The proteasome: Destroy to live

Molecular Biology

Volumn 36, Issue 5, 2002, Pages 613-624

  Abramova, E B ^a   Sharova, N P ^a   Karpov, V L ^b  

^a KOL TSOV INSTITUTE OF DEVELOPMENTAL BIOLOGY   (Russian Federation)

^b ENGELHARDT INSTITUTE OF MOLECULAR BIOLOGY   (Russian Federation)

Author keywords

ATP and ubiquitin dependent protein degradation; Proteasome; Regulation; Ubiquitin

Indexed keywords

ACTIVATING TRANSCRIPTION FACTOR 1; CELL PROTEIN; CYCLIC AMP; DNA DIRECTED DNA POLYMERASE BETA; HEAT SHOCK PROTEIN; HELIX LOOP HELIX PROTEIN; HYPOXIA INDUCIBLE FACTOR 1; I KAPPA B ALPHA; IMMUNOGLOBULIN ENHANCER BINDING PROTEIN; INTERFERON REGULATORY FACTOR 1; MAJOR HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN CLASS 1; MYOD PROTEIN; ONCOPROTEIN; POLYPEPTIDE; PROTEASOME; PROTEIN C FOS; PROTEIN C JUN; PROTEIN C MOS; PROTEIN C MYC; PROTEIN P53; RETINOID X RECEPTOR; TRANSCRIPTION FACTOR; TRANSCRIPTION FACTOR E2F; TRANSCRIPTION FACTOR GEN4; TRANSCRIPTION FACTOR MAT ALPHA 2; TRANSCRIPTION FACTOR RPN4; TRANSCRIPTION FACTOR YY1; TUMOR SUPPRESSOR PROTEIN; UBIQUITIN; UNCLASSIFIED DRUG; UNINDEXED DRUG;

CATALYSIS; ENZYME ACTIVITY; ENZYME ANALYSIS; ENZYME DEGRADATION; ENZYME REGULATION; ENZYME STRUCTURE; ENZYME SUBSTRATE; METABOLISM; NONHUMAN; PROTEIN ASSEMBLY; PROTEIN FUNCTION; PROTEIN INDUCTION; REVIEW; SIGNAL TRANSDUCTION;

EID: 0036405291     PISSN: 00268933     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1023/A:1020654926226     Document Type: Review

References (139)

