Oligosaccharide analysis by mass spectrometry: A review of recent developments

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 1, 2014, Pages 196-212

  Kailemia, Muchena J ^a   Ruhaak, L Renee ^b   Lebrilla, Carlito B ^b   Amster, I Jonathan ^a  

^a UNIVERSITY OF GEORGIA   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

OLIGOSACCHARIDE;

ANIMAL; CHEMISTRY; HUMAN; MASS SPECTROMETRY; METHODOLOGY; REVIEW;

ANIMALS; HUMANS; MASS SPECTROMETRY; OLIGOSACCHARIDES; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION;

EID: 84891761089     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac403969n     Document Type: Review

References (198)

1. Hillenkamp, F.; Karas, M.; Beavis, R. C.; Chait, B. T. Anal. Chem. 1991, 63, 1193A-1203A
2. Tanaka, K.; Waki, H.; Ido, Y.; Akita, S.; Yoshida, Y.; Yoshida, T.; Matsuo, T. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1988, 2, 151-153
3. Fenn, J.; Mann, M.; Meng, C.; Wong, S.; Whitehouse, C. Science 1989, 246, 64-71
4. Harvey, D. J. J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2011, 879, 1196-1225
5. Zhou, W.; Hakansson, K. Curr. Proteomics 2011, 8, 297-308
6. Zaia, J. OMICS 2010, 14, 401-418
7. Zaia, J. Mass Spectrom. Rev. 2004, 23, 161-227
8. Wuhrer, M. Glycoconjugate J. 2013, 30, 11-22
9. Park, Y.; Lebrilla, C. B. Mass Spectrom. Rev. 2005, 24, 232-264
10. Harvey, D. J. Proteomics 2005, 5, 1774-1786
11. Harvey, D. J. Proteomics 2001, 1, 311-328
12. Harvey, D. J. Mass Spectrom. Rev. 1999, 18, 349-450
13. Domann, P.; Spencer, D. I. R.; Harvey, D. J. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2012, 26, 469-479
14. Rodrigues, J. A.; Taylor, A. M.; Sumpton, D. P.; Reynolds, J. C.; Pickford, R.; Thomas-Oates, J. In Advances in Carbohydrate Chemistry and Biochemistry, Vol. 61; Horton, D., Ed.; Elsevier: Amsterdam, The Netherlands, 2008; pp 59-141.
15. Wu, C. L.; Wang, C. C.; Lai, Y. H.; Lee, H.; Lin, J. D.; Lee, Y. T.; Wang, Y. S. Anal. Chem. 2013, 85, 3836-3841
16. Kaneshiro, K.; Fukuyama, Y.; Iwamoto, S.; Sekiya, S.; Tanaka, K. Anal. Chem. 2011, 83, 3663-3667
17. Nishikaze, T.; Kaneshiro, K.; Kawabata, S.-i.; Tanaka, K. Anal. Chem. 2012, 84, 9453-9461
18. Nishikaze, T.; Fukuyama, Y.; Kawabata, S.-i.; Tanaka, K. Anal. Chem. 2012, 84, 6097-6103
19. Liang, C.-W.; Chang, P.-J.; Lin, Y.-J.; Lee, Y.-T.; Ni, C.-K. Anal. Chem. 2012, 84, 3493-3499
20. Karas, M.; Bahr, U.; Dülcks, T. Fresenius J. Anal. Chem. 2000, 366, 669-676
21. Yang, B.; Solakyildirim, K.; Chang, Y.; Linhardt, R. J. Anal. Bioanal. Chem. 2011, 399, 541-557
22. Fabrik, I.; Cmelik, R.; Bobalova, J. Int. J. Mass Spectrom. 2012, 309, 88-96
23. Ruhaak, L. R.; Zauner, G.; Huhn, C.; Bruggink, C.; Deelder, A. M.; Wuhrer, M. Anal. Bioanal. Chem. 2010, 397, 3457-3481
24. Walker, S. H.; Lilley, L. M.; Enamorado, M. F.; Comins, D. L.; Muddiman, D. C. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 1309-1317
25. Heiss, C.; Wang, Z.; Azadi, P. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2011, 25, 774-778
26. Chang, Y.-L.; Lee, Y.-C.; Yang, W.-B.; Chen, C.-H. J. Mass Spectrom. 2011, 46, 367-375
27. Zaia, J. Chem. Biol. 2008, 15, 881-892
28. An, H. J.; Lebrilla, C. B. Mass Spectrom. Rev. 2011, 30, 560-578
29. Khoo, K.-H.; Yu, S.-Y. In Glycomics; Methods in Enzymology, Vol. 478; Fukuda, M., Ed.; Elsevier: Amsterdam, The Netherlands, 2010; pp 3-26.
