Metabolomics in diabetic complications

Molecular BioSystems

Volumn 12, Issue 4, 2016, Pages 1090-1105

  Filla, Laura A ^a   Edwards, James L ^a  

^a Saint Louis University   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL MARKER;

ANIMAL; DIABETES COMPLICATIONS; ENERGY METABOLISM; HUMAN; METABOLISM; METABOLOME; METABOLOMICS; OXIDATIVE STRESS; PROCEDURES;

ANIMALS; BIOMARKERS; DIABETES COMPLICATIONS; ENERGY METABOLISM; HUMANS; METABOLIC NETWORKS AND PATHWAYS; METABOLOME; METABOLOMICS; OXIDATIVE STRESS;

EID: 84962052959     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c6mb00014b     Document Type: Review

References (113)

1. World Health Organization, Global status report on noncommunicable diseases 2014, Geneva, accessed January 4, 2016
2. C. D. Mathers D. Loncar PLoS Med. 2006 3 e442
3. K. M. Sas A. Karnovsky G. Michailidis S. Pennathur Diabetes 2015 64 718 732
4. J. R. Bain R. D. Stevens B. R. Wenner O. Ilkayeva D. M. Muoio C. B. Newgard Diabetes 2009 58 2429 2443
5. J. Carroll M. Raththagala W. Subasinghe S. Baguzis T. D'Amico Oblak P. Root D. Spence Mol. BioSyst. 2006 2 305 311
6. J. S. Carroll C.-J. Ku W. Karunarathne D. M. Spence Anal. Chem. 2007 79 5133 5138
7. S. S. M. Chung E. C. M. Ho K. S. L. Lam S. K. Chung J. Am. Soc. Nephrol. 2003 14 S233 S236
8. J. M. Tarr K. Kaul M. Chopra E. M. Kohner R. Chibber ISRN Ophthalmol. 2013 2013 13
9. F. Giacco M. Brownlee Circ. Res. 2010 107 1058 1070
10. M. Brownlee Nature 2001 414 813 820
11. R. Pop-Busui M. J. Stevens D. M. Raffel E. A. White M. Mehta C. D. Plunkett M. B. Brown E. L. Feldman Diabetologia 2013 56 1835 1844
12. K. E. Schemmel R. S. Padiyara J. J. D'Souza J. Diabetes Complications 2010 24 354 360
13. N. Hotta R. Kawamori M. Fukuda Y. Shigeta Diabetic Med. 2012 29 1529 1533
14. R. Babaei-Jadidi N. Karachalias N. Ahmed S. Battah P. J. Thornalley Diabetes 2003 52 2110 2120
15. A. Nenna F. Nappi S. S. Avtaar Singh F. W. Sutherland F. Di Domenico M. Chello C. Spadaccio Man. Res. Tech. Cardiovasc. Med. 2015 4 e26949
16. W. K. Bolton D. C. Cattran M. E. Williams S. G. Adler G. B. Appel K. Cartwright P. G. Foiles B. I. Freedman P. Raskin R. E. Ratner B. S. Spinowitz F. C. Whittier J. P. Wuerth Am. J. Nephrol. 2004 24 32 40
17. J. M. Forbes and M. E. Cooper, Mechanisms of Diabetic Complications, 2013
18. O. Yanes R. Tautenhahn G. J. Patti G. Siuzdak Anal. Chem. 2011 83 2152 2161
19. M. A. Lorenz C. F. Burant R. T. Kennedy Anal. Chem. 2011 83 3406 3414
20. J. Folch M. Lees G. H. Sloane Stanley J. Biol. Chem. 1957 226 497 509
21. W. B. Dunn N. J. C. Bailey H. E. Johnson Analyst 2005 130 606 625
22. G. Sun K. Yang Z. Zhao S. Guan X. Han R. W. Gross Anal. Chem. 2007 79 6629 6640
