High throughput screening for neurodegeneration and complex disease phenotypes

Combinatorial Chemistry and High Throughput Screening

Volumn 11, Issue 3, 2008, Pages 238-248

  Varma, Hemant ^a   Lo, Donald C ^b   Stockwell, Brent R ^a  

^a 614 Fairchild Center MC2406 ^*  (United States)

^b DUKE UNIVERSITY MEDICAL CENTER   (United States)

Author keywords

Aggregation; Cell death; Drugs; High throughput; High content; Huntington's disease; Neurodegeneration; Screening

Indexed keywords

CELL PROTEIN;

ALZHEIMER DISEASE; CELL DEATH; CONTENT ANALYSIS; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; HIGH THROUGHPUT SCREENING; HUNTINGTON CHOREA; IN VITRO STUDY; IN VIVO STUDY; MICROARRAY ANALYSIS; NERVE DEGENERATION; NONHUMAN; PARKINSON DISEASE; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; REVIEW;

ANIMALS; CELL DEATH; DRUG EVALUATION, PRECLINICAL; HUMANS; HUNTINGTON DISEASE; NERVE TISSUE PROTEINS; NEURODEGENERATIVE DISEASES; PROTEIN BINDING; SMALL MOLECULE LIBRARIES;

EID: 41649114424     PISSN: 13862073     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/138620708783877753     Document Type: Review

References (68)

