Transient responses via regulation of mRNA stability as an immunological strategy for countering infectious diseases

Infectious Disorders - Drug Targets

Volumn 8, Issue 4, 2008, Pages 232-240

  Nakagawa, Junichi ^a  

^a TOKYO UNIVERSITY OF AGRICULTURE   (Japan)

Author keywords

ARE; AUBP; Chemotherapy; Cytokine; Exosome; Hematopoietic differentiation; mRNA decay; Posttranscriptional regulation

Indexed keywords

4 (4 FLUOROPHENYL) 2 (4 METHYLSULFINYLPHENYL) 5 (4 PYRIDYL)IMIDAZOLE; CAP BINDING PROTEIN; CIS ACTING ELEMENT; CYCLOOXYGENASE 2; CYCLOSPORIN A; CYTOKINE; GAMMA INTERFERON; HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN D; INITIATION FACTOR; INTERLEUKIN 10; INTERLEUKIN 12; INTERLEUKIN 13; INTERLEUKIN 17; INTERLEUKIN 1BETA; INTERLEUKIN 2; INTERLEUKIN 23P19; INTERLEUKIN 4; INTERLEUKIN 5; INTERLEUKIN 6; INTERLEUKIN 8; MESSENGER RNA; NUCLEASE; POLYADENYLIC ACID BINDING PROTEIN; RADICICOL; TACROLIMUS; TRANS ACTING FACTOR; TUMOR NECROSIS FACTOR ALPHA; ADENINE; ANTIINFECTIVE AGENT;

3' UNTRANSLATED REGION; ADENYLATION; B LYMPHOCYTE; CYTOKINE PRODUCTION; EXOSOME; GENE EXPRESSION REGULATION; GENETIC TRANSCRIPTION; GRAFT VERSUS HOST REACTION; HUMAN; IMMUNE RESPONSE; IMMUNOPATHOLOGY; INFECTION; NONHUMAN; PROTEIN DEGRADATION; PROTEIN PHOSPHORYLATION; PROTEIN STABILITY; PROTEIN STRUCTURE; REGULATORY MECHANISM; REGULATORY T LYMPHOCYTE; REVIEW; RNA TRANSLATION; SIGNAL TRANSDUCTION; STIMULUS; T LYMPHOCYTE; TH1 CELL; TH17 CELL; TH2 CELL; ANIMAL; ARTICLE; BIOSYNTHESIS; CAPPING PHENOMENON; DRUG EFFECT; GENETICS; IMMUNOLOGY; METABOLISM; PHYSIOLOGY; PROTEIN BINDING; RNA PROCESSING;

ADENINE; ANIMALS; ANTI-INFECTIVE AGENTS; CYTOKINES; HUMANS; IMMUNOLOGIC CAPPING; INFECTION; PROTEIN BINDING; RNA PROCESSING, POST-TRANSCRIPTIONAL; RNA, MESSENGER; SIGNAL TRANSDUCTION; T-LYMPHOCYTES;

EID: 58249089733     PISSN: 18715265     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/187152608786734214     Document Type: Review

References (95)

