SCOPUS 정보 검색 플랫폼

ACS Catalysis

Volumn 4, Issue 9, 2014, Pages 3201-3211

Engineering of flexible loops in enzymes

(2) Nestl, Bettina M a Hauer, Bernhard a

a UNIVERSITY OF STUTTGART (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84907713544 PISSN: 21555435 EISSN: None Source Type: Journal
DOI: 10.1021/cs500325p Document Type: Review

Times cited : (155)

References (53)

1
- 0036683309
- Todd, A. E.; Orengo, C. A.; Thornton, J. M. Trends Biochem. Sci. 2002, 27, 419-426
- (2002) Trends Biochem. Sci. , vol.27 , pp. 419-426
- Todd, A.E.¹ Orengo, C.A.² Thornton, J.M.³

2
- 84861166806
- Christov, C. Karabencheva-Christova, T. Academic Press: Waltham, MA
- Kokkinidis, M.; Glykos, N. M.; Fadouloglou, V. E. In Advances in Protein Chemistry and Structural Biology; Christov, C.; Karabencheva-Christova, T., Eds.; Academic Press: Waltham, MA, 2012; Vol. 87, pp 181-218.
- (2012) Advances in Protein Chemistry and Structural Biology , vol.87 , pp. 181-218
- Kokkinidis, M.¹ Glykos, N.M.² Fadouloglou, V.E.³

3
- 84861165933
- Furnham, N.; Sillitoe, I.; Holliday, G. L.; Cuff, A. L.; Laskowski, R. A.; Orengo, C. A.; Thornton, J. M. PLoS Comput. Biol. 2012, 8, e1002403
- (2012) PLoS Comput. Biol. , vol.8 , pp. 1002403
- Furnham, N.¹ Sillitoe, I.² Holliday, G.L.³ Cuff, A.L.⁴ Laskowski, R.A.⁵ Orengo, C.A.⁶ Thornton, J.M.⁷

4
- 33746325760
- Hammes-Schiffer, S.; Benkovic, S. J. Annu. Rev. Biochem. 2006, 75, 519-541
- (2006) Annu. Rev. Biochem. , vol.75 , pp. 519-541
- Hammes-Schiffer, S.¹ Benkovic, S.J.²

5
- 0035928796
- Osborne, M. J.; Schnell, J.; Benkovic, S. J.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Biochemistry 2001, 40, 9846-9859
- (2001) Biochemistry , vol.40 , pp. 9846-9859
- Osborne, M.J.¹ Schnell, J.² Benkovic, S.J.³ Dyson, H.J.⁴ Wright, P.E.⁵

6
- 79953823548
- Bhabha, G.; Lee, J.; Ekiert, D. C.; Gam, J.; Wilson, I. A.; Dyson, H. J.; Benkovic, S. J.; Wright, P. E. Science 2011, 332, 234-238
- (2011) Science , vol.332 , pp. 234-238
- Bhabha, G.¹ Lee, J.² Ekiert, D.C.³ Gam, J.⁴ Wilson, I.A.⁵ Dyson, H.J.⁶ Benkovic, S.J.⁷ Wright, P.E.⁸

7
- 0026757079
- Li, L.; Wright, P. E.; Benkovic, S. J.; Falzone, C. J. Biochemistry 1992, 34) 7826-7833
- (1992) Biochemistry , Issue.34 , pp. 7826-7833
- Li, L.¹ Wright, P.E.² Benkovic, S.J.³ Falzone, C.J.⁴

8
- 20244380954
- Venkitakrishnan, R. P.; Zaborowski, E.; McElheny, D.; Benkovic, S. J.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Biochemistry 2005, 44, 5948-5948
- (2005) Biochemistry , vol.44 , pp. 5948-5948
- Venkitakrishnan, R.P.¹ Zaborowski, E.² McElheny, D.³ Benkovic, S.J.⁴ Dyson, H.J.⁵ Wright, P.E.⁶

9
- 84883681327
- Chen, S.; Fahmi, N. E.; Wang, L.; Bhattacharya, C.; Benkovic, S. J.; Hecht, S. M. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 12924-12927
- (2013) J. Am. Chem. Soc. , vol.135 , pp. 12924-12927
- Chen, S.¹ Fahmi, N.E.² Wang, L.³ Bhattacharya, C.⁴ Benkovic, S.J.⁵ Hecht, S.M.⁶

