The living test-tube: Imaging of real-time gene expression

Soft Matter

Volumn 2, Issue 5, 2006, Pages 361-370

  Shav Tal, Yaron ^a  

^a BAR ILAN UNIVERSITY   (Israel)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 33745727726     PISSN: 1744683X     EISSN: 17446848     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b600234j     Document Type: Review

References (91)

1. R. Y. Tsien Annu. Rev. Biochem. 1998 67 509 544
2. A. I. Lamond D. L. Spector Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2003 4 605 612
3. T. Misteli J. F. Caceres D. L. Spector Nature 1997 387 523 527
4. J. Lippincott-Schwartz G. H. Patterson Science 2003 300 87 91
5. D. Axelrod D. E. Koppel J. Schlessinger E. Elson W. W. Webb Biophys. J. 1976 16 1055 1069
6. N. B. Cole C. L. Smith N. Sciaky M. Terasaki M. Edidin J. Lippincott-Schwartz Science 1996 273 797 801
7. M. Dundr U. Hoffmann-Rohrer Q. Hu I. Grummt L. I. Rothblum R. D. Phair T. Misteli Science 2002 298 1623 1626
8. G. H. Patterson J. Lippincott-Schwartz Science 2002 297 1873 1877
9. R. M. Clegg O. Holub C. Gohlke Methods Enzymol. 2003 360 509 542
10. D. Magde E. L. Elson W. W. Webb Biopolymers 1974 13 29 61
11. J. C. Politz R. A. Tuft T. Pederson R. H. Singer Curr. Biol. 1999 9 285 291
12. J. C. Ritland Politz R. A. Tuft K. V. Prasanth N. Baudendistel K. E. Fogarty L. M. Lifshitz J. Langowski D. L. Spector T. Pederson Mol. Biol. Cell 2005
13. L. Schmiedeberg K. Weisshart S. Diekmann G. Meyer Zu Hoerste P. Hemmerich Mol. Biol. Cell 2004 15 2819 2833
14. M. Wachsmuth W. Waldeck J. Langowski J. Mol. Biol. 2000 298 677 689
15. J. M. Levsky R. H. Singer J. Cell Sci. 2003 116 2833 2838
16. J. C. Politz K. L. Taneja R. H. Singer Nucleic Acids Res. 1995 23 4946 4953
17. K. Ainger D. Avossa F. Morgan S. J. Hill C. Barry E. Barbarese J. H. Carson J. Cell Biol. 1993 123 431 441
18. M. R. Jacobson T. Pederson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 7981 7986
19. M. R. Jacobson L. G. Cao Y. L. Wang T. Pederson J. Cell Biol. 1995 131 1649 1658
20. G. S. Wilkie I. Davis Cell 2001 105 209 219
21. E. L. Barry F. A. Gesek P. A. Friedman Biotechniques 1993 15 1016 1018, 1020
22. P. L. McNeil E. Warder J. Cell Sci. 1987 88 Pt 5 669 678
23. M. Carmo-Fonseca R. Pepperkok B. S. Sproat W. Ansorge M. S. Swanson A. I. Lamond EMBO J. 1991 10 1863 1873
24. C. Molenaar A. Abdulle A. Gena H. J. Tanke R. W. Dirks J. Cell Biol. 2004 165 191 202
25. C. Molenaar K. Wiesmeijer N. P. Verwoerd S. Khazen R. Eils H. J. Tanke R. W. Dirks EMBO J. 2003 22 6631 6641
26. S. Agrawal Z. Jiang Q. Zhao D. Shaw Q. Cai A. Roskey L. Channavajjala C. Saxinger R. Zhang Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1997 94 2620 2625
27. T. L. Fisher T. Terhorst X. Cao R. W. Wagner Nucleic Acids Res. 1993 21 3857 3865
28. P. Lorenz B. F. Baker C. F. Bennett D. L. Spector Mol. Biol. Cell 1998 9 1007 1023
