A strategy based on nucleotide specificity leads to a subfamily-selective and cell-active inhibitor of N6-methyladenosine demethylase FTO

Chemical Science

Volumn 6, Issue 1, 2015, Pages 112-122

  Toh, Joel D W ^a,b   Sun, Lingyi ^a   Lau, Lisa Z M ^a   Tan, Jackie ^c   Low, Joanne J A ^a   Tang, Colin W Q ^a   Cheong, Eleanor J Y ^a   Tan, Melissa J H ^a   Chen, Yun ^c   Hong, Wanjin ^b   Gao, Yong Gui ^b,c   Woon, Esther C Y ^a  

^a NATIONAL UNIVERSITY OF SINGAPORE   (Singapore)

^b INSTITUTE OF MOLECULAR AND CELL BIOLOGY   (Singapore)

^c NANYANG TECHNOLOGICAL UNIVERSITY   (Singapore)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BINDING SITES; NUCLEIC ACIDS; REPAIR;

EPIGENETIC MODIFICATION; MOLECULAR MECHANISM; NUCLEOTIDE-BINDING SITES; POTENT INHIBITION; PROOF OF PRINCIPLES; SELECTIVE INHIBITORS; STRUCTURAL DIFFERENCES; SUBSTRATE SPECIFICITY;

NUCLEOTIDES;

EID: 84918841325     PISSN: 20416520     EISSN: 20416539     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4sc02554g     Document Type: Article

References (42)

