Signal peptidases

Chemical Reviews

Volumn 102, Issue 12, 2002, Pages 4549-4579

  Paetzel, Mark ^a,b   Karla, Andrew ^a,b   Strynadka, Natalie C J ^a,b   Dalbey, Ross E ^a,b  

^a OHIO STATE UNIVERSITY   (United States)

^b UNIVERSITY OF BRITISH COLUMBIA   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; CATALYSIS; CELLS; MOLECULAR WEIGHT; SYNTHESIS (CHEMICAL);

AMINO TERMINAL EXTENSION; ENDOPLASMIC RETICULUM VESICLES; SIGNAL PEPTIDASES;

ENZYMES;

ASPARTIC PROTEINASE; BACTERIAL PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN; METALLOPROTEINASE; MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE; SERINE PROTEINASE; SIGNAL PEPTIDASE II; SIGNAL PEPTIDE; SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE; STROMAL PROCESSING PEPTIDASE; TYPE I SIGNAL PEPTIDASE; VEGETABLE PROTEIN;

CHEMISTRY; ENZYME SPECIFICITY; GENETICS; METABOLISM; REVIEW;

ASPARTIC ENDOPEPTIDASES; BACTERIAL PROTEINS; MEMBRANE PROTEINS; METALLOENDOPEPTIDASES; PLANT PROTEINS; PROTEIN SORTING SIGNALS; SERINE ENDOPEPTIDASES; SUBSTRATE SPECIFICITY;

EID: 0036922508     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr010166y     Document Type: Article

References (314)

1. Blobel, G., Sabatini, D. D. Biomembranes 1971, 2, 193.
2. Milstein, C.; Brownlee, G. G.; Harrison, T. M.; Mathews, M. B. Nat. New Biol. 1972, 239, 117.
3. Blobel, G.; Dobberstein, B. J. Cell Biol. 1975, 67, 852.
4. Schatz, P. J.; Beckwith, J. Annu. Rev. Genet. 1990, 24, 215.
5. Bedouelle, H.; Bassford, P. J., Jr.; Fowler, A. V.; Zabin, I.; Beckwith, J.; Hofnung, M. Nature 1980, 285, 78.
6. Puziss, J. W.; Fikes, J. D.; Bassford, P. J., Jr. J. Bacteriol. 1989, 171, 2303.
7. Nesmeyanova, M. A.; Karamyshev, A. L.; Karamysheva, Z. N.; Kalinin, A. E.; Ksenzenko, V. N.; Kajava, A. V. FEBS Lett. 1997, 403, 203.
8. Briggs, M. S.; Cornell, D. G.; Dluhy, R. A.; Gierasch, L. M. Science 1986, 233, 206.
9. Schechter, I.; Berger, A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1967, 27, 157.
10. Miller, A.; Wang, L.; Kendall, D. A. J. Biol. Chem. 1998, 273, 11409.
11. Wang, L.; Miller, A.; Kendall, D. A. J. Biol. Chem. 2000, 275, 10154.
12. Hoyt, D. W.; Gierasch, L. M. J. Biol. Chem. 1991, 266, 14406.
13. Nielsen, H.; Engelbrecht, J.; Brunak, S.; von Heijne, G. Int. J. Neural Syst. 1997, 8, 581.
14. Nielsen, H.; Engelbrecht, J.; Brunak, S.; von Heijne, G. Protein Eng. 1997, 10, 1.
15. von Heijne, G.; Abrahmsen, L. FEBS Lett. 1989, 244, 439.
16. Edman, M.; Jarhede, T.; Sjostrom, M.; Wieslander, A. Proteins 1999, 35, 195.
17. Berks, B. C. Mol. Microbiol. 1996, 22, 393.
18. Stanley, N. R.; Palmer, T.; Berks, B. C. J. Biol. Chem. 2000, 275, 11591.
19. Bogsch, E.; Brink, S.; Robinson, C. EMBO J. 1997, 16, 3851.
20. Hayashi, S.; Wu, H. C. J. Bioenerg. Biomembr. 1990, 22, 451.
21. Strom, M. S.; Lory, S. Annu. Rev. Microbiol. 1993, 47, 565.
22. Reyss, I.; Pugsley, A. P. Mol. Gen. Genet. 1990, 222, 176.
23. Lindeberg, M.; Collmer, A. J. Bacteriol. 1992, 174, 7385.
24. Nunn, D. N.; Lory, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 47.
25. Bally, M.; Filloux, A.; Akrim, M.; Ball, G.; Lazdunski, A.; Tommassen, J. Mol. Microbiol. 1992, 6, 1121.
26. Cioffi, J. A.; Allen, K. L.; Lively, M. O.; Kemper, B. J. Biol. Chem. 1989, 264, 15052.
27. Kaiser, C. A.; Preuss, D.; Grisafi, D. Science 1987, 235, 312.
28. Nielsen, H.; Engelbrecht, J.; von Heijne, G.; Brunak, S. Proteins 1996, 24, 165.
29. Zheng, N.; Gierasch, L. M. Cell 1996, 86, 849.
30. Ng, D. T.; Brown, J. D.; Walter, P. J. Cell Biol. 1996, 134, 269.
31. Martoglio, B.; Dobberstein, B. Trends Cell Biol. 1998, 8, 410.
32. von Heijne, G.; Steppuhn, J.; Hermann, R. G. Eur. J. Biochem. 1989, 180, 535.
33. von Heijne, G. EMBO J. 1986, 5, 1335.
34. Roise, D.; Horvath, S. J.; Tomich, J. M.; Richards, J. H.; Schatz, G. EMBO J. 1986, 5, 1327.
35. Roise, D.; Theiler, F.; Horvath, S. J.; Tomich, J. M.; Richards, J. H.; Allison, D. S.; Schatz, G. EMBO J. 1988, 7, 649.