10
- 84894148788
- Singh, P.; Sen, A.; Francis, K.; Kohen, A. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 2575-2582
- (2014) J. Am. Chem. Soc. , vol.136 , pp. 2575-2582
- Singh, P.¹ Sen, A.² Francis, K.³ Kohen, A.⁴

11
- 84902258731
- Wang, Z.; Singh, P.; Czekster, C. M.; Kohen, A.; Schramm, V. L. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 8333-8341
- (2014) J. Am. Chem. Soc. , vol.136 , pp. 8333-8341
- Wang, Z.¹ Singh, P.² Czekster, C.M.³ Kohen, A.⁴ Schramm, V.L.⁵

12
- 0028049327
- Falzone, C. J.; Wright, P. E.; Benkovic, S. J. Biochemistry 1994, 33, 439-442
- (1994) Biochemistry , vol.33 , pp. 439-442
- Falzone, C.J.¹ Wright, P.E.² Benkovic, S.J.³

13
- 0029102089
- Epstein, D. M.; Benkovic, S. J.; Wright, P. E. Biochemistry 1995, 34, 11037-11048
- (1995) Biochemistry , vol.34 , pp. 11037-11048
- Epstein, D.M.¹ Benkovic, S.J.² Wright, P.E.³

14
- 84880055385
- Boehr, D. D.; Schnell, J. R.; McElheny, D.; Bae, S.-H.; Duggan, B. M.; Benkovic, S. J.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Biochemistry 2013, 52, 4605-4619
- (2013) Biochemistry , vol.52 , pp. 4605-4619
- Boehr, D.D.¹ Schnell, J.R.² McElheny, D.³ Bae, S.-H.⁴ Duggan, B.M.⁵ Benkovic, S.J.⁶ Dyson, H.J.⁷ Wright, P.E.⁸

15
- 33750441144
- Wang, L.; Goodey, N. M.; Benkovic, S. J.; Kohen, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 15753-15758
- (2006) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.103 , pp. 15753-15758
- Wang, L.¹ Goodey, N.M.² Benkovic, S.J.³ Kohen, A.⁴

16
- 80052149070
- Adamczyk, A. J.; Cao, J.; Kamerlin, S. C. L.; Warshel, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 14115-14120
- (2011) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.108 , pp. 14115-14120
- Adamczyk, A.J.¹ Cao, J.² Kamerlin, S.C.L.³ Warshel, A.⁴

17
- 84860196682
- Chesters, C.; Wilding, M.; Goodall, M.; Micklefield, J. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 4344-4348
- (2012) Angew. Chem., Int. Ed. , vol.51 , pp. 4344-4348
- Chesters, C.¹ Wilding, M.² Goodall, M.³ Micklefield, J.⁴

18
- 80054998427
- Du, J.; Say, R. F.; Lu, W.; Fuchs, G.; Einsle, O. Nature 2011, 478, 534-537
- (2011) Nature , vol.478 , pp. 534-537
- Du, J.¹ Say, R.F.² Lu, W.³ Fuchs, G.⁴ Einsle, O.⁵

19
- 80055018027
- Fushinobu, S.; Nishimasu, H.; Hattori, D.; Song, H.-J.; Wakagi, T. Nature 2011, 478, 538-541
- (2011) Nature , vol.478 , pp. 538-541
- Fushinobu, S.¹ Nishimasu, H.² Hattori, D.³ Song, H.-J.⁴ Wakagi, T.⁵

20
- 13944277320
- Yuan, Z.; Bailey, T. L.; Teasdale, R. D. Proteins Struct. Funct. Bioinf. 2005, 58, 905-912
- (2005) Proteins Struct. Funct. Bioinf. , vol.58 , pp. 905-912
- Yuan, Z.¹ Bailey, T.L.² Teasdale, R.D.³

21
- 84860688588
- Zimmermann, M. T.; Jernigan, R. L. Entropy 2012, 14, 687-700
- (2012) Entropy , vol.14 , pp. 687-700
- Zimmermann, M.T.¹ Jernigan, R.L.²

22
- 9944237833
- Grunberg, R.; Leckner, J.; Nilges, M. Structure 2004, 12, 2125-2136
- (2004) Structure , vol.12 , pp. 2125-2136
- Grunberg, R.¹ Leckner, J.² Nilges, M.³

