Synthesis and characterization of DNA-modified silicon (111) surfaces

Journal of the American Chemical Society

Volumn 122, Issue 6, 2000, Pages 1205-1209

  Strother, Todd ^a   Cai, Wei ^a   Zhao, Xinsheng ^b   Hamers, Robert J ^a   Smith, Lloyd M ^a  

^a UNIVERSITY OF WISCONSIN MADISON   (United States)

^b PEKING UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; OLIGODEOXYNUCLEOTIDE; SILICON DERIVATIVE;

ARTICLE; CHEMICAL ANALYSIS; CHEMICAL REACTION; CHEMICAL STRUCTURE; CONTROLLED STUDY; DENSITY; DNA HYBRIDIZATION; MOLECULAR RECOGNITION; SEMICONDUCTOR; SYNTHESIS; TECHNIQUE; ULTRAVIOLET RADIATION;

EID: 0034673351     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja9936161     Document Type: Article

References (44)

1. Linford, M. R.; Fenter, P.; Eisenberger, P. M.; Chidsey, C. E. D. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 3145-3155.
2. Chrisey, L. A.; Lee, G.; O'Ferrall, C. E. Nucleic Acids Res. 1996, 25, 3031-3039.
3. Frutos, A. G., Liu, Q.; Thiel, A. J.; Sanner, A. M. W.; Condon, A. E.; Smith, L. M.; Corn, R. M. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 4748-4757.
4. Shchepinov, M. S.; Case-Green, S. C.; Southern, E. M. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 1155-1161.
5. Wagner, P.; Nock, S.; Spudich, J. A.; Volkmuth, W. D.; Chu, S.; Cicero, R. L.; Wade, C. P.; Linford, M. R.; Chidsey, C. E. D. J. Struct. Biol. 1997, 119, 189-201.
6. Arnold, B. A.; Hepler, R. W.; Keller, P. M. BioTechniques 1998, 25, 106-110.
7. Bamdad, S. Biophys. J. 1998, 75, 1997-2003.
8. Livache, T.; Fouque, B.; Roget, A.; Marchand, J.; Bidan, G.; Teoule, R.; Mathis, G. Anal. Biochem. 1998, 255, 188-194.
9. Sieval, A. B.; Demirel, A. L.; Nissink, J. W. M.; Linford, M. R.; van der Mass, J. H.; de Jeu, W. H.; Zuilhof, H.; Sudholter, E. J. R. Langmuir 1998, 14, 1759-1768.
10. Smith, L. M.; Corn, R. M.; Condon, A. E.; Lagally, M. G.; Frutos, A. G.; Liu, Q.; Thiel, A. J. J. Comput. Biol. 1998, 5, 255-267.
11. Yang, M.; Kong, R. Y. C.; Kazmi, M.; Leung, K. C. Chem. Lett. 1998, 257-258.
12. Rasmussen, S. R.; Larsen, M. R.; Rasmussen, S. E. Anal. Biochem. 1991, 30, 138-142.
13. Kremski, J. N.; Wooters, J. L.; Dougherty, J. P.; Meyers, R. E.; Collins, M.; Brown, E. L. Nucleic Acids Res. 1987, 15, 2891-2909.
14. Liu, Q.; Frutos, A. G.; Thiel, A. J.; Corn, R. M.; Smith, L. M. J. Comput. Biol. 1998, 5, 269-278.
15. Lund, V.; Schmid, R.; Rickwood, D.; Hornes, E. Nucleic Acids Res. 1988, 16, 10860-10878.
16. Pan, S.; Castner, D. G.; Ratner, B. D. Langmuir 1998, 14, 3545-3550.
17. Huang, J.; Dahlgren, D. A.; Hemminger, J. C. Langmuir 1994, 10, 626-628.
18. Bain, C. D.; Troughton, B. E.; Tao, Y.; Evall, J.; Whitesides, G. M.; Nuzzo, R. G. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 321-335.
