Stability of DNA origami nanoarrays in cell lysate

Nano Letters

Volumn 11, Issue 4, 2011, Pages 1477-1482

  Mei, Qian ^a   Wei, Xixi ^a   Su, Fengyu ^a   Liu, Yan ^a   Youngbull, Cody ^a   Johnson, Roger ^a   Lindsay, Stuart ^a   Yan, Hao ^a   Meldrum, Deirdre ^a  

^a ARIZONA STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

biocompatibility; DNA origami; self assembly; structural DNA nanotechnology

Indexed keywords

AGAROSE GEL ELECTROPHORESIS; ATOMIC FORCE MICROSCOPES; BIOLOGICAL APPLICATIONS; CANCEROUS CELLS; CELL LYSATES; CELLULAR SYSTEM; DISEASE DETECTION; DNA NANOSTRUCTURES; DNA STRUCTURE; DOUBLE STRANDED DNA; FUNCTIONAL ASSAYS; IN-CELL; LABEL FREE; NANOARRAYS; RNA DETECTION; SELF ASSEMBLED NANOSTRUCTURES; SELF-ASSEMBLED DNA; SINGLE MOLECULE REACTION; STRUCTURAL DNA NANOTECHNOLOGY; TRANSMISSION ELECTRON MICROSCOPE;

ATOMIC FORCE MICROSCOPY; BIOCOMPATIBILITY; CELL CULTURE; DNA; ELECTROPHORESIS; NANOSTRUCTURES; OLIGONUCLEOTIDES; RNA; SELF ASSEMBLY; TRANSMISSION ELECTRON MICROSCOPY;

NUCLEIC ACIDS;

DNA; NANOMATERIAL;

ARTICLE; CELL FREE SYSTEM; CHEMISTRY; HUMAN; MATERIALS TESTING; PARTICLE SIZE; ULTRASTRUCTURE;

CELL-FREE SYSTEM; DNA; HUMANS; MATERIALS TESTING; NANOSTRUCTURES; PARTICLE SIZE;

EID: 79954497718     PISSN: 15306984     EISSN: 15306992     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/nl1040836     Document Type: Article

References (36)

