Benchmark database of barrier heights for heavy atom transfer, nucleophilic substitution, association, and unimolecular reactions and its use to test theoretical methods

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 109, Issue 9, 2005, Pages 2012-2018

  Zhao, Yan ^a   González Garda, Núria ^a   Truhlar, Donald G ^a  

^a University of Minnesota   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GENERALIZED GRADIENT APPROXIMATION (GGA); KINETIC ENERGY DENSITY; ORBITALS; WAVE FUNCTION THEORY;

APPROXIMATION THEORY; DATABASE SYSTEMS; EXTRAPOLATION; KINETIC ENERGY; MATHEMATICAL MODELS; PARAMETER ESTIMATION; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; REACTION KINETICS;

CHEMICAL REACTIONS;

EID: 15544366274     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp045141s     Document Type: Article

References (90)

1. Hohenberg, P.; Kohn, W. Phys. Rev. B 1964, 136, 864.
2. Kohn, W.; Sham, L. J. Phys. Rev. A 1965, 140, 1133.
3. Perdew, J. P.; Zunger, A. Phys. Rev. B 1981, 23, 5048.
4. Perdew, J. P. Phys. Rev. B 1986, 33, 8822.
5. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098.
6. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
7. Tschinke, V.; Ziegler, T. A. J. Chem. Phys. 1990, 93, 8051.
8. Perdew, J. P. In Electronic Structure of Solids 91; Ziesche, P., Eschig, H., Eds.; Akademie Verlag: Berlin, 1991; p 11.
9. Perdew, J. P.; Wang, Y. Phys. Rev. B 1992, 45, 13244.
10. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 1372.
11. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
12. Stephens, P. J.; Devlin, F. J.; Chabalowski, C. F.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 11623.
13. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1996, 104, 1040.
14. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett 1996, 77, 3865.
15. Perdew, J. P.; Ernzerhof, M.; Burke, K. J. Chem. Phys. 1996, 105, 9982.
16. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1997, 107, 8554.
17. Filatov, M.; Thiel, W. Mol. Phys. 1997, 847.
18. Gritsenko, O. V.; Schipper, P. R. T.; Baerends, E. J. J. Chem. Phys. 1997, 107, 5007.
19. Adamo, C.; Barone, V. J. Chem. Phys. 1998, 108, 664.
20. Schmider, H. L.; Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1998, 108, 9624.
21. Voorhis, T. V.; Scuseria, G. E. J. Chem. Phys. 1998, 109, 400.
22. Hamprecht, F. A.; Cohen, A. J.; Tozer, D. J.; Handy, N. C. J. Chem. Phys. 1998, 109, 6264.
23. Krieger, J. B.; Chen, J.; Iafrate, G. J. Int. J. Quantum Chem. 1998, 69, 255.
24. Rey, J.; Savin, A. Int. J. Quantum Chem. 1998, 69, 581.
25. Krieger, J. B.; Chen, J.; Iafrate, G. J.; Savin, A. In Electron Correlations and Materials Properties; Gonis, A., Kioussis, N., Eds.; Plenum: New York, 1999.
26. Engel, E.; Dreizler, R. M. J. Comput. Chem. 1999, 20, 31.
27. Hammer, B.; Hansen, L. B.; Norskov, J. K. Phys. Rev. B 1999, 59, 7413.
28. Perdew, J. P.; Kurth, S.; Zupan, A.; Blaha, P. Phys. Rev. Lett 1999, 82, 2544.
29. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 2000, 112, 4020.
30. Lynch, B. J.; Fast, P. L.; Harris, M.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 4811.
31. Proynov, E.; Chermette, H.; Salahub, D. R. J. Chem. Phys. 2000, 113, 10013.
32. Handy, N. C.; Cohen, A. J. Mol. Phys. 2001, 99, 403.
33. Hoe, W.-M.; Cohen, A. J.; Handy, N. C. Chem. Phys. Lett. 2001, 341, 319.
34. Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 2936.
35. Wilson, P. J.; Bradley, T. J.; Tozer, D. J. J. Chem. Phys. 2001, 115, 9233.
36. Adamo, C.; Barone, V. J. Chem. Phys. 2002, 116, 5933.
37. Menconi, G.; Tozer, D. J. Chem. Phys. Lett. 2002, 360, 38.
38. Boese, A. D.; Handy, N. C. J. Chem. Phys. 2002, 116, 9559.
39. Baker, J.; Pulay, P. J. Chem. Phys. 2002, 117, 1441.
40. Toulouse, J.; Savin, A.; Adamo, C. J. Chem. Phys. 2002, 117, 10465.
41. Coote, M. L.; Wood, G. P. F.; Radom, L. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 12124.
42. Lynch, B. J.; Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 1384.
43. Karasiev, V. V. J. Chem. Phys. 2003, 118, 8576.
44. Boese, A. D.; Martin, J. M. L.; Handy, N. C. J. Chem. Phys. 2003, 119, 3005.
45. Guner, V.; Khuong, K. S.; Leach, A. G.; Lee, P. S.; Bartberger, M. D.; Houk, K. N. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 1445.
46. Staroverov, V. N.; Scuseria, G. E.; Tao, J.; Perdew, J. P. J. Chem. Phys. 2003, 119, 12129.
47. Hsu, J. Y. Phys. Rev. Lett 2003, 91, 133001.