30. Jiao, J.; Zhang, H.; Reinhold, V. N. Int. J. Mass Spectrom. 2011, 303, 109-117
31. Reinhold, V.; Zhang, H.; Hanneman, A.; Ashline, D. Mol. Cell. Proteomics 2013, 12, 866-873
32. Cody, R.; Burnier, R.; Freiser, B. Anal. Chem. 1982, 54, 96-101
33. Little, D. P.; Speir, J. P.; Senko, M. W.; O'Connor, P. B.; McLafferty, F. W. Anal. Chem. 1994, 66, 2809-2815
34. Zubarev, R. A.; Kelleher, N. L.; McLafferty, F. W. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 3265-3266
35. Budnik, B. A.; Haselmann, K. F.; Zubarev, R. A. Chem. Phys. Lett. 2001, 342, 299-302
36. Syka, J. E. P.; Coon, J. J.; Schroeder, M. J.; Shabanowitz, J.; Hunt, D. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 9528-9533
37. Herron, W. J.; Goeringer, D. E.; McLuckey, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 11555-11562
38. Zaia, J.; Miller, M. J. C.; Seymour, J. L.; Costello, C. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 952-960
39. Zaia, J.; Costello, C. E. Anal. Chem. 2003, 75, 2445-2455
40. Kailemia, M. J.; Li, L.; Ly, M.; Linhardt, R. J.; Amster, I. J. Anal. Chem. 2012, 84, 5475-5478
41. Xie, Y.; Lebrilla, C. B. Anal. Chem. 2003, 75, 1590-1598
42. Wuhrer, M.; Deelder, A. M.; van der Burgt, Y. E. M. Mass Spectrom. Rev. 2011, 30, 664-680
43. Lee, H.; An, H. J.; Lerno, L. A., Jr.; German, J. B.; Lebrilla, C. B. Int. J. Mass Spectrom. 2011, 305, 138-150
44. McFarland, M.; Marshall, A.; Hendrickson, C.; Nilsson, C.; Fredman, P.; MaÌŠnsson, J.-E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005, 16, 752-762
45. Harvey, D. J.; Rudd, P. M. Int. J. Mass Spectrom. 2011, 305, 120-130
46. Rohmer, M.; Baeumlisberger, D.; Stahl, B.; Bahr, U.; Karas, M. Int. J. Mass Spectrom. 2011, 305, 199-208
47. Chai, W.; Lawson, A.; Piskarev, V. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2002, 13, 670-679
48. Harvey, D. J.; Bateman, R. H.; Green, M. R. J. Mass Spectrom. 1997, 32, 167-187
49. Chai, W.; Piskarev, V.; Lawson, A. M. Anal. Chem. 2001, 73, 651-657
50. Yoo, H. J.; Wang, N.; Zhuang, S.; Song, H.; HaÌŠkansson, K. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 16790-16793
51. Wolff, J. J.; Amster, I. J.; Chi, L.; Linhardt, R. J. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 234-244
52. Wolff, J. J.; Leach, F. E.; Laremore, T. N.; Kaplan, D. A.; Easterling, M. L.; Linhardt, R. J.; Amster, I. J. Anal. Chem. 2010, 82, 3460-3466
53. Wolff, J. J.; Chi, L.; Linhardt, R. J.; Amster, I. J. Anal. Chem. 2007, 79, 2015-2022
54. Wolff, J. J.; Laremore, T. N.; Busch, A. M.; Linhardt, R. J.; Amster, I. J. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008, 19, 790-798
55. Adamson, J. T.; HaÌŠkansson, K. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 2162-2172
56. Kornacki, J. R.; Adamson, J. T.; HaÌŠkansson, K. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2012, 23, 2031-2042
57. Han, L.; Costello, C. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 997-1013
58. Zhao, P.; Viner, R.; Teo, C. F.; Boons, G.-J.; Horn, D.; Wells, L. J. Proteome Res. 2011, 10, 4088-4104
59. Hersberger, K. E.; HaÌŠkansson, K. Anal. Chem. 2012, 84, 6370-6377
60. Domon, B.; Costello, C. E. Glycoconjugate J. 1988, 5, 397-409
61. Sekiya, S.; Iida, T. Trends Glycosci. Glycotechnol. 2008, 20, 51-65
62. Han, L.; Costello, C. Biochemistry Moscow 2013, 78, 710-720
63. Laremore, T. N.; Leach, F. E., III; Solakyildirim, K.; Amster, I. J.; Linhardt, R. J. In Glycomics; Methods in Enzymology, Vol. 478; Fukuda, M., Ed.; Elsevier: Amsterdam, The Netherlands, 2010; pp 79-108.