1. Deshaies, R.J., Trends Cell Biol., 1995, vol. 5, pp. 428-434.
2. King, R.W., Deshaies, R.J., Peters, J.-M., and Kirschner, M.W., Science, 1996, vol. 274, pp. 1652-1659.
3. Lee, D.H. and Goldberg, A.L., Trends Cell Biol., 1998, vol. 8, pp. 397-403.
4. Ciechanover, A., EMBO J., 1998, vol. 17, pp. 7151-7160.
5. Ciechanover, A. and Schwartz, A.L., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1998, vol. 95, pp. 2727-2730.
6. Voges, D., Zwickl, P., and Baumeister, W., Annu. Rev. Biochem., 1999, vol. 68, pp. 1015-1068.
7. Yew, P.R., J. Cell. Physiol., 2001, vol. 187, pp. 1-10.
8. Goldberg, A.L., Eur. J. Biochem., 1992, vol. 203, pp. 9-23.
9. Udvardy, A., J. Biol. Chem., 1993, vol. 268, pp. 9055-9062.
10. Fujinami, K., Tanahashi, N., Tanaka, K., et al., J. Biol. Chem., 1994, vol. 269, pp. 25 905-25 910.
11. Coux, O., Tanaka, K., and Goldberg, A.L., Annu. Rev. Biochem., 1996, vol. 65, pp. 801-847.
12. Rivett, A.J., Palmer, A., and Knecht, E., J. Histochem. Cytochem., 1992, vol. 40, pp. 1165-1172.
13. Peters, J.M., Franke, W.W., and Kleinschmidt, J.A., J. Biol. Chem., 1994, vol. 269, pp. 7709-7718.
14. Russell, S.J., Steger, K.A., and Jonston, S.A., J. Biol. Chem., 1999, vol. 274, pp. 21943-21952.
15. Brooks, P., Fueertes, G., Murray, R.Z., et al., Biochem. J., 2000, vol. 346, pp. 155-161.
16. Rivett, A.J., Bose, S., Brooks, P., and Broadfoot, K.I., Biochimie, 2001, vol. 83, pp. 363-366.
17. Zwickl, P., Ng, D., Woo, K.M., et al., J. Biol. Chem., 1999, vol. 274, pp. 26008-26014.
18. Tamura, T., Nagy, I., Lupas, A., et al., Curr. Biol., 1995, vol. 5, pp. 766-774.
19. Arrigo, A.-P., Tanaka, K., Goldberg, A.L., and Welch, W.J., Nature, 1988, vol. 331, pp. 192-194.
20. Waxman, L., Fagan, J.M., and Goldberg, A.L., J. Biol. Chem., 1987, vol. 262, pp. 2451-2457.
21. Hough, R., Pratt, G., and Rechsteiner, M., J. Biol. Chem., 1987, vol. 262, pp. 8303-8313.
22. Eytan, E., Ganith, D., Armon, T., and Hershko, A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1989, vol. 86, pp. 7751-7755.
23. Löwe, J., Stock, D., Jap, B., et al., Science, 1995, vol. 268, pp. 533-539.
24. Groll, M., Ditzel, L., Löwe, J., et al., Nature, 1997, vol. 386, pp. 463-471.
25. Peters, J.M., Cejka, Z., Harris, J.R., et al., J. Mol. Biol., 1993, vol. 234, pp. 932-937.
26. Baumaister, W., Walz, J., Zühl, F., and Seemüller, E., Cell, 1998, vol. 92, pp. 367-380.
27. Walz, J., Erdmann, A., Kania, M., et al., J. Struct. Biol., 1998, vol. 121, pp. 19-29.
28. Tanaka, K., Ii, K., and Ichihara, A., J. Biol. Chem., 1986, vol. 261, pp. 15 197-15 203.
29. DeMartino, G.N. and Slaughter, C.A., J. Biol. Chem., 1999, vol. 274, pp. 22 123-22 126.
30. Rubin, D.M. and Finley, D., Curr. Biol., 1995, vol. 5, pp. 854-858.
31. Bochtler, M., Ditzel, L., Groll, M., et al., Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct., 1999, vol. 28, pp. 295-317.
32. Tanaka, K., Biochem. Biophys. Res. Commun., 1998, vol. 247, pp. 537-541.
33. Griffin, T.A., Nandi, D., Cruz, M., et al., J. Exp. Med., 1998, vol. 187, pp. 97-104
34. Yang, Y., Fruh, K., Ahn, K., and Peterson, P.A., J. Biol. Chem., 1995, vol. 270, pp. 27687-27694.
35. Schmidtke, G., Schmidt, M., and Kloetzel, P.M., J. Mol. Biol., 1997, vol. 268, pp. 95-106.
