Pharmacogenomics of drug transporters: A new approach to functional analysis of the genetic polymorphisms of ABCB1 (P-glycoprotein/MDR1)

Biological and Pharmaceutical Bulletin

Volumn 27, Issue 7, 2004, Pages 939-948

  Ishikawa, Toshihisa ^a   Onishi, Yuko ^a   Hirano, Hiroyuki ^b   Oosumi, Keisuke ^c   Nagakura, Makoto ^c   Tarui, Shigeki ^b  

^a TOKYO INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (Japan)

^b GS PlatZ Co Ltd   (Japan)

^c BioTec Co Ltd   (Japan)

Author keywords

High throughput screening; P glycoprotein; Single nucleotide polymorphism

Indexed keywords

GLYCOPROTEIN P INHIBITOR; MULTIDRUG RESISTANCE PROTEIN 1; VERAPAMIL; CARRIER PROTEIN; GLYCOPROTEIN P;

BIOINFORMATICS; DNA POLYMORPHISM; DRUG RESPONSE; DRUG TRANSPORT; ENZYME SPECIFICITY; FUNCTIONAL GENOMICS; GENE DELETION; GENE FUNCTION; GENE INSERTION; GENETIC VARIABILITY; HUMAN; METHODOLOGY; PHARMACOGENOMICS; REVIEW; SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM; STRUCTURE ACTIVITY RELATION; ANIMAL; CHEMISTRY; GENETIC POLYMORPHISM; GENETICS; METABOLISM; PHARMACOGENETICS; PHYSIOLOGY;

ANIMALS; HUMANS; MEMBRANE TRANSPORT PROTEINS; P-GLYCOPROTEIN; PHARMACOGENETICS; POLYMORPHISM, GENETIC;

EID: 16644381719     PISSN: 09186158     EISSN: 13475215     Source Type: Journal    
DOI: 10.1248/bpb.27.939     Document Type: Review

References (86)