23
- 73349117207
- Wlodarski, T.; Zagrovic, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 19346-19351
- (2009) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.106 , pp. 19346-19351
- Wlodarski, T.¹ Zagrovic, B.²

24
- 84902132307
- Alvarez-Garcia, D.; Barril, X. J. Chem. Theory Comput. 2014, 10, 2608-2614
- (2014) J. Chem. Theory Comput. , vol.10 , pp. 2608-2614
- Alvarez-Garcia, D.¹ Barril, X.²

25
- 64849101493
- Tokuriki, N.; Tawfik, D. S. Science 2009, 324, 203-207
- (2009) Science , vol.324 , pp. 203-207
- Tokuriki, N.¹ Tawfik, D.S.²

26
- 0043237705
- Gunasekaran, K.; Ma, B.; Nussinov, R. J. Mol. Biol. 2003, 332, 143-159
- (2003) J. Mol. Biol. , vol.332 , pp. 143-159
- Gunasekaran, K.¹ Ma, B.² Nussinov, R.³

27
- 0028242876
- Pries, F.; van den Wijngaard, A. J.; Bos, R.; Pentenga, M.; Janssen, D. B. J. Biol. Chem. 1994, 269, 17490-4
- (1994) J. Biol. Chem. , vol.269 , pp. 17490-17494
- Pries, F.¹ Van Den Wijngaard, A.J.² Bos, R.³ Pentenga, M.⁴ Janssen, D.B.⁵

28
- 84860115640
- Althoff, E. A.; Wang, L.; Jiang, L.; Giger, L.; Lassila, J. K.; Wang, Z.; Smith, M.; Hari, S.; Kast, P.; Herschlag, D.; Hilvert, D.; Baker, D. Protein Sci. 2012, 21, 717-726
- (2012) Protein Sci. , vol.21 , pp. 717-726
- Althoff, E.A.¹ Wang, L.² Jiang, L.³ Giger, L.⁴ Lassila, J.K.⁵ Wang, Z.⁶ Smith, M.⁷ Hari, S.⁸ Kast, P.⁹ Herschlag, D.¹⁰ Hilvert, D.¹¹ Baker, D.¹²

29
- 84855858058
- Wang, L.; Althoff, E. A.; Bolduc, J.; Jiang, L.; Moody, J.; Lassila, J. K.; Giger, L.; Hilvert, D.; Stoddard, B.; Baker, D. J. Mol. Biol. 2012, 415, 615-625
- (2012) J. Mol. Biol. , vol.415 , pp. 615-625
- Wang, L.¹ Althoff, E.A.² Bolduc, J.³ Jiang, L.⁴ Moody, J.⁵ Lassila, J.K.⁶ Giger, L.⁷ Hilvert, D.⁸ Stoddard, B.⁹ Baker, D.¹⁰

30
- 84880920662
- Giger, L.; Caner, S.; Obexer, R.; Kast, P.; Baker, D.; Ban, N.; Hilvert, D. Nature Chem. Biol. 2013, 9, 494-498
- (2013) Nature Chem. Biol. , vol.9 , pp. 494-498
- Giger, L.¹ Caner, S.² Obexer, R.³ Kast, P.⁴ Baker, D.⁵ Ban, N.⁶ Hilvert, D.⁷

31
- 67249107701
- Murphy, P. M.; Bolduc, J. M.; Gallaher, J. L.; Stoddard, B. L.; Baker, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 9215-9220
- (2009) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.106 , pp. 9215-9220
- Murphy, P.M.¹ Bolduc, J.M.² Gallaher, J.L.³ Stoddard, B.L.⁴ Baker, D.⁵

32
- 84856723541
- Eiben, C. B.; Siegel, J. B.; Bale, J. B.; Cooper, S.; Khatib, F.; Shen, B. W.; Players, F.; Stoddard, B. L.; Popovic, Z.; Baker, D. Nat. Biotechnol. 2012, 30, 190-192
- (2012) Nat. Biotechnol. , vol.30 , pp. 190-192
- Eiben, C.B.¹ Siegel, J.B.² Bale, J.B.³ Cooper, S.⁴ Khatib, F.⁵ Shen, B.W.⁶ Players, F.⁷ Stoddard, B.L.⁸ Popovic, Z.⁹ Baker, D.¹⁰

