Ab initio simulation of the grafting of phenylacetylene on hydrogenated surfaces of crystalline silicon catalyzed by a lewis acid

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 46, 2006, Pages 23403-23409

  Zipoli, Federico ^a   Bernasconi, Marco ^a  

^a UNIVERSITY OF MILANO BICOCCA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACETYLENE; ACIDS; ACTIVATION ENERGY; ALKYLATION; CATALYSIS; COMPUTER SIMULATION; CRYSTALLINE MATERIALS; GRAFTING (CHEMICAL); HYDROGENATION; SILANES; STYRENE;

AB INITIO SIMULATION; HYDROSILYLATION REACTION; METADYNAMICS;

POROUS SILICON;

EID: 33846087393     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp064518m     Document Type: Article

References (56)

1. Buriak, J. M. Chem. Rev. 2002, 102, 1271-1308.
2. Wayner, D. D. M.; Wolkow, R. A. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2002, 2, 23-24.
3. (a) Lopinsky, G. P.; Wayner, D. D. M.; Wolkow, R. A. Nature (London) 2000, 406, 48-51.
4. (b) Lopinsky, G. P.; Wayner, D. D. M.; Wolkow, R. A. Nature (London) 1998, 392, 909-911.
5. Sung, M. M.; Kluth, G. J.; Yauw, O. W., Maboudian, R. Langmuir 1997, 13, 6164-6168.
6. Sieval, A. B.; Demirel, A. L.; Nissink, J. W. M.; Linford, M. R.; van der Maas, J. H.; de Jeu, W. H.; Zuilhof, H.; Sudholter, E. J. R. Langmuir 1998, 14, 1759-1768.
7. Cerofolini, G. F.; Galati, C.; Reina, S.; Renna, L. Semicond. Sci. Technol. 2003, 18, 423-429.
8. Sieval, A. B.; Opitz, R.; Maas, H. P. A.; Shoeman, M. G.; Meijer, G.; Vergeldt, F. J.; Zuilhof, H.; Sudholter, E. J. R. Langmuir 2000, 16, 10359-10368.
9. Lehner, A.; Steinhoff, G.; Brandt, M. S.; Eickoff, M.; Stutzmann, M. J. Appl. Phys. 2003, 94, 2289-2294.
10. Terry, J.; Linford, M. R.; Wigren, C.; Cao, R. Y.; Pianetta, P.; Chidsey, C. E. D. Appl. Phys. Lett. 1997, 71, 1056-1058.
11. Terry, J.; Linford, M. R.; Wigren, C.; Cao, R. Y.; Pianetta, P.; Chidsey, C. E. D. J. Appl. Phys. 1999, 85, 213-221.
12. Cicero, R. L.; Linford, M. R.; Chidsey, C. E. D. Langmuir 2000, 16, 5688-5695.
13. Effenberger, F.; Gotz, G.; Bidlingmaier, B.; Wezstein, M. Angew. Chem., Int. Ed. 1998, 37, 2462-2464.
14. Niederhauser, T. L.; Jiang, G. L.; Lua, Y. Y.; Dorff, M. J.; Woolley, A. T.; Asplund, M. C.; Berges, D. A.; Linford, M. R. Langmuir 2001, 17 5889-5900.
15. Strother, T.; Cai, W.; Zhao, X. S.; Hamers, R. J.; Smith, L. M. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 1205-1209.
16. Sun, Q. Y.; de Smet, L. C. P. M.; van Lagen, B.; Wright, A.; Zuilhof, H.; Sudholter. E. J. R. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 1352-1355.
17. Yam, C. M.; Lopez-Romero, J. M.; Gu, J.; Cai, C. Chem. Commun. 2004, 21, 2510-2511.
18. Fidelis, A.; Ozanam, F.; Chazalviel, J. N. Surf. Sci. 2000, 444, L7-L10.
19. Allongue, P.; Delamar, M.; Desbat, B.; Fagebaume, O.; Hitmi, R.; Pinson, J.; Saveant, J.-M. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 201.
20. Kim, N. Y.; Laibinis, P. E. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 7162-7163.
21. Bansal, A.; Li, X. L.; Lauermann, L.; Lewis, N. S.; Yi, S. I.; Weinberg, W. H. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 7225-7226.
22. Webb, L. J.; Lewis, N. S. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 5404-5412.
23. Boukherroub, R.; Morin, S.; Bensebaa, F.; Wayner, D. D. M. Langmuir 1999, 15, 3831-3835.