29. P. Lorenz T. Misteli B. F. Baker C. F. Bennett D. L. Spector Nucleic Acids Res. 2000 28 582 592
30. S. Tyagi F. R. Kramer Nat. Biotechnol. 1996 14 303 308
31. N. Nitin P. J. Santangelo G. Kim S. Nie G. Bao Nucleic Acids Res. 2004 32 e58
32. A. Calapez H. M. Pereira A. Calado J. Braga J. Rino C. Carvalho J. P. Tavanez E. Wahle A. C. Rosa M. Carmo-Fonseca J. Cell Biol. 2002 159 795 805
33. W. E. Theurkauf T. I. Hazelrigg Development 1998 125 3655 3666
34. E. Bertrand P. Chartrand M. Schaefer S. M. Shenoy R. H. Singer R. M. Long Mol. Cell 1998 2 437 445
35. A. S. Belmont Trends Cell Biol. 2001 11 250 257
36. E. M. Manders H. Kimura P. R. Cook J. Cell Biol. 1999 144 813 821
37. W. F. Marshall A. Straight J. F. Marko J. Swedlow A. Dernburg A. Belmont A. W. Murray D. A. Agard J. W. Sedat Curr. Biol. 1997 7 930 939
38. J. Vazquez A. S. Belmont J. W. Sedat Curr. Biol. 2001 11 1227 1239
39. P. Heun T. Laroche K. Shimada P. Furrer S. M. Gasser Science 2001 294 2181 2186
40. J. R. Chubb S. Boyle P. Perry W. A. Bickmore Curr. Biol. 2002 12 439 445
41. S. M. Gasser Science 2002 296 1412 1416
42. F. Hediger F. R. Neumann G. van Houwe K. Dubrana S. M. Gasser Curr. Biol. 2002 12 2076 2089
43. K. Bystricky T. Laroche G. van Houwe M. Blaszczyk S. M. Gasser J. Cell Biol. 2005 168 375 387
44. V. Levi Q. Ruan M. Plutz A. S. Belmont E. Gratton Biophys. J 2005 89 4275 4285
45. D. Zink T. Cremer R. Saffrich R. Fischer M. F. Trendelenburg W. Ansorge E. H. Stelzer Hum. Genet. 1998 102 241 251
46. T. Cremer C. Cremer Nat. Rev. Genet. 2001 2 292 301
47. A. Bolzer G. Kreth I. Solovei D. Koehler K. Saracoglu C. Fauth S. Muller R. Eils C. Cremer M. R. Speicher T. Cremer PLoS Biol. 2005 3 e157
48. T. Misteli A. Gunjan R. Hock M. Bustin D. T. Brown Nature 2000 408 877 881
49. R. D. Phair T. Misteli Nature 2000 404 604 609
50. H. Kimura P. R. Cook J. Cell Biol. 2001 153 1341 1353
51. M. A. Lever J. P. Th'ng X. Sun M. J. Hendzel Nature 2000 408 873 876
52. R. D. Phair P. Scaffidi C. Elbi J. Vecerova A. Dey K. Ozato D. T. Brown G. Hager M. Bustin T. Misteli Mol. Cell. Biol. 2004 24 6393 6402
53. D. Gerlich J. Beaudouin B. Kalbfuss N. Daigle R. Eils J. Ellenberg Cell 2003 112 751 764
54. J. Walter L. Schermelleh M. Cremer S. Tashiro T. Cremer J. Cell Biol. 2003 160 685 697
55. E. M. Manders A. E. Visser A. Koppen W. C. de Leeuw R. van Liere G. J. Brakenhoff R. van Driel Chromosome Res. 2003 11 537 547
56. T. Tumbar G. Sudlow A. S. Belmont J. Cell Biol. 1999 145 1341 1354
57. T. Tsukamoto N. Hashiguchi S. M. Janicki T. Tumbar A. S. Belmont D. L. Spector Nat. Cell Biol. 2000 2 871 878
58. T. Tumbar A. S. Belmont Nat. Cell Biol. 2001 3 134 139
59. S. Dietzel K. Zolghadr C. Hepperger A. S. Belmont J. Cell Sci. 2004 117 4603 4614
60. J. G. McNally W. G. Muller D. Walker R. Wolford G. L. Hager Science 2000 287 1262 1265
61. W. G. Muller D. Walker G. L. Hager J. G. McNally J. Cell Biol. 2001 154 33 48
