Strategies for facilitated forward chemical genetics

ChemBioChem

Volumn 5, Issue 7, 2004, Pages 903-908

  Khersonsky, Sonya M ^a   Chang, Young Tae ^a  

^a NEW YORK UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

Bioorganic chemistry; Forward chemical genetics; Phenotype screening; Proteins; Small molecule libraries

Indexed keywords

2,2 DIMETHYLBENZOPYRAN; ANTIDIABETIC AGENT; ANTIHYPERTENSIVE AGENT; ANTIINFECTIVE AGENT; ANTIMALARIAL AGENT; ANTINEOPLASTIC AGENT; CYCLIN DEPENDENT KINASE INHIBITOR; DIMINUTOL; DIURETIC AGENT; ENZYME INHIBITOR; OLOMOUCINE; PURMORPHAMINE; PURVALANOL A; PURVALANOL B; PYRAN DERIVATIVE; REVERSINE; SULFONAMIDE; TAXUS BREVIFOLIA EXTRACT; UNCLASSIFIED DRUG;

BIODIVERSITY; CHEMICAL GENETICS; FRACTIONATION; GENE LIBRARY; GENOME; HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MEDICAL RESEARCH; MOLECULAR BIOLOGY; PHENOTYPE; PRIORITY JOURNAL; SCREENING TEST; SHORT SURVEY; STRUCTURE ACTIVITY RELATION;

ANIMALS; COMBINATORIAL CHEMISTRY TECHNIQUES; DRUG EVALUATION, PRECLINICAL; GENE EXPRESSION PROFILING; GENOMICS; HUMANS; MOLECULAR BIOLOGY; ORGANIC CHEMICALS;

TAXUS; TAXUS BREVIFOLIA;

EID: 4544334518     PISSN: 14394227     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cbic.200400047     Document Type: Short Survey

References (53)