64. Wuhrer, M.; Catalina, M. I.; Deelder, A. M.; Hokke, C. H. J. Chromatogr., B 2007, 849, 115-128
65. Vékey, K.; Ozohanics, O.; Tóth, E.; Jeko, A.; Révész, á.; Krenyácz, J.; Drahos, L. Int. J. Mass Spectrom. 2013, 345-347, 71-79
66. Jensen, P. H.; Karlsson, N. G.; Kolarich, D.; Packer, N. H. Nat. Protoc. 2012, 7, 1299-1310
67. Bird, B.; Romeo, M. J.; Diem, M.; Bedrossian, K.; Laver, N.; Naber, S. Vib. Spectrosc 2008, 48, 101-106
68. Ly, M.; Leach, F. E., III; Laremore, T. N.; Toida, T.; Amster, I. J.; Linhardt, R. J. Nat. Chem. Biol. 2011, 7, 827-833
69. Laremore, T. N.; Leach, F. E., 3rd; Amster, I. J.; Linhardt, R. J. Int. J. Mass Spectrom. 2011, 305, 109-115
70. Chi, L.; Wolff, J. J.; Laremore, T. N.; Restaino, O. F.; Xie, J.; Schiraldi, C.; Toida, T.; Amster, I. J.; Linhardt, R. J. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 2617-2625
71. McClellan, J. E.; Costello, C. E.; O'Connor, P. B.; Zaia, J. Anal. Chem. 2002, 74, 3760-3771
72. Oh, H.; Leach, F., III; Arungundram, S.; Al-Mafraji, K.; Venot, A.; Boons, G.-J.; Amster, I. J. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 582-590
73. Zaia, J.; Li, X.; Chan, S.; Costello, C. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2003, 14, 1270-1281
74. Bielik, A. M.; Zaia, J. Int. J. Mass Spectrom. 2011, 305, 131-137
75. Leach, F., III; Ly, M.; Laremore, T.; Wolff, J.; Perlow, J.; Linhardt, R.; Amster, I. J. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2012, 23, 1488-1497
76. Jones, C. J.; Beni, S.; Limtiaco, J. F. K.; Langeslay, D. J.; Larive, C. K. Annu. Rev. Anal. Chem. 2011, 4, 439-465
77. Kailemia, M. J.; Li, L.; Xu, Y.; Liu, J.; Linhardt, R. J.; Amster, I. J. Mol. Cell. Proteomics 2013, 12, 979-990
78. Liu, H.; Hakansson, K. Int. J. Mass Spectrom. 2011, 305, 170-177
79. Devakumar, A.; Thompson, M. S.; Reilly, J. P. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2005, 19, 2313-2320
80. Ko, B. J.; Brodbelt, J. S. Anal. Chem. 2011, 83, 8192-8200
81. Harvey, D. J.; Scarff, C. A.; Crispin, M.; Scanlan, C. N.; Bonomelli, C.; Scrivens, J. H. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2012, 23, 1955-1966
82. Leach, F. E., III; Wolff, J. J.; Laremore, T. N.; Linhardt, R. J.; Amster, I. J. Int. J. Mass Spectrom. 2008, 276, 110-115
83. Yu, X.; Huang, Y.; Lin, C.; Costello, C. E. Anal. Chem. 2012, 84, 7487-7494
84. Zhang, H.; Zhang, S.; Tao, G.; Zhang, Y.; Mulloy, B.; Zhan, X.; Chai, W. Anal. Chem. 2013, 85, 5940-5949
85. Wu, S.; Grimm, R.; German, J. B.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2011, 10, 856-868
86. Fukui, K.; Takahashi, K. Anal. Chem. 2012, 84, 2188-2194