36. Abe, Y.; Shodai, T.; Muto, T.; Mihara, K.; Torii, H.; Nishikawa, S.; Endo, T.; Kohda, D. Cell 2000, 100, 551.
37. Honlinger, A.; Keil, P.; Nelson, R. J.; Craig, E. A.; Pfanner, N. Biol. Chem. Hoppe-Seyler 1995, 376, 515.
38. Bollinger, L.; Junne, T.; Schatz, G.; Lithgow, T. EMBO J. 1995, 14, 6318.
39. Dietmeier, K.; Honlinger, A.; Bomer, U.; Dekker, P. J.; Eckerskorn, C.; Lottspeich, F.; Kubrich, M.; Pfanner, N. Nature 1997, 388, 195.
40. Schatz, G. Nature 1997, 388, 121.
41. Voos, W.; Martin, H.; Krimmer, T.; Pfanner, N. Biochim. Biophys. Acta 1999, 1422, 235.
42. Schneider, G.; Sjoling, S.; Wallin, E.; Wrede, P.; Glaser, E.; von Heijne, G. Proteins 1998, 30, 49.
43. Gavel, Y.; von Heijne, G. Protein Eng. 1990, 4, 33.
44. Hendrick, J. P.; Hodges, P. E.; Rosenberg, L. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 4056.
45. Hartl, F. U.; Neupert, W. Science 1990, 247, 930.
46. Ko, K.; Cashmore, A. R. EMBO J. 1989, 8, 317.
47. Blight, K. J.; Kolykhalov, A. A.; Reed, K. E.; Agapov, E. V.; Rice, C. M. Antiviral Ther. 1998, 3, 71.
48. Law, L. M.; Duncan, R.; Esmaili, A.; Nakhasi, H. L.; Hobman, T. C. J. Virol. 2001, 75, 1978.
49. Lober, C.; Anheier, B.; Lindow, S.; Klenk, H.D.; Feldmann, H. Virology 2001, 289, 224.
50. Lindemann, D.; Pietschmann, T.; Picard-Maureau, M.; Berg, A.; Heinkelein, M.; Thurrow, J.; Knaus, P.; Zentgraf, H.; Rethwilm A. J. Virol. 2001, 75, 5762.
51. Mullins, C.; Lu, Y.; Campbell, A.; Fang, H.; Green, N. J. Biol. Chem. 1995, 270, 17139.
52. Tjalsma, H.; Kontinen, V. P.; Pragai, Z.; Wu, H.; Meima, R.; Venema, G.; Bron, S.; Sarvas, M.; van Dijl, J. M. J. Biol. Chem. 1999, 274, 1698.
53. Tjalsma, H.; Zanen, G.; Bron, S.; van Dijl, J. M. In Cotranslational and Posttranslational Proteolysis of Proteins, 3rd ed.; Dalbey,E. R., Sigman, D. S., Eds.; Academic Press: San Diego, CA, 2001; Vol. XXII.
54. Fraser, C. M.; Gocayne, J. D.; White, O.; Adams, M. D.; Clayton, R. A.; Fleischmann, R. D.; Bult, C. J.; Kerlavage, A. R.; Sutton, G.; Kelley, J. M.; et al. Science 1995, 270, 397.
55. Pratje, E.; Esser, K.; Michaelis, G. In Signal Peptidases; Heijne, G. v., Ed.; R. G. Landes Co.: Austin, TX, 1994.
56. Robinson, C. In Signal Peptidases; Heijne, G. v., Ed.; R. G. Landes Co.: Austin, TX, 1994.
57. Inada, T.; Court, D. L.; Ito, K.; Nakamura, Y. J. Bacteriol. 1989, 171, 585.
58. Bolhius, A.; Tjalsma, H.; Stephenson, K.; Harwood, C. R.; Venema, G.; Bron, S.; van Dijl, J. M. J. Biol. Chem. 1999, 274, 15865.
59. Bohni, P. C.; Deshaies, R. J.; Schekman, R. W. J. Cell Biol. 1988, 106, 1035.
60. Behrens, M.; Michaelis, G.; Pratje, E. Mol. Gen. Genet. 1991, 228, 167.
61. Yamagata, H.; Ippolito, C.; Inukai, M.; Inouye, M. J. Bacteriol. 1982, 152, 1163.
62. Pollock, R. A.; Hartl, F. U.; Cheng, M. Y.; Ostermann, J.; Horwich, A.; Neupert, W. EMBO J. 1988, 7, 3493.
63. Yaffe, M. P.; Schatz, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1984, 81, 4819.
64. Dalbey, R. E.; Wickner, W. J. Biol. Chem. 1985, 260, 15925.
65. van Dijl, J. M.; van den Bergh, R.; Reversma, T.; Smith, H.; Bron, S.; Venema, G. Mol. Gen. Genet. 1990, 223, 233.
66. Wan, J.; Bringloe, D.; Lamppa, G. K. Plant J. 1998, 15, 459.
67. Black, M. T.; Bruton, G. Curr. Pharm. Des. 1998, 4, 133.
68. Hussain, M.; Ichihara, S.; Mizushima, S. J. Biol. Chem. 1980, 255, 3707.
69. Zwizinski, C.; Wickner, W. J. Biol. Chem. 1980, 255, 7973.
70. Tokunaga, M.; Loranger, J. M.; Wolfe, P. B.; Wu, H. C. J. Biol. Chem. 1982, 257, 9922.
71. Jackson, R. C. Methods Enzymol. 1983, 96, 784.
72. Strauss, A. W.; Zimmerman, M.; Boime, I.; Ashe, B.; Mumford, R. A.; Alberts, A. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1979, 76, 4225.
