Pathogenic properties of Alzheimer's β-amyloid identified from structure-property patient-phenotype correlations

Dalton Transactions

Volumn 44, Issue 6, 2015, Pages 2747-2754

  Tiwari, Manish K ^a   Kepp, Kasper P ^a  

^a TECHNICAL UNIVERSITY OF DENMARK   (Denmark)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GLYCOPROTEINS; HOSPITAL DATA PROCESSING; HYDROPHOBICITY; MONOMERS; NEURODEGENERATIVE DISEASES; SURFACE CHEMISTRY;

ALZHEIMER'S DISEASE; CHEMICAL DATA; CHEMICAL ENVIRONMENT; GENETIC VARIANTS; HYDROPHOBIC SURFACES; MOLECULAR MECHANISM; STRUCTURE PROPERTY; VARIABLE STRUCTURES;

CONFORMATIONS;

EID: 84922163167     PISSN: 14779226     EISSN: 14779234     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4dt03122a     Document Type: Article

References (75)

1. K. P. Kepp Chem. Rev. 2012 112 5193 5239
2. M. Eisenstein Nature 2011 475 S20 S22
3. G. M. McKhann D. S. Knopman H. Chertkow B. T. Hyman C. R. Jack Jr. C. H. Kawas W. E. Klunk W. J. Koroshetz J. J. Manly R. Mayeux R. C. Mohs J. C. Morris M. N. Rossor P. Scheltens M. C. Carrillo B. Thies S. Weintraub C. H. Phelps Alzheimer's Dementia 2011 7 263 269
4. S. Ayton P. Lei A. I. Bush Free Radical Biol. Med. 2013 62 76 89
5. A. Rauk Chem. Soc. Rev. 2009 38 2698 2715
6. R. J. Guerreiro D. R. Gustafson J. Hardy Neurobiol. Aging 2012 33 437 456
7. D. E. Barnes K. Yaffe Lancet Neurol. 2011 10 819 828
8. E. Levy-Lahad W. Wasco P. Poorkaj D. M. Romano J. Oshima W. H. Pettingell C. E. Yu P. D. Jondro S. D. Schmidt K. Wang et al. Science 1995 269 973 977
9. L. Chávez-Gutiérrez L. Bammens I. Benilova A. Vandersteen M. Benurwar M. Borgers S. Lismont L. Zhou S. Van Cleynenbreugel H. Esselmann J. Wiltfang L. Serneels E. Karran H. Gijsen J. Schymkowitz F. Rousseau K. Broersen B. De Strooper EMBO J. 2012 31 2261 2274
10. B. Schneider D. Prvulovic V. Oertel-Knochel C. Knochel B. Reinke M. Grexa B. Weber H. Hampel Prog. Neurobiol. 2011 95 703 717
11. J. A. Hardy G. A. Higgins Science 1992 256 184 185
12. G. M. Shankar D. M. Walsh Mol. Neurodegener. 2009 4 48
13. E. Karran M. Mercken B. De Strooper Nat. Rev. Drug Discovery 2011 10 698 712
14. R. Kayed E. Head J. L. Thompson T. M. McIntire S. C. Milton C. W. Cotman C. G. Glabe Science 2003 300 486 489
15. J. P. Cleary D. M. Walsh J. J. Hofmeister G. M. Shankar M. A. Kuskowski D. J. Selkoe K. H. Ashe Nat. Neurosci. 2005 8 79 84
16. S. Lesne M. T. Koh L. Kotilinek R. Kayed C. G. Glabe A. Yang M. Gallagher K. H. Ashe Nature 2006 440 352 357
17. J. V. Rushworth N. M. Hooper Int. J. Alzheimer's Dis. 2011 2011 603052
18. S. Ohnishi K. Takano Cell. Mol. Life Sci. 2004 61 511 524
19. E. Hubin N. A. van Nuland K. Broersen K. Pauwels Cell. Mol. Life Sci. 2014 71 3507 3521
20. A. K. Paravastu R. D. Leapman W. M. Yau R. Tycko Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 18349 18354
21. M. Fandrich M. Schmidt N. Grigorieff Trends Biochem. Sci. 2011 36 338 345
22. I. Bertini L. Gonnelli C. Luchinat J. Mao A. Nesi J. Am. Chem. Soc. 2011 133 16013 16022
23. H. A. Scheidt I. Morgado S. Rothemund D. Huster M. Fandrich Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 2837 2840
24. M. Ahmed J. Davis D. Aucoin T. Sato S. Ahuja S. Aimoto J. I. Elliott W. E. Van Nostrand S. O. Smith Nat. Struct. Mol. Biol. 2010 17 561 567
25. J. P. Colletier A. Laganowsky M. Landau M. Zhao A. B. Soriaga L. Goldschmidt D. Flot D. Cascio M. R. Sawaya D. Eisenberg Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 16938 16943