1. Rothemund, P. W. K. Nature 2006, 440, 297
2. Kuzuya, A.; Komiyama, M. Nanoscale 2010, 2, 310
3. Nangreave, J.; Han, D.; Liu, Y.; Yan, H. Curr. Opin. Chem. Biol. 2010, 14, 608
4. Douglas, S. M.; Dietz, H.; Liedl, T.; Hogberg, B.; Graf, F.; Shih, W. M. Nature 2009, 459, 414
5. Andersen, E. S.; Dong, M.; Nielsen, M. M.; Jahn, K.; Subramani, R.; Mamdouh, W.; Golas, M. M.; Sander, B.; Stark, H.; Oliveira, C. L. P.; Pedersen, J. S.; Birkedal, V.; Besenbacher, F.; Gothelf, K. V.; Kjems, J. Nature 2009, 459, 73
6. Ke, Y. G.; Douglas, S. M.; Liu, M. H.; Sharma, J.; Cheng, A. C.; Leung, A.; Liu, Y.; Shih, W. M.; Yan, H. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 15903
7. Dietz, H.; Douglas, S. M.; Shih, W. M. Science 2009, 325, 725
8. Kuzuya, A.; Komiyama, M. Chem Commun 2009, 4182
9. Endo, M.; Katsuda, Y.; Hidaka, K.; Sugiyama, H. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1592
10. Lund, K.; Manzo, A. J.; Dabby, N.; Michelotti, N.; Johnson-Buck, A.; Nangreave, J.; Taylor, S.; Pei, R. J.; Stojanovic, M. N.; Walter, N. G.; Winfree, E.; Yan, H. Nature 2010, 465, 206
11. Voigt, N. V.; Torring, T.; Rotaru, A.; Jacobsen, M. F.; Ravnsbaek, J. B.; Subramani, R.; Mamdouh, W.; Kjems, J.; Mokhir, A.; Besenbacher, F.; Gothelf, K. V. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 200
12. Rinker, S.; Ke, Y. G.; Liu, Y.; Chhabra, R.; Yan, H. Nat. Nanotechnol. 2008, 3, 418
13. Kuzuya, A.; Kimura, M.; Numajiri, K.; Koshi, N.; Ohnishi, T.; Okada, F.; Komiyama, M. ChemBioChem 2009, 10, 1811
14. Kuzyk, A.; Laitinen, K. T.; Torma, P. Nanotechnology 2009, 20
15. Ke, Y. G.; Lindsay, S.; Chang, Y.; Liu, Y.; Yan, H. Science 2008, 319, 180
16. Subramanian, H. K. K.; Chakraborty, B.; Sha, R.; Seeman, N. C. Nano Lett. 2011, 11, 910
17. Kodera, N.; Yamamoto, D.; Ishikawa, R.; Ando, T. Nature 2010, 468, 72
18. Sannohe, Y.; Endo, M.; Katsuda, Y.; Hidaka, K.; Sugiyama, H. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 16311
19. Steinhauer, C.; Jungmann, R.; Sobey, T. L.; Simmel, F. C.; Tinnefeld, P. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 8870
20. Glasgow, I.; Batton, J.; Aubry, N. Lab Chip 2004, 4, 558
21. Howell, P. B.; Mott, D. R.; Fertig, S.; Kaplan, C. R.; Golden, J. P.; Oran, E. S.; Ligler, F. S. Lab Chip 2005, 5, 524
22. Mei, Q.; Xia, Z.; Xu, F.; Soper, S. A.; Fan, Z. H. Anal. Chem. 2008, 80, 6045
23. Stroock, A. D.; Dertinger, S. K. W.; Ajdari, A.; Mezic, I.; Stone, H. A.; Whitesides, G. M. Science 2002, 295, 647
24. Bienvenue, J. M.; Duncalf, N.; Marchiarullo, D.; Ferrance, J. P.; Landers, J. P. J. Forensic Sci. 2006, 51, 266
25. Chen, X.; Cui, D. F.; Liu, C. C.; Li, H.; Chen, J. Anal. Chim. Acta 2007, 584, 237
26. Kim, J.; Jang, S. H.; Jia, G. Y.; Zoval, J. V.; Da Silva, N. A.; Madou, M. J. Lab Chip 2004, 4, 516
27. McClain, M. A.; Culbertson, C. T.; Jacobson, S. C.; Allbritton, N. L.; Sims, C. E.; Ramsey, J. M. Anal. Chem. 2003, 75, 5646
28. Mun, B. P.; Jung, S. M.; Yoon, S. Y.; Kim, S. H.; Lee, J. H.; Yang, S. Microfluid. Nanofluid. 2010, 8, 695
29. Schilling, E. A.; Kamholz, A. E.; Yager, P. Anal. Chem. 2002, 74, 1798
30. Das, C.; Zhang, J.; Denslow, N. D.; Fan, Z. H. Lab Chip 2007, 7, 1806
31. Fan, R.; Vermesh, O.; Srivastava, A.; Yen, B. K. H.; Qin, L. D.; Ahmad, H.; Kwong, G. A.; Liu, C. C.; Gould, J.; Hood, L.; Heath, J. R. Nat. Biotechnol. 2008, 26, 1373
32. Hatch, A. V.; Herr, A. E.; Throckmorton, D. J.; Brennan, J. S.; Singh, A. K. Anal. Chem. 2006, 78, 4976
33. Hellmich, W.; Pelargus, C.; Leffhalm, K.; Ros, A.; Anselmetti, D. Electrophoresis 2005, 26, 3689
34. Barton, G. M.; Medzhitov, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 14943
35. Mitchell, P. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 1013
36. Palanca-Wessels, M. C.; Barrett, M. T.; Galipeau, P. C.; Rohrer, K. L.; Reid, B. J.; Rabinovitch, P. S. Gastroenterology 1998, 114, 295