73. Bohni, P. C.; Daum, G.; Schatz, G. J. Biol. Chem. 1983, 258, 4937.
74. McAda, P. C.; Douglas, M. G. J. Biol. Chem. 1982, 257, 3177.
75. Wickner, W.; Moore, K.; Dibb, N.; Geissert, D.; Rice, M. J. Bacteriol. 1987, 169, 3821.
76. Chatterjee, S.; Suciu, D.; Dalbey, R. E.; Kahn, P. C.; Inouye, M. J. Mol. Biol. 1995, 245, 311.
77. Gallagher, J.; Kaderbhai, N. N.; Kaderbhai, M. A. Biochim. Biophys. Acta 2001, 1550, 1.
78. Dev, I. K.; Ray, P. H.; Novak, P. J. Biol. Chem. 1990, 265, 20069.
79. Yaron, A.; Carmel, A.; Katchalski-Katzir, E. Anal. Biochem. 1979, 95, 228.
80. Zhong, W.; Benkovic, S. J. Anal. Biochem. 1998, 255, 66.
81. Rosse, G.; Kueng, E.; Page, M. G.; Schauer-Vukasinoic, V.; Giller, T.; Lahm, H. W.; Hunziker, P.; Schlatter, D. J. Comb. Chem. 2000, 2, 461.
82. Peng, S. B.; Zheng, F.; Angleton, E. L.; Smiley, D.: Carpenter, J.; Scott, J. E. Anal. Biochem. 2001, 293, 88.
83. Paetzel, M.; Dalbey, R. E.; Strynadka, N. C. Pharmacol. Ther. 2000, 87, 27.
84. Carlos, J. L.; Paetzel, M.; Klenotic, P. A.; Strynadka, N. C.; Dalbey, R. E. In Co-translational and Posttranslational Proteolysis of Proteins, 3rd ed.; Dalbey, R. E., Sigman, D. S., Eds.; Academic Press: San Diego, CA 2001; Vol. XXII.
85. Green, N.; Fang, H.; Miles, S.; Lively, M. O. In Co-translational and Posttranslational Proteolysis of Proteins, 3rd ed.; Dalbey, R. E., Sigmaan, D. S., Eds.; Academic Press: San Diego, CA, 2001; Vol. XXII.
86. Howe, C. J.; Floyd, K. A. In Co-translational and Posttranslational Proteolysis of Proteins, 3rd ed.; Dalbey, R. E., Sigman, D. S., Eds.; Academic Press: San Diego, CA, 2001; Vol. XXII.
87. Date, T.; Wickner, W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1981, 78, 6106.
88. Wolfe, P. B.; Wickner, W.; Goodman, J. M. J. Biol. Chem. 1983, 258, 12073.
89. Sung, M.; Dalbey, R. E. J. Biol. Chem. 1992, 267, 13154.
90. Tschantz, W. R.; Sung, M.; Delgado-Partin, V. M.; Dalbey, R.E. J. Biol. Chem. 1993, 268, 27349.
91. Paetzel, M.; Strynadka, N. C.; Tschantz, W. R.; Casareno, R.; Bullinger, P. R.; Dalbey, R. E. J. Biol. Chem. 1997, 272, 9994.
92. Paetzel, M.; Dalbey, R. E.; Strynadka, N. C. Nature 1998, 396, 186.
93. Wolfe, P. B.; Silver, P.; Wickner, W. J. Biol. Chem. 1982, 257, 7898.
94. Tjalsma, H.; Noback, M. A.; Bron, S.; Venema, G.; Yamane, K.; van Dijl, J. M. J. Biol. Chem. 1997, 272, 25983.
95. Meijer, W. J.; de Jong, A.; Bea, G.; Wisman, A.; Tjalsma, H.; Venema, G.; Bron, S.; van Dijl, J. M. Mol. Microbiol. 1995, 17, 621.
96. Parro, V.; Schacht, S.; Anne, J.; Mellado, R. P. Microbiology 1999, 145, 2255.
97. Cregg, K. M.; Wilding, I.; Black, M. T. J. Bacteriol. 1996, 178, 5712.
98. Date, T. J. Bacteriol. 1983, 154, 76.
99. Zhang, Y. B.; Greenberg, B.; Lacks, S. A. Gene 1997, 194, 249.
100. Watts, C.; Wickner, W.; Zimmermann, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1983, 80, 2809.
101. von Heijne, G. Eur. J. Biochem. 1983, 116, 17.
102. Fikes, J. D.; Barkocy-Gallagher, G. A.; Klapper, D. G.; Bassford, P. J., Jr. J. Biol. Chem. 1990, 265, 3417.
103. Shen, L. M.; Lee, J. I.; Cheng, S. Y.; Jutte, H.; Kuhn, A.; Dalbey, R. E. Biochemistry 1991, 30, 11775.
104. Karamyshev, A. L.; Karamysheva, Z. N.; Kajava, A. V.; Ksenzenko, V. N.; Nesmeyanova, M. A. J. Mol. Biol. 1998, 277, 859.
105. Nilsson, I.; von Heijne, G. FEBS Lett. 1992, 299, 243.
106. Barkocy-Gallagher, G. A.; Bassford, P. J.,Jr. J. Biol. Chem. 1992, 267, 1231.
107. von Heijne, G. Nucleic Acids Res. 1986, 14, 4683.
108. Carlos, J. L.; Paetzel, M.; Brubaker, G.; Karla, A.; Ashwell, C. M.; Lively, M. O.; Cao, G.; Bullinger, P.; Dalbey, R. E. J. Biol. Chem. 2000, 275, 38813.
