Insights from the sea: Structural biology of marine polyketide synthases

Natural Product Reports

Volumn 29, Issue 10, 2012, Pages 1038-1049

  Akey, David L ^a   Gehret, Jennifer J ^a,b   Khare, Dheeraj ^a   Smith, Janet L ^a,b  

^a UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

^b UNIVERSITY OF MICHIGAN MEDICAL SCHOOL   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL PRODUCT; CURACIN A; CYCLOPROPANE DERIVATIVE; POLYKETIDE; POLYKETIDE SYNTHASE; THIAZOLE DERIVATIVE;

CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; MARINE BIOLOGY; METABOLISM; PROTEIN CONFORMATION; REVIEW;

BIOLOGICAL AGENTS; CYCLOPROPANES; MARINE BIOLOGY; MOLECULAR STRUCTURE; POLYKETIDE SYNTHASES; POLYKETIDES; PROTEIN CONFORMATION; THIAZOLES;

EID: 84871548647     PISSN: 02650568     EISSN: 14604752     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2np20016c     Document Type: Review

References (65)

1. A. C. Jones E. A. Monroe E. B. Eisman L. Gerwick D. H. Sherman W. H. Gerwick Nat. Prod. Rep. 2010 27 1048 1065
2. A. L. Lane B. S. Moore Nat. Prod. Rep. 2011 28 411 428
3. L. T. Tan Phytochemistry 2007 68 954 979
4. W. H. Gerwick B. S. Moore Chem. Biol. 2012 19 85 98
5. N. Engene E. C. Rottacker J. Kastovsky T. Byrum H. Choi M. H. Ellisman J. Komarek W. H. Gerwick Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2011 10.1099/ijs.0.033761- 0
6. W. H. Gerwick P. J. Proteau D. G. Nagle E. Hamel A. Blokhin D. L. Slate J. Org. Chem. 1994 59 1243 1245
7. Z. Chang N. Sitachitta J. V. Rossi M. A. Roberts P. M. Flatt J. Jia D. H. Sherman W. H. Gerwick J. Nat. Prod. 2004 67 1356 1367
8. L. Gu T. W. Geders B. Wang W. H. Gerwick K. Hakansson J. L. Smith D. H. Sherman Science 2007 318 970 974
9. L. Gu J. Jia H. Liu K. Hakansson W. H. Gerwick D. H. Sherman J. Am. Chem. Soc. 2006 128 9014 9015
10. L. Gu B. Wang A. Kulkarni T. W. Geders R. V. Grindberg L. Gerwick K. Hakansson P. Wipf J. L. Smith W. H. Gerwick D. H. Sherman Nature 2009 459 731 735
11. L. Gu B. Wang A. Kulkarni J. J. Gehret K. R. Lloyd L. Gerwick W. H. Gerwick P. Wipf K. Hakansson J. L. Smith D. H. Sherman J. Am. Chem. Soc. 2009 131 16033 16035
12. D. L. Akey J. R. Razelun J. Tehranisa D. H. Sherman W. H. Gerwick J. L. Smith Structure 2010 18 94 105
13. A. Busche D. Gottstein C. Hein N. Ripin I. Pader P. Tufar E. B. Eisman L. Gu C. T. Walsh D. H. Sherman F. Lohr P. Guntert V. Dotsch ACS Chem. Biol. 2012 7 378 386
14. T. W. Geders L. Gu J. C. Mowers H. Liu W. H. Gerwick K. Hakansson D. H. Sherman J. L. Smith J. Biol. Chem. 2007 282 35954 35963
15. J. J. Gehret L. Gu W. H. Gerwick P. Wipf D. H. Sherman J. L. Smith J. Biol. Chem. 2011 286 14445 14454
16. D. Khare B. Wang L. Gu J. Razelun D. H. Sherman W. H. Gerwick K. Hakansson J. L. Smith Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 14099 14104
17. A. S. Eustaquio F. Pojer J. P. Noel B. S. Moore Nat. Chem. Biol. 2008 4 69 74
18. B. S. Moore C. Hertweck Nat. Prod. Rep. 2002 19 70 99
19. F. Dyda D. C. Klein A. B. Hickman Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2000 29 81 103
20. M. W. Vetting S.d. C. LP M. Yu S. S. Hegde S. Magnet S. L. Roderick J. S. Blanchard Arch. Biochem. Biophys. 2005 433 212 226
21. J. Piel D. Hui G. Wen D. Butzke M. Platzer N. Fusetani S. Matsunaga Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 16222 16227
22. R. V. Grindberg T. Ishoey D. Brinza E. Esquenazi R. C. Coates W. T. Liu L. Gerwick P. C. Dorrestein P. Pevzner R. Lasken W. H. Gerwick PLoS One 2011 6 e18565
23. S. Sudek N. B. Lopanik L. E. Waggoner M. Hildebrand C. Anderson H. Liu A. Patel D. H. Sherman M. G. Haygood J. Nat. Prod. 2007 70 67 74
24. J. Piel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 14002 14007
25. V. Simunovic J. Zapp S. Rachid D. Krug P. Meiser R. Muller ChemBioChem 2006 7 1206 1220
26. W. Mattheus L. J. Gao P. Herdewijn B. Landuyt J. Verhaegen J. Masschelein G. Volckaert R. Lavigne Chem. Biol. 2010 17 149 159
27. R. Kellmann T. K. Mihali Y. J. Jeon R. Pickford F. Pomati B. A. Neilan Appl. Environ. Microbiol. 2008 74 4044 4053
28. L. P. Partida-Martinez C. Hertweck ChemBioChem 2007 8 41 45