1. Ishikawa T., "Nature Encyclopedia of the Human Genome," Vol. 4, ed. by Cooper D. N., Nature Publishing Group, London, 2003, pp. 154-160.
2. Borst P., Oude Elferink R., Ann. Rev. Biochem., 71, 537-592 (2002).
3. Kim R. B., Curr. Opin. Drug Discov. Develop., 3, 94-101 (2002).
4. Mizuno N., Sugiyama Y., Drug Metabol. Pharmacokin., 17, 93-108 (2002).
5. Gao B., Meier P. J., Microsc. Res. Tech., 52, 60-64 (2001).
6. Ayrton A., Morgan P., Xenobiotica, 31, 469-497 (2001).
7. Inui K., Masuda S., Saito H., Kidney Int., 5, 944-958 (2000).
8. Meier D. K., Hooiveld G. J., Schinkel A. H., van Montfoort J. E., Haas M., de Zeeuw D., Moolenaar F., Smit J. W., Meier P. J., Nephrol. Dial. Transplant., 14, 1-3 (1999).
9. Zhang L., Brett C. M., Giacomini K. M., Rev. Pharmacol. Toxicol., 38, 431-460 (1998).
10. Tsuji A., Tamai, I., Pharm. Res., 13, 963-977 (1996).
11. Wada M., Uchiumi T., Kuwano, M., "Membrane Transport Diseases: Molecular Basis of Inherited Transport Defects," ed. by Bröer S., Wagner C. A., Kluwer Academic/Plenum Pulishers, New York, 2004, in press.
12. Kanai Y., Endou H., J. Toxicol. Sci., 28, 1-17 (2003).
13. Ishikawa T., Yoshikawa M., "Toxiogenomics," ed. by Inoue T., Pennie W. D., Springer Verlag, Tokyo, 2003, pp 109-114.
14. Smigielski E. M., Sirotkin K., Ward M., Sherry S. T., Nucleic Acids Res., 28, 352-355 (2000).
15. The International SNP Map Working Group, Nature (London), 409, 928-933 (2001).
16. Ishikawa T., Tsuji A., Inui K., Sai Y., Anzai N., Wada M., Endou H., Sumino Y., Pharmacogenomics, 5, 67-99 (2004).
17. Ling V., Cancer Chemother. Pharmacol., 40, S3-S8 (1997).
18. Ambudkar S. V., Dey S., Hrycyna C. A., Ramachandra M., Pastan I., Gottesman M. M., Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol., 39, 361-398 (1999).
19. Virgintino D., Robertson D., Errede M., Benagiano V., Girolamo F., Maiorano E., Roncali L., Bertossi M., J. Histochem. Cytochem., 50, 1671-1676 (2002).
20. Schinkel A. H., Smit J. J., van Tellingen O., Beijnen J. H., Waagenaar E., van Deemter L., Mol C. A., van der Valk M. A., Robanus-Maandag E. C., te Riele H. P., Cell, 77, 491-502 (1994).
21. Rao U. S., J. Biol. Chem., 270, 6686-6690 (1995).
22. Kerb R., Hoffmeyer S., Brinkmann U., Pharmacogenomics, 2, 51-64 (2001).
23. Sparreboom A., Danesi R., Ando Y., Chan J., Figg W. D., Drug Resist. Updat., 6, 71-84 (2003).
24. Saito S., Iida A., Sekine A., Miura Y., Ogawa C., Kawachi S., Higuchi S., Nakamura Y., J. Hum. Genet., 47, 38-50 (2002).
25. Schwab M., Eichelbaum M., Fromm M. F., Ann. Rev. Pharmacol. Toxicol., 43, 285-307 (2003).
26. Evans W. E., McLeod H. L., New Engl. J. Med., 348, 538-549 (2003).
27. Weinshilboum R., New Engl. J. Med., 348, 529-537 (2003).
28. Itoda M., Saito Y., Komamura K., Ueno K., Kamakura S., Ozawa S., Sawada J., Drug Metab. Pharmacokin., 17, 566-571 (2002).
29. Anglicheau D., Verstuyft C., Laurent-Puig P., Becquemont L., Schlageter M. H., Cassinat B., Beaune P., Legendre C., Thervet E., J. Am. Soc. Nephrol., 14, 1889-1896 (2003).
30. Kafka A., Sauer G., Jaeger C., Grundmann R., Kreienberg R., Zeillinger R., Deissler H., Int. J. Oncol., 22, 1117-1121 (2003).
31. Brumme Z. L., Dong W. W., Chan K. L., Hogg R. S., Montaner J. S., O'Shaughnessy M. V., Harrigan P. R., AIDS, 17, 201-208 (2003).
32. Macphee I. A., Fredericks S., Tai T., Syrris P., Carter N. D., Johnston A., Goldberg L., Holt D. W., Transplantation, 74, 1486-1489 (2002).