109. Jain, R. G.; Rusch, S. L.; Kendall, D. A. J. Biol. Chem. 1994, 269, 16305.
110. Kuo, D. W.; Chan, H. K.; Wilson, C. J.; Griffin, P. R.; Williams, H.; Knight, W. B. Arch. Biochem. Biophys. 1993, 303, 274.
111. Tschantz, W. R.; Paetzel, M.; Cao, G.; Suciu, D.; Inouye, M.; Dalbey, R. E. Biochemistry 1995, 34, 3935.
112. Paetzel, M.; Strynadka, N. J. C.; James, M. N. G.; Dalbey, R. E. In Proteolysis in Cell Functions; Hopsu-Havu, V. K., Jarvinen, M., Kirschke, H., Eds.; IOS Press: Amsterdam, 1997, Vol. 13.
113. Paetzel, M.; Chernaia, M.; Strynadka, N.; Tschantz, W.; Cao, G.; Dalbey, R. E.; James, M. N. Proteins 1995, 23, 122.
114. Paetzel, M.; Dalbey, R. E.; Strynadka, N. C. J. Biol. Chem. 2002, 277, 9512.
115. Klenotic, P. A.; Carlos, J. L.; Samuelson, J. C.; Schuenemann, T. A.; Tschantz, W. R.; Paetzel, M.; Strynadka, N. C.; Dalbey, R. E. J. Biol. Chem. 2000, 275, 6490.
116. van Klompenburg, W.; Paetzel, M.; de Jong, J. M.; Dalbey, R. E.; Demel, R. A.; von Heijne, G.; de Kruiff, B. FEBS Lett. 1998, 431, 75.
117. van den Brink-van der Laan, E.; Dalbey, R. E.; Demel, R. A.; Killian, J. A.; de Kruijff, B. Biochemistry 2001, 40, 9677.
118. Paetzel, M.; Strynadka, N. C. Protein Sci. 1999, 8, 2533.
119. Peat, T. S.; Frank, E. G.; McDonald, J. P.; Levine, A. S.; Woodgate, R.; Hendrickson, W. A. Nature 1996, 380, 727.
120. Luo, Y., Pfuetzner, R. A.; Mosimann, S.; Paetzel, M.; Frey, E. A.; Cherney, M.; Kim, B.; Little, J. W.; Strynadka, N.C. Cell 2001, 106, 585.
121. Bell, C. E.; Frescura, P.; Hochschild, A.; Lewis, M. Cell 2000, 101, 801.
122. Black, M. T. J. Bacteriol. 1993, 175, 4957.
123. Paetzel, M.; Dalbey, R. E. Trends Biochem. Sci. 1997, 22, 28.
124. Carlos, J. L.; Klenotic, P. A.; Paetzel, M.; Strynadka, N. C.; Dalbey, R. E. Biochemistry 2000, 39, 7276.
125. van Dijl, J. M.; de Jong, A.; Venema, G.; Bron, S. J. Biol. Chem. 1995, 270, 3611.
126. Zwizinski, C.; Date, T.; Wickner, W. J. Biol. Chem. 1981, 256, 3593.
127. Black, M. T.; Munn, J. G.; Allsop, A. E. Biochem. J. 1992, 282, 539.
128. Kuo, D.; Weidner, J.; Griffin, P.; Shah, S. K.; Knight, W. B. Biochemistry 1994, 33, 8347.
129. Allsop, A. E.; Brooks, G.; Bruton, G.; Coulton, S.; Edwards, P. D.; Hatton, I. K.; Kaura, A. C.; McLean, S. D.; Pearson, N. D.; Smale, T. C.; Southgate, R. Biorg. Med. Chem. Lett. 1995, 5, 443.
130. Allsop, A.; Brooks, G.; Edwards, P. D.; Kaura, A. C.; Southgate, R. J. Antibiot. (Tokyo) 1996 49, 921.
131. Evans, E. A.; Gilmore, R.; Blobel, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1986, 83, 581.
132. Baker, R. K.; Lively, M. O. Biochemistry 1987, 26, 8561.
133. YaDeau, J. T.; Klein, C.; Blobel, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 517.
134. Meyer, H. A.; Hartmann, E. J. Biol. Chem. 1997, 272, 13159.
135. Shelness, G. S.; Blobel, G. J. Biol. Chem. 1990, 265, 9512.
136. Greenburg, G.; Shelness, G. S.; Blobel, G. J. Biol. Chem. 1989, 264, 15762.
137. Dalbey, R. E.; Lively, M. O.; Bron, S.; van Dijl, J. M. Protein Sci. 1997, 6, 1129.
138. van Dijl, J. M.; de Jong, A.; Vehmaanpera, J.; Venema, G.; Bron, S. EMBO J. 1992, 11, 2819.