29. C. T. Calderone Nat. Prod. Rep. 2008 25 845 853
30. T. J. Buchholz C. M. Rath N. B. Lopanik N. P. Gardner K. Hakansson D. H. Sherman Chem. Biol. 2010 17 1092 1100
31. C. T. Calderone D. F. Iwig P. C. Dorrestein N. L. Kelleher C. T. Walsh Chem. Biol. 2007 14 835 846
32. C. T. Calderone W. E. Kowtoniuk N. L. Kelleher C. T. Walsh P. C. Dorrestein Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 8977 8982
33. D. J. Edwards B. L. Marquez L. M. Nogle K. McPhail D. E. Goeger M. A. Roberts W. H. Gerwick Chem. Biol. 2004 11 817 833
34. Y. Tang C. Y. Kim Mathews II D. E. Cane C. Khosla Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 11124 11129
35. Y. Tang A. Y. Chen C. Y. Kim D. E. Cane C. Khosla Chem. Biol. 2007 14 931 943
36. C. S. Neumann D. G. Fujimori C. T. Walsh Chem. Biol. 2008 15 99 109
37. E. Mevers W. T. Liu N. Engene H. Mohimani T. Byrum P. A. Pevzner P. C. Dorrestein C. Spadafora W. H. Gerwick J. Nat. Prod. 2011 74 928 936
38. L. A. Salvador J. S. Biggs V. J. Paul H. Luesch J. Nat. Prod. 2011 74 917 927
39. L. C. Blasiak F. H. Vaillancourt C. T. Walsh C. L. Drennan Nature 2006 440 368 371
40. C. Wong D. G. Fujimori C. T. Walsh C. L. Drennan J. Am. Chem. Soc. 2009 131 4872 4879
41. D. P. Galonic E. W. Barr C. T. Walsh J. M. Bollinger Jr. C. Krebs Nat. Chem. Biol. 2007 3 113 116
42. L. M. Hoffart E. W. Barr R. B. Guyer J. M. Bollinger Jr. C. Krebs Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 14738 14743
43. M. L. Matthews C. M. Krest E. W. Barr F. H. Vaillancourt C. T. Walsh M. T. Green C. Krebs J. M. Bollinger Biochemistry 2009 48 4331 4343
44. M. L. Matthews C. S. Neumann L. A. Miles T. L. Grove S. J. Booker C. Krebs C. T. Walsh J. M. Bollinger Jr. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 17723 17728
45. A. S. Eustaquio R. P. McGlinchey Y. Liu C. Hazzard L. L. Beer G. Florova M. M. Alhamadsheh A. Lechner A. J. Kale Y. Kobayashi K. A. Reynolds B. S. Moore Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 12295 12300
46. T. A. Gulder B. S. Moore Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 9346 9367
47. C. Dong F. Huang H. Deng C. Schaffrath J. B. Spencer D. O'Hagan J. H. Naismith Nature 2004 427 561 565
48. L. Gu E. B. Eisman S. Dutta T. M. Franzmann S. Walter W. H. Gerwick G. Skiniotis D. H. Sherman Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 2795 2798
49. A. Keatinge-Clay J. Mol. Biol. 2008 384 941 953
50. T. Maier S. Jenni N. Ban Science 2006 311 1258 1262
51. T. Maier M. Leibundgut N. Ban Science 2008 321 1315 1322
52. M. Leesong B. S. Henderson J. R. Gillig J. M. Schwab J. L. Smith Structure 1996 4 253 264
53. P. Caffrey ChemBioChem 2003 4 654 657
54. P. Caffrey Chem. Biol. 2005 12 1060 1062
55. J. W. Giraldes D. L. Akey J. D. Kittendorf D. H. Sherman J. L. Smith R. A. Fecik Nat. Chem. Biol. 2006 2 531 536
56. J. B. Scaglione D. L. Akey R. Sullivan J. D. Kittendorf C. M. Rath E. S. Kim J. L. Smith D. H. Sherman Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 5726 5730
57. S. C. Tsai H. Lu D. E. Cane C. Khosla R. M. Stroud Biochemistry 2002 41 12598 12606
58. S. C. Tsai L. J. Miercke J. Krucinski R. Gokhale J. C. Chen P. G. Foster D. E. Cane C. Khosla R. M. Stroud Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 14808 14813
59. S. D. Bruner T. Weber R. M. Kohli D. Schwarzer M. A. Marahiel C. T. Walsh M. T. Stubbs Structure 2002 10 301 310
60. H. B. Claxton D. L. Akey M. K. Silver S. J. Admiraal J. L. Smith J. Biol. Chem. 2009 284 5021 5029
61. A. Koglin F. Lohr F. Bernhard V. V. Rogov D. P. Frueh E. R. Strieter M. R. Mofid P. Guntert G. Wagner C. T. Walsh M. A. Marahiel V. Dotsch Nature 2008 454 907 911
62. S. A. Samel B. Wagner M. A. Marahiel L. O. Essen J. Mol. Biol. 2006 359 876 889
63. J. R. Whicher G. Florova P. K. Sydor R. Singh M. Alhamadsheh G. L. Challis K. A. Reynolds J. L. Smith J. Biol. Chem. 2011 286 22558 22569
64. D. Mendez-Perez M. B. Begemann B. F. Pfleger Appl. Environ. Microbiol. 2011 77 4264 4267
65. A. Sultana P. Kallio A. Jansson J. S. Wang J. Niemi P. Mantsala G. Schneider EMBO J. 2004 23 1911 1921