DNA-mediated electron transfer: A sensitive probe of DNA-protein interactions

Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

Volumn 17, Issue SUPPL. 1, 2000, Pages 285-291

  Rajski, Scott R ^a   Barton, Jacqueline K ^a  

^a California Institute of Technology   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; DNA BINDING PROTEIN;

BASE PAIRING; CHEMISTRY; DNA DAMAGE; ELECTRON; ELECTRON TRANSPORT;

BASE PAIRING; DNA; DNA DAMAGE; DNA-BINDING PROTEINS; ELECTRON TRANSPORT; ELECTRONS;

EID: 0001767536     PISSN: 07391102     EISSN: 15380254     Source Type: Journal    
DOI: 10.1080/07391102.2000.10506633     Document Type: Article

References (66)

1. a) R. E. Holmlin, P. J. Dandliker, J. K. Barton, Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 36, 2714 (1997)
2. b) S. O. Kelley and J. K. Barton, Met. Ions Biol. Sys. 36, 211 1999.
3. a) D. G. Knorre, O. S. Fedorova, E. I. Frolova, Uspekhi Khimii 62, 70 (1992);
4. b) L. E. Rabow, J. Stubbe, J. W. Kozarich, J. Am. Chem. Soc. 112, 3196 (1990)
5. c) D. S. Sigman, C. B. Chen, Annu. Rev. Biochem. 59, 207 (1990)
6. d) T. D. Tullius, B. A. Dombroski, M. E. A. Churchill, L. Kam, Meth. Enz. 155, 537 (1987)
7. e) D. Schulte-Frohlinde, K. Hildenbrand, Free Radicals In Synthesis and Biology 335, (1989)
8. f) B. Giese, X. Berich-Graf, P. Erdmann, M. Petretta, U. Schwitter, Chem. Biol. 2, 367 (1995)
9. g) T. Melvin, S. M. T. Cunniffe, P. O'Neill, A. W. Parker, T. Roldan-Arjona, Nucleic Acids Res. 26, 4935 (1998)
10. h) W. K. Pogozelski, T. D. Tullius, Chem. Rev. 98, 1089 (1998)
11. i) L. J. Kennedy, K. Moore Jr., J. L. Caulfield, S. R. Tannenbaum, P. C. Dedon, Chem. Res. Toxicol. 10, 386 (1997)
12. j) C. J. Burrows, J. G. Muller, Chem. Rev. 98, 1109 (1998).
13. a) P. Lincoln, E. Tuite, B. Norden, J. Am. Chem. Soc. 119, 1454 (1997)
14. b) E. Meggers, D. Kusch, M. Spichty, U. Wille, B. Giese, Angew. Chem. Int. Ed. 37, 460, (1998)
15. c) B. Armitage, D. Ly, T. Koch, H. Frydenlund, H. Orum, H. G. Batz, G. B. Schuster, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94, 12320 (1997)
16. d) T. J. Meade, J. F. Kayyem, Angew. Chem. 107, 358 (1995)
17. e) F. D. Lewis, T. Wu, Y. Zhang, R. L. Letsinger, S. R. Greenfield, M. R. Wasielewski, Science 277, 673 (1995)
18. f) S. Priyadarshy, S. M. Risser, D. N. Beratan, J. Phys. Chem. 100, 17678 (1996)
19. g) P. O'Neill, E. M. Fielden, Adv. Radiat. Biol. 17, 53 (1993)
20. h) M. G. Debije, M. T. Milano, W. A. Bernhard, Angew. Chem. Int. Ed. 38, 2752 (1999)
21. i) A. Pezedhk, M. C. R. Symons, J. D. McClymont, J. Phys. Chem. 100, 18562 (1996).
22. D. D. Eley, D. I. Spivey, Trans. Faraday Soc. 58, 411 (1962).
23. a) C. Y. Liang, E. G. Scalo, J. Chem. Phys. 40, 919 (1964)
24. b) R. S. Snart, Biopolymers 6, 293 (1968)
25. c) D. W. Whillans, Biochim. Biophys. Acta. 414, 193 (1975)
26. d) S. Gregoli, C. Taverna, A. Bertinchamps, Int. J. Radiat. Biol. 18, 577 (1970)
27. e) P. M. Cullis, J. D. McClymont, M. C. R. Symons, J. Chem. Soc. Faraday Trans., 86, 591 (1990)
28. f) H. W. Fink, C. Schonenberger, Nature 398, 407 (1999).
29. M. E. Nunez, D. B. Hall, J. K. Barton. Chem. Biol. 6, 85 (1999).
30. P. T. Henderson, D. Jones, G. Hampikian, K. Z. Kan, G. B. Schuster, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 8353 (1999).
31. R. A. Marcus, N. Sutin, Biochim. Biophys. Acta 811, 265 (1985).