23. E. J. Want B. F. Cravatt G. Siuzdak ChemBioChem 2005 6 1941 1951
24. J. L. Edwards W. Yuan Bioanalysis 2010 2 953 963
25. R. J. Koenig C. M. Peterson R. L. Jones C. Saudek M. Lehrman A. Cerami N. Engl. J. Med. 1976 295 417 420
26. T. J. Lyons A. Basu Transl. Res. 2012 159 303 312
27. A. American Diabetes Diabetes Care 2010 33 S62 S69
28. A. Borai C. Livingstone F. Abdelaal A. Bawazeer V. Keti G. Ferns Scand. J. Clin. Lab. Invest. 2011 71 168 172
29. G. Lippi G. Targher Clin. Chem. Lab. Med. 2010 48 609 614
30. V. J. Nikiforova P. Giesbertz J. Wiemer B. Bethan R. Looser V. Liebenberg P. Ruiz Noppinger H. Daniel D. Rein J. Diabetes Res. 2014 2014 9
31. P. Würtz V.-P. Mäkinen P. Soininen A. J. Kangas T. Tukiainen J. Kettunen M. J. Savolainen T. Tammelin J. S. Viikari T. Rönnemaa M. Kähönen T. Lehtimäki S. Ripatti O. T. Raitakari M.-R. Järvelin M. Ala-Korpela Diabetes 2012 61 1372 1380
32. A. Moran D. R. Jacobs J. Steinberger L. M. Steffen J. S. Pankow C.-P. Hong A. R. Sinaiko Circulation 2008 117 2361 2368
33. M. Matsuda R. A. DeFronzo Diabetes Care 1999 22 1462 1470
34. M. Lucio A. Fekete C. Weigert B. Wägele X. Zhao J. Chen A. Fritsche H.-U. Häring E. D. Schleicher G. Xu P. Schmitt-Kopplin R. Lehmann PLoS One 2010 5 e13317
35. X. Zhang Y. Wang F. Hao X. Zhou X. Han H. Tang L. Ji J. Proteome Res. 2009 8 5188 5195
36. W. E. Gall K. Beebe K. A. Lawton K.-P. Adam M. W. Mitchell P. J. Nakhle J. A. Ryals M. V. Milburn M. Nannipieri S. Camastra A. Natali E. Ferrannini R. S. G. for the PLoS One 2010 5 e10883
37. L. A. Filla W. Yuan E. L. Feldman S. Li J. L. Edwards J. Proteome Res. 2014 13 6121 6134
38. T. J. Wang M. G. Larson R. S. Vasan S. Cheng E. P. Rhee E. McCabe G. D. Lewis C. S. Fox P. F. Jacques C. Fernandez C. J. O'Donnell S. A. Carr V. K. Mootha J. C. Florez A. Souza O. Melander C. B. Clish R. E. Gerszten Nat. Med. 2011 17 448 453
39. C. B. Newgard Cell Metab. 2012 15 606 614
40. F. Xu S. Tavintharan C. F. Sum K. Woon S. C. Lim C. N. Ong J. Clin. Endocrinol. Metab. 2013 98 E1060 E1065
41. P. Felig E. Marliss G. F. Cahill N. Engl. J. Med. 1969 281 811 816
42. M. Krebs M. Krssak E. Bernroider C. Anderwald A. Brehm M. Meyerspeer P. Nowotny E. Roth W. Waldhausl M. Roden Diabetes 2002 51 599 605
43. S. G. Anderson W. B. Dunn M. Banerjee M. Brown D. I. Broadhurst R. Goodacre G. J. S. Cooper D. B. Kell J. K. Cruickshank PLoS One 2014 9 e103217
44. A. Ali F. Iqbal A. Taj Z. Iqbal M. J. Amin Q. Z. Iqbal Pak. J. Med. Sci. 2013 29 899 902
45. V.-P. Mäkinen C. Forsblom L. M. Thorn J. Wadén D. Gordin O. Heikkilä K. Hietala L. Kyllönen J. Kytö M. Rosengård-Bärlund M. Saraheimo N. Tolonen M. Parkkonen K. Kaski M. Ala-Korpela P.-H. Groop Diabetes 2008 57 2480 2487