139. Fang, H.; Mullins, C.; Green, N. J. Biol. Chem. 1997, 272, 13152.
140. Shelness, G. S.; Kanwar, Y. S.; Blobel, G. J. Biol. Chem. 1988, 263, 17063.
141. Newsome, A. L.; McLean, J. W.; Lively, M. O. Biochem. J. 1992, 282, 447.
142. Fang, H.; Panzner, S.; Mullins, C.; Hartmann, E.; Green, N. J. Biol. Chem. 1996, 271, 16460.
143. Kalies, K. U.; Rapoport, T. A.; Hartmann, E. J. Cell Biol. 1998, 141, 887.
144. Antonin, W.; Meyer, H. A.; Hartmann, E. J. Biol. Chem. 2000, 275, 34068.
145. Shelness, G. S.; Lin, L.; Nicchitta, C. V. J. Biol. Chem. 1993, 268, 5201.
146. Kalies, K. U.; Hartmann, E. J. Biol. Chem. 1996, 271, 3925.
147. Van Valkenburgh, C.; Chen, X.; Mullins, C.; Fang, H.; Green, N. J. Biol. Chem. 1999, 274, 11519.
148. Tjalsma, H.; Stover, A. G.; Driks, A.; Venema, G.; Bron, S.; van Dijl, J. M. J. Biol. Chem. 2000, 275, 25102.
149. Lin, C.; Lindenbach, B. D.; Pragai, B. M.; McCourt, D. W.; Rice, C. M. J. Virol. 1994, 68, 5063.
150. Wu, J. Z. IUBMB Life 2001, 51, 19.
151. Amberg, S. M.; Rice, C. M. J. Virol. 1999, 73, 8083.
152. Hongo, S.; Sugawara, K.; Muraki, Y.; Matsuzaki, Y.; Takashita, E.; Kitame, F.; Nakamura, K. J. Virol. 1999, 73, 46.
153. Pekosz, A.; Lamb, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 13233.
154. Pratje, E.; Mannhaupt, G.; Michaelis, G.; Beyreuther, K. EMBO J. 1983, 2, 1049.
155. Pratje, E.; Guiard, B. EMBO J. 1986, 5, 1313.
156. Schneider, A.; Behrens, M.; Scherer, P.; Pratje, E.; Michaelis, G.; Schatz, G. EMBO J. 1991, 10, 247.
157. Schneider, A.; Oppliger, W.; Jeno, P. J. Biol. Chem. 1994, 269, 8635.
158. Nunnari, J.; Fox, T. D.; Walter, P. Science 1993, 262, 1997.
159. Jan, P. S.; Esser, K.; Pratje, E.; Michaelis, G. Mol. Gen. Genet. 2000, 263, 483.
160. Bauerfeind, M.; Esser, K.; Michaelis, G. Mol. Gen. Genet. 1998, 257, 635.
161. Esser, K.; Pratje, E.; Michaelis, G. Mol. Gen. Genet. 1996, 252, 437.
162. Chaal, B. K.; Mould, R. M.; Barbrook, A. C.; Gray, J. C.; Howe, C. J. J. Biol. Chem. 1998, 273, 689.
163. Chen, X.; Van Valkenburgh, C.; Fang, H.; Green, N. J. Biol. Chem. 1999, 274, 37750.
164. Barbrook, A. C.; Packer, J. C.; Howe, C. J. FEBS Lett. 1996, 398, 198.
165. Halpin, C.; Elderfield, P. D.; James, H. E.; Zimmermann, R.; Dunbar, B.; Robinson, C. EMBO J. 1989, 8, 3917.
166. Shackleton, J. B.; Robinson, C. J. Biol. Chem. 1991, 266, 12152.
167. Braun, V. Biochim. Biophys. Acta 1975, 415, 335.
168. Mizuno, T. J. Biochem. (Tokyo) 1979, 86, 991.
169. Yamagata, H.; Daishima, K.; Mizushima, S. FEBS Lett. 1983, 158, 301.
170. Tokunaga, M.; Loranger, J. M.; Wu, H. C. J. Biol. Chem. 1983, 258, 12102.
171. Yu, F.; Yamada, H.; Daishima, K.; Mizushima, S. FEBS Lett. 1984, 173, 264.
172. Innis, M. A.; Tokunaga, M.; Williams, M. E.; Loranger, J. M.; Chang, S. Y.; Chang, S.; Wu, H. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1984, 81, 3708.
173. Tokunaga, M.; Tokunaga, H.; Wu, H. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1982, 79, 2255.
174. Hussain, M.; Ichihara, S.; Mizushima, S. J. Biol. Chem. 1982, 257, 5177.
175. Dev, I. K.; Ray, P. H. J. Biol. Chem. 1984, 259, 11114.
176. Dev, I. K.; Harvey, R. J.; Ray, P. H. J. Biol. Chem. 1985, 260, 5891.
177. Tokunaga, M.; Loranger, J. M.; Wu, H. C. J. Cell Biochem. 1984, 24, 113.
178. von Heijne, G. J. Mol. Biol. 1992, 225, 487.
179. Munoa, F. J.; Miller, K. W.; Beers, R.; Graham, M.; Wu, H. C. J. Biol. Chem. 1991, 266, 17667.
180. Manoil, C.; Beckwith, J. Science 1986, 233, 1403.
181. Tjalsma, H.; Zanen, G.; Venema, G.; Bron, S.; van Dijl, J. M. J. Biol. Chem. 1999, 274, 28191.
182. Neurath, H. In Proteolytic Enzymes. A Practical Approach; Beynon, R. J., Bond, J. S., Eds.; IRL Press: Cary, NC, 1989.
183. Sankaran, K.; Wu, H. C. J. Biol. Chem. 1994, 269, 19701.
184. Sankaran, K.; Wu, H. C. In Signal Peptidases; Heijne, G. v., Ed.; R. G. Landes Co.: Austin, TX, 1994.
185. Pollitt, S.; Inouye, S.; Inouye, M. J. Biol. Chem. 1986, 261, 1835.
186. Inouye, S.; Duffaud, G.; Inouye, M. J. Biol. Chem. 1986, 261, 10970.
187. Strom, M. S.; Bergman, P.; Lory, S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 15788.
188. Strom, M. S.; Nunn, D. N.; Lory, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 2404.
189. Nunn, D. N.; Lory, S. J. Bacteriol. 1993, 175, 4375.
190. Pugsley, A. P. Mol. Microbiol. 1993, 9, 295.
191. Pepe, J. C.; Lory, S. J. Biol. Chem. 1998, 273, 19120.
192. LaPointe, C. F.; Taylor, R. K. J. Biol. Chem. 2000, 275, 1502.
193. Maccecchini, M. L.; Rudin, Y.; Blobel, G.; Schatz, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1979, 76, 343.