87. Hogan, J. M.; Pitteri, S. J.; Chrisman, P. A.; McLuckey, S. A. J. Proteome Res. 2005, 4, 628-632
88. Dube, D. H.; Bertozzi, C. R. Nat. Rev. Drug Discovery 2005, 4, 477-488
89. Ohtsubo, K.; Marth, J. D. Cell 2006, 126, 855-867
90. Nairn, A. V.; York, W. S.; Harris, K.; Hall, E. M.; Pierce, J. M.; Moremen, K. W. J. Biol. Chem. 2008, 283, 17298-17313
91. Prescher, J. A.; Bertozzi, C. R. Cell 2006, 126, 851-854
92. Orlando, R. Methods Mol. Biol. 2013, 951, 197-215
93. De Leoz, M. L. A.; Wu, S.; Strum, J. S.; Niñonuevo, M. R.; Gaerlan, S. C.; Mirmiran, M.; German, J. B.; Mills, D. A.; Lebrilla, C. B.; Underwood, M. A. Anal. Bioanal. Chem. 2013, 405, 4089-4105
94. Bao, Y.; Chen, C.; Newburg, D. S. Anal. Biochem. 2013, 433, 28-35
95. Auray-Blais, C.; Bherer, P.; Gagnon, R.; Young, S. P.; Zhang, H. H.; An, Y.; Clarke, J. T. R.; Millington, D. S. Mol. Genet. Metab. 2011, 102, 49-56
96. Hua, S.; An, H. J.; Ozcan, S.; Ro, G. S.; Soares, S.; DeVere-White, R.; Lebrilla, C. B. Analyst 2011, 136, 3663-3671
97. Kang, P.; Mechref, Y.; Kyselova, Z.; Goetz, J. A.; Novotny, M. V. Anal. Chem. 2007, 79, 6064-6073
98. Ma, H.; Miao, X.; Ma, Q.; Zheng, W.; Zhou, H.; Jia, L. IUBMB Life 2013, 65, 409-422
99. Alvarez-Manilla, G.; Warren, N. L.; Abney, T.; Atwood, J.; Azadi, P.; York, W. S.; Pierce, M.; Orlando, R. Glycobiology 2007, 17, 677-687
100. Atwood, J. A.; Cheng, L.; Alvarez-Manilla, G.; Warren, N. L.; York, W. S.; Orlando, R. J. Proteome Res. 2007, 7, 367-374
101. Ninonuevo, M. R.; Ward, R. E.; LoCascio, R. G.; German, J. B.; Freeman, S. L.; Barboza, M.; Mills, D. A.; Lebrilla, C. B. Anal. Biochem. 2007, 361, 15-23
102. Bowman, M. J.; Zaia, J. Anal. Chem. 2010, 82, 3023-3031
103. Hahne, H.; Neubert, P.; Kuhn, K.; Etienne, C.; Bomgarden, R.; Rogers, J. C.; Kuster, B. Anal. Chem. 2012, 84, 3716-3724
104. Orlando, R.; Lim, J.-M.; Atwood, J. A.; Angel, P. M.; Fang, M.; Aoki, K.; Alvarez-Manilla, G.; Moremen, K. W.; York, W. S.; Tiemeyer, M.; Pierce, M.; Dalton, S.; Wells, L. J. Proteome Res. 2009, 8, 3816-3823
105. Kitteringham, N. R.; Jenkins, R. E.; Lane, C. S.; Elliott, V. L.; Park, B. K. J. Chromatogr., B 2009, 877, 1229-1239
106. Wolf-Yadlin, A.; Hautaniemi, S.; Lauffenburger, D. A.; White, F. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 5860-5865
107. Toyama, A.; Nakagawa, H.; Matsuda, K.; Sato, T.-A.; Nakamura, Y.; Ueda, K. Anal. Chem. 2012, 84, 9655-9662
108. Zhao, Y.; Jia, W.; Wang, J.; Ying, W.; Zhang, Y.; Qian, X. Anal. Chem. 2011, 83, 8802-8809
109. Song, E.; Pyreddy, S.; Mechref, Y. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2012, 26, 1941-1954
