Design and synthesis of a cell-permeable synthetic transcription factor mimic

Journal of Combinatorial Chemistry

Volumn 9, Issue 4, 2007, Pages 592-600

  Xiao, Xiangshu ^a   Yu, Peng ^a   Lim, Hyun Suk ^a   Sikder, Devanjan ^a   Kodadek, Thomas ^a  

^a UNIVERSITY OF TEXAS SOUTHWESTERN MEDICAL CENTER   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOMIMETIC MATERIAL; NYLON; PEPTOID; TRANSCRIPTION FACTOR;

ANIMAL; ARTICLE; CELL LINE; CELL MEMBRANE PERMEABILITY; CELL SURVIVAL; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; DRUG DESIGN; DRUG EFFECT; GENETIC TRANSCRIPTION; GENETICS; HAMSTER; HUMAN; ISOLATION AND PURIFICATION; PROTEIN DATABASE; SYNTHESIS;

ANIMALS; BIOMIMETIC MATERIALS; CELL LINE; CELL MEMBRANE PERMEABILITY; CELL SURVIVAL; CRICETINAE; DATABASES, PROTEIN; DRUG DESIGN; HUMANS; MOLECULAR STRUCTURE; NYLONS; PEPTOIDS; TRANSCRIPTION FACTORS; TRANSCRIPTION, GENETIC;

EID: 34547157531     PISSN: 15204766     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cc070023a     Document Type: Article

References (48)