1. Brunner, D.; Nestler, E.; Leahy, E. Drug Discov. Today, 2002, 7, S107.
2. Fleming, S. M.; Chesselet, M.F. Behav. Pharmacol., 2006, 17, 383.
3. Roberson, E.D.; Mucke, L. Science (New York, N.Y.), 2006, 314, 781.
4. Newman, M.; Musgrave, F.I.; Lardelli, M. Biochim. Biophys. Acta, 2007, 1772, 285.
5. Fleming, S.M.; Fernagut, P.O.; Chesselet, M.F. NeuroRx J. Am. Soc. Exper. NeuroTherapeut., 2005, 2, 495.
6. Brouillet, E.; Conde, F.; Beal, M.F.; Hantraye, P. Prog. Neurobiol., 1999, 59, 427.
7. Sipione, S.; Cattaneo, E. Mol. Neurobiol., 2001, 23, 21.
8. Menalled, L.B.; Chesselet, M.F. Trends Pharmacol. Sci., 2002, 23, 32.
9. Di Prospero, N.A.; Fischbeck, K.H. Nat. Rev. Genetics, 2005, 6, 756.
10. DiFiglia, M.; Sapp, E.; Chase, K.O.; Davies, S.W.; Bates, G.P.; Vonsattel, J.P.; Aronin, N. Science, 1997, 277, 1990.
11. Lansbury, P.T.; Lashuel, H.A. Nature, 2006, 443, 774.
12. Heiser, V.; Engemann, S.; Brocker, W.; Dunkel, I.; Boeddrich, A.; Waelter, S.; Nordhoff, E.; Lurz, R.; Schugardt, N.; Rautenberg, S.; Herhaus, C.; Barnickel, G.; Bottcher, H.; Lehrach, H.; Wanker, E.E. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2002, 99 Suppl 4, 16400.
13. Lacomblez, L.; Bensimon, G.; Leigh, P.N.; Guillet, P.; Meininger, V. Lancet, 1996, 347, 1425.
14. Hockly, E.; Tse, J.; Barker, A.L.; Moolman, D.L.; Beunard, J.L.; Revington, A.P.; Holt, K.; Sunshine, S.; Moffitt, H.; Sathasivam, K.; Woodman, B.; Wanker, E.E.; Lowden, P.A.; Bates, G. P. Neurobiol. Dis., 2006, 21, 228.
15. Wang, J.; Gines, S.; MacDonald, M.E.; Gusella, J.F. BMC Neurosci., 2005, 6, 1.
16. Chong, C.R.; Chen, X.; Shi, L.; Liu, J.O.; Sullivan, D.J. Jr. Nat.Chem. Biol., 2006, 2, 415.
17. Chong, C.R.; Qian, D.Z.; Pan, F.; Wei, Y.; Pili, R.; Sullivan, D.J. Jr.; Liu, J.O. J.Med. Chem., 2006, 49, 2677.
18. Stavrovskaya, I.G.; Narayanan, M.V.; Zhang, W.; Krasnikov, B.F.; Heemskerk, J.; Young, S.S.; Blass, J.P.; Brown, A.M.; Beal, M.F.; Friedlander, R.M.; Kristal, B.S. J. Exper. Med., 2004, 200, 211.
19. Wang, H.; Guan, Y.; Wang, X.; Smith, K.; Cormier, K.; Zhu, S.; Stavrovskaya, I.G.; Huo, C.; Ferrante, R.J.; Kristal, B.S.; Friedlander, R.M. Eur. J. Neurosci., 2007, 26, 633.
20. Overington, J.P.; Al-Lazikani, B.; Hopkins, A.L. Nat. Rev. Drug Discov., 2006, 5, 993.
21. Allison, A.C.; Cacabelos, R.; Lombardi, V.R.; Alvarez, X.A.; Vigo, C. Prog. Neuropsychopharmacol. Biol. Psychiat., 2001, 25, 1341.
22. Bonelli, R.M.; Hèodl, A.K.; Hofmann, P.; Kapfhammer, H.P. Int. Clin. Psychopharmacol., 2004, 19, 337.
23. Zhang, X.; Smith, D.L.; Meriin, A.B.; Engemann, S.; Russel, D.E.; Roark, M.; Washington, S.L.; Maxwell, M.M.; Marsh, J.L.; Thompson, L.M.; Wanker, E.E.; Young, A.B.; Housman, D.E.; Bates, G.P.; Sherman, M.Y.; Kazantsev, A.G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2005, 102, 892.
24. Vogel, S.S.; Thaler, C.; Koushik, S.V. Sci. STKE, 2006, 2006, re2.
25. Pollitt, S.K.; Pallos, J.; Shao, J.; Desai, U.A.; Ma, A.A.; Thompson, L.M.; Marsh, J.L.; Diamond, M.I. Neuron, 2003, 40, 685.