1. J. A. Law S. E. Jacobsen Nat. Rev. Genet. 2010 11 204
2. S. C. Wu Y. Zhang Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2010 11 607
3. Y. Fu D. Dominissini G. Rechevi C. He Nat. Rev. Genet. 2014 15 293
4. R. M. Kohli Y. Zhang Nature 2013 502 472
5. X. L. Ping B. F. Sun L. Wang W. Xiao X. Yang W. J. Wang S. Adhikari Y. Shi Y. Lv Y. S. Chen X. Zhao A. Li Y. Yang U. Dahal X. M. Lou X. Liu J. Huang W. P. Yuan X. F. Zhu T. Cheng Y. L. Zhao X. Wang J. M. Rendtlew Danielsen F. Liu Y. G. Yang Cell Res. 2014 24 177
6. J. Liu Y. Yue D. Han X. Wang Y. Fu L. Zhang G. Jia M. Yu Z. Lu X. Deng Q. Dai W. Chen C. He Nat. Chem. Biol. 2014 10 93
7. S. C. Trewick T. F. Henshaw R. P. Hausinger T. Lindahl B. Sedgwick Nature 2002 419 174
8. K. Tsujikawa K. Koike K. Kitae A. Shinkawa H. Arima T. Suzuki M. Tsuchiya Y. Makino T. Furukawa N. Konishi H. Yamamoto J. Cell. Mol. Med. 2007 11 1105
9. C. G. Yang C. Yi E. M. Duguid C. T. Sullivan X. Jian P. A. Rice C. He Nature 2008 452 961
10. G. Jia Y. Fu X. Zhao Q. Dai G. Zheng Y. Yang C. Yi T. Lindahl T. Pan Y. G. Yang C. He Nat. Chem. Biol. 2011 7 885
11. G. Zheng J. A. Dahl Y. Niu P. Fedorcsak C. M. Huang C. J. Li C. B. Vagbo Y. Shi W. L. Wang S. H. Song Z. Lu R. P. Bosmans Q. Dai Y. J. Hao X. Yang W. M. Zhao W. M. Tong X. J. Wang F. Bogdan K. Furu Y. Fu G. Jia X. Zhao J. Liu H. E. Krokan A. Klungland Y. G. Yang C. He Mol. Cell 2013 49 18
12. B. Yu J. F. Hunt Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 14315
13. Z. Han T. Niu J. Chang X. Lei M. Zhao Q. Wang W. Cheng J. Wang Y. Feng J. Chai Nature 2010 464 1205
14. C. Zhu C. Yi Angew. Chem., Int. Ed. 2014 53 3659
15. W. Aik J. S. Scotti H. Choi L. Gong M. Demetriades C. J. Schofield M. A. McDonough Nucleic Acids Res. 2014 42 4741
16. C. Feng Y. Liu G. Wang Z. Deng Q. Zhang W. Wu Y. Tong C. Cheng Z. Chen J. Biol. Chem. 2014 289 11571
17. J. Ringvoll L. M. Nordstrand C. B. Vagbo V. Talstad K. Reite P. A. Aas K. H. Lauritzen N. B. Liabakk A. Bjork R. W. Doughty P. O. Falnes H. E. Krokan A. Klungland EMBO J. 2006 25 2189
18. K. Koike Y. Ueda H. Hase K. Kitae Y. Fusamae S. Masai T. Inagaki Y. Saigo S. Hirasawa K. Nakajima I. Ohshio Y. Makino N. Konishi H. Yamamoto K. Tsujikawa Curr. Cancer Drug Targets 2012 12 847
19. T. M. Frayling N. J. Timpson M. N. Weedon E. Zeggini R. M. Freathy C. M. Lindgren J. R. Perry K. S. Elliott H. Lango N. W. Rayner B. Shields L. W. Harries J. C. Barrett S. Ellard C. J. Groves B. Knight A. M. Patch A. R. Ness S. Ebrahim D. A. Lawlor S. M. Ring Y. Ben-Shlomo M. R. Jarvelin U. Sovio A. J. Bennett D. Melzer L. Ferrucci R. J. Loos I. Barroso N. J. Wareham F. Karpe K. R. Owen L. R. Cardon M. Walker G. A. Hitman C. N. Palmer A. S. Doney A. D. Morris G. D. Smith A. T. Hattersley M. I. McCarthy Science 2007 316 889
20. T. Gerken C. A. Girard Y. C. Tung C. J. Webby V. Saudek K. S. Hewitson G. S. Yeo M. A. McDonough S. Cunliffe L. A. McNeill J. Galvanovskis P. Rorsman P. Robins X. Prieur A. P. Coll M. Ma Z. Jovanovic I. S. Farooqi B. Sedgwick I. Barroso T. Lindahl C. P. Ponting F. M. Ashcroft S. O'Rahilly C. J. Schofield Science 2007 318 1469
21. X. Zhao Y. Yang B. F. Sun Y. L. Zhao Y. G. Yang Curr. Diabetes Rep. 2014 14 486
22. M. M. Li A. Nilsen Y. Shi M. Fusser Y. H. Ding Y. Fu B. Liu Y. Niu Y. S. Wu C. M. Huang M. Olofsson K. X. Jin Y. Lv X. Z. Xu C. He M. Q. Dong J. M. Rendtlew Danielsen A. Klungland Y. G. Yang Nat. Commun. 2013 4 1832
23. E. van den Born C. B. Vagbo L. Songe-Moller V. Leihne G. F. Lien G. Leszczynska A. Malkiewicz H. E. Krokan F. Kirpekar A. Klungland P. O. Falnes Nat. Commun. 2011 2 172
24. B. Chen F. Ye L. Yu G. Jia X. Huang X. Zhang S. Peng K. Chen M. Wang S. Gong R. Zhang J. Yin H. Li Y. Yang H. Liu J. Zhang H. Zhang A. Zhang H. Jiang C. Luo C. G. Yang J. Am. Chem. Soc. 2012 134 17963
25. E. C. Y. Woon M. Demetriades E. A. Bagg W. Aik S. M. Krylova J. H. Ma M. Chan L. J. Walport D. W. Wegman K. N. Dack M. A. McDonough S. N. Krylov C. J. Schofield J. Med. Chem. 2012 55 2173
26. W. Aik M. Demetriades M. K. Hamdan E. A. Bagg K. K. Yeoh C. Lejeune Z. Zhang M. A. McDonough C. J. Schofield J. Med. Chem. 2013 56 3680
27. S. Nakao M. Mabuchi T. Shimizu Y. Itoh Y. Takeuchi M. Ueda H. Mizuno N. Shigi I. Ohshio K. Jinguji Y. Ueda M. Yamamoto T. Furukawa S. Aoki K. Tsujikawa A. Tanaka Bioorg. Med. Chem. Lett. 2014 24 1071
28. G. Zheng T. Cox L. Tribbey G. Z. Wang P. Iacoban M. E. Booher G. J. Gabriel L. Zhou N. Bae J. Rowles C. He M. J. Olsen ACS Chem. Neurosci. 2014 5 658
29. J. C. Delaney J. M. Essigmann Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 14051
30. P. Koivisto P. Robins T. Lindahl B. Sedgwick J. Biol. Chem. 2004 279 40470
31. O. Sundheim C. B. Vagbo M. Bjoras M. M. Sousa V. Talstad P. A. Aas F. Drablos H. E. Krokan J. A. Tainer G. Slupphaug EMBO J. 2006 25 3389
32. F. H. Niesen H. Berglund M. Vedadi Nat. Protoc. 2007 2 2212
33. N. R. Rose E. C. Y. Woon A. Tumber L. Walport R. Chowdhury X. S. Li O. N. F. King C. Lejeune S. S. Ng T. Krojer M. C. Chan A. M. Rydzik R. J. Hopkinson K. H. Che M. Daniel C. Strain-Damerell C. Gileadi G. Kochan I. K. H. Leung J. Dunford K. K. Yeoh P. J. Ratcliffe N. Burgess-Brown F. von Delft S. Muller B. Marsden P. E. Brennan M. A. McDonough U. Oppermann R. J. Klose C. J. Schofield A. Kawamura J. Med. Chem. 2012 55 6639
34. B. Yu W. C. Edstrom J. Benach Y. Hamuro P. C. Weber B. R. Gibney J. F. Hunt Nature 2006 439 879
35. B. Yu W. C. Edstrom J. Benach Y. Hamuro P. C. Weber B. R. Gibney J. F. Hunt Nature 2006 439 879
36. P. J. Holland T. Hollis PLoS One 2010 5 e8680
37. K. K. Yeoh M. C. Chan A. Thalhammer M. Demetriades R. Chowdhury Y. M. Tian I. Stolze L. A. McNeill M. K. Lee E. C. Y. Woon M. M. Mackeen A. Kawamura P. J. Ratcliffe J. Mecinovic C. J. Schofield Org. Biomol. Chem. 2013 11 732
38. C. J. Schofield P. J. Ratcliffe Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2004 5 343
39. M. Demetriades I. K. H. Leung R. Chowdhury M. C. Chan M. A. McDonough K. K. Yeoh Y.-M. Tian T. D. W. Claridge P. J. Ratcliffe E. C. Y. Woon C. J. Schofield Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 6672
40. R. J. Klose E. M. Kallin Y. Zhang Nat. Rev. Genet. 2006 7 715
41. E. C. Y. Woon A. Tumber A. Kawamura L. Hillringhaus W. Ge N. R. Rose J. H. Y. Ma M. C. Chan L. J. Walport K. H. Che S. S. Ng B. D. Marsden U. Oppermann M. A. McDonough C. J. Schofield Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 1631
42. S. Ito L. Shen Q. Dai S. C. Wu L. B. Collins J. A. Swenberg C. He Y. Zhang Science 2011 333 1300