1. Hanahan, D.; Weinberg, R. A. Cell 2000, 100, 57-70.
2. Novina, G D.; Sharp, P. A. Nature 2004, 430, 161-164.
3. Denison, C.; Kodadek, T. Chem. Biol. 1998, 5, R129-R145.
4. Ansari, A. Z.; Mapp, A. K. Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 765-772.
5. Arndt, H, D. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 4552-4560.
6. Ptashne, M. Nature 1988, 335, 683-689.
7. Brent, R.; Ptashne, M. Cell 1985, 43, 729-736.
8. Sadowski, I.; Ma, J.; Triezenberg, S.; Ptashne, M, Nature 1988, 335, 563-564.
9. Tan, S. Y.; Guschin, D.; Davalos, A.; Lee, Y. L.; Snowden, A. W.; Jouvenot, Y.; Zhang, H. S.; Howes, K.; McNamara, A. R.; Lai, A.; Ullman, C.; Reynolds, L.; Moore, M.; Isalan, M.; Berg, L. P.; Campos, B.; Qi, H.; Spratt, S. K.; Case, C. C.; Pabo, C. O.; Campisi, J.; Gregory, P. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 11997-12002.
10. Lund, G V.; Biancafort, P.; Popkov, M.; Barbas, C. F. J. Mol. Biol. 2004, 340, 599-613.
11. Beerli, R. R.; Barbas, C. F. Nat. Biotechnol. 2002, 20, 135-141.
12. Mapp, A. K.; Ansari, A. Z.; Ptashne, M.; Dervan, P. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 3930-3935.
13. Ansari, A. Z.; Mapp, A. K.; Nguyen, D. H.; Dervan, P. B.; Ptashne, M. Chem. Biol. 2001, 8, 583-592.
14. Arora, P. S.; Ansari, A. Z.; Best, T. P.; Ptashne, M.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 13067-13071.
15. Liu, B.; Han, Y.; Corey, D. R.; Kodadek, T. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 1838-1839.
16. Liu, B.; Han, Y.; Ferdous, A.; Corey, D. R.; Kodadek, T. Chem. Biol. 2003, 10, 909-916.
17. Stanojevic, D.; Young, R. A. Biochemistry 2002, 41, 7209-7216.
18. Minter, A. R.; Brennan, B. B.; Mapp, A. K. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 10504-10505.
19. Liu, B.; Alluri, P. G.; Yu, P.; Kodadek, T. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 8254-8255.
20. Shimogawa, H.; Kwon, Y.; Mao, Q.; Kawazoe, Y.; Choi, Y.; Asada, S.; Kigoshi, H.; Uesugi, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 3461-3471.
21. Kwonj, Y.; Arndt, H. D.; Qian, M.; Choi, Y.; Kawazoe, Y.; Dervan, P. B.; Uesugi, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 15940-15941.
22. Simon, R. J.; Kania, R. S.; Zuckermann, R. N.; Huebner, V. D.; Jewell, D. A.; Banville, S.; Ng, S.; Wang, L.; Rosenberg, S.; Marlowe, G K.; Spellmeyer, D. C.; Tan, R. Y.; Frankel, A. D.; Santi, D. V.; Cohen, F. E.; Bartlett, P. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 9367-9371.
23. Chrivia, J. C.; Kwok, R. P. S.; Lamb, N.; Hagiwara, M.; Montminy, M. R.; Goodman, R. H. Nature 1993, 365, 855-859.
24. Xiao, X.; Yu, P.; Lim, H.; Sikder, D.; Kodadek, T. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 2865-2868.
25. Frangioni, J. V.; LaRiccia, L. M.; Cantley, L. C.; Montminy, M. R. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 1080-1085.
26. Volkman, H. M.; Rutledge, S. E.; Schepartz, A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 4649-4658.
27. Alluri, P. G.; Reddy, M. M.; Bachhawat-Sikder, K.; Olivos, H. J.; Kodakek, T. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13995-14004.
28. Olivos, H. I.; Bachhawat-Sikder, K.; Kodadek, T. Chem-BioChem. 2003, 4, 1242-1245.
29. Radhakrishnan, I.; Perez-Alvarado, G. C.; Parker, D.; Dyson, H. J.; Montminy, M. R.; Wright, P. E. Cell 1997, 91, 741 -752.
30. Picard, D. Methods Enzymol. 2000, 327, 385-401.
31. Yu, P.; Liu, B.; Kodadek, T. Nat. Biotechnol. 2005, 23, 746-751.
32. Rousseau, G. G.; Kirchhoff, J.; Formstecher, P.; Lusten-berger, P. Nature 1979, 279, 158-160.
33. Licitra, E. J.; Liu, J. O. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 12817-12821.
34. Nyanguile, O.; Uesugi, M.; Austin, D. J.; Verdine, G. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 13402-13406.
35. Triezenberg, S. J.; Kingsbury, R. C.; McKnight, S. L. Genes Dev. 1988, 2, 718-729.
36. Dickinson, L. A.; Burnett, R.; Melander, C.; Edelson, B. S.; Arora, P. S.; Dervan, P. B.; Gottesfeld, J. M. Chem. Biol. 2004, 11, 1583-1594.
37. Dervan, P. B.; Edelson, B. S. Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 284-299.
38. Liu, B.; Yu, P.; Alluri, P. G.; Kodadek, T. Mol. BioSyst. 2005, 1, 307-317.
39. Olenyuk, B. Z.; Zhang, G. J.; Klco, J. M.; Nickols, N. G.; Kaelin, W. G.; Dervan, P. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 16768-16773.
40. Dudouet, B.; Burnett, R.; Dickinson, L. A.; Wood, M. R.; Melander, C.; Belitsky, J. M.; Edelson, B.; Wurtz, N.; Briehn, C.; Dervan, P. B.; Gottesfeld, J. M. Chem. Biol. 2003, 10, 859-867.
41. Supekova, L.; Pezacki, J. P.; Su, A. I.; Loweth, C. J.; Riedl, R.; Geierstanger, B.; Schultz, P. G.; Wemmer, D. E. Chem. Biol. 2002, 9, 821-827.
42. Alluri, P. G.; Liu, B.; Yu, P.; Xiao, X.; Kodadek, T. Mol. BioSyst. 2006, 2, 568-579.
43. Chi, T. H.; Lieberman, P.; Ellwood, K.; Carey, M. Nature 1995, 377, 254-257.
44. Herschlag, D.; Johnson, F. B. Genes Dev. 1993, 7, 173-179.
45. Hiroi, M.; Ohmori, Y. J. Biol. Chem. 2003, 278, 651-660.
46. Mink, S.; Haenig, B.; Klempnauer, K. H. Mol. Cell. Biol. 1997, 17, 6609-6617.
47. Zuckermann, R. N.; Kerr, J. M.; Kent, S. B. H.; Moos, W. H. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10646-10647.
48. Olivos, H. J.; Alluri, P. G.; Reddy, M. M.; Salony, D.; Kodadek, T. Org. Lett. 2002, 4, 4057-4059.