems

Volumn 7, Issue 1, 2011, Pages 169-179

  Zou, Jun ^a   Luo, Shi Dong ^a   Wei, Yu Quan ^a   Yang, Sheng Yong ^a  

^a SICHUAN UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AURKA PROTEIN, HUMAN; CELL CYCLE PROTEIN; ENZYME INHIBITOR; ONCOPROTEIN; POLO LIKE KINASE 1; POLO-LIKE KINASE 1; PROTEIN SERINE THREONINE KINASE;

ALGORITHM; ARTICLE; BIOLOGICAL MODEL; BIOLOGY; CELL CYCLE; CELL SURVIVAL; DRUG ANTAGONISM; DRUG EFFECT; GENETICS; HELA CELL; HUMAN; METABOLISM; PHYSIOLOGY; WESTERN BLOTTING;

ALGORITHMS; BLOTTING, WESTERN; CELL CYCLE; CELL CYCLE PROTEINS; CELL SURVIVAL; COMPUTATIONAL BIOLOGY; ENZYME INHIBITORS; HELA CELLS; HUMANS; MODELS, BIOLOGICAL; PROTEIN-SERINE-THREONINE KINASES; PROTO-ONCOGENE PROTEINS;

EID: 78650086757     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0mb00004c     Document Type: Article

References (63)