46. W. B. Dunn R. Goodacre L. Neyses M. Mamas Bioanalysis 2011 3 2205 2222
47. J. Teul F. J. Rupérez A. Garcia J. Vaysse S. Balayssac V. Gilard M. Malet-Martino J. L. Martin-Ventura L. M. Blanco-Colio J. Tuñón J. Egido C. Barbas J. Proteome Res. 2009 8 5580 5589
48. W. P. Castelli R. J. Garrison P. W. Wilson R. D. Abbott S. Kalousdian W. B. Kannel JAMA, J. Am. Med. Assoc. 1986 256 2835 2838
49. J. D. Otvos E. J. Jeyarajah D. W. Bennett R. M. Krauss Clin. Chem. 1992 38 1632 1638
50. A. Festa K. Williams A. J. G. Hanley J. D. Otvos D. C. Goff L. E. Wagenknecht S. M. Haffner Circulation 2005 111 3465 3472
51. N. Amigó R. Mallol M. Heras S. Martínez-Hervás F. Blanco-Vaca J. C. Escolà-Gil N. Plana Ó. Yanes L. Masana X. Correig Sci. Rep. 2016 6 19249
52. R. M. Badeau M. J. Honka R. Lautamaki M. Stewart A. J. Kangas P. Soininen M. Ala-Korpela P. Nuutila Ann. Med. 2014 46 18 23
53. E. A. Schwartz P. D. Reaven Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Biol. Lipids 2012 1821 858 866
54. C. Kusminski S. Shetty L. Orci R. Unger P. Scherer Apoptosis 2009 14 1484 1495
55. L. Hue H. Taegtmeyer Am. J. Physiol.: Endocrinol. Metab. 2009 297 E578 E591
56. C. Esch D. S. Hui R. Lee J. L. Edwards Anal. Methods 2015 7 7164 7169
57. W. Yuan J. L. Edwards S. Li Chem. Commun. 2013 49 11080 11082
58. V. G. Demarco D. A. Ford E. J. Henriksen A. R. Aroor M. S. Johnson J. Habibi L. Ma M. Yang C. J. Albert J. W. Lally C. A. Ford M. Prasannarong M. R. Hayden A. T. Whaley-Connell J. R. Sowers Endocrinology 2013 154 159 171
59. T. Wu G. Xie Y. Ni T. Liu M. Yang H. Wei W. Jia G. Ji J. Proteome Res. 2015 14 447 456
60. H. V. Lin A. Frassetto E. J. Kowalik Jr A. R. Nawrocki M. M. Lu J. R. Kosinski J. A. Hubert D. Szeto X. Yao G. Forrest D. J. Marsh PLoS One 2012 7 e35240
61. T. Todesco A. V. Rao O. Bosello D. J. Jenkins Am. J. Clin. Nutr. 1991 54 860 865
62. T. Connell Metabolites 2013 3 931 945
63. M. Magnusson, G. D. Lewis, U. Ericson, M. Orho-Melander, B. Hedblad, G. Engström, G. Östling, C. Clish, T. J. Wang, R. E. Gerszten and O. Melander, A diabetes-predictive amino acid score and future cardiovascular disease, 2013
64. W. Yuan J. Zhang S. Li J. L. Edwards J. Proteome Res. 2011 10 5242 5250
65. P. Wurtz M. Tiainen V. P. Makinen A. J. Kangas P. Soininen J. Saltevo S. Keinanen-Kiukaanniemi P. Mantyselka T. Lehtimaki M. Laakso A. Jula M. Kahonen M. Vanhala M. Ala-Korpela Diabetes Care 2012 35 1749 1756
66. M. J. Rovetto W. F. Lamberton J. R. Neely Circ. Res. 1975 37 742 751
67. J. R. Greenfield I. S. Farooqi J. M. Keogh E. Henning A. M. Habib A. Blackwood F. Reimann J. J. Holst F. M. Gribble Am. J. Clin. Nutr. 2009 89 106 113
68. S. M. Setter R. K. Campbell C. J. Cahoon Ann. Pharmacother. 2003 37 1858 1866
