A pharmacogenetic study of pregnane X receptor (NR112) in Han Chinese

Current Drug Metabolism

Volumn 8, Issue 8, 2007, Pages 778-786

  Wang, Xue Ding ^a   Li, Jia Li ^a   Su, Qi Biao ^a   Deng, Xiao Ying ^a   Lu, Yan ^a   Chen, Jie ^a   Zhang, Jin Xin ^a   Zhao, Li Zi ^a   Zuo, Zhong ^b   Chan, Eli ^c   Chen, Xiao ^a   Chowbay, Balram ^d   Xue, Charlie Changli ^e   Huang, Min ^a   Zhou, Shu Feng ^f  

^a SUN YAT SEN UNIVERSITY   (China)

^b and Hong Kong Branch of CAS Center for Excellence in Animal Evolution and Genetics   (Hong Kong)

^c NATIONAL UNIVERSITY OF SINGAPORE   (Singapore)

^d DIVISION OF MEDICAL ONCOLOGY   (Singapore)

^e RMIT UNIVERSITY   (Australia)

^f QUEENSLAND UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Australia)

Author keywords

Chinese; Ethnicity; Haplotype; Pregnane X receptor (NR 112); SNP

Indexed keywords

ADENINE; CYTOSINE; ERYTHROMYCIN; GENOMIC DNA; GUANINE; LUCIFERASE; PREGNANE X RECEPTOR; RIFAMPICIN; THYMINE;

5' UNTRANSLATED REGION; ADULT; CHINESE; CONTROLLED STUDY; DNA ISOLATION; DNA SEQUENCE; ETHNIC DIFFERENCE; ETHNIC GROUP; EXON; FEMALE; GENE ACTIVITY; GENE AMPLIFICATION; GENE FREQUENCY; GENE LINKAGE DISEQUILIBRIUM; GENOTYPE; HAPLOTYPE; HUMAN; HUMAN CELL; INTRON; LEUKOCYTE; MALE; MUTANT; NUCLEOTIDE SEQUENCE; PHARMACOGENETICS; POLYMERASE CHAIN REACTION; PROMOTER REGION; REPORTER GENE; REVIEW; SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM; STATISTICAL SIGNIFICANCE; WILD TYPE;

ASIAN CONTINENTAL ANCESTRY GROUP; BASE SEQUENCE; ETHNIC GROUPS; HAPLOTYPES; HUMANS; POLYMORPHISM, SINGLE NUCLEOTIDE; RECEPTORS, STEROID;

EID: 36949014514     PISSN: 13892002     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/138920007782798199     Document Type: Review

References (37)