26. A. Jan O. Adolfsson I. Allaman A. L. Buccarello P. J. Magistretti A. Pfeifer A. Muhs H. A. Lashuel J. Biol. Chem. 2011 286 8585 8596
27. E. Hellstrand B. Boland D. M. Walsh S. Linse ACS Chem. Neurosci. 2010 1 13 18
28. Y. Miller B. Ma R. Nussinov Chem. Rev. 2010 110 4820 4838
29. S. Nag B. Sarkar A. Bandyopadhyay B. Sahoo V. K. Sreenivasan M. Kombrabail C. Muralidharan S. Maiti J. Biol. Chem. 2011 286 13827 13833
30. D. J. Hayne S. Lim P. S. Donnelly Chem. Soc. Rev. 2014 43 6701 6715
31. A. Deshpande E. Mina C. Glabe J. Busciglio J. Neurosci. 2006 26 6011 6018
32. R. M. Murphy Annu. Rev. Biomed. Eng. 2002 4 155 174
33. R. J. Morris K. Eden R. Yarwood L. Jourdain R. J. Allen C. E. Macphee Nat. Commun. 2013 4 1891
34. M. Coles W. Bicknell A. A. Watson D. P. Fairlie D. J. Craik Biochemistry 1998 37 11064 11077
35. O. Crescenzi S. Tomaselli R. Guerrini S. Salvadori A. M. D'Ursi P. A. Temussi D. Picone Eur. J. Biochem. 2002 269 5642 5648
36. S. A. Kotler P. Walsh J. R. Brender A. Ramamoorthy Chem. Soc. Rev. 2014 43 6692 6700
37. R. Kayed C. A. Lasagna-Reeves J. Alzheimers Dis. 2013 33 S67 S78
38. L. M. Hou H. Y. Shao Y. B. Zhang H. Li N. K. Menon E. B. Neuhaus J. M. Brewer I. J. L. Byeon D. G. Ray M. P. Vitek T. Iwashita R. A. Makula A. B. Przybyla M. G. Zagorski J. Am. Chem. Soc. 2004 126 1992 2005
39. S. Mitternacht I. Staneva T. Hard A. Irback Proteins 2010 78 2600 2608
40. A. Sandberg L. M. Luheshi S. Sollvander T. Pereira de Barros B. Macao T. P. Knowles H. Biverstal C. Lendel F. Ekholm-Petterson A. Dubnovitsky L. Lannfelt C. M. Dobson T. Hard Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 15595 15600
41. D. Lambracht-Washington R. N. Rosenberg Discov. Med. 2013 15 319 326
42. S. Vivekanandan J. R. Brender S. Y. Lee A. Ramamoorthy Biochem. Biophys. Res. Commun. 2011 411 312 316
43. S. Tomaselli V. Esposito P. Vangone N. A. van Nuland A. M. Bonvin R. Guerrini T. Tancredi P. A. Temussi D. Picone ChemBioChem 2006 7 257 267
44. M. K. Tiwari R. K. Singh R. Singh M. Jeya H. Zhao J. K. Lee J. Biol. Chem. 2012 287 19429 19439
45. B. R. Brooks C. L. Brooks III A. D. Mackerell Jr. L. Nilsson R. J. Petrella B. Roux Y. Won G. Archontis C. Bartels S. Boresch A. Caflisch L. Caves Q. Cui A. R. Dinner M. Feig S. Fischer J. Gao M. Hodoscek W. Im K. Kuczera T. Lazaridis J. Ma V. Ovchinnikov E. Paci R. W. Pastor C. B. Post J. Z. Pu M. Schaefer B. Tidor R. M. Venable H. L. Woodcock X. Wu W. Yang D. M. York M. Karplus J. Comput. Chem. 2009 30 1545 1614
46. Y. Yoshiike T. Akagi A. Takashima Biochemistry 2007 46 9805 9812
47. B. Moores E. Drolle S. J. Attwood J. Simons Z. Leonenko PLoS One 2011 6 e25954
48. J. Krishnamoorthy J. R. Brender S. Vivekanandan N. Jahr A. Ramamoorthy J. Phys. Chem. B 2012 116 13618 13623
49. S. M. Butterfield H. A. Lashuel Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 5628 5654
50. S. A. Kotler P. Walsh J. R. Brender A. Ramamoorthy Chem. Soc. Rev. 2014 43 6692 6700
51. M. F. M. Sciacca S. A. Kotler J. R. Brender J. Chen D. K. Lee A. Ramamoorthy Biophys. J. 2012 103 702 710
52. A. Rijal Upadhaya I. Kosterin S. Kumar C. A. von Arnim H. Yamaguchi M. Fandrich J. Walter D. R. Thal Brain 2014 137 887 903
53. A. Ramamoorthy M. H. Lim Biophys. J. 2013 105 287 288