69. N. Kaiser S. Sasson E. P. Feener N. Boukobza-Vardi S. Higashi D. E. Moller S. Davidheiser R. J. Przybylski G. L. King Diabetes 1993 42 80 89
70. H. Ishii D. Koya G. L. King J. Mol. Med. 1998 76 21 31
71. J. C. Jha K. A. Jandeleit-Dahm M. E. Cooper Adv. Chronic Kidney Dis. 2014 21 318 326
72. M. Li X. Wang J. Aa W. Qin W. Zha Y. Ge L. Liu T. Zheng B. Cao J. Shi C. Zhao X. Wang X. Yu G. Wang Z. Liu Am. J. Physiol. 2013 304 F1317 F1324
73. W. G. Couser G. Remuzzi S. Mendis M. Tonelli Kidney Int. 2011 80 1258 1270
74. T. W. Meyer T. H. Hostetter N. Engl. J. Med. 2007 357 1316 1325
75. M. A. Niewczas T. L. Sirich A. V. Mathew J. Skupien R. P. Mohney J. H. Warram A. Smiles X. Huang W. Walker J. Byun E. D. Karoly E. M. Kensicki G. T. Berry J. V. Bonventre S. Pennathur T. W. Meyer A. S. Krolewski Kidney Int. 2014 85 1214 1224
76. W. Dunn D. Broadhurst S. Deepak M. Buch G. McDowell I. Spasic D. Ellis N. Brooks D. Kell L. Neyses Metabolomics 2007 3 413 426
77. L. Dou E. Bertrand C. Cerini V. Faure J. Sampol R. Vanholder Y. Berland P. Brunet Kidney Int. 2004 65 442 451
78. H. Zhang J. Saha J. Byun M. Schin M. Lorenz R. T. Kennedy M. Kretzler E. L. Feldman S. Pennathur F. C. Brosius 3rd Am. J. Physiol. 2008 295 F1071 1081
79. I. Nakabayashi M. Nakamura K. Kawakami T. Ohta I. Kato K. Uchida M. Yoshida Nephrol., Dial., Transplant. 2011 26 1094 1098
80. F. M. van der Kloet F. W. Tempels N. Ismail R. van der Heijden P. T. Kasper M. Rojas-Cherto R. van Doorn G. Spijksma M. Koek J. van der Greef V. P. Makinen C. Forsblom H. Holthofer P. H. Groop T. H. Reijmers T. Hankemeier Metabolomics 2012 8 109 119
81. M. G. Schooneman F. M. Vaz S. M. Houten M. R. Soeters Diabetes 2013 62 1 8
82. T. Miyata C. V. de Strihou K. Kurokawa J. W. Baynes Kidney Int. 1999 55 389 399
83. J. M. Forbes M. E. Cooper M. D. Oldfield M. C. Thomas J. Am. Soc. Nephrol. 2003 14 S254 S258
84. P. J. Beisswenger S. K. Howell G. B. Russell M. E. Miller S. S. Rich M. Mauer Diabetes Care 2013 36 3234 3239
85. Y.-H. You T. Quach R. Saito J. Pham K. Sharma J. Am. Soc. Nephrol. 2016 27 466 481
86. S. Chen B. Jim F. N. Ziyadeh Semin. Nephrol. 2003 23 532 543
87. K. Sharma B. Karl A. V. Mathew J. A. Gangoiti C. L. Wassel R. Saito M. Pu S. Sharma Y.-H. You L. Wang M. Diamond-Stanic M. T. Lindenmeyer C. Forsblom W. Wu J. H. Ix T. Ideker J. B. Kopp S. K. Nigam C. D. Cohen P.-H. Groop B. A. Barshop L. Natarajan W. L. Nyhan R. K. Naviaux J. Am. Soc. Nephrol. 2013 24 1901 1912
88. J. Liu C. Wang F. Liu Y. Lu J. Cheng Anal. Bioanal. Chem. 2015 407 2569 2579
89. J. L. Edwards A. Vincent T. Cheng E. L. Feldman Pharmacol. Ther. 2008 120 1 34
90. L. M. Hinder A. Vivekanandan-Giri L. L. McLean S. Pennathur E. L. Feldman J. Endocrinol. 2013 216 1 11
