Stability of DNA origami nanostructure under diverse chemical environments

Chemistry of Materials

Volumn 26, Issue 18, 2014, Pages 5265-5273

  Kim, Hyojeong ^a   Surwade, Sumedh P ^a   Powell, Anna ^a   O'Donnell, Christina ^a   Liu, Haitao ^a  

^a UNIVERSITY OF PITTSBURGH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALKALINITY; DNA; NANOSTRUCTURES;

CHEMICAL ENVIRONMENT; DNA NANOSTRUCTURES; DNA ORIGAMIS; EFFECT OF CHEMICALS; PHYSICAL TREATMENTS; PROCESSING CONDITION; STRUCTURAL STABILITIES; THERMAL-ANNEALING;

CHEMICAL STABILITY;

EID: 84990064221     PISSN: 08974756     EISSN: 15205002     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cm5019663     Document Type: Article

References (56)

1. Andersen, E. S.; Dong, M.; Nielsen, M. M.; Jahn, K.; Lind-Thomsen, A.; Mamdouh, W.; Gothelf, K. V.; Besenbacher, F.; Kjems, J. ACS Nano 2008, 2, 1213.
2. Han, D.; Pal, S.; Nangreave, J.; Deng, Z.; Liu, Y.; Yan, H. Science 2011, 332, 342.
3. Ke, Y.; Ong, L. L.; Shih, W. M.; Yin, P. Science 2012, 338, 1177.
4. Rothemund, P. W. K. Nature 2006, 440, 297.
5. Wei, B.; Dai, M.; Yin, P. Nature 2012, 485, 623.
6. Burns, J. R.; Stulz, E.; Howorka, S. Nano Lett. 2013, 13, 2351.
7. Borman, S. Chem. Eng. News 2005, 83, 11.
8. Gu, Q.; Cheng, C.; Gonela, R.; Suryanarayanan, S.; Anabathula, S.; Dai, K.; Haynie, D. T. Nanotechnology 2006, 17, R14.
9. He, Y.; Chen, Y.; Liu, H.; Ribbe, A. E.; Mao, C. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12202.
10. Paukstelis, P. J. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 6794.
11. Becerril, H. A.; Ludtke, P.; Willardson, B. M.; Woolley, A. T. Langmuir 2006, 22, 10140.
12. Li, H.; Park, S. H.; Reif, J. H.; LaBean, T. H.; Yan, H. J. Am. Chem. Soc. 2003, 126, 418.
13. Geng, Y.; Liu, J.; Pound, E.; Gyawali, S.; Harb, J. N.; Woolley, A. T. J. Mater. Chem. 2011, 21, 12126.
14. Nakao, H.; Shiigi, H.; Yamamoto, Y.; Tokonami, S.; Nagaoka, T.; Sugiyama, S.; Ohtani, T. Nano Lett. 2003, 3, 1391.
15. Pilo-Pais, M.; Goldberg, S.; Samano, E.; LaBean, T. H.; Finkelstein, G. Nano Lett. 2011, 11, 3489.
16. Zheng, J.; Constantinou, P. E.; Micheel, C.; Alivisatos, A. P.; Kiehl, R. A.; Seeman, N. C. Nano Lett. 2006, 6, 1502.
17. Liu, J.; Geng, Y.; Pound, E.; Gyawali, S.; Ashton, J. R.; Hickey, J.; Woolley, A. T.; Harb, J. N. ACS Nano 2011, 5, 2240.
18. Pearson, A. C.; Liu, J.; Pound, E.; Uprety, B.; Woolley, A. T.; Davis, R. C.; Harb, J. N. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 10551.
19. Uprety, B.; Gates, E. P.; Geng, Y.; Woolley, A. T.; Harb, J. N. Langmuir 2014, 30, 1134.
20. Malo, J.; Mitchell, J. C.; Vénien-Bryan, C.; Harris, J. R.; Wille, H.; Sherratt, D. J.; Turberfield, A. J. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 3057.
21. Shimada, J.; Maruyama, T.; Kitaoka, M.; Yoshinaga, H.; Nakano, K.; Kamiya, N.; Goto, M. Chem. Commun. 2012, 48, 6226.
22. Keren, K.; Berman, R. S.; Buchstab, E.; Sivan, U.; Braun, E. Science 2003, 302, 1380.
23. Li, S.; He, P.; Dong, J.; Guo, Z.; Dai, L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 127, 14.
24. Liu, Y. Nat. Nanotechnol. 2011, 6, 463.
25. Becerril, H. A.; Woolley, A. T. Small 2007, 3, 1534.
26. Deng, Z.; Mao, C. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 4068.