54. S. Lee X. Y. Zheng J. Krishnamoorthy M. G. Savelieff H. M. Park J. R. Brender J. H. Kim J. S. Derrick A. Kochi H. J. Lee C. Kim A. Ramamoorthy M. T. Bowers M. H. Lim J. Am. Chem. Soc. 2014 136 299 310
55. Accelrys Inc., 2013
56. A. Sali T. L. Blundell J. Mol. Biol. 1993 234 779 815
57. R. Fraczkiewicz W. Braun J. Comput. Chem. 1998 19 319 333
58. C. Alland F. Moreews D. Boens M. Carpentier S. Chiusa M. Lonquety N. Renault Y. Wong H. Cantalloube J. Chomilier J. Hochez J. Pothier B. O. Villoutreix J. F. Zagury P. Tuffery Nucleic Acids Res. 2005 33 W44 W49
59. B. Neron H. Menager C. Maufrais N. Joly J. Maupetit S. Letort S. Carrere P. Tuffery C. Letondal Bioinformatics 2009 25 3005 3011
60. E. G. Hutchinson J. M. Thornton Protein Sci. 1996 5 212 220
61. C. Nilsberth A. Westlind-Danielsson C. B. Eckman M. M. Condron K. Axelman C. Forsell C. Stenh J. Luthman D. B. Teplow S. G. Younkin J. Naslund L. Lannfelt Nat. Neurosci. 2001 4 887 893
62. T. Jonsson J. K. Atwal S. Steinberg J. Snaedal P. V. Jonsson S. Bjornsson H. Stefansson P. Sulem D. Gudbjartsson J. Maloney K. Hoyte A. Gustafson Y. Liu Y. Lu T. Bhangale R. R. Graham J. Huttenlocher G. Bjornsdottir O. A. Andreassen E. G. Jonsson A. Palotie T. W. Behrens O. T. Magnusson A. Kong U. Thorsteinsdottir R. J. Watts K. Stefansson Nature 2012 488 96 99
63. G. Di Fede M. Catania M. Morbin G. Rossi S. Suardi G. Mazzoleni M. Merlin A. R. Giovagnoli S. Prioni A. Erbetta C. Falcone M. Gobbi L. Colombo A. Bastone M. Beeg C. Manzoni B. Francescucci A. Spagnoli L. Cantu E. Del Favero E. Levy M. Salmona F. Tagliavini Science 2009 323 1473 1477
64. K. Ono M. M. Condron D. B. Teplow J. Biol. Chem. 2010 285 23186 23197
65. Y. Hori T. Hashimoto Y. Wakutani K. Urakami K. Nakashima M. M. Condron S. Tsubuki T. C. Saido D. B. Teplow T. Iwatsubo J. Biol. Chem. 2007 282 4916 4923
66. W. T. Chen C. J. Hong Y. T. Lin W. H. Chang H. T. Huang J. Y. Liao Y. J. Chang Y. F. Hsieh C. Y. Cheng H. C. Liu Y. R. Chen I. H. Cheng PLoS One 2012 7 e35807
67. L. Zhou N. Brouwers I. Benilova A. Vandersteen M. Mercken K. Van Laere P. Van Damme D. Demedts F. Van Leuven K. Sleegers K. Broersen C. Van Broeckhoven R. Vandenberghe B. De Strooper EMBO Mol. Med. 2011 3 291 302
68. D. Kaden A. Harmeier C. Weise L. M. Munter V. Althoff B. R. Rost P. W. Hildebrand D. Schmitz M. Schaefer R. Lurz S. Skodda R. Yamamoto S. Arlt U. Finckh G. Multhaup EMBO Mol. Med. 2012 4 647 659
69. W. E. Van Nostrand J. P. Melchor H. S. Cho S. M. Greenberg G. W. Rebeck J. Biol. Chem. 2001 276 32860 32866
70. L. Miravalle T. Tokuda R. Chiarle G. Giaccone O. Bugiani F. Tagliavini B. Frangione J. Ghiso J. Biol. Chem. 2000 275 27110 27116
71. T. Tomiyama T. Nagata H. Shimada R. Teraoka A. Fukushima H. Kanemitsu H. Takuma R. Kuwano M. Imagawa S. Ataka Y. Wada E. Yoshioka T. Nishizaki Y. Watanabe H. Mori Ann. Neurol. 2008 63 377 387
72. L. Obici A. Demarchi G. de Rosa V. Bellotti S. Marciano S. Donadei E. Arbustini G. Palladini M. Diegoli E. Genovese G. Ferrari S. Coverlizza G. Merlini Ann. Neurol. 2005 58 639 644
73. D. A. Carter E. Desmarais M. Bellis D. Campion F. Clerget-Darpoux A. Brice Y. Agid A. Jaillard-Serradt J. Mallet Nat. Genet. 1992 2 255 256
74. C. T. Jones S. Morris C. M. Yates A. Moffoot C. Sharpe D. J. Brock D. St Clair Nat. Genet. 1992 1 306 309
75. Y. Tomidokoro A. Rostagno T. A. Neubert Y. Lu G. W. Rebeck B. Frangione S. M. Greenberg J. Ghiso Am. J. Pathol. 2010 176 1841 1854