1. Shaw, G.; Kamen, R. Cell, 1986, 46, 659.
2. Brewer, G. Aging Res. Rev., 2002, 1, 607.
3. Barreau, C.; Paillard, L.; Osborne, H. B. Nucleic Acid Res., 2005, 33, 7138.
4. Shim, J.; Karin, M. Mol. Cells, 2002, 14, 323.
5. Wilusz, C. J.; Wilustz, J. Trends in Genetics, 2004, 20, 491.
6. Meyer, S.; Temme, C.; Wahle, E. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol., 2004, 39, 197.
7. Chen, C.-Y.; Gherzi, R.; Ong, S.-E.; Chan, E. L.; Rajimakers, R.; Pruijn, G. J. M.; Stoecklin, G.; Moroni, C.; Mann, M.; Karin, M. Cell, 2001, 107, 451.
8. Mukherjee, D.; Gao, M.; O'Connor, J. P.; Raijmakers, R.; Pruijn, G.; Lutz, C. S.; Wilustz, J. EMBO J., 2002, 21, 165.
9. Shyu, A. B.; Belasco, J. G.; Greenberg, M. E. Genes Dev., 1991, 5, 221.
10. Chen, C-Y. A.; Shyu, A-B. Trends Biochem. Sci., 1995, 20, 465.
11. Lagnado, C. A.; Brown, C. Y.; Goodall, G. J. Mol. Cell Biol., 1994, 14, 7984.
12. Bakheet, T.; Frevel, M.; Williams, B.R.; Greer, W.; Khabar, K. S. Nucleic Acid Res., 2001, 29, 246.
13. Bakheet, T.; Williams, B. R.; Khabar, K. S. Nucleic Acid Res., 2006, 34, D111.
14. Halees, A. S.; El-Badrawi, R.; Khabar, K. S. Nucleic. Acid Res., 2008, 36, D137
15. Brewer, G. Mol. Cell Biol., 1991, 11, 2460.
16. Laroia, G.; Cuesta, R.; Brewer, G.; Shneider, R. J. Science, 1999, 284, 499-502.
17. Keledijan, M.; DeMaria, C. T.; Brewer, G.; Novik, K. Mol. Cell Biol., 1997, 17, 4870.
18. Hajarnis, S.; Schroeder, J. M.; Cuthoys, N. P. J. Biol. Chem., 2005, 280, 28272.
19. Sarker, B.; Xi, O.; He, C.; Schneider, R. J. Mol. Cell. Biol., 2003, 23, 6685.
20. Arao, Y.: Kikuchi, A.; Kishida, M.; Yoneyama, M.; Inoue, A; Yasuda, S.; Wada, S.; Ikeda, K.; Kayama, F. Mol. Endocrinol., 2004, 18, 2255.
21. He, C.; Schneider, R.J. EMBO J., 2006, 25, 3823.
22. Lu, J. Y.; Bergman, N.; Sadri, N.; Schneider, R. J. RNA, 2006, 12, 883
23. Sagliocco, F.; Laloo, B.; Cosson, B.; Laborde, L.; Castroviejo, M.; Rosenbaum, J.; Ripoche, J.; Grosset, C. Biochem, J., 2006, 400, 337.
24. Lu, J.-Y.; Sadre, N.; Schneider, R. J. Genes Dev., 2006, 20, 3174.
25. Caballo, E.; Lai, W. S.; Blackshear, P. J. Science, 1998, 281, 1001.
26. Taylor, G. A. et.al. Immunity, 1996, 4, 445.
27. Stoechklin, G.; Ming, X.-F.; Looser, R.; Moroni, C. Mol. Cell Biol., 2000, 20, 3753.
28. Lai, W. S.; Parker, J. S. Grissom, S. F.; Stumpo, D. J.; Blackshear, P. J. Mol. Cell Biol., 2006, 26, 9196.
29. Jalonen, U.; Nieminen, R.; Vuolteenaho, K.; Kankaanranta, H.; Moilanen, E. Mediators Inflammation, 2006, 2006, 1-8.
30. Emmons, J.; Towley-Tilson, W. H.; Deleault, K. M.; Skimmer, S. J.; Gross, R. H.; Whitfield, M. L.; Brooks, S. A. RNA, 2008, 14, 888.
31. Stoecklin, G.; Tenenbaum, S. A.; Mayo, T.; Chittur, S. V.; George, A. D.; Baroni, T.E.; Blackshear, P. J.; Anferson, P. J. Biol. Chem., 2008, 283, 11689.
32. Sandler, H.; Stoecklin, G. Biochem. Soc. Trans., 2008, 36, 491.
33. Franks, T., M.; Lykke-Andersen, J. Genes Dev., 2007, 21, 719.
34. Stumpo, D. J.; Byrd, N. A.; Phillips, R. S.; Ghosh, S.; Maronpot, R. R.; Castranio, T.; Meyers, E. N.; Mishina, Y.; Blackshear, P. J. Mol. Cell Biol., 2004, 24, 6445.
35. Maitra, S.; Chou, C. F.; Luber, C. A.; Lee, K. Y.; Mann, M.; Chen C. Y. RNA, 2008, 14, 950.