26. Root, D.E.; Flaherty, S.P.; Kelley, B.P.; Stockwell, B.R. Chem. Biol., 2003, 10, 881.
27. Desai, U.A.; Pallos, J.; Ma, A.A.; Stockwell, B.R.; Thompson, L.M.; Marsh, J.L.; Diamond, M.I. Hum. Mol. Genet., 2006, 15, 2114.
28. Blanchard, B.J.; Stockwell, B.R.; Ingram, V.M. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2002, 293, 1204.
29. Blanchard, B.J.; Chen, A.; Rozeboom, L.M.; Stafford, K.A.; Weigele, P.; Ingram, V.M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004, 101, 14326.
30. Varma, H.; Voisine, C.; DeMarco, C.T.; Cattaneo, E.; Lo, D.C.; Hart, A.C.; Stockwell, B.R. Nat. Chem. Biol., 2007, 3, 99.
31. Wang, W.; Duan, W.; Igarashi, S.; Morita, H.; Nakamura, M.; Ross, C.A. Neurobiol. Dis., 2005, 20, 500.
32. Aiken, C.T.; Tobin, A.J.; Schweitzer, E.S. Neurobiol. Dis., 2004, 16, 546.
33. Graham, R.K.; Deng, Y.; Slow, E.J.; Haigh, B.; Bissada, N.; Lu, G.; Pearson, J.; Shehadeh, J.; Bertram, L.; Murphy, Z.; Warby, S.C.; Doty, C.N.; Roy, S.; Wellington, C.L.; Leavitt, B.R.; Raymond, L.A.; Nicholson, D.W.; Hayden, M.R. Cell, 2006, 125, 1179.
34. Thornberry, N.A.; Lazebnik, Y. Science, 1998, 281, 1312.
35. Thornberry, N.A.; Rano, T.A.; Peterson, E.P.; Rasper, D.M.; Timkey, T.; Garcia-Calvo, M.; Houtzager, V.M.; Nordstrom, P.A.; Roy, S.; Vaillancourt, J.P.; Chapman, K.T.; Nicholson, D.W. The J. Biol. Chem., 1997, 272, 17907.
36. Piccioni, F.; Roman, B.R.; Fischbeck, K.H.; Taylor, J.P. Hum. Mol. Genet., 2004, 13, 437.
37. Rigamonti, D.; Bauer, J.H.; De-Fraja, C.; Conti, L.; Sipione, S.; Sciorati, C.; Clementi, E.; Hackam, A.; Hayden, M.R.; Li, Y.; Cooper, J.K.; Ross, C.A.; Govoni, S.; Vincenz, C.; Cattaneo, E. J. Neurosci., 2000, 20, 3705.
38. Chen, M.; Ona, V.O.; Li, M.; Ferrante, R.J.; Fink, K.B.; Zhu, S.; Bian, J.; Guo, L.; Farrell, L.A.; Hersch, S.M.; Hobbs, W.; Vonsattel, J.P.; Cha, J.H.; Friedlander, R.M. Nat. Med., 2000, 6, 797.
39. Varma, H.; Cheng, R.; Voisine, C.; Hart, A.C.; Stockwell, B.R. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2007, 104, 14525.
40. Coufal, M.; Maxwell, M.M.; Russel, D.E.; Amore, A.M.; Altmann, S.M.; Hollingsworth, Z.R.; Young, A.B.; Housman, D.E.; Kazantsev, A.G. J. Biomol. Screen., 2007, 12, 351.
41. Yamamoto, A.; Lucas, J.J.; Hen, R. Cell, 2000, 101, 57.
42. Sarkar, S.; Perlstein, E.O.; Imarisio, S.; Pineau, S.; Cordenier, A.; Maglathlin, R.L.; Webster, J.A.; Lewis, T.A.; O'Kane, C.J.; Schreiber, S.L.; Rubinsztein, D.C. Nat. Chem. Biol., 2007, 3, 331.
43. Monani, U.R.; Coovert, D.D.; Burghes, A.H. Human Mol. Genet., 2000, 9, 2451.
44. Lefebvre, S.; Burlet, P.; Liu, Q.; Bertrandy, S.; Clermont, O.; Munnich, A.; Dreyfuss, G.; Melki, J. Nat. Genet., 1997, 16, 265.
45. Monani, U.R. Neuron, 2005, 48, 885.
46. Jarecki, J.; Chen, X.; Bernardino, A.; Coovert, D.D.; Whitney, M.; Burghes, A.; Stack, J.; Pollok, B.A. Hum.Mol Genet., 2005, 14, 2003.
47. Lunn, M.R.; Root, D.E.; Martino, A.M.; Flaherty, S.P.; Kelley, B.P.; Coovert, D.D.; Burghes, A.H.; Man, N.T.; Morris, G.E.; Zhou, J.; Androphy, E.J.; Sumner, C.J.; Stockwell, B.R. Chem. Biol., 2004, 11, 1489.