36. Arent, C.S. and Hochstrasser, M., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997, vol. 94, pp. 7156-7161.
37. Groll, M., Bajorek, M., Kohler, A., et al., Nat. Struct. Biol., 2000, vol. 7, pp. 999-1001.
38. Groll, M., Heinemeyer, W., Jager, S., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1999, vol. 96, pp. 10976-10983.
39. Wilk, S. and Orlowski, M., J. Neurochem., 1983, vol. 40, pp. 842-849.
40. Orlowski, M., Biochemistry, 1990, vol. 29, pp. 10289-10297.
41. Kisselev, A.F., Akopian, T.S., Castillo, V., and Goldberg, A.L., Mol. Cell., 1999, vol. 4, pp. 395-402.
42. Orlowski, M., Cardozo, C., and Michaud, C., Biochemistry, 1993, vol. 32, pp. 1563-1572.
43. Dick, T.P., Nussbaum, A.K., Deeg, M., et al., J. Biol. Chem., 1998, vol. 273, pp. 25637-25646.
44. Cardozo, C., Michaud, C., and Orlowski, M., Biochemistry, 1999, vol. 38, pp. 9768-9777.
45. Kisselev, A.F., Songyang, Z., and Goldberg, A.L., J. Biol. Chem., 2000, vol. 275, pp. 14831-14837.
46. Rock, K.L., Gramm, C., Rothstein, L., et al., Cell, 1994, vol. 78, pp. 761-771.
47. Kisselev, A.F. and Goldberg, A.L., Chem. Biol., 2001, vol. 8, pp. 739-758.
48. Kessler, B.M., Tortorella, D., Altun, M., et al., Chem. Biol., 2001, vol. 8, pp. 913-929.
49. Craiu, A., Gaczynsca, M., Akopian, T., et al., J. Biol. Chem., 1997, vol. 272, pp. 13 437-13 445.
50. Nazif, T. and Bogyo, M., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2001, vol. 98, pp. 2967-2972.
51. Kohler, A., Bajorek, M., Groll, M., et al., Biochimie, 2001, vol. 83, pp. 325-332.
52. Kohler, A., Cascio, P., Leggett, D.S., et al., Mol. Cell., 2001, vol. 7, pp. 1143-1152.
53. Kisselev, A.F., Kaganovich, D., and Goldberg, A.L., J. Biol. Chem. (in press).
54. Kanayama, H., Tamura, T., Ugai, S., et al., Eur. J. Biochem., 1992, vol. 206, pp. 567-578.
55. Glickmann, M.H., Rubin, D.M., Fried, V.A., and Finley, D., Mol. Cell. Biol., 1998, vol. 18, pp. 149-162.
56. Ferrell, K., Wilkinson, C.R., Dubiel, W., and Gordon, C., Trends Cell Biol., 2000, vol. 25, pp. 83-88.
57. Glickmann, M., Rubin, D.M., Coux, O., et al., Cell, 1998, vol. 94, pp. 615-623.
58. Mason, G.G.P., Hendil, K.B., and Rivett, A.J., Eur. J. Biochem., 1996, vol. 238, pp. 453-462.
59. Mason, G.G.P., Murray, R.Z., Pappin, D., and Rivett, A.J., FEBS Lett., 1998, vol. 430, pp. 269-274.
60. Satoh, K., Sasajima, H., Nyoumura, K., et al., Biochemistry, 2001, vol. 40, pp. 314-319.
61. Bose, S., Brooks, P., Mason, G.G.P., and Rivett, A.J., Biochem. J., 2001, vol. 353, pp. 291-297.
62. Hilt, W. and Wolf, D.H., Trends Biol. Sci., 1996, vol. 21, pp. 96-102.
63. Mannhaupt, G., Schnall, R., Karpov, V., et al., FEBS Lett., 1999, vol. 450, pp. 27-34.
64. Kapranov, A.V., Kuryatova, A.V., Preobrazhenskaya, O.I., et al., Mol. Biol., 2001, vol. 35, pp. 356-364.
65. Hochshtrasser, M., Annu. Rev. Genet., 1996, vol. 30, pp. 405-439.
66. Rock, K.L. and Goldberg, A.L., Annu. Rev. Immunol., 1999, vol. 17, pp. 739-779.
67. Schwartz, A.L. and Ciechanover, A., Annu. Rev. Med., 1999, vol. 50, pp. 57-74.
68. Pickart, C.M., Annu. Rev. Biochem., 2001, vol. 70, pp. 503-533.
69. You, J. and Pickart, C.M., J. Biol. Chem., 2001, vol. 276, pp. 19 871-19 878.
70. Jackson, P.K., Eldridge, A.G., Freed, E., et al., Trends Cell Biol., 2000, vol. 10, pp. 429-439.
71. Hatakeyama, S., Yada, M., Matsumoto, M., et al., J. Biol. Chem., 2001, vol. 276, pp. 33 111-33 120.