194. Maccecchini, M. L.; Rudin, Y.; Schatz, G. J. Biol. Chem. 1979, 254, 7468.
195. Glaser, E.; Dessi, P. J. Bioenerg. Biomembr. 1999, 31, 259.
196. Adamec, J.; Kalousek, F.; Isaya, G. In Co-translational and Posttranslational Proteolysis of Proteins, 3rd ed.; Dalbey, R. E., Sigman, D. S., Eds.; Academic Press: San Diego, CA, 2001; Vol. XXII.
197. Ito, A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1999, 265, 611.
198. Matsushita, Y.; Kitakawa, M.; Isono, K. Mol. Gen. Genet. 1989, 219, 119.
199. Van der Pas, J. C.; Rohlen, D. A.; Weidner, U.; Weiss, H. Biochim. Biophys. Acta 1991, 1089, 389.
200. Okamura, T.; John, M. E.; Zuber, M. X.; Simpson, E. R.; Waterman, M. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1985, 82, 5705.
201. Karslake, C.; Piotto, M. E.; Pak, Y. K.; Weiner, H.; Gorenstein, D. G. Biochemistry 1990, 29, 9872.
202. Thornton, K.; Wang, Y.; Weiner, H.; Gorenstein, D. G. J. Biol. Chem. 1993, 268, 19906.
203. Hammen, P. K.; Gorenstein, D. G.; Weiner, H. Biochemistry 1994, 33, 8610.
204. Hurt, E. C.; Muller, U.; Schatz, G. EMBO J. 1985, 4, 3509.
205. Hurt, E. C.; Pesold-Hurt, B.; Suda, K.; Oppliger, W.; Schatz, G. EMBO J. 1985, 4, 2061.
206. Haldi, M.; Guarente, L. J. Biol. Chem. 1989, 264, 17107.
207. Nishi, T.; Nagashima, F.; Tanase, S.; Fukumoto, Y.; Joh, T.; Shimada, K.; Matsukado, Y.; Ushio, Y.; Morino, Y. J. Biol. Chem. 1989, 264, 6044.
208. Maarse, A. C.; Van Loon, A. P.; Riezman, H.; Gregor, I.; Schatz, G.; Grivell, L. A. EMBO J. 1984, 3, 2831.
209. Hurt, E. C.; Allison, D. S.; Muller, U.; Schatz, G. J. Biol. Chem. 1987, 262, 1420.
210. Arretz, M.; Schneider, H.; Guiard, B.; Brunner, M.; Neupert, W. J. Biol. Chem. 1994, 269, 4959.
211. Ogishima, T.; Niidome, T.; Shimokata, K.; Kitada, S.; Ito, A. J. Biol. Chem. 1995, 270, 30322.
212. Niidome, T.; Kitada, S.; Shimokata, K.; Ogishima, T.; Ito, A. J. Biol. Chem. 1994, 269, 24719.
213. Bohni, P., Gasser, S., Schatz, G., Kroon, A. M., Saccone, C., Eds. The Organization and Expression of the Mitochondrial Genome; Elsevier: Amsterdam, 1980; pp 423-433.
