Enhanced signal dispersion in saturation transfer difference experiments by conversion to a 1D-STD-homodecoupled spectrum

Journal of Biomolecular NMR

Volumn 36, Issue 2, 2006, Pages 103-109

  Martín Pastor, Manuel ^a   Vega Vázquez, Marino ^a   De Capua, Antonia ^b   Canales, Angeles ^c   André, Sabine ^d   Gabius, Hans Joachim ^d   Jiménez Barbero, Jesús ^d  

^a UNIVERSITY OF SANTIAGO DE COMPOSTELA   (Spain)

^b SECOND UNIVERSITY OF NAPLES   (Italy)

^c CENTRO DE INVESTIGACIONES BIOLÓGICAS   (Spain)

^d UNIVERSITY OF MUNICH   (Germany)

Author keywords

J resolved spectroscopy; Lectin; Saturation transfer difference; Sugar code; T1 relaxation filter

Indexed keywords

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CONTROLLED STUDY; EPITOPE MAPPING; INFORMATION PROCESSING; LIGAND BINDING; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE IMAGING; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PRIORITY JOURNAL; QUANTITATIVE ANALYSIS; RECEPTOR BINDING; SIGNAL DETECTION; STRUCTURE ANALYSIS;

CARBOHYDRATE CONFORMATION; CARBOHYDRATE SEQUENCE; COMPUTER SIMULATION; MODELS, CHEMICAL; MODELS, MOLECULAR; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, BIOMOLECULAR;

EID: 33749182806     PISSN: 09252738     EISSN: 15735001     Source Type: Journal    
DOI: 10.1007/s10858-006-9055-4     Document Type: Article

References (58)