72. Ferell, K., Deveraux, Q., van Nocker, S., and Rechsteiner, M., FEBS Lett., 1996, vol. 381, pp. 143-148.
73. Deveraux, Q., Ustrell, V., Pickart, C., and Rechsteiner, M., J. Biol. Chem., 1994, vol. 269, pp. 7059-7061.
74. van Nocker, S., Sadis, S., Rubin, D.M., et al., Mol. Cell. Biol., 1996, vol. 16, pp. 6020-6028.
75. Lam, Y.A., Lawson, T.G., Velayutham, M., et al., Nature, 2002, vol. 18, pp. 763-767.
76. Varshavsky, A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1996, vol. 93, pp. 12 142-12 149.
77. Starkova, N.N., Koroleva, E.P., and Rotanova, T.V., Bioorgen. Khim., 2000, vol. 26, pp. 83-96.
78. Murakami, Y., Matsufuji, S., Kameji, T., et al., Nature, 1992, vol. 360, pp. 597-599.
79. Medina, R., Wing, S.S., and Goldberg, A.L., Biochem. J., 1995, vol. 307, pp. 631-637.
80. Ward, C.L., Omura, S., and Kopito, R.R., Cell, 1995, vol. 83, pp. 121-127.
81. Bachmair, A., Finley, D., and Varshavsky, A., Science, 1986, vol. 234, pp. 179-186.
82. Staub, O., Gautschi, I., Ishikawa, Y., et al., EMBO J., 1997, vol. 16, pp. 6325-6336.
83. Lopes, U.G., Erhardt, P., Yao, R., and Cooper, G.M., J. Biol. Chem., 1997, vol. 272, pp. 12893-12896.
84. Chen, F., Chang, D., Goh, M., et al., Cell Growth Diff., 2000, vol. 11, pp. 239-246.
85. Treier, M., Staszewski, L.M., and Bohmann, D., Cell, 1994, vol. 78, pp. 787-798.
86. Lin, L., DeMartino, G.N., and Greene, W.C., Cell, 1998, vol. 92, pp. 819-828.
87. Bush, K.T., Goldberg, A.L., and Nigan, S.K., J. Biol. Chem., 1997, vol. 272, pp. 9086-9092.
88. Lee, D.H., and Goldberg, A.L., Mol. Cell. Biol., 1998, vol. 18, pp. 30-38.
89. Hilt, W., Heinemeyer, W., and Wolf, D.H., Adv. Exp. Med. Biol., 1996, vol. 389, pp. 197-202.
90. Krek, W., Curr. Opin. Genet. Dev., 1998, vol. 8, pp. 36-42.
91. Kisselev, A.F., Akopian, T.N., Woo, K.M., and Goldberg, A.L., J. Biol. Chem., 1999, vol. 274, pp. 3363-3371.
92. Groettrup, M., Ruppert, T., Kuehn, L., et al., J. Biol. Chem., 1995, vol. 270, pp. 23 808-23815.
93. Tanaka, K. and Kasahara, M., Immunol. Rev., 1998, vol. 163, pp. 161-176.
94. Shimbara, N., Nakajima, H., Tanahashi, N., et al., Genes Cells, 1997, vol. 2, pp. 785-800.
95. Toes, R.E.M., Nussbuam, A.K., Degermann, S., et al., J. Exp. Med., 2001, vol. 194, pp. 1-12.
96. Cascio, P., Hilton, C., Kisselev, A.F., et al., EMBO J., 2001, vol. 20, pp. 2357-2366.
97. Eleuteri, A.M., Kohanski, R.A., Cardozo, C., and Orlowski, M., J. Biol. Chem., 1997, vol. 272, pp. 11842-11831.
98. Cardozo, C. and Kohanski, R.A., J. Biol. Chem., 1998, vol. 273, pp. 16764-16770.
99. Noda, C., Tanahashi, N., Shimbara, N., et al., Biochim. Biophys. Res. Commun., 2000, vol. 277, pp. 348-354.
100. Whitby, F.G., Masters, E.I., Kramer, L., et al., Nature, 2000, vol. 408, pp. 115-120.
101. Tanahashi, N., Murakami, Y., Minami, Y., et al., J. Biol. Chem., 2000, vol. 275, pp. 14336-14345.
102. Cardozo, C., Eleuteri, A.M., and Orlowski, M., J. Biol. Chem., 1995, vol. 270, pp. 22645-22651.
103. Klein, U., Gernold, M., and Kloetzel, P.M., J. Cell Biol., 1990, vol. 111, pp. 2275-2282.
104. Macagno, A., Gillet, M., Sallusto, F., et al., Eur. J. Immunol., 1999, vol. 29, pp. 4037-4042.
105. Gautier, J., Pal, J.K., Gross de Sa, M.F., et al., J. Cell. Sci., 1988, vol. 90, pp. 543-553.