33
- 62649156400
- Ochoa-Leyva, A.; Soberon, X.; Sanchez, F.; Argaello, M.; Montero-Moran, G.; Saab-Rincon, G. J. Mol. Biol. 2009, 387, 949-964
- (2009) J. Mol. Biol. , vol.387 , pp. 949-964
- Ochoa-Leyva, A.¹ Soberon, X.² Sanchez, F.³ Argaello, M.⁴ Montero-Moran, G.⁵ Saab-Rincon, G.⁶

34
- 79960696816
- Ochoa-Leyva, A.; Barona-Gomez, F.; Saab-Rincon, G.; Verdel-Aranda, K.; Sanchez, F.; Soberon, X. J. Mol. Biol. 2011, 411, 143-157
- (2011) J. Mol. Biol. , vol.411 , pp. 143-157
- Ochoa-Leyva, A.¹ Barona-Gomez, F.² Saab-Rincon, G.³ Verdel-Aranda, K.⁴ Sanchez, F.⁵ Soberon, X.⁶

35
- 81055145266
- De Luca, F.; Benvenuti, M.; Carboni, F.; Pozzi, C.; Rossolini, G. M.; Mangani, S.; Docquier, J.-D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 108, 18424-18429
- (2013) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.108 , pp. 18424-18429
- De Luca, F.¹ Benvenuti, M.² Carboni, F.³ Pozzi, C.⁴ Rossolini, G.M.⁵ Mangani, S.⁶ Docquier, J.-D.⁷

36
- 31544477181
- Park, H.-S.; Nam, S.-H.; Lee, J. K.; Yoon, C. N.; Mannervik, B.; Benkovic, S. J.; Kim, H.-S. Science 2006, 311, 535-538
- (2006) Science , vol.311 , pp. 535-538
- Park, H.-S.¹ Nam, S.-H.² Lee, J.K.³ Yoon, C.N.⁴ Mannervik, B.⁵ Benkovic, S.J.⁶ Kim, H.-S.⁷

37
- 84859833076
- Guntas, G.; Kanwar, M.; Ostermeier, M. PLoS One 2012, 7, e35998
- (2012) PLoS One , vol.7 , pp. 35998
- Guntas, G.¹ Kanwar, M.² Ostermeier, M.³

38
- 79955164750
- Bastian, S.; Liu, X.; Meyerowitz, J. T.; Snow, C. D.; Chen, M. M. Y.; Arnold, F. H. Metab. Eng. 2011, 13, 345-352
- (2011) Metab. Eng. , vol.13 , pp. 345-352
- Bastian, S.¹ Liu, X.² Meyerowitz, J.T.³ Snow, C.D.⁴ Chen, M.M.Y.⁵ Arnold, F.H.⁶

39
- 84879706316
- Brinkman-Chen, S.; Flock, T.; Cahn, J. K. B.; Snow, C. D.; Brustad, E. M.; McIntosh, J. A.; Meinhold, P.; Zhang, L.; Arnold, F. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 10946-10951
- (2013) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.110 , pp. 10946-10951
- Brinkman-Chen, S.¹ Flock, T.² Cahn, J.K.B.³ Snow, C.D.⁴ Brustad, E.M.⁵ McIntosh, J.A.⁶ Meinhold, P.⁷ Zhang, L.⁸ Arnold, F.H.⁹

40
- 0037470646
- Wintrode, P. L.; Zhang, D.; Vaidehi, N.; Arnold, F. H.; Goddard, W. A., III J. Mol. Biol. 2003, 327, 745-757
- (2003) J. Mol. Biol. , vol.327 , pp. 745-757
- Wintrode, P.L.¹ Zhang, D.² Vaidehi, N.³ Arnold, F.H.⁴ Goddard, W.A.⁵

41
- 0035098779
- Vieille, C.; Zeikus, G. J. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2001, 65, 1-43
- (2001) Microbiol. Mol. Biol. Rev. , vol.65 , pp. 1-43
- Vieille, C.¹ Zeikus, G.J.²

42
- 18044369861
- Eijsink, V. G. H.; Gaseidnes, S.; Borchert, T. V.; van den Burg, B. Biomol. Eng. 2005, 22, 21-30
- (2005) Biomol. Eng. , vol.22 , pp. 21-30
- Eijsink, V.G.H.¹ Gaseidnes, S.² Borchert, T.V.³ Van Den Burg, B.⁴