33. Johne A., Kopke K., Gerloff T., Mai I., Rietbrock S., Meisel C., Hoffmeyer S., Kerb R., Fromm M. F., Brinkmann U., Eichelbaum M., Brookmoller J., Cascorbi I., Roots I., Clin. Pharmacol. Ther., 72, 584-594 (2002).
34. Siegmund W., Ludwig K., Giessmann T., Dazart P., Schroeder E., Sperker B., Warzok R., Kroemer H. K., Cascorbi I., Clin. Pharmacol. Ther., 72, 572-583 (2002).
35. Kim R. B., Pharmacogenetics, 12, 425-427 (2002).
36. Roberts R. L., Joyce P. R., Mulder R. T., Begg E. J., Kennedy M. A., Pharmacogenomics J., 2, 191-196 (2002).
37. Calado R. T., Falcao R. P., Garcia A. B., Gabellini S. M., Zago M. A., Franco R. F., Haematologica, 87, 564-568 (2002).
38. Hoffmeyer S., Burk O., von Richter O., Arnold H. P., Brockmoller J., Johne A., Cascorbi I., Gerloff T., Roots I., Eichelbaum M., Brinkmann U., Proc. Natl. Acad. Soc. U.S.A., 97, 3473-3478 (2000).
39. Balram C., Sharma A., Sivathasan C., Lee E. L., Br. J. Clin. Pharmacol., 56, 78-83 (2003).
40. Tang K., Ngoi S. M., Gwee P. C., Chua J. M., Lee E. J., Chong S. S., Lee C. G., Pharmacogenetics, 12, 437-450 (2002).
41. Illmer T., Schuler U. S., Thiede C., Schwartz U. I., Kim R. B., Gotthard S., Freund D., Schakel U., Ehninger G., Schaich M., Cancer Res., 62, 4955-4962 (2002).
42. Drescher S., Scheffeler E., Hitzl M., Hofmann U., Schwab M., Brinkmann U., Eichelbaum M., Fromm M. F., Br. J. Clin. Pharmacol., 53, 526-534 (2002).
43. Hitzl M., Drescher S., van der Kuip H., Scheffeler E., Fischer J., Schwab M., Eichelbaum M., Fromm M. F., Pharmacogenetics, 11, 293-298 (2001).
44. Fellay J., Marzolini C., Meaden E. R., Back D. J., Buclin T., Chave J. P., Decosterd L. A., Furrer H., Opravil M., Pantaleo G., Retelska D., Ruiz L., Schinkel A. H., Vernazza P., Eap C. B., Telenti A., Lancet, 359, 30-36 (2002).
45. Nakamura T., Sakaeda T., Horinouchi M., Tamura T., Aoyama N., Shirakawa T., Matsuo M., Kasuga M., Okumura K., Clin. Pharmacol. Ther., 71, 297-303 (2002).
46. Moriya Y., Nakamura T., Horinouchi M., Sakaeda T., Tamura T., Aoyama N., Shirakawa T., Gotoh A., Fujimoto S., Matsuo M., Kasuga M. Okumura K., Biol. Pharm. Bull., 25, 1356-1359 (2002).
47. van der Heiden L. P., van der Heuvel M. M., Wiemer E., Pieters R., Lindemans J., van den Anker J., van Schaik R., Clin. Pharmacol. Ther., 73, p. 58 abstract (2003).
48. Desai D. G., Maruyama N., Lantz M., Woo J. M., Chan W., Benet L. Z., Clin. Pharmacol. Ther., 37, p. 13 abstract (2003).
49. von Ahsens N., Richter M., Grupp C., Ringe B., Oellerich M., Armstrong V. W., Clin. Chem., 47, 1048-1052 (2001).
50. Min D. I., Elingrod V. L., Ther. Drug. Monit., 24, 400-404 (2002).
51. Chowbay B., Cumaraswamy S., Cheng Y. B., Zhou Q., Lee E. J. D., Pharmacogenetics, 13, 89-95 (2003).
52. van Schaik R., Hesselink D. A., van der Heiden I. P., van der Werf M., Lindemans, J., van Gelder T., Clin. Pharmacol. Ther., 73, p. 56 abstract (2003).
53. Putnam W., Desai D. G., Huang Y., Woo J. M., Benet L. Z., Clin. Pharmacol. Ther., 73, p. 57 abstract (2003).
54. Becquemont L., Verstuyft C., Kerb R., Brinkmann U., Lebot M., Jaillon P., Funk-Bretano C., Clin. Pharmacol. Ther., 70, 311-316 (2001).
55. Sakaeda T., Nakamura T., Horinouchi M., Kakumoto M., Ohmoto N., Sakai T., Morita Y., Tamura T., Aoyama N., Hirai M., Kasuga M., Okumura K., Pharm. Res., 18, 1400-1404 (2001).
56. Gerloff T., Schaefer M., Johne A., Oselin K., Meisel C., Cascorbi I., Roots I., Br. J. Pharmacol., 54, 610-616 (2002).