110. Higel, F.; Demelbauer, U.; Seidl, A.; Friess, W.; Soergel, F. Anal. Bioanal. Chem. 2013, 405, 2481-2493
111. Huang, R.; Pomin, V. H.; Sharp, J. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 1577-1587
112. Huang, Y.; Mao, Y.; Shao, C.; Zaia, J. Glycobiology 2012, 22, 1609-1609
113. Galeotti, F.; Volpi, N. Anal. Chem. 2011, 83, 6770-6777
114. Yang, B.; Chang, Y.; Weyers, A. M.; Sterner, E.; Linhardt, R. J. J. Chromatogr. 2012, 1225, 91-98
115. Langeslay, D. J.; Urso, E.; Gardini, C.; Naggi, A.; Torri, G.; Larive, C. K. J. Chromatogr., A 2013, 1292, 201-10
116. Yang, B.; Weyers, A.; Baik, J. Y.; Sterner, E.; Sharfstein, S.; Mousa, S. A.; Zhang, F.; Dordick, J. S.; Linhardt, R. J. Anal. Biochem. 2011, 415, 59-66
117. Wang, B.; Buhse, L. F.; Al-Hakim, A.; Boyne, M. T., II; Keire, D. A. J. Pharm. Biomed. Anal. 2012, 67-68, 42-50
118. Jones, C. J.; Beni, S.; Larive, C. K. Anal. Chem. 2011, 83, 6762-6769
119. Fenner, A. M.; Kerns, R. J. Carbohydr. Res. 2011, 346, 2792-2800
120. Xue, B.; Alves, S.; Desbans, C.; Souchaud, M.; Filali-Ansary, A.; Soubayrol, P.; Tabet, J.-C. J. Mass Spectrom. 2011, 46, 689-695
121. Alekseeva, A.; Casu, B.; Torri, G.; Pierro, S.; Naggi, A. Anal. Biochem. 2013, 434, 112-122
122. Zauner, G.; Deelder, A. M.; Wuhrer, M. Electrophoresis 2011, 32, 3456-3466
123. Fong, B.; Ma, K.; McJarrow, P. J. Agric. Food Chem. 2011, 59, 9788-9795
124. Marino, K.; Lane, J. A.; Abrahams, J. L.; Struwe, W. B.; Harvey, D. J.; Marotta, M.; Hickey, R. M.; Rudd, P. M. Glycobiology 2011, 21, 1317-1330
125. Hernandez-Hernandez, O.; Montanes, F.; Clemente, A.; Javier Moreno, F.; Luz Sanz, M. J. Chromatogr. 2011, 1218, 7691-7696
126. Hernandez-Hernandez, O.; Calvillo, I.; Lebron-Aguilar, R.; Moreno, F. J.; Sanz, M. L. J. Chromatogr. 2012, 1220, 57-67
127. Leijdekkers, A. G. M.; Sanders, M. G.; Schols, H. A.; Gruppen, H. J. Chromatogr. 2011, 1218, 9227-9235
128. Gilar, M.; Yu, Y. Q.; Ahn, J.; Xie, H.; Han, H.; Ying, W.; Qian, X. Anal. Biochem. 2011, 417, 80-88
129. Ruhaak, L. R.; Huhn, C.; Waterreus, W. J.; de Boer, A. R.; Neususs, C.; Hokke, C. H.; Deelder, A. M.; Wuhrer, M. Anal. Chem. 2008, 80, 6119-6126
130. Rudd, P. M.; Guile, G. R.; Kuster, B.; Harvey, D. J.; Opdenakker, G.; Dwek, R. A. Nature 1997, 388, 205-207
131. Huang, Y.; Shi, X.; Yu, X.; Leymarie, N.; Staples, G. O.; Yin, H.; Killeen, K.; Zaia, J. Anal. Chem. 2011, 83, 8222-8229
132. Staples, G. O.; Bowman, M. J.; Costello, C. E.; Hitchcock, A. M.; Lau, J. M.; Leymarie, N.; Miller, C.; Naimy, H.; Shi, X.; Zaia, J. Proteomics 2009, 9, 686-695
133. Li, J.; Li, X.; Guo, Z.; Yu, L.; Zou, L.; Liang, X. Analyst 2011, 136, 4075-4082
134. Jensen, P. H.; Mysling, S.; Hojrup, P.; Jensen, O. N. Methods Mol. Biol. 2013, 951, 131-144