1. Alonso-Plaza J.M., Canales M.A., Jiménez M., Roldán J.L., García-Herrero A., Hurrino L., Asensio J.L., Caàada F.J., Romero A., Siebert H.-C., André S., Sols D., Gabius H.-J., Jiménez-Barbero J. (2001). Biochim. Biophys. Acta 1568:225-236
2. André S., Kaltner H., Lensch M., Russwurm R., Siebert H.-C., Fallsehr C., Tajkhorshid E., Heck A.J.R., von Knebel Doeberitz M., Gabius H.-J., Kopitz J. (2005). Int. J. Cancer 114:46-57
3. Asensio J.L., Espinosa J.F., Dietrich H., Cañada F.J., Schmidt R.R., Martín-Lomas M., André S., Gabius H.-J., Jiménez-Barbero J. (1999). J. Am. Chem. Soc. 121:8995-9000
4. Breg J., Romijn, D., van Halbeek H., Vliegenthart J.F.G., Visser R.A., Haasnoot C.A.G. (1988). Carbohydr. Res. 174:23-36
5. Chen A., Shapiro M.J. (1998). J. Am. Chem. Soc. 120:10258-10259
6. Chen A., Shapiro M.J. (2000). J. Am. Chem. Soc. 122:414
7. Claasen B., Axmann M., Meinecke R., Meyer B. (2005). J. Am. Chem. Soc. 127:916-919
8. Cobas J.C., Martín-Pastor M. (2004). J. Magn. Reson. 171:20-24
9. Cobas J.C., Sardina F.J. (2004). Concepts Magn. Reson. 19A:80-96
10. Dalvit C., Fasolini M., Flocco M., Knapp S., Pevarello P., Veronesi M. (2002). J. Med. Chem. 45:2610-2614
11. Dalvit C., Pevarello P., Tato M., Veronesi M., Vulpetti A., Sundstrom M. (2000). J. Biomol. NMR 18:65-68
12. Dam T.K., Gabius H.-J., André S., Kaltner H., Lensch M., Brewer C.F. (2005). Biochemistry 44:12564-12571
13. Di Micco S., Bassarello C., Bifulco G., Riccio R., Gomez-Paloma L. (2005). Angew. Chem. Int. Ed. 44:1-5
14. Gabius H.-J. (1997). Eur. J. Biochem. 243:543-576
15. Gabius H.-J. (2001). Anat. Histol. Embryol. 30:3-31
16. Gabius H.-J. (2006). Crit. Rev. Immunol. 26:43-79
17. Gabius H.-J., Siebert H.-C., André S., Jiménez-Barbero J., Rüdiger H. (2004). ChemBioChem 5:740-764
18. Guenneau F., Mutzenhardt P., Grandclaude D., Canet D. (1999). J. Magn. Reson. 140:250-258
19. Hajduk P.J., Mack J.C., Olejniczak E.T., Park C., Dandliker P.J., Beutel B.A. (2004). J. Am. Chem. Soc. 126:2390-2398
20. Hajduk P.J., Olejniczak E.T., Fesik S.W. (1997). J. Am. Chem. Soc. 119:12257-12261
21. Jahnke W., Floersheim P., Ostermeier C., Zhang X., Hemmig R., Hurth K., Uzunov D.P. (2002). Angew. Chem. Int. Ed. 41:3420-3423
22. Jayalakshmi V., Krishna N.R. (2005). J. Am. Chem. Soc. 127:14080-14084
23. Jayalakshmi V., Krishna N.R. (2004). J. Magn. Reson. 168:36-45
24. Jayalakshmi V., Biet T., Peters T., Krishna N.R. (2004). J. Am. Chem. Soc. 126:8610-8611
25. Johnson M.A., Pinto B.M. (2002). J. Am. Chem. Soc. 124:15368-15374
26. Klein J., Meinecke R., Mayer M., Meyer B. (1999). J. Am. Chem. Soc. 121:5336-5337
27. Kopitz J., Russwurm R., Kaltner H., André S., Dotti C.G., Gabius H.-J., Abad-Rodriguez J. (2004). Dev. Brain. Res. 153:189-196
28. LaPlante S.R., Aubry N., Deziel R., Ni F., Xu P. (2000). J. Am. Chem. Soc. 120:12530-12535
29. Leonidas D.D., Vatzaki E.H., Vorum H., Celis J.E., Madsen P., Acharya K.R. (1998). Biochemistry 37:13930-13940
30. Li D., DeRose E.F., London R.E. (1999). J. Biomol. NMR 15:71-76
31. Li D., Levy L.A., Gabel S.A., Lebetkin M.S., DeRose E.F., Wall M.J., Howell E.E., London R.E. (2001). Biochemistry 40:4242-4252
32. Lin M., Shapiro M.J. (1996). J. Org. Chem. 61:7617-7619
33. Lin M., Shapiro M.J., Wareing J.R. (1997). J. Am. Chem. Soc. 119:5249-5250
34. London R.E. (1999). J. Magn. Reson. 141:301-311
35. López-Lucendo M.F., Solís D., André S., Hirabayashi J., Kasai K.-I., Kaltner H., Gabius H.-J., Romero A. (2004). J. Mol. Biol. 343:957-970
36. Mari S., Serrano-Gomez D., Cañada F.J., Corbi A.L., Jiménez-Barbero J. (2005). Angew. Chem. Int. Ed. 44:296-298
37. Mayer M., Meyer B. (1999). Angew. Chem. Int. Ed. Eng. 38:1784-1788
38. Mayer M., Meyer B. (2000). J. Med. Chem. 43:2093-2099
39. Mayer M., Meyer B. (2001). J. Am. Chem. Soc. 123:6108-6117
40. Meyer B., Peters T. (2003). Angew. Chem. Int. Ed. 42:864-890
41. Meyer B., Weimar T., Peters T. (1997). Eur. J. Biochem. 246:705-709
42. Möller H., Serttas N., Paulsen H., Burchell J.M., Taylor-Papadimitriou J., Meyer B. (2002). Eur. J. Biochem. 269:1444-1455
43. Peng J.W., Moore J., Abdul-Manan N. (2004). Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 44:225-256
44. Piotto M., Saudek V., Sklena V. (1992). J. Biomol. NMR 2:661-665
45. Platzer N., Davoust D., Lhermitte M., Bauvy D., Meyer D.M., Derappe C. (1989). Carbohydr. Res. 191:191-207
46. Reuter G., Gabius H.-J. (1999). Cell. Mol. Life Sci. 55:368-422
47. Rivera A., Cañada J., Nieto O., Jimenez-Barbero J., Martin-Lomas M. (1992). Eur. J. Biochem. 209:415-422
48. Siebert H.-C., André S., Lu S.Y., Frank M., Kaltner H., van Kuik J.A., Korchagina E.Y., Bovin N.V., Tojkhorshid E., Kaptein R., Vliegenthart J.F.G., von der Lieth C.-W., Jiménez-Barbero J., Gabius H.-J. (2003). Biochemistry 42:14762-14773
49. Siriwardena A.H., Tian F., Noble S., Prestegard J.H. (2002). Angew. Chem. Int. Ed. 41:3454-3457
50. Solis D., Fernandez P., Diaz-Maurino T., Jiménez-Barbero J., Martin-Lomas M. (1993). Eur. J. Biochem. 214:677-683
51. Solís D., Jiménez-Barbero J., Kaltner H., Romero A., Siebert H.-C., von der Lieth C.-W., Gabius H.-J. (2001). Cells Tissues Organs 168:5-23
52. Solís D., Romero A., Kaltner H., Gabius H.-J., Diaz-Mauriño T. (1996). J. Biol. Chem. 271:12744-12748
53. Varela P.F., Solís D., Díaz-Mauriño T., Kaltner H., Gabius H.-J., Romero A. (1999). J. Mol. Biol. 294:537-549
54. Vogtherr M., Peters T. (2000). J. Am. Chem. Soc. 122:6093-6099
55. Wang Y.-S., Liu D., Wyss F.D. (2004). Magn. Reson. Chem. 42:485-489
56. Wu L.N.S., Lin X., Zheng L., Rui L. (2002). J. Chem. Inf. Comput. Sci. 42:274-283
57. Yan J., Kline A.D., Mo H., Zartler E.R., Shapiro M.J. (2002). J. Am. Chem. Soc. 124:9984-9985
58. Yuen Y., Wen X., Sanders D.A.R., Pinto B.M. (2005). Biochemistry 44:14080-14089