Adenosine kinase inhibitor design based on pharmacophore modeling

Bulletin of the Korean Chemical Society

Volumn 28, Issue 4, 2007, Pages 561-566

  Lee, Yuno ^a   Bharatham, Nagakumar ^a   Bharatham, Kavitha ^a   Keun, Woo Lee ^a  

^a Gyeongsang National University   (South Korea)

Author keywords

Adenosine (ADO); Adenosine kinase (AK) inhibitors; Computer aided drug design; New lead search; Pharmacophore hypotheses

Indexed keywords

CATALYSIS; COMPUTER AIDED DESIGN; COMPUTER SOFTWARE; CORRELATION METHODS; PHARMACODYNAMICS;

ADENOSINE (ADO); ADENOSINE KINASE (AK) INHIBITORS; NEW LEAD SEARCH; PHARMACOPHORE HYPOTHESES;

ENZYMES;

EID: 34247591800     PISSN: 02532964     EISSN: 12295949     Source Type: Journal    
DOI: 10.5012/bkcs.2007.28.4.561     Document Type: Article

References (31)

1. Williams, M.; Jarvis, M. Biochem. Pharmacol. 2000, 59, 1173.
2. Ralevic, V.; Burnstock, G. Pharmacol. Rev. 1998, 50, 413.
3. Fredholm, B. B.; IJzerman, A. P.; Jacobson, K. A.; Klotz, K. N.; Linden, J. Pharmacol. Rev. 2001, 53, 527.
4. Kim, S.; Jacobson, K. A.; Kim, H. S. Bull. Korean Chem. Soc. 2005, 26, 1503.
5. Williams, M.; Burnstock, G. In Purinergic Approaches in Experimental Therapeutics; Jacobson, K. A., Jarvis, M. F., Eds.; Wiley-liss: New York, 1997; p 3.
6. Jarvis, M. F. Rev. Analgesia 2003, 7, 1.
7. Kowaluk, E. A.; Bhagwat, S. S.; Jarvis, M. F. Curr. Pharm. Des. 1998, 4, 403.
8. Arch, J. R. S.; Newsholme, E. A. Essays Biochem. 1978, 14, 82.
9. Brake, A.; Schumacher, M.; Julius, D. Chem. Biol. 1996, 3, 229.
10. CATALYST 4.10; Accelrys, Inc.: San Diego, CA, 2005, http://www.accelrys.com
11. Samuel, T.; Jayashree, S.; Allister, J. M.; Jon, S. J. Chem. Inf. Model. 2006, 46, 728.
12. The MDL ISIS/base is available from MDL Information Systems Inc.: San Leandro, CA, http://www.mdl.com
13. Smellie, A.; Teig, S.; Towbin, P. J. Comp. Chem. 1995, 16, 171.
14. Cowart, M.; Lee, C. H.; Gfesser, G. A.; Bayburt, E. K.; Bhagwat, S. S.; Stewart, A. O.; Yu, H.; Kohlhaas, K. L.; McGaraughty, S.; Wismer, C. T.; Mikusa, J.; Zhu, C.; Alexander, K. M.; Jarvis, M. F.; Kowaluk, E. A. Biorg. Med. Chem. Lett. 2001, 11, 83.
15. Ugarkar, B. G.; Castellino, A. J.; DaRe, J. S.; Ramirez-Weinhouse, M.; Kopcho, J. J.; Rosengren, S.; Erion, M. D. J. Med. Chem. 2003, 46, 4750.
16. Perner, R. J.; Gu, Y. G.; Lee, C. H.; Bayburt, E. K.; McKie, J.; Alexander, K. M.; Kohlhaas, K. L.; Wismer, C. T.; Mikusa, J.; Jarvis, M. F.; Kowaluk, E. A.; Bhagwat, S. S. J. Med. Chem. 2003, 46, 5249.
17. Ugarkar, B. G.; Castellino, A. J.; DaRe, J. M.; Kopcho, J. J.; Wiesner, J. B.; Schanzer, J. M.; Erion, M. D. J. Med. Chem. 2000, 43, 2894.