135. Wan, H.; Yan, J.; Yu, L.; Sheng, Q.; Zhang, X.; Xue, X.; Li, X.; Liang, X. Analyst 2011, 136, 4422-4430
136. Selman, M. H.; Hemayatkar, M.; Deelder, A. M.; Wuhrer, M. Anal. Chem. 2011, 83, 2492-2499
137. An, Y.; Cipollo, J. F. Anal. Biochem. 2011, 415, 67-80
138. Liu, J.; Wang, F.; Lin, H.; Zhu, J.; Bian, Y.; Cheng, K.; Zou, H. Anal. Chem. 2013, 85, 2847-2852
139. Li, X.; Shen, G.; Zhang, F.; Yang, B.; Liang, X. J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2013, 941, 45-49
140. Parker, B. L.; Thaysen-Andersen, M.; Solis, N.; Scott, N. E.; Larsen, M. R.; Graham, M. E.; Packer, N. H.; Cordwell, S. J. J. Proteome Res. 2013, 12, 5791-5800
141. Kuo, C. W.; Wu, I. L.; Hsiao, H. H.; Khoo, K. H. Anal. Bioanal. Chem. 2012, 402, 2765-2776
142. Gimenez, E.; Sanz-Nebot, V.; Rizzi, A. Anal. Bioanal. Chem. 2013, 405, 7307-7319
143. Mauko, L.; Nordborg, A.; Hutchinson, J. P.; Lacher, N. A.; Hilder, E. F.; Haddad, P. R. Anal. Biochem. 2011, 408, 235-241
144. Mauko, L.; Pelzing, M.; Dolman, S.; Nordborg, A.; Lacher, N. A.; Haddad, P. R.; Hilder, E. F. J. Chromatogr. 2011, 1218, 6419-6425
145. Neville, D. C.; Alonzi, D. S.; Butters, T. D. J. Chromatogr., A 2012, 1233, 66-70
146. Ruhaak, L. R.; Deelder, A. M.; Wuhrer, M. Anal. Bioanal. Chem. 2009, 394, 163-174
147. Karlsson, N. G.; Wilson, N. L.; Wirth, H. J.; Dawes, P.; Joshi, H.; Packer, N. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2004, 18, 2282-2292
148. Chu, C. S.; Ninonuevo, M. R.; Clowers, B. H.; Perkins, P. D.; An, H. J.; Yin, H.; Killeen, K.; Miyamoto, S.; Grimm, R.; Lebrilla, C. B. Proteomics 2009, 9, 1939-1951
149. Ninonuevo, M.; An, H.; Yin, H.; Killeen, K.; Grimm, R.; Ward, R.; German, B.; Lebrilla, C. Electrophoresis 2005, 26, 3641-3649
150. Karlsson, N. G.; Schulz, B. L.; Packer, N. H.; Whitelock, J. M. J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2005, 824, 139-147
151. Gill, V. L.; Wang, Q.; Shi, X.; Zaia, J. Anal. Chem. 2012, 84, 7539-7546
152. Aldredge, D.; An, H. J.; Tang, N.; Waddell, K.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2012, 11, 1958-1968
153. Ruhaak, L. R.; Miyamoto, S.; Kelly, K.; Lebrilla, C. B. Anal. Chem. 2012, 84, 396-402
154. Ruhaak, L. R.; Taylor, S. L.; Miyamoto, S.; Kelly, K.; Leiserowitz, G. S.; Gandara, D.; Lebrilla, C. B.; Kim, K. Anal. Bioanal. Chem. 2013, 405, 4953-4958
155. Hua, S.; Williams, C. C.; Dimapasoc, L. M.; Ro, G. S.; Ozcan, S.; Miyamoto, S.; Lebrilla, C. B.; An, H. J.; Leiserowitzf, G. S. J. Chromatogr. 2013, 1279, 58-67