24. Sudo, T.; Asao, N.; Gevorgyan, V.; Yamamoto, Y. J. Org. Chem. 1999, 64, 2494-2499.
25. Asao, N.; Sudo, T.; Yamamoto, Y. J. Org. Chem. 1996, 61, 7654-7655.
26. Buriak, J. M.; Stewart, M. P.; Geders, T. W.; Allen, M. J.; Choi, H. C.; Smith, J.; Raftery, D.; Canham, L. T. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 11491-11502.
27. Narducci, D.; Bernardinello, P.; Oldani, M. Appl. Surf. Sci. 2003, 212, 491-496.
28. Laio, A.; Parrinello, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 12562-12566.
29. Iannuzzi, M.; Laio, A.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 2003, 90, 238302-238304.
30. Zipoli, F.; Bernasconi, M.; Laio, A. ChemPhysChem 2005, 6, 1772-1775.
31. Car, R.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1985, 55, 2471-2474.
32. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3865-3868.
33. CPMD V3.9, Copyright IBM Corp (1990-2005) and MPI fuer Festkoerperforschung Stuttgart (1995-2001).
34. Marx, D.; Hutter, J. In Modem Methods and Algorithms of Quantum Chemistry, Forschungszentrum Juelich, NIC Series, 2000; Vol. 1, p 301.
35. Vanderbilt, D. Phys. Rev. B 1990, 41, 7892-7895.
36. Tagami, K.; Tsuchida, E.; Tsukada, M. Surf. Sci. 2000, 446, L108-L112.
37. Takeuchi, N.; Kanai, Y.; Selloni, A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 15890-15896.
38. Reboredo, F. A.; Schwegler, E.; Galli, G. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 15243-15249.
39. Raiteri, P.; Gervasio, F. L.; Laio, A.; Micheletti, C.; Parrinello, M. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 3533-3539.
40. Laio, A.; Rodriguez-Fortea, A.; Gervasio, F. L.; Ceccarelli, M.; Parrinello, M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 6714-6721.
41. Ensig, B.; Laio, A.; Parrinello, M.; Klein, M. L. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 6676-6687.
42. Churakov, S. V.; Iannuzzi, M.; Parrinello, M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 11567-11574.
43. Stirling, A.; Iannuzzi, M.; Parrinello, M.; Molnar, F.; Bernhart, V.; Luinstra, G. A. Organometallics 2005, 24, 2533-2537.
44. Stirling, A.; Innuzzi, M.; Laio, A.; Parrinello M. ChemPhysChem 2004, 5, 1558-1568.
45. Donadio, D.; Bernasconi, M. Phys. Rev. B 2005, 71, 73307.
46. Billeter, S. R.; Curioni, A.; Andreoni, W. Comput Mater. Sci. 2003, 27, 437-445.
47. Banerjee, A.; Adams, N.; Simons, J.; Shepard, R. J. Phys. Chem. B 1985, 89, 52.
48. Henkelman, G.; Jonsson, H. J. Chem. Phys. 2000, 113, 9978-9985.
49. Marzari, N.; Vanderbilt, D. Phys. Rev. B 1997, 56, 12847-12864.
50. Silvestrelli, P. L.; Marzari, N.; Vanderbilt, D.; Parrinello, M. Solid State Commun. 1998, 107, 7-11.
51. Boys, S. F. Rev. Mod. Phys. 1960, 32, 296-299.
52. Zhao, Y.; González-Garcia, N.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 2012-2018.
53. 3 adduct spontaneously rotates during the simulation to reach the transition state of Figure 4c.
54. Pedemenonte, L.; Bracco, G.; Relini, A.; Rolandi, R.; Narducci, D. Appl. Surf. Sci. 2003, 212, 595-600.
55. Mayo, S. L.: Olafson, B. D.; Goddard, W. A., III J. Phys. Chem. 1990, 94, 8897-8909.
56. Rappe, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Goddard, W. A., III; Skiff, W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024-10035.