36. Schmidin, M.; Lu, M.; Leuenberger, S. A.; Stoecklin, G.; Mallun, M.; Gross, B.; Gherzi, R.; Hess, D.; Hemmings, B. A.; Moroni, C. EMBO J., 2004, 23, 4760.
37. Benjamin, D.; Schmidin, M.; Min, L.; Gross, B.; Moroni, C. Mol. Cell Biol., 2006, 26, 9497.
38. Winzen, R.; Thakur, B. K.; Dittrich-Breiholz, O.; Shah, M.; Redich, N.; Dhamija, S.; Kracht, M.; Holtmann, H. Mol. Cell Biol., 2007, 27, 8388.
39. Nakagawa, J.; Waaaldner, H.; Meyer-Monard, S.; Hofsteenge, J.; Jen , P.; Moroni, C. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1995, 92, 2051.
40. Nakagawa, J.; Moroni, C. Eur. J. Biochem., 1977, 244, 890.
41. Kurimoto, K.; Fukai, S.; Nureki, O.; Muto, Y.; Yokoyama, S. Structure, 2001, 9, 1253.
42. Brennan, L., E.; Nakagawa, J.; Egger, D.; Bienz, K.; Moroni, C. Gene, 1999, 228, 85.
43. Muellner, E.; W., Neupert, B.; Kuehn, L, C. Cell, 1989, 53, 373.
44. Rouault, T.A.; Stout, C. D.; Kaptain, S.; Hrford J. B.; Klausner, R. D. Cell, 1991, 64, 881.
45. Gagliardi, D.; Stepien, P. P.; Tempeley, R. J.; Lightwlers, R. N.; Chrzanowska-Lightwlers, Z. M. A. Trends Genetics, 2004, 20, 260.
46. Szabo, A.; Dalmau, J.; Manley, G.; Rosenfeld, M.; Wong, E.; Henson, J.; Posner, J. B.; Furneaux, H. M. Cell, 1991, 67, 325.
47. Myer, V. E.; Fan, X. C.; Steitz, J. A. EMBO J., 1997, 16, 2130.
48. Zhu, H.; Hasman, R. A.; Barron, V. A. Mol. Biol. Cell., 2006, 17, 5105.
49. Fialcowiz-White, E. J.; Brewer, B. Y..; Ballin, J. D.; Willis, C. D.; Toth, E. A.; Wilson, G. M. J. Biol. Chem., 2007, 282, 20948.
50. Brennan, G. M.: Steitz, J. A. Cell. Mol. Life Sci., 2001, 58, 266.
51. Abdelmohsen, K.; Pullmann, R. Jr.; lai, A.; Kim, H. H.; Galban, S.; Yang, X.; Blethrow, J. D.; Walker, M.; Shubert, J.; Gillespie, D. A.; Furneaux, H.; Gorospe, M. Mol. Cell, 2007, 25, 543.
52. Casoralo, V.; Fang, X.; Tancowny, B.; Fan, J.; Wu, F.; Srikantan, S.; Asaki, S. Y.; DeFanis, U.; Huang, S. K.; Gorospe, M.; Atasoy, U. X.; Stellato, C. J. Allergy Clin. Immunol., 2008, 121, 853.
53. Sureban, S. M.; Murmu, N.; Rodriguez, P.; May, R.; Maheshwari, R.; Diekgraefe, B. K.; Houchen, C. W.; Anant, S. Gastroenterology, 2007, 132, 1055.
54. Niesporek, S.; Kristiansen, G.: Thoma, A.; Weichert, W.; Noske, A.; Buckendahl, A. C.; Jung, K.; Stephan, C.; Dietel, M.; Denkert, C. Int. J. Oncol., 2008, 32, 341.
55. Kloess, S.; Rodenbach, D.; Bordel, R.l; Muelsh, A. Hypertension, 2005, 45, 1200.
56. Shim, J.; Lim, H. R.; Yates, J.; Karin, M. Mol. Cell, 2002, 10, 1331.
57. Chen, C. Y.; Gherzi, R.; Anderson, J. S.; Gaietta, G.; Juerchott, K.; Royer, H. D.; Mann, M.; Karin, M. Genes Dev., 2000, 14, 1236.
58. Evdokimova, V.; Ruzanov, P.; Imataka, H.; Raught, B.; Svitkin, Y.; Ovchinnikov, L. P.; Sonnenberg, N. EMBO J., 2001, 20, 5491.
59. Sonnenberg, N. Biochem. Cell Biol., 2008, 86, 178.
60. Seal, R.; Temperley, R.; Wilustz, J.; Lightowlers, R. N.; Chrzanowska-Lightowlers, Z. M. Nucleic Acid Res., 2005, 33, 376.
61. Sheth, U.; Parker, R. Science, 2003, 300, 5620.
62. Beelman, C. A.; Stevens, A.; Caponigro, G.; LaGrandeur, T. E.; Hatfield, L.; Fortner, D. M.; Parker, R. Nature, 1996, 283, 642.
63. Dunckley, T.; Parker, R. EMBO J., 1999, 18, 5411.
64. Deshmukh, M. V.; Jones, B. N.; Quang-Dang, D. U.; Flinders, J.; Floor, S. N.; Kim. C.; Jemielity, J.; Kalek, M.; Darzynkiewicz, E.; Gross, J. D. Mol. Cell, 2008, 29, 324.