62. G. V. Rayasam C. Elbi D. A. Walker R. Wolford T. M. Fletcher D. P. Edwards G. L. Hager Mol. Cell. Biol. 2005 25 2406 2418
63. D. L. Stenoien A. C. Nye M. G. Mancini K. Patel M. Dutertre B. W. O'Malley C. L. Smith A. S. Belmont M. A. Mancini Mol. Cell. Biol. 2001 21 4404 4412
64. D. L. Stenoien K. Patel M. G. Mancini M. Dutertre C. L. Smith B. W. O'Malley M. A. Mancini Nat. Cell Biol. 2001 3 15 23
65. K. Sugaya M. Vigneron P. R. Cook J. Cell Sci. 2000 113 Pt 15 2679 2683
66. H. Kimura K. Sugaya P. R. Cook J. Cell Biol. 2002 159 777 782
67. M. Hieda H. Winstanley P. Maini F. J. Iborra P. R. Cook Chromosome Res. 2005 13 135 144
68. M. Becker C. Baumann S. John D. A. Walker M. Vigneron J. G. McNally G. L. Hager EMBO Rep. 2002 3 1188 1194
69. J. M. Levsky R. H. Singer Trends Cell Biol. 2003 13 4 6
70. M. Muratani D. Gerlich S. M. Janicki M. Gebhard R. Eils D. L. Spector Nat. Cell Biol. 2002 4 106 110
71. M. Platani I. Goldberg A. I. Lamond J. R. Swedlow Nat. Cell Biol. 2002 4 502 508
72. Y. Shav-Tal J. Blechman X. Darzacq C. Montagna B. T. Dye J. G. Patton R. H. Singer D. Zipori Mol. Biol. Cell 2005 16 2395 2413
73. D. Chen S. Huang J. Cell Biol. 2001 153 169 176
74. S. Snaar K. Wiesmeijer A. G. Jochemsen H. J. Tanke R. W. Dirks J. Cell Biol. 2000 151 653 662
75. K. E. Handwerger C. Murphy J. G. Gall J. Cell Biol. 2003 160 495 504
76. J. E. Sleeman L. Trinkle-Mulcahy A. R. Prescott S. C. Ogg A. I. Lamond J. Cell Sci. 2003 116 2039 2050
77. J. C. Politz E. S. Browne D. E. Wolf T. Pederson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 6043 6048
78. Y. Shav-Tal X. Darzacq S. M. Shenoy D. Fusco S. M. Janicki D. L. Spector R. H. Singer Science 2004 304 1797 1800
79. S. M. Janicki T. Tsukamoto S. E. Salghetti W. P. Tansey R. Sachidanandam K. V. Prasanth T. Ried Y. Shav-Tal E. Bertrand R. H. Singer D. L. Spector Cell 2004 116 683 698
80. Z. Zachar J. Kramer I. P. Mims P. M. Bingham J. Cell Biol. 1993 121 729 742
81. J. M. Bridger C. Kalla H. Wodrich S. Weitz J. A. King K. Khazaie H. G. Krausslich P. Lichter Exp. Cell Res. 2005 302 180 193
82. M. Carmo-Fonseca M. Platani J. R. Swedlow Trends Cell Biol. 2002 12 491 495
83. Y. Shav-Tal R. H. Singer J. Cell Sci. 2005 118 4077 4081
84. D. Fusco N. Accornero B. Lavoie S. M. Shenoy J. M. Blanchard R. H. Singer E. Bertrand Curr. Biol. 2003 13 161 167
85. E. Basyuk T. Galli M. Mougel J. M. Blanchard M. Sitbon E. Bertrand Dev. Cell 2003 5 161 174
86. Z. Q. Cui Z. P. Zhang X. E. Zhang J. K. Wen Y. F. Zhou W. H. Xie Nucleic Acids Res. 2005 33 3245 3252
87. P. Santangelo N. Nitin L. Laconte A. Woolums G. Bao J. Virol. 2006 80 682 688
88. K. M. Forrest E. R. Gavis Curr. Biol. 2003 13 1159 1168
89. B. J. Cha B. S. Koppetsch W. E. Theurkauf Cell 2001 106 35 46
90. J. B. Glotzer R. Saffrich M. Glotzer A. Ephrussi Curr. Biol. 1997 7 326 337
91. D. P. Bratu B. J. Cha M. M. Mhlanga F. R. Kramer S. Tyagi Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 13308 13313