214. Schmidt, B.; Wachter, E.; Sebald, W.; Neupert, W. Eur. J. Biochem. 1984, 144, 581.
215. Conboy, J. G.; Fenton, W. A.; Rosenberg, L. E. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1982, 105, 1.
216. Miura, S.; Mori, M.; Amaya, Y.; Tatibana, M. Eur. J. Biochem. 1982, 122, 641.
217. Hawlitschek, G.; Schneider, H.; Schmidt, B.; Tropschug, M.; Hartl, F. U.; Neupert, W. Cell 1988, 53, 795.
218. Yang, M.; Jensen, R. E.; Yaffe, M. P.; Oppliger, W.; Schatz, G. EMBO J. 1988, 7, 3857.
219. Ou, W. J.; Ito, A.; Okazaki, H.; Omura, T. EMBO J. 1989, 8, 2605.
220. Kleiber, J.; Kalousek, F.; Swaroop, M.; Rosenberg, L. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 7978.
221. Braun, H. P.; Emmermann, M.; Kruft, V.; Schmitz, U. K. EMBO J. 1992, 11, 3219.
222. Braun, H. P.; Schmitz, U. K. Trends Biochem. Sci. 1995, 20, 171.
223. Eriksson, A. C.; Sjoling, S.; Glaser, E. J. Bioenerg. Biomembr. 1996, 28, 285.
224. Eriksson, A. C.; Glaser, E. Biochim. Biophys. Acta 1992, 1140, 208.
225. Witte, C.; Jensen, R. E.; Yaffe, M. P.; Schatz, G. EMBO J. 1988, 7, 1439.
226. Paces, V.; Rosenberg, L. E.; Fenton, W. A.; Kalousek, F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 5355.
227. Emmermann, M.; Braun, H. P.; Arretz, M.; Schmitz, U. K. J. Biol. Chem. 1993, 268, 18936.
228. Luciano, P.; Tokatlidis, K.; Chambre, I.; Germanique, J. C.; Geli, V. J. Mol. Biol. 1998, 280, 193.
229. Adamec, J.; Gakh, O.; Spizek, J.; Kalousek, F. Arch. Biochem. Biophys. 1999, 370, 77.
230. Braun, H. P.; Schmitz, U. K. Eur. J. Biochem. 1992, 208, 761.
231. Rawlings, N. D.; Barrett, A. J. Methods Enzymol. 1995, 248, 183.
232. Matthews, B. W. Acc. Chem. Res. 1988, 21, 333.
233. Kitada, S.; Shimokata, K.; Niidome, T.; Ogishima, T.; Ito, A. J. Biochem. (Tokyo) 1995, 117, 1148.
234. Striebel, H. M.; Rysavy, P.; Adamec, J.; Spizek, J.; Kalousek, F. Arch. Biochem. Biophys. 1996, 335, 211.
235. Nagao, Y.; Kitada, S.; Kojima, K.; Toh, H.; Kuhara, S.; Ogishima, T.; Ito, A. J. Biol. Chem. 2000, 275, 34552.
236. Shimokata, K.; Kitada, S.; Ogishima, T.; Ito, A. J. Biol. Chem. 1998, 273, 25158.
237. Kojima, K.; Kitada, S.; Ogishima, T.; Ito, A. J. Biol. Chem. 2001, 276, 2115.
238. Becker, A. B.; Roth, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 3835.
239. Perlman, R. K.; Gehm, B. D.; Kuo, W. L.; Rosner, M. R. J. Biol. Chem. 1993, 268, 21538.
240. Kitada, S.; Kojima, K.; Shimokata, K.; Ogishima, T.; Ito, A. J. Biol. Chem. 1998, 273, 32547.
241. Becker, A. B.; Roth, R. A. Biochem. J. 1993, 292, 137.
242. Xia, D.; Yu, C. A.; Kim, H.; Xia, J. Z.; Kachurin, A. M.; Zhang, L.; Yu, L.; Deisenhofer, J. Science 1997, 277, 60.
243. Iwata, S.; Lee, J. W.; Okada, K.; Lee, J. K.; Iwata, M.; Rasmussen, B.; Link, T. A.; Ramaswamy, S.; Jap, B. K. Science 1998, 281, 64.
244. Zhang, Z.; Huang, L.; Shulmeister, V. M.; Chi, Y. I.; Kim, K. K.; Hung, L. W.; Crofts, A. R.; Berry, E. A.; Kim, S. H. Nature 1998, 392, 677.
245. Taylor, A. B.; Smith, B. S.; Kitada, S.; Kojima, K.; Miyaura, H.; Otwinowski, Z.; Ito, A.; Deisenhofer, J. Structure (Camb) 2001, 9, 615.
246. Branda, S. S.; Isaya, G. J. Biol. Chem. 1995, 270, 27366.
247. Isaya, G.; Kalousek, F.; Rosenberg, L. E. J. Biol. Chem. 1992, 267, 7904.
248. Kalousek, F.; Isaya, G.; Rosenberg, L. E. EMBO J. 1992, 11, 2803.
249. Chew, A.; Rollins, R. A.; Sakati, W. R.; Isaya, G. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1996, 226, 822.
250. Isaya, G.; Kalousek, F.; Rosenberg, L. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 8317.
251. Isaya, G.; Miklos, D.; Rollins, R. A. Mol. Cell Biol. 1994, 14, 5603.
252. Isaya, G.; Sakati, W. R.; Rollins, R. A.; Shen, G. P.; Hanson, L. C.; Ullrich, R. C.; Novotny, C. P. Genomics 1995, 28, 450.
253. Chew, A.; Buck, E. A.; Peretz, S.; Sirugo, G.; Rinaldo, P.; Isaya, G. Genomics 1997, 40, 493.
254. Bode, W.; Gomis-Ruth, F. X.; Huber, R.; Zwilling, R.; Stocker, W. Nature 1992, 358, 164.
255. Dobberstein, B.; Blobel, G.; Chua, N. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1977, 74, 1082.
256. Robinson, C.; Ellis, R. J. Eur. J. Biochem. 1984, 142, 337.
257. Oblong, J. E.; Lamppa, G. K. EMBO J. 1992, 11, 4401.
258. Gavel, Y.; von Heijne, G. FEBS Lett. 1990, 261, 455.
259. Ostrem, J. A.; Ramage, R. T.; Bohnert, H. J.; Wasmann, C. C. J. Biol. Chem. 1989, 264, 3662.
260. Pilon, M.; Wienk, H.; Sips, W.; de Swaaf, M.; Talboom, I.; van't Hof, R.; de Korte-Kool, G.; Demel, R.; Weisbeek, P.; de Kruijff, B. J. Biol. Chem. 1995, 270, 3882.
261. Rensink, W. A.; Pilon, M.; Weisbeek, P. Plant Physiol. 1998, 118, 691.
262. Rensink, W. A.; Schnell, D. J.; Weisbeek, P. J. J. Biol. Chem. 2000, 275, 10265.
263. Archer, E. K.; Keegstra, K. Plant Mol. Biol. 1993, 23, 1105.
264. Bassham, D. C.; Creighton, A. M.; Karnauchov, I.; Herrmann, R. G.; Klosgen, R. B.; Robinson, C. J. Biol. Chem. 1994, 269, 16062.
265. Clark, S. E.; Lamppa, G. K. J. Cell Biol. 1991, 114, 681.
266. Richter, S.; Lamppa, G. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 7463.
267. Emanuelsson, O.; Nielsen, H.; von Heijne, G. Protein Sci. 1999, 8, 978.
268. VanderVere, P. S.; Bennett, T. M.; Oblong, J. E.; Lamppa, G. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 7177.
269. Ichihara, S.; Beppu, N.; Mizushima, S. J. Biol. Chem. 1984, 259, 9853.
270. Pacaud, M. J. Biol. Chem. 1982, 257, 4333.
271. Ichihara, S.; Suzuki, T.; Suzuki, M.; Mizushima, S. J. Biol. Chem. 1986, 261, 9405.
272. Suzuki, T.; Itoh, A.; Ichihara, S.; Mizushima, S. J. Bacteriol. 1987, 169, 2523.
273. Bolhuis, A.; Matzen, A.; Hyyrylainen, H. L.; Kontinen, V. P.; Meima, R.; Chapuis, J.; Venema, G.; Bron, S.; Freudl, R.; van Dijl, J. M. J. Biol. Chem. 1999, 274, 24585.