65. Tucker, M.; Valencia-Sanchez, M. A.; Staples, R. R.; Chen, J.; Denis. C. L.; Parker, R. Cell, 2001, 104, 377.
66. Baggs, J. E.; Green, C. B. Curr. Biol., 2003, 13, 189.
67. Wang, Z.; Kiledjian, M. Cell, 2001, 107, 751.
68. Yamashita, A.; Chang, T. C.; Yamashita, Y.; Zhu, W.; Zhong, Z.; Chen, C. Y.; Shyu, A.-B. Nat. Struct. Mol. Biol., 2005, 12, 1054.
69. Fenger-Groen, M.; Fillman, C.; Norrild, B.; Lykke-Andersen. J. Mol. Cell, 2005, 20, 905.
70. Valencia-sanchez, M. Liu, J.; Hannon, G. J; Parker, R. Genes Dev., 2006, 20, 515.
71. Jing, Q.; huang, G.; Guth, S.; Zarubin, T.; Motoyama, A.; Chen, J.; Di Padova, F.; Lin, S. C.; Gram, H.; Han, J. Cell, 2005, 120, 623.
72. Lindsten, T.; June, C. H.; Ledbetter, J. A.; Stella, G.; Thompson, C. B. Science, 1989, 244, 339.
73. Malter, J. S. Science, 1989, 246, 664.
74. Ming, X.-F.; Kaiser, M.; Moroni, C. EMBO J., 1998, 20, 6039.
75. Ming, X.-F.; Stoecklin, G.; Lu, M.; Looser, R.; Moroni, C. Mol. Cell. Biol., 2001, 21, 5778.
76. Stoecklin, G.; Stubbs, T. Kedersha, N.; Wax, S.; Rigby, W. F.; Blackwell, T. K.; Anderson, P. EMBO J., 2004, 23, 1313.
77. Fan, X. C.; Steitz, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1998, 95, 15293.
78. Wilson, G. M.; Lu, J.; Sutphen, K.; Suarez, Y.; Sinha, S.; Brewer, B.; Villanueva-Feliciano, E. C.; Ysia, R. M.; Charles, S.; Brewer, G. J. Biol. Chem., 2003, 273, 33039.
79. Chen, C. Y.; DelGatto-Konczak, F.; Wu, Z; Karin, M. Science, 1998, 280, 1945.
80. Dean, J. L.; Brook, M; Clark, A. R.; Saklatvala, J. J. Biol. Chem., 1999, 274, 264.
81. Frevel, M. A.; Bakheet, T.; Silva, A. M.; Hissong, J. G.; Khabar, K. S. A.; Williams, B. R. G. Mol. Cell Biol., 2003, 23, 425.
82. Neininger, A.; Kontoyjannis, D.; Kotlyarov.; Winzen, R.; Eckert, R.; Volk, H. D.; Holtman, H.; Kollas, G.; Gaestel, M. J. Biol. Chem., 2002, 277, 3065.
83. Chu, C. Q.; Song, Z.; Mayton, L.; Wu, B.; Wooley, P. H. Ann. Rheum. Dis., 2003, 62, 983.
84. Sato, K.; Suematsu, A.; Okamoto, K.; Yamaguchi, A. J. Exp. Med., 2006, 203, 2673.
85. Yang, X. O.; Panopoulos, A. D.; Nurieva, R.; Chang, S. H.; Wang, D.; Watowich, S. S.; Dong, C. J. Biol. Chem., 2007, 282, 9358.
86. Tang, Q.; Bluestone, J. A. Immunol. Rev., 2006, 212, 217.
87. Tang, Q.; Adams, J. Y.; Penaranda, C.; Melli, K.; Piaggio, E.; Sgouroudis, E.; Piccirillo, C. A.; Salomon, B. L.; Bluestone, J. A. Immunity, 2008, 28, 687.
88. Askenasy, N.; Kaminitz, A.; Yarkoni, S. Autoimmun. Rev., 2008, 7, 370.
89. Yarovinsky, T. O.; Butler, N. S.; Monick M. M.; Hunninghake, G. W. J. Immunol., 2006, 177, 4426.
90. Kastelic, T.; Schnyder, J.; Leutwiler, A.; Traber, R.; Streit, B.; Niggli, H.; MacKenzie, A.; Cheneval, D. Cytokine, 1996, 8, 751.
91. Mak, I., W., Y.; Liu, L.; Ling, V.; Kastelic, T. Genomics, 2007, 90, 723.
92. Meisner, N. C.; Hintersteiner, M.; Mueller, K.; Bauer, R.; selfert, J. M.; Naegeli, H. U.; Ottl, J.; Oberer, L.; Guenat, C.; Moss, S.; Harrer, N.; Woisetschlaeger, M.; Buehler, C.; Uhi, V.; Auer, M. Nat. Chem. Biol., 2007, 3, 508.
93. Nair, A. P.; Hahn, S.; Banholzer, R.; Hirsch, H. H.; Moroni, C. Nature, 1994, 369, 239.
94. Patil, C.; Zhu, X.; Rossa, C, Jr.; Kim, Y. J.; Kirkwood, K. L. Immun. Invest., 2004, 33, 213.
95. Hollams, E. M.; Giles, K. M.; Thomson, A. M.; Leedman, P. J. Neurocchem. Res., 2002, 27, 957.