18. Zheng, G. Z.; Lee, C. H.; Pratt, J. K.; Perner, R. J.; Jiang, M. Q.; Gomtsyan, A.; Matulenko, M. A.; Mao, Y.; Koenig, J. R.; Kim, K. H.; Muchmore, S.; Yu, H.; Kohlhaas, K.; Alexander, K. M.; McGaraughty, S.; Chu, K. L.; Wismer, C. T.; Mikusa, J.; Jarvis, M. F.; Marsh, K.; Kowaluk, E. A.; Bhagwat, S. S.; Stewart, A. O. Biorg. Med. Chem. Lett. 2001, 11, 2071.
19. Zheng, G. Z.; Mao, Y.; Lee, C. H.; Pratt, J. K.; Koenig, J. R.; Perner, R. J.; Cowart, M. D.; Gfesser, G. A.; McGaraughty, S.; Chu, K. L.; Zhu, C.; Yu, H.; Kohlhaas, K.; Alexander, K. M.; Wismer, C. T.; Mikusa, J.; Jarvis, M. F.; Kowaluk, E. A.; Stewart, A. O. Biorg. Med. Chem. Lett. 2003, 13, 3041.
20. Perner, R. J.; Lee, C. H.; Jiang, M.; Gu, Y. G.; Didomenico, S.; Bayburt, E. K.; Alexander, K. M.; Kohlhaas, K. L.; Jarvis, M. F.; Kowaluk, E. L.; Bhagwat, S. S. Biorg. Med. Chem. Lett. 2005, 15, 2803.
21. Gomtsyan, A.; Didomenico, S.; Lee, C. H.; Stewart, A. O.; Bhagwat, S. S.; Kowaluk, E. A.; Jarvis, M. F. Biorg. Med. Chem. Lett. 2004, 14, 4165.
22. Matulenko, M. A.; Lee, C. H.; Jiang, M.; Frey, R. R.; Cowart, M. D.; Bayburt, E. K.; Didomenico, S.; Gfesser, G. A.; Gomtsyan, A.; Zheng, G. Z.; McKie, J. A.; Stewart, A. O.; Yu, H.; Kohlhaas, K. L.; Alexander, K. M.; McGaraughty, S.; Wismer, C. T.; Mikusa, J.; Marsh, K. C.; Snyder, R. D.; Diehl, M. S.; Kowaluk, E. A.; Jarvis, M. F.; Bhagwat, S. S. Biorg. Med. Chem. 2005, 13, 3705.
23. Gomtsyan, A.; Didomenico, S.; Lee, C. H.; Matulenko, M. A.; Kim, K.; Kowaluk, E. A.; Wismer, C. T.; Mikusa, J.; Yu, H.; Kohlhaas, K.; Jarvis, M. F.; Bhagwat, S. S. J. Med. Chem. 2002, 45, 3639.
24. Lee, C. H.; Jiang, M.; Cowart, M.; Gfesser, G.; Perner, R.; Kim, K. H.; Gu, Y. G.; Williams, M.; Jarvis, M. F.; Kowaluk, E. A.; Stewart, A. O.; Bhagwat, S. S. J. Med. Chem. 2001, 44, 2133.
25. Lee, C. H.; Daanen, J. F.; Jiang, M.; Yu, H.; Kohlhaas, K. L.; Alexander, K.; Jarvis, M. F.; Kowaluk, E. L.; Bhagwat, S. S. Biorg. Med. Chem. Lett. 2001, 11, 2419.
26. Bharatham, N.; Bharatham, K.; Lee, K. W. J. Mol. Graph. Model. 2006, 25, 813.
27. Du, L. P.; Li, M. Y.; Tsai, K. C.; You, Q. D.; Xia, L. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2005, 332, 677.
28. Bharatham, N.; Bharatham, K.; Lee, K. W. Bull. Korean Chem. Soc. 2007, 28, 200.
29. Lipinski, C. A.; Lombardo, F.; Domiay, B. W.; Freeney, P. J. Adv. Drug Deliv. Rev. 1997, 23, 3.
30. Tetko, I. V. Mini-Rev. Med. Chem. 2003, 3, 809.
31. Sprague, P. In Perspectives in Drug Discovery and Design; Anderson, P. S., Kenyon, G. L., Marshall, G. R., Muller, K., Eds.; ESCOM: Leiden, 1995; Vol. 3, pp 1-20.