27. Jin, Z.; Sun, W.; Ke, Y.; Shih, C.-J.; Paulus, G. L. C.; Hua Wang, Q.; Mu, B.; Yin, P.; Strano, M. S. Nat. Commun. 2013, 4, 1663.
28. Surwade, S. P.; Zhao, S.; Liu, H. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 11868.
29. Surwade, S. P.; Zhou, F.; Wei, B.; Sun, W.; Powell, A.; O'Donnell, C.; Yin, P.; Liu, H. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 6778.
30. Conway, J. W.; McLaughlin, C. K.; Castor, K. J.; Sleiman, H. Chem. Commun. 2013, 49, 1172.
31. Keum, J.-W.; Bermudez, H. Chem. Commun. 2009, 7036.
32. Mei, Q.; Wei, X.; Su, F.; Liu, Y.; Youngbull, C.; Johnson, R.; Lindsay, S.; Yan, H.; Meldrum, D. Nano Lett. 2011, 11, 1477.
33. Rajendran, A.; Endo, M.; Katsuda, Y.; Hidaka, K.; Sugiyama, H. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 14488.
34. Tagawa, M.; Shohda, K.-i.; Fujimoto, K.; Suyama, A. Soft Matter 2011, 7, 10931.
35. Kornberg, A.; Baker, A. B. DNA Replication, 2nd ed.; University Science Books: Sausalito, CA, 2005; p 10.
36. Vesenka, J.; Vellandi, C.; Kumar, I.; Marsh, T.; Henderson, E. Scanning Microsc. 1998, 12, 329.
37. Albrechts, B.; Hautzinger, D. S.; Kruger, M.; Elwenspoek, M.; Muller, K.; Korvink, J. G. Proceedings of the 21st Micromechanics and Micro Systems Europe Workshop, Enschede, The Netherlands, September 26-29, 2010.
38. Kershner, R. J.; Bozano, L. D.; Micheel, C. M.; Hung, A. M.; Fornof, A. R.; Cha, J. N.; Rettner, C. T.; Bersani, M.; Frommer, J.; Rothemund, P. W. K.; Wallraff, G. M. Nat. Nanotechnol. 2009, 4, 557.
39. Carta, G.; El Habra, N.; Crociani, L.; Rossetto, G.; Zanella, P.; Zanella, A.; Paolucci, G.; Barreca, D.; Tondello, E. Chem. Vap. Deposition 2007, 13, 185.
40. Lim, B. S.; Rahtu, A.; Gordon, R. G. Nat. Mater. 2003, 2, 749.
41. Niinisto, J.; Putkonen, M.; Niinisto, L.; Stoll, S. L.; Kukli, K.; Sajavaara, T.; Ritala, M.; Leskela, M. J. Mater. Chem. 2005, 15, 2271.
42. Khandelwal, G.; Bhyravabhotla, J. PLoS One 2010, 5, e12433.
43. Aoi, K.; Takasu, A.; Okada, M. Polymer 2000, 41, 2847.
44. Gates, K. S. Chem. Res. Toxicol. 2009, 22, 1747.
45. Dickson, K. S.; Burns, C. M.; Richardson, J. P. J. Biol. Chem. 2000, 275, 15828.
46. Schroeder, G. K.; Lad, C.; Wyman, P.; Williams, N. H.; Wolfenden, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 4052.
47. Wolfenden, R.; Ridgway, C.; Young, G. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 833.
48. Lindahl, T.; Nyberg, B. Biochemistry 1974, 13, 3405.
49. Lindahl, T. Nature 1993, 362, 709.
50. Lindahl, T.; Nyberg, B. Biochemistry 1972, 11, 3610.
51. Chang, C.-Y.; Lan, T.-W.; Chi, G.-C.; Chen, L.-C.; Chen, K.-H.; Chen, J.-J.; Jang, S.; Ren, F.; Pearton, S. J. Electrochem. Solid-State Lett. 2006, 9, G155.
52. Crespo-Quesada, M.; Andanson, J.-M.; Yarulin, A.; Lim, B.; Xia, Y.; Kiwi-Minsker, L. Langmuir 2011, 27, 7909.
53. Delabie, A.; Swerts, J.; Elshocht, S. V.; Jung, S.-H.; Raisanen, P. I.; Givens, M. E.; Shero, E. J.; Peeters, J.; Machkaoutsan, V.; Maes, J. W. J. Electrochem. Soc. 2011, 158, D259.
54. Hämäläinen, J.; Puukilainen, E.; Sajavaara, T.; Ritala, M.; Leskelä, M. Thin Solid Films 2013, 531, 243.
55. Rampelberg, G.; Schaekers, M.; Martens, K.; Xie, Q.; Deduytsche, D.; De Schutter, B.; Blasco, N.; Kittl, J.; Detavernier, C. Appl. Phys. Lett. 2011, 98, 162902.
56. Pillers, M. A.; Lieberman, M. J. Vac. Sci. Technol., B 2014, 32, 040602.