106. Kawahara, H. and Yokosawa, H., Dev. Biol., 1992, vol. 151, pp. 27-33.
107. Enenkel, C., Lehmann, A., and Kloetzel, P.M., EMBO J., 1998, vol. 17, pp. 6144-6154.
108. Wilkinson, C.R., Wallace, M., Morphew, M., et al., EMBO J., 1998, vol. 17, pp. 6465-6476.
109. Wigley, W.C., Fabunmi, R.P., Lee, M.G., et al., J. Cell. Biol., 1999, vol. 145, pp. 481-490.
110. McCutchen-Maloney, S.L., Matsuda, K., Shimbara, N., et al., J. Biol. Chem., 2000, vol. 275, pp. 18557-18565.
111. Kawahara, H. and Yokosawa, H., Dev. Biol., 1994, vol. 166, pp. 623-633.
112. Tanahashi, N., Kawahara, H., Murakami, Y., and Tanaka, K., Mol. Biol. Rep., 1999, vol. 26, pp. 3-9.
113. Seeger, M., Ferrell, K., Frank, R., and Dudiel, W., J. Biol. Chem., 1997, vol. 272, pp. 8145-8148.
114. Berezutskaya, E. and Bagchi, S., J. Biol. Chem., 1997, vol. 272, pp. 30135-30140.
115. Zhang, Z., Torii, N., Furusaka, A., et al., J. Biol. Chem., 2000, vol. 275, pp. 15 157-15 165.
116. Xie, Y. and Varshavsky, A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2001, vol. 98, pp. 3056-3061.
117. Kawahara, H., Kasahara, M., Nishiyama, A., et al., EMBO J., 2000, vol. 19, pp. 4144-4153.
118. Hershko, A. and Ciechanover, A., Annu. Rev. Biochem., 1998, vol. 67, pp. 425-479.
119. Schauber, C., Chen, L., Tongaonkar, P., et al., Nature, 1998, vol. 391, pp. 715-718.
120. Grune, T., Biogerontology, 2000, vol. 1, pp. 31-40.
121. Stolzng, A. and Grune, T., Clin. Exp. Dermatol., 2000, vol. 26, pp. 566-572.
122. Walowitz, J.L., Bradley, M.E., Chen, S., and Lee, T., J. Biol. Chem., 1998, vol. 273, pp. 6656-6661.
123. Fuchs, S.Y., Tappin, I., and Ronai, Z., J. Biol. Chem., 2000, vol. 275, pp. 12 560-12 564.
124. Ravi, R., Mookerjee, B., Bhujwalla, Z.M., et al., Genes Dev., 2000, vol. 14, pp. 34-44.
125. Folco, E.J. and Koren, G., Biochem. J., 1997, vol. 328, pp. 37-43.
126. Floyd, Z.E., Trausch-Azar, J.S., Reinstein, E., et al., J. Biol. Chem., 2001, vol. 276, pp. 22 468-22 475.
127. Adachi, S., Matsushima-Nishiwaki, R., Takano, Y., et al., Hepatology, 2002, vol. 35, pp. 332-340.
128. Richter-Ruoff, B., Wolf, D.H., and Hochstrasser, M., FEBS Lett., 1994, vol. 354, pp. 50-52.
129. Kornitzer, D., Raboy, B., Kulka, R.G., and Fink, G.R., EMBO J., 1994, vol. 13, pp. 6021-6030.
130. Nakagawa, K. and Yokosawa, H., Eur. J. Biochem., 2000, vol. 267, pp. 1680-1686.
131. Campanero, M.R. and Flemington, E.K., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997, vol. 94, pp. 2221-2226.
132. He, H., Qi, X.-M., Grossmann, J., and Distelhorst, C.W., J. Biol. Chem., 1998, vol. 273, pp. 25015-25019.
133. Ishida, N., Tanaka, K., Tamura, T., et al., FEBS Lett., 1993, vol. 324, pp. 345-348.
134. Kho, C.J., Huggins, G.S., Endege, W.O., et al., J. Biol. Chem., 1997, vol. 272, pp. 3845-3851.
135. Salghetti, S.E., Kim, S.Y., and Tansey, W.P., EMBO J., 1999, vol. 18, pp. 717-726.
136. Mitsui, A. and Sharp, P.A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1999, vol. 96, pp. 6054-6059.
137. Mao, Y., Desai, S.D., Ting, C.Y., et al., J. Biol. Chem., 2001, vol. 276, pp. 40 652-40 658.
138. Fu, Q. Kim, S.W., Chen, H.X., and Cheng, Y.C., Mol. Pharmacol., 1999, vol. 55, pp. 677-683.
139. Schork, S.M., Bee, G., Thumm, M., and Wolf, D.H., FEBS Lett., 1994, vol. 349, pp. 270-274.