48. Zuccato, C.; Ciammola, A.; Rigamonti, D.; Leavitt, B.R.; Goffredo, D.; Conti, L.; MacDonald, M.E.; Friedlander, R.M.; Silani, V.; Hayden, M.R.; Timmusk, T.; Sipione, S.; Cattaneo, E. Science, 2001, 293, 493.
49. Staudt, L.M.; Brown, P.O., Genomic views of the immune system. Annu.Rev. Immunol., 2000, 18, 829.
50. Stegmaier, K.; Ross, K.N.; Colavito, S.A.; O'Malley, S.; Stockwell, B.R.; Golub, T.R. Nat. Genet., 2004, 36, 257.
51. Hodges, A.; Strand, A.D.; Aragaki, A.K.; Kuhn, A.; Sengstag, T.; Hughes, G.; Elliston, L.A.; Hartog, C.; Goldstein, D.R.; Thu, D.; Hollingsworth, Z.R.; Collin, F.; Synek, B.; Holmans, P.A.; Young, A.B.; Wexler, N.S.; Delorenzi, M.; Kooperberg, C.; Augood, S.J.; Faull, R.L.; Olson, J.M.; Jones, L.; Luthi-Carter, R. Hum. Mol. Genet., 2006, 15, 965.
52. Gatchel, J.R.; Zoghbi, H.Y. Nat. Rev. Genet., 2005, 6, 743.
53. Xu, X.L.; Olson, J.M.; Zhao, L.P. Hum. Mol. Gen., 2002, 11, 1977.
54. Valenza, M.; Rigamonti, D.; Goffredo, D.; Zuccato, C.; Fenu, S.; Jamot, L.; Strand, A.; Tarditi, A.; Woodman, B.; Racchi, M.; Mariotti, C.; Di Donato, S.; Corsini, A.; Bates, G.; Pruss, R.; Olson, J.M.; Sipione, S.; Tartari, M.; Cattaneo, E. J. Neurosci., 2005, 25, 9932.
55. Gladstone, D.J.; Black, S.E.; Hakim, A.M. Stroke, 2002, 33, 2123.
56. Rytter, A.; Cronberg, T.; Asztâely, F.; Nemali, S.; Wieloch, T. Cereb. Blood Flow Metab.: Off. J. Int. Soc. Cereb. Blood Flow Metab., 2003, 23, 23.
57. Sundstrom, L.; Morrison, B., 3rd; Bradley, M.; Pringle, A. Drug Discov.Today, 2005, 10, 993.
58. Wang, J.K.; Portbury, S.; Thomas, M.B.; Barney, S.; Ricca, D.J.; Morris, D.L.; Warner, D.S.; Lo, D.C. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2006, 103, 10461.
59. Murphy, R.C.; Messer, A. Brain Res. Mol. Brain Res., 2004, 121, 141.
60. Khoshnan, A.; Ko, J.; Watkin, E.E.; Paige, L.A.; Reinhart, P.H.; Patterson, P.H. J. Neurosci., 2004, 24, 7999.
61. Burns, C.G.; Milan, D.J.; Grande, E.J.; Rottbauer, W.; MacRae, C.A.; Fishman, M.C. Nat. Chem. Biol., 2005, 1, 263.
62. Schiffer, N.W.; Broadley, S.A.; Hirschberger, T.; Tavan, P.; Kretzschmar, H.A.; Giese, A.; Haass, C.; Hartl, F.U.; Schmid, B. J. Biol. Chem., 2007, 282, 9195.
63. Miller, V.M.; Nelson, R.F.; Gouvion, C.M.; Williams, A.; Rodriguez-Lebron, E.; Harper, S.Q.; Davidson, B.L.; Rebagliati, M.R.; Paulson, H.L. J. Neurosci., 2005, 25, 9152.
64. Voisine, C.; Varma, H.; Walker, N.; Bates, E.A.; Stockwell, B.R.; Hart, A.C. PLoS One, 2007, 2, e504.
65. Bodner, R.A.; Outeiro, T.F.; Altmann, S.; Maxwell, M.M.; Cho, S.H.; Hyman, B.T.; McLean, P.J.; Young, A.B.; Housman, D.E.; Kazantsev, A.G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2006, 103, 4246.
66. Perrimon, N.; Friedman, A.; Mathey-Prevot, B.; Eggert, U.S. Drug Discov.Today, 2007, 12, 28.
67. Eggert, U.S.; Kiger, A.A.; Richter, C.; Perlman, Z.E.; Perrimon, N.; Mitchison, T.J.; Field, C.M. PLoS Biol., 2004, 2, e379.
68. Kwok, T.C.; Ricker, N.; Fraser, R.; Chan, A.W.; Burns, A.; Stanley, E.F.; McCourt, P.; Cutler, S.R.; Roy, P.J. Nature, 2006, 441, 91.