156. Ruhaak, L. R.; Nguyen, U. T.; Stroble, C.; Taylor, S. L.; Taguchi, A.; Hanash, S. M.; Lebrilla, C. B.; Kim, K.; Miyamoto, S. Proteomics Clin. Appl. 2013, 10.1002/prca.201200131
157. Ni, W.; Bones, J.; Karger, B. L. Anal. Chem. 2013, 85, 3127-3135
158. Grass, J.; Pabst, M.; Kolarich, D.; Poeltl, G.; Leonard, R.; Brecker, L.; Altmann, F. J. Biol. Chem. 2011, 286, 5977-5984
159. Kenny, D. T.; Gaunitz, S.; Hayes, C. A.; Gustafsson, A.; Sjoblom, M.; Holgersson, J.; Karlsson, N. G. Methods Mol. Biol. 2013, 988, 145-167
160. Kolarich, D.; Jensen, P. H.; Altmann, F.; Packer, N. H. Nat. Protoc. 2012, 7, 1285-1298
161. Nwosu, C. C.; Aldredge, D. L.; Lee, H.; Lerno, L. A.; Zivkovic, A. M.; German, J. B.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2012, 11, 2912-2924
162. Nwosu, C. C.; Huang, J.; Aldredge, D. L.; Strum, J. S.; Hua, S.; Seipert, R. R.; Lebrilla, C. B. Anal. Chem. 2013, 85, 956-963
163. Wu, S.; Tao, N.; German, J. B.; Grimm, R.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2010, 9, 4138-4151
164. Aldredge, D. L.; Geronimo, M. R.; Hua, S.; Nwosu, C. C.; Lebrilla, C. B.; Barile, D. Glycobiology 2013, 23, 664-676
165. Pompach, P.; Chandler, K. B.; Lan, R.; Edwards, N.; Goldman, R. J. Proteome Res. 2012, 11, 1728-1740
166. Brokl, M.; Hernandez-Hernandez, O.; Cristina Soria, A.; Luz Sanz, M. J. Chromatogr. 2011, 1218, 7697-7703
167. Melmer, M.; Stangler, T.; Premstaller, A.; Lindner, W. J. Chromatogr., A 2011, 1218, 118-123
168. Mauko, L.; Lacher, N. A.; Pelzing, M.; Nordborg, A.; Haddad, P. R.; Hilder, E. F. J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2012, 911, 93-104
169. Harvey, S. R.; Macphee, C. E.; Barran, P. E. Methods 2011, 54, 454-61
170. Konijnenberg, A.; Butterer, A.; Sobott, F. Biochim. Biophys. Acta 2013, 1834, 1239-1256
171. Purves, R. W.; Guevremont, R.; Day, S.; Pipich, C. W.; Matyjaszczyk, M. S. Rev. Sci. Instrum. 1998, 69, 4094-4105
172. Creese, A. J.; Cooper, H. J. Anal. Chem. 2012, 84, 2597-2601
173. Kailemia, M.; Park, M.; Kaplan, D.; Venot, A.; Boons, G.-J.; Li, L.; Linhardt, R.; Amster, I. J. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2013, 10.1007/s13361-013-0771-1
174. Fenn, L. S.; Kliman, M.; Mahsut, A.; Zhao, S. R.; McLean, J. A. Anal. Bioanal. Chem. 2009, 394, 235-244
175. Fenn, L. S.; McLean, J. A. Methods Mol. Biol. 2013, 951, 171-194
176. Pagel, K.; Harvey, D. J. Anal. Chem. 2013, 85, 5138-5145
177. Harvey, D. J.; Scarff, C. A.; Edgeworth, M.; Crispin, M.; Scanlan, C. N.; Sobott, F.; Allman, S.; Baruah, K.; Pritchard, L.; Scrivens, J. H. Electrophoresis 2013, 34, 2368-2378
178. Harvey, D. J.; Sobott, F.; Crispin, M.; Wrobel, A.; Bonomelli, C.; Vasiljevic, S.; Scanlan, C. N.; Scarff, C. A.; Thalassinos, K.; Scrivens, J. H. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 568-581