43
- 0035712796
- Farinas, E. T.; Bulter, T.; Arnold, F. H. Curr. Opin. Biotechnol. 2001, 12, 545-551
- (2001) Curr. Opin. Biotechnol. , vol.12 , pp. 545-551
- Farinas, E.T.¹ Bulter, T.² Arnold, F.H.³

44
- 1842835981
- Bloom, J. D.; Wilke, C. O.; Arnold, F. H.; Adami, C. Biophys. J. 2004, 86, 2758-2764
- (2004) Biophys. J. , vol.86 , pp. 2758-2764
- Bloom, J.D.¹ Wilke, C.O.² Arnold, F.H.³ Adami, C.⁴

45
- 34047128801
- Polizzi, K. M.; Bommarius, A. S.; Broering, J. M.; Chaparro-Riggers, J. F. Curr. Opin. Chem. Biol. 2007, 11, 220-225
- (2007) Curr. Opin. Chem. Biol. , vol.11 , pp. 220-225
- Polizzi, K.M.¹ Bommarius, A.S.² Broering, J.M.³ Chaparro-Riggers, J.F.⁴

46
- 0032973026
- Zhao, H.; Arnold, F. H. Protein Eng. 1999, 12, 47-53
- (1999) Protein Eng. , vol.12 , pp. 47-53
- Zhao, H.¹ Arnold, F.H.²

47
- 0030623398
- Nagi, A. D.; Regan, L. Folding Des. 1997, 2, 67-75
- (1997) Folding Des. , vol.2 , pp. 67-75
- Nagi, A.D.¹ Regan, L.²

48
- 53049086149
- Dumon, C.; Varvak, A.; Wall, M. A.; Flint, J. E.; Lewis, R. J.; Lakey, J. H.; Morland, C.; Luginbuahl, P.; Healey, S.; Todaro, T.; DeSantis, G.; Sun, M.; Parra-Gessert, L.; Tan, X.; Weiner, D. P.; Gilbert, H. J. J. Biol. Chem. 2008, 283, 22557-22564
- (2008) J. Biol. Chem. , vol.283 , pp. 22557-22564
- Dumon, C.¹ Varvak, A.² Wall, M.A.³ Flint, J.E.⁴ Lewis, R.J.⁵ Lakey, J.H.⁶ Morland, C.⁷ Luginbuhl, P.⁸ Healey, S.⁹ Todaro, T.¹⁰ Desantis, G.¹¹ Sun, M.¹² Parra-Gessert, L.¹³ Tan, X.¹⁴ Weiner, D.P.¹⁵ Gilbert, H.J.¹⁶

49
- 84894231107
- Damnjanovic, J.; Nakano, H.; Iwasaki, Y. Biotechnol. Bioeng. 2013, 111, 674-682
- (2013) Biotechnol. Bioeng. , vol.111 , pp. 674-682
- Damnjanovic, J.¹ Nakano, H.² Iwasaki, Y.³

50
- 84863643229
- Damnjanovic, J.; Takahashi, R.; Suzuki, A.; Nakano, H.; Iwasaki, Y. Protein Eng. Des. Sel. 2012, 25, 415-424
- (2012) Protein Eng. Des. Sel. , vol.25 , pp. 415-424
- Damnjanovic, J.¹ Takahashi, R.² Suzuki, A.³ Nakano, H.⁴ Iwasaki, Y.⁵

51
- 84894958761
- Reich, S.; Kress, N.; Nestl, B. M.; Hauer, B. J. Struct. Biol. 2013, 185, 228-233
- (2013) J. Struct. Biol. , vol.185 , pp. 228-233
- Reich, S.¹ Kress, N.² Nestl, B.M.³ Hauer, B.⁴

52
- 33845288649
- Reetz, M. T.; Carballeira, J. D.; Vogel, A. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 7745-7751
- (2006) Angew. Chem., Int. Ed. , vol.45 , pp. 7745-7751
- Reetz, M.T.¹ Carballeira, J.D.² Vogel, A.³

53
- 0032176603
- Gerlt, J. A.; Babbitt, P. C. Curr. Opin. Chem. Biol. 1998, 2, 607-612
- (1998) Curr. Opin. Chem. Biol. , vol.2 , pp. 607
- Gerlt, J.A.¹ Babbitt, P.C.²

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.