57. Kurata Y., Ieiri I., Kimura M., Morita T., Irie S., Urae A., Ohdo S., Ohtani H., Sawada Y., Higuchi S., Otsubo K., Clin. Pharmacol. Ther., 72, 209-219 (2002).
58. Verstuyft C., Strabach S., El Morabet H., Kerb R., Brinkmann U., Dubert L., Jaillon P., Funk-Brentano C., Trugman G., Becquemont L., Clin. Pharmacol. Ther., 73, 51-60 (2003).
59. Goh B. C., Lee S. C., Wang L. Z., Fan L., Guo J. Y., Lamba J., Schuetz E., Lim R., Lim H. L., Ong A. B., Lee H. S., J. Clin. Oncol., 20, 3683-3690 (2002).
60. Goto M., Masuda S., Saito H., Uemoto S., Kiuchi T., Tanaka K., Inui K., Pharmacogenetics, 12, 451-457 (2002).
61. Yamauchi A., Ieiri I., Kataoka Y., Tanabe M., Nishizaki T., Oishi R., Higuchi S., Otsubo K., Sugimachi K., Transplantation, 74, 571-572 (2002).
62. Mathijssen R. H., Loos W. J., Verweij J., Sparreboom A., Eur. J. Cancer, 38, S44 abstract (2002).
63. Kimchi-Sarfaty C., Griber J. J., Gottesman M. M., Mol. Pharmacol., 62, 1-6 (2002).
64. Mickley L. A., Lee J. S., Weng Z., Zhan Z., Alvarez M., Wilson W., Bates S. E., Fojo T., Blood, 91, 1749-1756 (1998).
65. Kim R. B., Leake B. F., Choo E. F., Dresser G. K., Kubba S. V., Schwartz U. I., Taylor A., Xie H. G., McKinsey J., Zhou S., Lan L. B., Schuetz J. D., Schuetz E. G., Wilkinson G. R., Clin. Pharmacol. Ther., 70, 189-199 (2001).
66. Carter S. G., Karl D. W., J. Biochem. Biophys. Methods, 7, 7-13 (1982).
67. Sarkadi B., Price E. M., Boucher R. C., Germann U. A., Scarborough G. A., J. Biol. Chem., 267, 4854-4858 (1992).
68. Senior A. E., Al-Shawi M. K., Urbatsch I. L., FEBS Lett., 377, 285-289 (1995).
69. Sauna Z. E., Ambudkar S. V., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 97, 2515-2520 (2000).
70. Garrigues A., Nugier J., Orlowski S., Ezan E., Anal. Biochem., 305, 106-114 (2002).
71. Onishi Y., Hirano H., Nakata K., Oosumi K., Nagakura M., Tarui S., Ishikawa T., Chem-Bio. Informatics J., 3, 175-193 (2003).
72. Norinder U., Osterberg T., Artursson P., Pharm. Res., 14, 1786-1791 (1997).
73. Ishikawa T., Kasamatsu S., HagiwaraY., Mitomo H., Kato R., Sumino Y., Drug Metabol. Pharamcokin., 18, 194-202 (2003).
74. Higgins C. F., Gottesman M. M., Trends Biochem. Sci., 17, 18-21 (1992).
75. Seelig A., Gottschlich R., Devant R. M., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 91, 68-72 (1994).
76. Fischer H., Gottschlich R., Seelig A., J. Membr. Biol., 165, 201-211 (1998).
77. Seelig A., Landwojtowicz E., Eur. J. Pharm. Sci., 12, 31-40 (2000).
78. Klopman G., Shi L. M., Ramu A., Mol. Pharmacol., 52, 323-334 (1997).
79. Schmid D., Ecker G., Kopp S., Hitzler M., Chiba P., Biochem. Pharmacol., 58, 1447-1456 (1999).
80. Ekins S., Kim R. B., Leake B. F., Dantzig A. H., Schuetz E. G., Lan L. B., Yasuda K., Shepard R. L., Winter M. A., Schuetz J. D., Wikel J. H., Wrighton S. A., Mol. Pharmacol., 61, 964-973 (2002)
81. Ekins S., Kim R. B., Leake B. F., Danzig A. H., Schuetz E. G., Lan L. B., Yasuda K., Shepard R. L., Winter M. A., Schuetz J. D., Wikel J. H., Wrighton S. A., Mol. Pharmacol., 61, 974-981 (2002).
82. Stouch T. R., Gudmundsson O., Adv. Drug Deliv. Rev., 54, 315-328 (2002).
83. Osterberg T., Norinder U., Eur. J. Pharm. Sci., 10, 295-303 (2000).
84. http://thomsonderwent.com/products/patentresarch/markushtopfrag/
85. http://thomsonderwent.com/derwenthome/media/support/userguides/ chemindguide.pdf
86. Qu Q., Chu J. W. K., Sharom F. J., Biochemistry, 42, 1345-1353 (2003).