179. Zhu, F.; Lee, S.; Valentine, S. J.; Reilly, J. P.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2012, 23, 2158-2166
180. Yamaguchi, Y.; Nishima, W.; Re, S.; Sugita, Y. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2012, 26, 2877-2884
181. Isailovic, D.; Plasencia, M. D.; Gaye, M. M.; Stokes, S. T.; Kurulugama, R. T.; Pungpapong, V.; Zhang, M.; Kyselova, Z.; Goldman, R.; Mechref, Y.; Novotny, M. V.; Clemmer, D. E. J. Proteome Res. 2012, 11, 576-585
182. Gaye, M. M.; Valentine, S. J.; Hu, Y.; Mirjankar, N.; Hammoud, Z. T.; Mechref, Y.; Lavine, B. K.; Clemmer, D. E. J. Proteome Res. 2012, 11, 6102-6110
183. Pepe, M. S.; Etzioni, R.; Feng, Z.; Potter, J. D.; Thompson, M. L.; Thornquist, M.; Winget, M.; Yasui, Y. J. Natl. Cancer Inst. 2001, 93, 1054-1061
184. Pepe, M. S.; Feng, Z.; Janes, H.; Bossuyt, P. M.; Potter, J. D. J. Natl. Cancer Inst. 2008, 100, 1432-1438
185. Seo, Y.; Andaya, A.; Leary, J. A. Anal. Chem. 2012, 84, 2416-2423
186. Fenn, L. S.; McLean, J. A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 2196-2205
187. Fasciotti, M.; Sanvido, G. B.; Santos, V. G.; Lalli, P. M.; McCullagh, M.; de Sa, G. F.; Daroda, R. J.; Peter, M. G.; Eberlin, M. N. J. Mass Spectrom. 2012, 47, 1643-1647
188. Woodin, C. L.; Maxon, M.; Desaire, H. Analyst 2013, 138, 2793-803
189. Dallas, D. C.; Martin, W. F.; Hua, S.; German, J. B. Briefings Bioinf. 2013, 14, 361-374
190. Desaire, H. Mol. Cell. Proteomics 2013, 12, 893-901
191. Artemenko, N. V.; McDonald, A. G.; Davey, G. P.; Rudd, P. M. Methods Mol. Biol. 2012, 899, 325-350
192. Kronewitter, S. R.; De Leoz, M. L.; Strum, J. S.; An, H. J.; Dimapasoc, L. M.; Guerrero, A.; Miyamoto, S.; Lebrilla, C. B.; Leiserowitz, G. S. Proteomics 2012, 12, 2523-2538
193. Campbell, M. P.; Royle, L.; Radcliffe, C. M.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M. Bioinformatics 2008, 24, 1214-1216
194. Hayes, C. A.; Karlsson, N. G.; Struwe, W. B.; Lisacek, F.; Rudd, P. M.; Packer, N. H.; Campbell, M. P. Bioinformatics 2011, 27, 1343-1344
195. Peltoniemi, H.; Natunen, S.; Ritamo, I.; Valmu, L.; Rabina, J. Glycoconjugate J. 2013, 30, 159-170
196. Strum, J. S.; Kim, J.; Wu, S.; De Leoz, M. L. A.; Peacock, K.; Grimm, R.; German, J. B.; Mills, D. A.; Lebrilla, C. B. Anal. Chem. 2012, 84, 7793-7801
197. Dreyfuss, J. M.; Jacobs, C.; Gindin, Y.; Benson, G.; Staples, G. O.; Zaia, J. Anal. Bioanal. Chem. 2011, 399, 727-735
198. Maxwell, E.; Tan, Y.; Tan, Y.; Hu, H.; Benson, G.; Aizikov, K.; Conley, S.; Staples, G. O.; Slysz, G. W.; Smith, R. D.; Zaia, J. PLoS One 2012, 7, e45474