19. Millan, K. M.; Spurmanis, A. J.; Mikkelsen, S. R. Electroanalysis 1992, 4, 929-932.
20. Zhao, Y.; Pang, D.; Wang, Z.; Cheng, J.; Qi, Y. J. Electroanal. Chem. 1997, 431, 203-209.
21. Hashimoto, K.; Ito, K.; Ishimori, Y. Anal. Chem. 1994, 66, 3830-3833.
22. Pang, D.; Zhang, M.; Wang, Z.; Qi, Y.; Cheng, J.; Liu, Z. J. Electroanal. Chem. 1996, 403, 183-188.
23. Wang, J.; Fernandes, J. R.; Kubota, L. T. Anal. Chem. 1998, 70, 3699-3702.
24. Piunno, P. A. E.; Krull, U. J.; Hudson, R. H. E.; Damha, M. J.; Cohen, H. Anal. Chim. Acta 1994, 288, 205-214.
25. Souteyrand, E.; Cloarec, J. P.; Martin, J. R.; Wilson, C.; Lawrence, I.; Mikkelsen, S.; Lawrence, M. F. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 2980-2985.
26. Henke, L.; Piunno, P. A. E.; McClure, A. C.; Krull, U. J. Anal. Chim. Acta 1997, 344, 201-213.
27. Millan, K. M.; Mikkelsen, S. R. Anal. Chem. 1993, 65, 2317-2323.
28. Frutos, A. G.; Smith, L. M.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10277-10282.
29. Lamture, J. B.; Beattie, K. L.; Burke, B. E.; Eggers, M. D.; Ehrlich, D. J.; Fowler, R.; Hollis, M. A.; Kosicki, B. B.; Reich, R. K.; Smith, S. R.; Varma, R. S.; Hogan, M. E. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 2121-2125.
30. Guo, Z.; Guilfoyle, R. A.; Thiel, A. J.; Wang, R.; Smith, L. M. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 5456-5465.
31. O'Donnell, M. J.; Tang, K.; Doster, H.; Smith, D. L.; Cantor, C. R. Anal. Chem. 1997, 69, 2438-2443.
32. Southern, E. M.; Case-Green, S. C.; Johnson, M.; Mir, K. U.; Wang, L.; Williams, J. C. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 1368-1373.
33. Rogers, Y.; Jiang-Baucom, P.; Huang, Z.; Bogdanov, V.; Anderson, S.; Boyce-Jacino, M. T. Anal. Biochem. 1999, 266, 23-30.
34. Waddell, T. G.; Leyden, D. E.; DeBello, M. T. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 5303-5307.
35. Ulman, A. Chem. Rev. 1996, 96, 1533-1554.
36. Terry, J.; Linford, M. R.; Wigren, C.; Cao, R.; Pianetta, P.; Chidsey, C. E. D. J. Appl. Phys. 1999, 85, 213-221.
37. Zhao, X.; Hamers, R. In preparation, 1999.
38. Hamers, R. J.; Hovis, J. S.; Seung, L.; Liu, H.; Shan, J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 1489-1492.
39. Chang, F. C.; Wood, N. F. Tetrahedron Lett. 1964, 40, 2969-2973.
40. Gassman, P. G.; Schenk, W. N. J. Org. Chem. 1976, 42, 918-920.
41. Jordan, C. E.; Frutos, A. G.; Thiel, A. J.; Corn, R. M. Anal. Chem. 1997, 4939-4947.
42. User Guide to DNA Modification; Glen Research Corporation: Sterling, VA, 1996.
43. Wasserman, S. R.; Tao, Y.; Whitesides, G. M. Langmuir 1989, 5, 1074-1087.
44. Sambrook, J.; Fritsch, E. F.; Maniatis, T. Molecular Cloning A laboratory Manual; Cold Spring Harbor Laboratory Press: Plainview, New York, 1989; Vol. 2.