274. Novak, P.; Ray, P. H.; Dev, I. K. J. Biol. Chem. 1986, 261, 420.
275. Vimr, E. R.; Green, L.; Miller, C. G. J. Bacteriol. 1983, 153, 1259.
276. Novak, P.; Dev, I. K. J. Bacteriol. 1988, 170, 5067.
277. Conlin, C. A.; Miller, C. G. J. Bacteriol. 1992, 174, 1631.
278. Conlin, C. A.; Trun, N. J.; Silhavy, T. J.; Miller, C. G. J. Bacteriol. 1992, 174, 5881.
279. Parsell, D. A.; Lindquist, S. Annu. Rev. Genet. 1993, 27, 437.
280. Georgopoulos, C.; Welch, W. J. Annu. Rev. Cell Biol. 1993, 9, 601.
281. Yura, T.; Nagai, H.; Mori, H. Annu. Rev. Microbiol. 1993, 47, 321.
282. Tisljar, U.; Barrett, A. J. Biochem. J. 1990, 267, 531.
283. Lyko, F.; Martoglio, B.; Jungnickel, B.; Rapoport, T. A.; Dobberstein, B. J. Biol. Chem. 1995, 270, 19873.
284. Klappa, P.; Dierks, T.; Zimmermann, R. Eur. J. Biochem. 1996, 239, 509.
285. Martoglio, B.; Graf, R.; Dobberstein, B. EMBO J. 1997, 16, 6636.
286. Braud, V. M.; Allan, D. S.; O'Callaghan, C. A.; Soderstrom, K.; D'Andrea, A.; Ogg, G. S.; Lazetic, S.; Young, N. T.; Bell, J. I.; Phillips, J. H.; Lanier, L. L.; McMichael, A. J. Nature 1998, 391, 795.
287. Lamberg, M. K.; Bland, F. A.; Weihofen, A.; Braud, V. M.; Martoglio, B. J. Immunol. 2001, 167, 6441.
288. Weihofen, A.; Lemberg, M. K.; Ploegh, H. L.; Bogyo, M.; Martoglio, B. J. Biol. Chem. 2000, 275, 30951.
289. Weihofen, A.; Binns, K.; Lemberg, M. K.; Ashman, K.; Martoglio, B. Science 2002, 296, 2215.
290. Ostersetzer, O.; Adam, Z. Plant Cell 1997, 9, 957.
291. Shanklin, J.; DeWitt, N. D.; Flanagan, J. M. Plant Cell 1995, 7, 1713.
292. Bolhuis, A.; Koetje, E.; Dubois, J. Y.; Vehmaanpera, J.; Venema, G.; Bron, S.; van Dijl, J. M. Mol. Biol. Evol. 2000, 17, 198.
293. Selkoe, D. J. J. Biol. Chem. 1996, 271, 18295.
294. Thompson, J. D.; Higgins, D. G.; Gibson, T. J. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 4673.
295. Altschul, S. F.; Madden, T. L.; Schaffer, A. A.; Zhang, J.; Zhang, Z.; Miller, W.; Lipman, D. J. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 3389.
296. Bairoch, A.; Apweiler, R. Nucleic Acids Res. 2000, 28, 45.
297. Tjalsma, H.; Bolhuis, A.; van Roosmalen, M. L.; Wiegert, T.; Schumann, W.; Broekhuizen, C. P.; Quax, W. J.; Venema, G.; Bron, S.; van Dijl, J. M. Genes Dev. 1998, 12, 2318.
298. Kraulis, P. G. J. Appl. Crystallogr. 1991, 24, 946.
299. Meritt, E. A.; Bacon, D. J. Methods Enzymol. 1997, 277, 505.
300. Koshland, D.; Botstein, D. Cell 1982, 30, 893.
301. Chang, C. N.; Blobel, G.; Model, P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1978, 75, 361.
302. Pragai, Z.; Tjalsma, H.; Bolhuis, A.; van Dijl, J. M.; Venema, G.; Bron, S. Microbiology 1997, 143, 1327.
303. Nunn, D. N.; Lory, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 3281.
304. Pugsley, A. P.; Dupuy, B. Mol. Microbiol. 1992, 6, 751.
305. Waters, M. G.; Evans, E. A.; Blobel, G. J. Biol. Chem. 1988, 263, 6209.
306. YaDeau, J. T.; Blobel, G. J. Biol. Chem. 1989, 264, 2928.
307. Yaffe, M. P.; Ohta, S.; Schatz, G. EMBO J. 1985, 4, 2069.
308. Kalousek, F.; Hendrick, J. P.; Rosenberg, L. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 7536.
309. Isaya, G.; Kalousek, F.; Fenton, W. A.; Rosenberg, L. E. J. Cell Biol. 1991, 113, 65.
310. Vierling, E.; Nagao, R. T.; DeRocher, A. E.; Harris, L. M. EMBO J. 1988, 7, 575.
311. Werneke, J. M.; Zielinski, R. E.; Ogren, W. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 787.
312. Smeekens, S.; van Binsbergen, J.; Weisbeek, P. Nucleic Acids Res. 1985, 13, 3179.
313. Stein, R. L.; Barbosa, M. D.; Bruckner, R. Biochemistry 2000, 39, 7973.
314. Caulfield, M. P.; Duong, L. T.; Baker, R. K.; Rosenblatt, M.; Lively, M. O. J. Biol. Chem. 1989, 264, 15813.