48. Tao, J.; Perdew, J. P.; Staroverov, V. N.; Scuseria, G. E. Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 146401.
49. Xu, X.; Goddard, W. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 2673.
50. Zhao, Y.; Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 2715.
51. Gomez-Balderas, R.; Coote, M. L.; Henry, D. J.; Radom, L. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 2874.
52. Li, Q. S.; Xu, X. D.; Zhang, S. Chem. Phys. Lett. 2004, 20.
53. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. 2004, 108, 6908.
54. Andersson, S.; Gruning, M. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 7621.
55. Boese, A. D.; Martin, J. M. L. J. Chem. Phys. 2004, 121, 3405.
56. Kohn, W.; Becke, A. D.; Parr, R. G. J. Phys. Chem. 1996, 100, 12974.
57. Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 3898.
58. Zhao, Y.; Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 4786.
59. Zhao, Y.; Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 43.
60. Pople, J. A.; Head-Gordon, M.; Raghavachari, K. J. Chem. Phys. 1987, 87, 5968.
61. Coote, M. L. J. Phys. Chem. 2004, 108, 3865.
62. Martin, J. M. L.; Oliveira, G. d. J. Chem. Phys. 1999, 111, 1843.
63. Parthiban, S.; de Oliveira, G.; Martin, J. M. L. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 895.
64. Martin, J. M. L.; Parthiban, S. In Quantum Mechanical Prediction of Thermochemical Data; Cioslowski, J., Ed.; Kluwer: Drdrecht, 2001.
65. Parthiban, S.; Martin, J. M. L. J. Chem. Phys. 2001, 114, 6014.
66. Boese, A. D.; Oren, M.; Atasoylu, O.; Martin, J. M. L.; Kállay, M.; Gauss, J. J. Chem. Phys. 2004, 120, 4129.
67. Tucker, S. C.; Truhlar, D. G. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 3338.
68. Villa, J.; Corchado, J. C.; Gonzalez-Lafont, A.; Lluch, J. M.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 5061.
69. Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 8996.
70. Slater, J. C. Quantum Theory of Molecular and Solids. Vol. 4: The Self-Consistent Field for Molecular and Solids; McGraw-Hill: New York, 1974.
71. Møller, C.; Plesset, M. S. Phys. Rev. 1934, 46, 618.
72. Hehre, W. J.; Radom, L.; Schleyer, P. v. R.; Pople, J. A. Ab Initio Molecular Orbital Theory; Wiley: New York, 1986.
73. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A.; Jr., T. V.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision C.01; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
74. Werner, H.-J.; Knowles, P. J.; Amos, R. D.; Bernhardsson, A.; Berning, A.; Celani, P.; Cooper, D. L.; Deegan, M. J. O.; Dobbyn, A. J.; Eckert, F.; Hampel, C.; Hetzer, G.; Korona, T.; Lindh, R.; Lloyd, A. W.; McNicholas, S. J.; Manby, F. R.; Meyer, W.; Mura, M. E.; Nicklass, A.; Palmieri, P.; Pitzer, R.; Rauhut, G.; Schütz, M.; Schumann, U.; Stoll, H.; Stone, A. J.; Tarroni, R.; Thorsteinsson, T. MOLPRO, 2002.6; University of Birmingham: Birmingham, 2002.
75. Fast, P. L.; Sanchez, M. L.; Truhlar, D. G. Chem. Phys. Lett. 1999, 306, 407.
76. Curtiss, L. A.; Redfern, P. C.; Raghavachari, K.; Rassolov, V.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1999, 110, 4703.
77. Curtiss, L. A.; Raghavachari, K.; Redfern, P. C.; Rassolov, V.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1998, 109, 7764.
78. Frisch, M. J.; Pople, J. A.; Binkley, J. S. J. Chem. Phys. 1984, 80, 3265.
79. Lynch, B. J.; Zhao, Y.; Truhlar, D. G. http://comp.chem.umn.edu/ database.
80. Farneth, W. E.; Brauman, J. I. J. Am. Chem. Soc. 1976, 98, 7891.
81. Olmstead, W. N.; Brauman, J. I. J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 4219.
82. Pellerite, M. J.; Brauman, J. I. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 5993.
83. Hu, W.-P.; Truhlar, D. G. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10726.
84. Gonzales, J. M.; Cox, R. S.; Brown, S. T.; Allen, W. D.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 11327.
85. Gonzales, J. M.; Pak, C.; Cox, R. S.; Allen, W. D.; Schaefer, H. F.; Csaszar, A. G.; Tarczay, G. Chem.-Eur. J. 2003, 9, 2173.
86. Chabinyc, M. L.; Craig, S. L.; Regan, C. K.; Brauman, J. I. Science 1998, 279, 1882.
87. Davico, G. E.; Bierbaum, V. M. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 1740.
88. Viggiano, A. A.; Midey, A. J. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 6786.
89. Angel, L. A.; Garcia, S. P.; Ervin, K. M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 105, 4042.
90. Zhao, Y.; Pu, J.; Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 673.