1. S. L. Schreiber, Chem. Eng. News 2003, 81, 51-61.
2. S. L. Schreiber, Bioorg. Med. Chem. 1998, 6, 1127-1152.
3. D. S. Tan, M. A. Foley, B. R. Stockwell, M. D. Shair, S. L. Schreiber, J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9073-9087.
4. D. S. Tan, Nat. Biotechnol. 2002, 20, 561-563.
5. R. S. Lokey, Curr. Opin. Chem. Biol. 2003, 7, 91-96.
6. G. E. Ward, K. L. Carey, N. J. Westwood, Cell. Microbiol. 2002, 4, 471-482.
7. N. S. Gray, Curr. Opin. Neurobiol. 2001, 11, 608-614.
8. R. Breinbauer, I. R. Vetter, H. Waldmann, Angew. Chem. 2002, 114, 3002-3015; Angew. Chem. Int. Ed. 2002, 41, 2878-2890.
9. R. Breinbauer, I. R. Vetter, H. Waldmann, Angew. Chem. 2002, 114, 3002-3015; Angew. Chem. Int. Ed. 2002, 41, 2878-2890.
10. P. M. Abreu, P. S. Branco, J. Braz. Chem. Soc. 2003, 14, 675-712.
11. U. Abel, C. Koch, M. Speitling, F. G. Hansske, Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 453-458.
12. A. M. Rouhi, Chem. Eng. News 2003, 81, 77-107.
13. Y. Z. Shu, J. Nat. Prod. 1998, 61, 7053-7071.
14. G. R. Eldridge, H. C. Vervoort, C. M. Lee, P. A. Cremin, C. T. Williams, S. M. Hart, M. G. Goering, M. O'Neil-Johnson, L. Zeng, Anal. Chem. 2002, 74, 3963-3977.
15. K. U. Bindseil, J. Jakupovic, D. Wolf, J. Lavayre, J. Leboul, D. van der Pyl, Drug Discovery Today 2001, 6, 840-847.
16. N. S. Gray, L. Wodicka, A. M. Thunnissen, T. C. Norman, S. Kwon, F. H. Espinoza, D. O. Morgan, G. Barnes, S. LeClerc, L. Meijer, S.-H. Kim, P. G. Schultz, Science 1998, 281, 533-538.
17. Y. T. Chang, N. S. Gray, G. R. Rosania, D. P. Sutherlin, S. Kwon, T. C. Norman, R. Sarohia, M. Leost, L. Meijer, P. G. Schultz, Chem. Biol. 1999, 6, 361-375.
18. Y. T. Chang, S. M. Wignall, G. R. Rosania, N. S. Gray, S. R. Hanson, A. I. Su, J. Merlie, Jr., H. S. Moon, S. B. Sangankar, O. Perez, R. Heald, P. G. Schultz, J. Med. Chem. 2001, 44, 4497-4500.
19. G. R. Rosania, Y. T. Chang, O. Perez, D. Sutherlin, H. Dong, D. J. Lockhart, P. G. Schultz, Nat. Biotechnol. 2000, 18, 304-308.
20. D. E. Verdugo, M. T. Cancilla, X. Ge, N. S. Gray, Y. T. Chang, P. G. Schultz, M. Negishi, J. A. Leary, C. R. Bertozzi, J. Med. Chem. 2001, 44, 2683-2686.
21. J. I. Armstrong, A. R. Portley, Y. T. Chang, D. M. Nierengarten, B. N. Cook, K. G. Bowman, A. Bishop, N. S. Gray, K. M. Shokat, P. G. Schultz, C. R. Bertozzi, Angew. Chem. 2000, 112, 1359-1362; Angew. Chem. Int. Ed. 2000, 39, 1303-1306.
22. J. I. Armstrong, A. R. Portley, Y. T. Chang, D. M. Nierengarten, B. N. Cook, K. G. Bowman, A. Bishop, N. S. Gray, K. M. Shokat, P. G. Schultz, C. R. Bertozzi, Angew. Chem. 2000, 112, 1359-1362; Angew. Chem. Int. Ed. 2000, 39, 1303-1306.
23. S. M. Wignall, N. S. Gray, Y. T. Chang, L. Juarez, R. Jacob, A. Burlingame, P. G. Schultz, R. Heald, Chem. Biol. 2004, 11, 135-146.
24. Y. T. Chang, G. Choi, Y. S. Bae, M. Burdett, H. S. Moon, J. W. Lee, N. S. Gray, P. G. Schultz, L. Meijer, S. K. Chung, K. Y. Choi, P. G. Suh, S. H. Ryu, Chem Bio Chem 2002, 3, 897-901.
25. X. Wu, S. Ding, Q. Ding, N. S. Gray, P. G. Schultz, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14520-14521.
26. S. B. Chen, Q. S. Zhang, X. Wu, P. G. Schultz, S. Ding, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 410-411.
27. K. C. Nicolaou, J. A. Pfefferkorn, A. J. Roecker, G. Q. Cao, S. Barluenga, H. J. Mitchell, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9939-9953.
28. K. C. Nicolaou, J. A. Pfefferkorn, H. J. Mitchell, A. J. Roecker, S. Barluenga, G. Q. Cao, R. L. Affleck, J. E. Lillig, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9954-9967.
29. K. C. Nicolaou, J. A. Pfefferkorn, S. Barluenga, H. J. Mitchell, A. J. Roecker, G. Q. Cao, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9968-9976.
30. K. C. Nicolaou, A. J. Roecker, S. Barluenga, J. A. Pfefferkorn, G. Q. Cao, ChemBioChem 2001, 2, 460-465.
31. K. C. Nicolaou, R. M. Evans, A. J. Roecker, R. Hughes, M. Downes, J. A. Pfefferkorn, Org. Biomol. Chem. 2003, 1, 908-920.
32. J. Drews, Science 2000, 287, 1960-1964.
33. A. Yokoi, J. Kuromitsu, T. Kawai, T. Nagasu, N. H. Sugi, K. Yoshimatsu, H. Yoshino, T. Owa, Mol. Cancer Ther. 2002, 1, 275-286.
34. S. W. Kim, C. Y. Hong, K. Lee, E. J. Lee, J. S. Koh, Bioorg. Med. Chem. Lett. 1998, 8, 735-738.
35. A. Ryckebusch, R. Deprez-Poulain, M. A. Debreu-Fontaine, R. Vandaele, E. Mouray, P. Grellier, C. Sergheraert, Bioorg. Med. Chem. Lett, 2002, 12, 2595-2598.
36. B. R. Stockwell, Nat. Rev. Genet. 2000, 1, 116-125.
37. J. H. Nadeau, P. J. Dunn, Curr. Opin. Genet. Dev. 1998, 8, 311-315.
38. D. E. Root, S. P. Flaherty, B. P. Kelley, B. R. Stockwell, Chem. Biol. 2003, 10, 881-892.
39. S. Hotha, J. C. Yarrow, J. G. Yang, S. Garrett, K. V. Renduchintala, T. U. Mayer, T. M. Kapoor, Angew. Chem. 2003, 115, 2481-2484; Angew. Chem. Int. Ed. 2003, 42, 2379-2382.
40. S. Hotha, J. C. Yarrow, J. G. Yang, S. Garrett, K. V. Renduchintala, T. U. Mayer, T. M. Kapoor, Angew. Chem. 2003, 115, 2481-2484; Angew. Chem. Int. Ed. 2003, 42, 2379-2382.
41. T. U. Mayer, Trends Cell Biol. 2003, 13, 270-277.
42. R. A. Blake, Curr. Opin. Pharmacol. 2001, 1, 533-539.
43. R. T. Peterson, B. A. Link, J. E. Dowling, S. L. Schreiber, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 12965-12969.
44. H. E. Pelish, N. J. Westwood, Y. Feng, T. Kirchhausen, M. D. Shair, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 6740-6741.
45. D. A. Jeffery, M. Bogyo, Curr. Opin. Biotechnol. 2003, 14, 87-95.
46. S. M. Khersonsky, D. W. Jung, T. W. Kang, D. P. Walsh, H. S. Moon, H. Jo, E. M. Jacobson, V. Shetty, T. A. Neubert, Y. T. Chang, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 11804-11805
47. Y. Oda, T. Owa, T. Sato, B. Boucher, S. Daniels, H. Yamanaka, Y. Shinohara, A, Yokoi, J. Kuromitsu, T, Nagasu, Anal. Chem. 2003, 75, 2159-2165.
48. D. Greenbaum, K. F. Medzihradszky, A. Burlingame, M. Bogyo, Chem. Biol. 2000, 7, 569-581.
49. M. Bogyo, S. Verhelst, V. Bellingard-Dubouchaud, S. Toba, D. Greenbaum, Chem. Biol. 2000, 7, 27-38.
50. M. P. Patricelli, D. K. Giang, L. M. Stamp, J. J. Burbaum, Proteomics 2001, 1, 1067-1071.
51. G. C. Adam, B. F. Cravatt, E. J. Sorensen, Chem. Biol. 2001, 8, 81-95.
52. G. C. Adam, E. J. Sorensen, B. F. Cravatt, Nat. Biotechnol. 2002, 20, 805-809.
53. G. Y. J. Chen, M. Uttamchandani, Q. Zhu, G. Wang, S. Q. Yao, ChemBioChem 2003, 4, 336-339.