1. M. Malumbres M. Barbacid Nat. Rev. Cancer 2009 9 153 166
2. A. Lindqvist V. Rodríguez-Bravo R. H. Medema J. Cell Biol. 2009 185 193 202
3. B. Novák J. J. Tyson J. Cell Sci. 1993 106 1153 1168
4. B. Novák J. J. Tyson B. Gyorffy A. Csikasz-Nagy Nat. Cell Biol. 2007 9 724 728
5. J. R. Pomerening E. D. Sontag J. E. Ferrell Nat. Cell Biol. 2003 5 346 351
6. J. R. Pomerening S. Y. Kim J. E. Ferrell Cell 2005 122 565 578
7. T. Takaki K. Trenz V. Costanzo M. Petronczki Curr. Opin. Cell Biol. 2008 20 650 660
8. V. Archambault D. M. Glover Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2009 10 265 275
9. A. Seki J. A. Coppinger C.-Y. Jang J. R. Yates G. Fang Science 2008 320 1655 1658
10. L. Macůrek A. Lindqvist D. Lim M. A. Lampson R. Klompmaker R. Freire C. Clouin S. S. Taylor M. B. Yaffe R. H. Medema Nature 2008 455 119 123
11. G. Vader S. M. Lens Biochim. Biophys. Acta 2008 1786 60 72
12. M. Lobrich P. A. Jeggo Nat. Rev. Cancer 2007 7 861 869
13. M. Donzelli G. F. Draetta EMBO Rep. 2003 4 671 677
14. R. Boutros V. Lobjois B. Ducommun Nat. Rev. Cancer 2007 7 495 507
15. I. Mamely M. A. Vugt V. A. Smits J. I. Semple B. Lemmens A. Perrakis R. H. Medema R. Freire Curr. Biol. 2006 16 1950 1955
16. S. Taylor J.-M. Peters Curr. Opin. Cell Biol. 2008 20 77 84
17. A. Csikasz-Nagy Briefings Bioinf. 2009 10 424 434
18. R. P. Araujo L. A. Liotta E. F. Petricoin Nat. Rev. Drug Discovery 2007 6 871 880
19. J. Vera J. Schultz S. Ibrahim Y. Raatz O. Wolkenhauer M. Kunz Mol. BioSyst. 2010 6 264 273
20. K. Strebhardt A. Ullrich Nat. Rev. Cancer 2006 6 321 330
21. X. Q. Deng H. Y. Wang Y. L. Zhao M. L. Xiang P. D. Jiang Z. X. Cao Y. Z. Zheng S. D. Luo L. T. Yu Y. Q. Wei S. Y. Yang Chem. Biol. Drug Des. 2008 71 533 539
22. H. Y. Wang Z. X. Cao L. L. Li P. D. Jiang Y. L. Zhao S. D. Luo L. Yang Y. Q. Wei S. Y. Yang Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008 18 4972 4977
23. J. R. Pollard M. Mortimore J. Med. Chem. 2009 52 2629 2651
24. S. Lapenna A. Giordano Nat. Rev. Drug Discovery 2009 8 547 566
25. J. Jia F. Zhu X. Ma Z. W. Cao Y. X. Li Y. Z. Chen Nat. Rev. Drug Discovery 2009 8 111 128
26. J. B. Fitzgerald B. Schoeberl U. B. Nielsen P. K. Sorger Nat. Chem. Biol. 2006 2 458 466
27. B. Schoeberl E. A. Pace J. B. Fitzgerald B. D. Harms L. Xu L. Nie B. Linggi A. Kalra V. Paragas R. Bukhalid V. Grantcharova N. Kohli K. A. West M. Leszczyniecka M. J. Feldhaus A. J. Kudla U. B. Nielsen Sci. Signaling 2009 2 ra31
28. M. Kanehisa S. Goto Nucleic Acids Res. 2000 28 27 30
29. G. Joshi-Tope M. Gillespie I. Vastrik P. D'Eustachio E. Schmidt B. de Bono B. Jassal G. R. Gopinath G. R. Wu L. Matthews S. Lewis E. Birney L. Stein Nucleic Acids Res. 2004 33 D428 D432
30. H. Hochegger S. Takeda T. Hunt Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2008 9 910 916
31. T. Arooz C. H. Yam W. Y. Siu A. Lau K. K. Li R. Y. Poon Biochemistry 2000 39 9494 9501
32. M. G. Manfredi J. A. Ecsedy K. A. Meetze S. K. Balani O. Burenkova W. Chen K. M. Galvin K. M. Hoar J. J. Huck P. J. LeRoy E. T. Ray T. B. Sells B. Stringer S. G. Stroud T. J. Vos G. S. Weatherhead D. R. Wysong M. Zhang J. B. Bolen C. F. Claiborne Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 4106 4111
33. N. Watanabe H. Arai J. Iwasaki M. Shiina K. Ogata T. Hunter H. Osada Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 11663 11668
34. A. Seki J. A. Coppinger H. Du C.-Y. Jang J. R. Yates G. Fang J. Cell Biol. 2008 181 65 78
35. D. Branzei M. Foiani Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2008 9 297 308
36. H. C. Reinhardt M. B. Yaffe Curr. Opin. Cell Biol. 2009 21 245 255
37. M. A. Vugt A. Bras R. H. Medema Cancer Res. 2005 65 7037 7040
38. N. Mailand S. Bekker-Jensen J. Bartek J. Lukas Mol. Cell 2006 23 307 318
39. W. S. Hlavacek Mol. Syst. Biol. 2008 5 240
40. M. Ashyraliyev Y. Fomekong-Nanfack J. A. Kaandorp J. G. Blom FEBS J. 2009 276 886 902
41. J. R. Banga BMC Syst. Biol. 2008 2 47
42. P. Lenart M. Petronczki M. Steegmaier B. D. Fiore J. J. Lipp M. Hoffmann W. J. Rettig N. Kraut J.-M. Peters Curr. Biol. 2007 17 304 315
43. A. Peschiaroli N. V. Dorrello D. Guardavaccaro M. Venere T. Halazonetis N. E. Sherman M. Pagano Mol. Cell 2006 23 319 329
44. L. Kuepfer M. Peter U. Sauer J. Stelling Nat. Biotechnol. 2007 25 1001 1006
45. W. W. Chen B. Schoeberl P. J. Jasper M. Niepel U. B. Nielsen D. A. Lauffenburger P. K. Sorger Mol. Syst. Biol. 2008 5 239
46. C. C. Wang M. Cirit J. M. Haugh Mol. Syst. Biol. 2009 5 246
47. C. Schlier Appl. Numer. Math. 2008 58 1467 1478
48. R. H. Byrd J. C. Gilbert J. Nocedal Math. Program. 2000 89 149 185
49. E. Balsa-Canto A. Alonso J. Banga BMC Syst. Biol. 2010 4 11
50. D. Desai H. Wessling R. Fisher D. Morgan Mol. Cell. Biol. 1995 15 345 350
51. N. Keen S. Taylor Nat. Rev. Cancer 2004 4 927 936
52. H. Kitano Nat. Rev. Drug Discovery 2007 6 202 210
53. J. Lehár A. S. Krueger W. Avery A. M. Heilbut L. M. Johansen E. R. Price R. J. Rickles G. F. Short J. E. Staunton X. Jin M. S. Lee G. R. Zimmermann A. A. Borisy Nat. Biotechnol. 2009 27 659 666
54. C. I. Bliss Ann. Appl. Biol. 1939 26 585 615
55. E. A. Harrington D. Bebbington J. Moore R. K. Rasmussen A. O. Ajose-Adeogun T. Nakayama J. A. Graham C. Demur T. Hercend A. Diu-Hercend M. Su J. M. Golec K. M. Miller Nat. Med. 2004 10 262 267
56. T. Haberichter B. Madge R. A. Christopher N. Yoshioka A. Dhiman R. Miller R. Gendelman S. V. Aksenov I. G. Khalil S. F. Dowdy Mol. Syst. Biol. 2007 3 84
57. A. Faure D. Thieffry Mol. BioSyst. 2009 5 1569 1581
58. T. Y. Tsai Y. S. Choi W. Ma J. R. Pomerening C. Tang J. E. Ferrell Science 2008 321 126 129
59. U. Alon Nat. Rev. Genet. 2007 8 450 461
60. I. B. Weinstein Science 2002 297 63 64
61. J. Luo N. L. Solimini S. J. Elledge Cell 2009 136 823 837
62. Z. A. Knight H. Lin K. M. Shokat Nat. Rev. Cancer 2010 10 130 137
63. A. C. Hindmarsh P. N. Brown K. E. Grant S. L. Lee R. Serban D. E. Shumaker C. S. Woodward Assoc. Comput. Mach., Trans. Math. Software 2005 31 363 396