32. a) C. J. Murphy, M. R. Arkin, N. D. Ghatlia, S. Bossmann, N. J. Turro, J. K. Barton, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 5315 (1994)
33. b) C. J. Murphy, M. R. Arkin, Y. Jenkins, N. D. Ghatlia, S. H. Bossmann, N. J. Turro, J. K. Barton, Science 262, 1025 (1993).
34. M. R. Arkin, E. D. A. Stemp, R. E. Holmlin, J. K. Barton, A. Hormann, E. J. C. Olson, P. A. Barbara, Science 273, 475 (1996).
35. H. B. Gray, J. R. Winkler, Annu. Rev. Biochem. 65, 537 (1996).
36. a) A. E. Friedman, J.-C. Chambron, J.-P. Sauvage, N. J. Turro, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 112, 4960 (1990)
37. b) E. J. C. Olson, D. Hu, A. Hormann, A. M. Jonkman, M. R. Arkin, E. D. A. Stemp, J. K. Barton, P. F. Barbara, J. Am. Chem. Soc. 119, 11458 (1997).
38. S. O. Kelley, J. K. Barton, Science 283, 375 (1999).
39. a) T. M. Nordlund, S. Andersson, L. Nilsson, R. Rigler, A. Grasslund, L. W. McLaughlin, Biochemistry 28, 9095 (1989)
40. b) D. Xu, K. O. Evans, T. M. Nordlund Biochemistry 33, 9592 (1994)
41. c) L. C. Sowers, G. V. Fazakerley, R. Eritja, B. Kaplan, M. F. Goodman, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83, 5434 (1986).
42. M. Kouchakdjian, M. Eisenberg, K. Yarema, A. Basu, J. Essigmann, D. J. Patel, Biochemistry, 30, 1820 (1991).
43. D. B. Hall, R. E. Holmlin, J. K. Barton Nature 382, 731 (1996).
44. T. W. Johann, J. K. Barton, Phil. Trans. R. Soc. Lond. A 354, 299 (1996).
45. B. H. Hudson, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 120, 6877 (1998).
46. S. S. David, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 115, 2984 (1993).
47. C. Turro, A. Evenzahav, S. H. Bossman, J. K. Barton, N. Turro, Inorg. Chim. Acta 243, 101 (1996).
48. A. Sitlani, E. C. Long, A. M. Pyle, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 114, 2303 (1992).
49. D. B. Hall, S. O. Kelley, J. K. Barton, Biochemistry 37, 15933 (1998).
50. a) D. T. Breslin, G. B. Schuster J. Am. Chem. Soc. 118, 2311 (1996)
51. b) S. M. Gasper, G. B. Schuster, J. Am. Chem. Soc. 119, 12762 (1997).
52. K. Nakatani, K. Fujisawa, C. Dohno, T. Nakamura, I. Saito, Tet. Lett. 39, 5995 (1998).
53. E. Meggers, M. E. Michel-Beyerle, B. Giese J. Am. Chem. Soc. 120, 12950 (1998).
54. B. Giese, S. Wessely, M. Spormann, U. Lindemann, E. Meggers, M. E. Michel-Beyerle, Angew. Chem. Int. Ed. 38, 996 (1999).
55. a) H. Sugiyama, I. Saito. J. Am. Chem. Soc., 118 7063 (1996)
56. b) I. Saito, T. Nakamura, K. Nakatani, Y. Yoshioka, K. Yamaguchi, H. Sugiyama J. Am. Chem. Soc. 120, 12686 (1998)
57. c) I. Saito, M. Takayama, H. Sugiyama, K. Nakatani, A. Tsuchida, M. Yamamoto, J. Am. Chem. Soc. 117, 6406 (1995).
58. F. Prat, K. N. Houk, C. S. Foote. J. Am. Chem. Soc. 120, 845 (1998).
59. D. Ly, L. Sanii, G. B. Schuster, J. Am. Chem. Soc. 121, 9400 (1999).
60. D. B. Hall, J. K. Barton. J. Am. Chem. Soc. 119, 5045 (1997).
61. S. Klimasauskas, S. Kumar, R. J. Roberts, X. Cheng. Cell 76, 357 (1994).
62. a) X. Cheng, S. Kumar, J. Posfai, J. W. Pflugrath, R. J. Roberts, Cell 74, 299 (1993)
63. b) M. O'Gara, S. Klimasauskas, R. J. Roberts, X. Cheng, J. Mol. Biol. 261, 634 (1996).
64. S. R. Rajski, S. Kumar, R. J. Roberts, and J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 121, 5615 (1999).
65. S. Klimasauskas and R. J. Roberts, Nuc. Acids Res. 23, 1388 (1995).
66. H. A. Wagenknecht, E. D. A. Stemp, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. in press (1999).