1. Blumberg, B.; Sabbagh, W., Jr.; Juguilon, H.; Bolado, J., Jr.; van Meter, C. M.; Ong, E. S.; Evans, R. M. (1998) Genes Dev. 12(20), 3195-3205.
2. Bertilsson, G.; Heidrich, J.; Svensson, K.; Asman, M.; Jendeberg, L.; Sydow-Backman, M.; Ohlsson, R.; Postlind, H.; Blomquist, P.; Berkenstam, A. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95(21), 12208-12213.
3. Kliewer, S. A.; Moore, J. T.; Wade, L.; Staudinger, J. L.; Watson, M. A.; Jones, S. A.; McKee, D. D.; Oliver, B. B.; Willson, T. M.; Zetterstrom, R. H.; Perlmann, T.; Lehmann, J. M. (1998) Cell, 92(1),73-82.
4. Lehmann, J. M.; McKee, D. D.; Watson, M. A.; Willson, T. M.; Moore, J. T.; Kliewer, S. A. (1998) J. Clin. Invest., 102(5), 1016-1023.
5. Goodwin, B.; Moore, L. B.; Stoltz, C. M.; McKee, D. D.; Kliewer, S. A. (2001) Mol. Pharmacol., 60(3), 427-431.
6. Synold, T. W.; Dussault, I.; Forman, B. M. (2001) Nat. Med. 7(5), 584-590.
7. Moore, D. D.; Kato, S.; Xie, W.; Mangelsdorf, D. J.; Schmidt, D. R.; Xiao, R.; Kliewer, S. A. (2006) Pharmacol. Rev., 58(4), 742-759.
8. Stanley, L. A.; Horsburgh, B. C.; Ross, J.; Scheer, N.; Wolf, C. R. (2006) Drug Metab. Rev., 38(3), 515-597.
9. Zhang, J.; Kuehl, P.; Green, E. D.; Touchman, J. W.; Watkins, P. B.; Daly, A.; Hall, S. D.; Maurel, P.; Relling, M.; Brimer,. C.; Yasuda, K.; Wrighton, S. A.; Hancock, M.; Kim, R. B.; Strom, S.; Thummel, K.; Russell, C. G.; Hudson, J. R., Jr.; Schuetz, E. G.; Boguski, M. S. (2001) Pharmacogenetics, 11(7), 555-572.
10. Martinez-Jimenez, C. P.; Jover, R.; Donato, M. T.; Castell, J. V.; Gomez-Lechon, M. J. (2007) Curr. Drug Metab., 8(2), 185-194.
11. Ma, X.; Shah, Y. M.; Guo, G. L.; Wang, T.; Krausz, K. W.; Idle, J. R.; Gonzalez, F. J. (2007) J. Pharmacol. Exp. Ther., 322(1), 391-398.
12. Urquhart, B. L.; Tirona, R. G.; Kim, R. B. (2007) J. Clin. Pharmacol., 47(5), 566-578.
13. Saussele, T.; Burk, O.; Blievernicht, J. K.; Klein, K.; Nussler, A.; Nussler, N.; Hengstler, J. G.; Eichelbaum, M.; Schwab, M.; Zanger, U. M. (2007) Clin. Pharmacol. Ther., doi: 10.1038/sj.clpt.6100138.
14. Moore, L. B.; Maglich, J. M.; McKee, D. D.; Wisely, B.; Willson, T. M.; Kliewer, S. A.; Lambert, M. H.; Moore, J. T. (2002) Mol. Endocrinol., 16(5), 977-986.
15. Watkins, R. E.; Wisely, G. B.; Moore, L. B.; Collins, J. L.; Lambert, M. H.; Williams, S. P.; Willson, T. M.; Kliewer, S. A.; Redinbo, M. R. (2001) Science, 292(5525), 2329-2333.
16. Matic, M.; Mahns, A.; Tsoli, M.; Corradin, A.; Polly, P.; Robertson, G. R. (2007) Int. J. Biochem. Cell Biol., 39(3), 478-483.
17. Gerbal-Chaloin, S.; Pascussi, J. M.; Pichard-Garcia, L.; Daujat, M.; Waechter, F.; Fabre, J. M.; Carrere, N.; Maurel, P. (2001) Drug Metab. Dispos., 29(3), 242-251.
18. Goodwin, B.; Redinbo, M. R.; Kliewer, S. A. (2002) Ann. Rev. Pharmacol. Toxicol., 42, 1-23.
19. Shimada, T.; Yamazaki, H.; Mimura, M.; Inui, Y.; Guengerich, F. P. (1994) J. Pharmacol. Exp. Ther., 270(1), 414-423.
20. Watkins, P. B. (1994) Pharmacogenetics, 4(4), 171-184.
21. Thummel, K. E.; Shen, D. D.; Podoll, T. D.; Kunze, K. L.; Trager, W. F.; Hartwell, P. S.; Raisys, V. A.; Marsh, C. L.; McVicar, J. P.; Barr, D. M.; Perkins, J. D. (1994) J. Pharmacol. Exp. Ther., 271(1), 549-556.
22. Evans, D. A.; McLeod, H. L.; Pritchard, S.; Tariq, M.; Mobarek, A. (2001) Drug Metab. Dispos., 29(4 Pt 2), 606-610.
23. Chowbay, B.; Zhou, S.; Lee, E. J. (2005) Drug Metab. Rev., 37(2), 327-378.
24. Hustert, E.; Zibat, A.; Presecan-Siedel, E.; Eiselt, R.; Mueller, R.; Fuss, C.; Brehm, I.; Brinkmann, U.; Eichelbaum, M.; Wojnowski, L.; Burk, O. (2001) Drug Metab. Dispos., 29(11), 1454-1459.
25. Koyano, S.; Kurose, K.; Ozawa, S.; Saeki, M.; Nakajima, Y.; Hasegawa, R.; Komamura, K.; Ueno, K.; Kamakura, S.; Nakajima, T.; Saito, H.; Kimura, H.; Goto, Y.; Saitoh, O.; Katoh, M.; Ohnuma, T.; Kawai, M.; Sugai, K.; Ohtsuki, T.; Suzuki, C.; Minami, N.; Saito, Y.; Sawada, J. (2002) Drug Metab. Pharmacokinet., 17(6), 561-565.
26. Koyano, S.; Kurose, K.; Saito, Y.; Ozawa, S.; Hasegawa, R.; Komatnura, K.; Ueno, K.; Kamakura, S.; Kitakaze, M.; Nakajima, T.; Matsumoto, K.; Akasawa, A.; Saito, H.; Sawada, J. (2004) Drug Metab. Dispos., 32(1), 149-154.
27. LeCluyse, E. L. (2001) Chem. Biol. Interact., 134(3), 283-289.
28. Lim, Y. P.; Liu, C. H.; Shyu, L. J.; Huang, J. D. (2005) Pharmacogenet. Genomics, 15(5), 337-341.
29. Bosch, T. M.; Deenen, M.; Pruntel, R.; Smits, P. H.; Schellens, J. H.; Beijnen, J. H.; Meijerman, I. (2006) Eur. J. Clin. Pharmacol., 62(5), 395-399.
30. Kurose, K.; Ikeda, S.; Koyano, S.; Tohkin, M.; Hasegawa, R.; Sawada, J. (2006) Mol. Cell. Biochem., 281(1-2), 35-43.
31. Boom, R.; Sol, C. J.; Salimans, M. M.; Jansen, C. L.; Wertheimvan Dillen, P. M.; van der Noordaa, J. (1990) J. Clin. Microbiol., 28(3), 495-503.
32. Nuclear Receptors Committee (1999) Cell, 97(2), 161-163.
33. Abecasis, G. R.; Cookson, W. O. (2000) Bioinformatics, 16(2), 182-183.
34. Stephens, M.; Scheet, P. (2005) Am. J. Hum. Genet., 76(3), 449-462.
35. Stephens, M.; Smith, N. J.; Donnelly, P. (2001) Am. J. Hum. Genet., 68(4), 978-989.
36. Xie, W.; Yeuh, M. F.; Radominska-Pandya, A.; Saini, S. P.; Negishi, Y.; Bottroff, B. S.; Cabrera, G. Y.; Tukey, R. H.; Evans, R. M. (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 100(7), 4150-4155.
37. Saini, S. P.; Mu, Y.; Gong, H.; Toma, D.; Uppal, H.; Ren, S.; Li, S.; Poloyac, S. M.; Xie, W. (2005) Hepatology, 41(3), 497-505.