91. O. J. Freeman R. D. Unwin A. W. Dowsey P. Begley S. Ali K. A. Hollywood N. Rustogi R. S. Petersen W. B. Dunn G. J. S. Cooper N. J. Gardiner Diabetes 2016 65 228 238
92. A. M. Vincent J. M. Hayes L. L. McLean A. Vivekanandan-Giri S. Pennathur E. L. Feldman Diabetes 2009 58 2376 2385
93. B. Inceoglu K. M. Wagner J. Yang A. Bettaieb N. H. Schebb S. H. Hwang C. Morisseau F. G. Haj B. D. Hammock Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012 109 11390 11395
94. K. Node Y. Huo X. Ruan B. Yang M. Spiecker K. Ley D. C. Zeldin J. K. Liao Science 1999 285 1276 1279
95. Y. F. Tian T. L. Hsia C. H. Hsieh D. W. Huang C. H. Chen P. S. Hsieh Life Sci. 2011 89 107 114
96. S. Pennathur C. Bergt B. Shao J. Byun S. Y. Kassim P. Singh P. S. Green T. O. McDonald J. Brunzell A. Chait J. F. Oram K. O'Brien R. L. Geary J. W. Heinecke J. Biol. Chem. 2004 279 42977 42983
97. V. R. Drel S. Lupachyk H. Shevalye I. Vareniuk W. Xu J. Zhang N. A. Delamere M. Shahidullah B. Slusher I. G. Obrosova Endocrinology 2010 151 2547 2555
98. R. N. Frank N. Engl. J. Med. 2004 350 48 58
99. R. H. Amin R. N. Frank A. Kennedy D. Eliott J. E. Puklin G. W. Abrams Invest. Ophthalmol. Visual Sci. 1997 38 36 47
100. K. H. Gabbay N. Engl. J. Med. 1973 288 831 836
101. I. Barba M. Garcia-Ramirez C. Hernandez M. A. Alonso L. Masmiquel D. Garcia-Dorado R. Simo Invest. Ophthalmol. Visual Sci. 2010 51 4416 4421
102. M. Lorenzi Exp. Diabetes Res. 2007 2007 61038
103. M. J. Stevens D. N. Henry T. P. Thomas P. D. Killen D. A. Greene Am. J. Physiol.: Endocrinol. Metab. 1993 265 E428 E438
104. L. C. MacGregor L. R. Rosecan A. M. Laties F. M. Matschinsky J. Biol. Chem. 1986 261 4046 4051
105. A. Ottlecz C. A. Garcia J. Eichberg D. A. Fox Curr. Eye Res. 1993 12 1111 1121
106. I. Obrosova X. Cao D. A. Greene M. J. Stevens Diabetologia 1998 41 1442 1450
107. L. P. Paris C. H. Johnson E. Aguilar Y. Usui K. Cho L. T. Hoang D. Feitelberg H. P. Benton P. D. Westenskow T. Kurihara J. Trombley K. Tsubota S. Ueda Y. Wakabayashi G. J. Patti J. Ivanisevic G. Siuzdak M. Friedlander Metabolomics 2016 12 15
108. A. Ishikawa S.-I. Ishiguro M. Tamai Curr. Eye Res. 1996 15 63 71
109. K. Gowda W. J. Zinnanti K. F. LaNoue J. Neurochem. 2011 117 309 320
110. T. R. Hall R. Wallin G. D. Reinhart S. M. Hutson J. Biol. Chem. 1993 268 3092 3098
111. D. Pieragostino M. D'Alessandro M. di Ioia C. Di Ilio P. Sacchetta P. Del Boccio Proteomics: Clin. Appl. 2015 9 169 186
112. L. Chen L. Zhou E. C. Chan J. Neo R. W. Beuerman J. Proteome Res. 2011 10 4876 4882
113. J. Capellades M. Navarro S. Samino M. Garcia-Ramirez C. Hernandez R. Simo M. Vinaixa O. Yanes Anal. Chem. 2016 88 621 628