Prospective use of molecular field points in ligand-based virtual screening: Efficient identification of new reversible Cdc25 inhibitors

MedChemComm

Volumn 4, Issue 8, 2013, Pages 1148-1155

  Collins, James C ^b   Armstrong, Alan ^b   Chapman, Kathryn L ^a   Cordingley, Hayley C ^a   Jaxa Chamiec, Albert A ^a   Judd, Katie E ^a,b   Mann, David J ^b   Scott, Katherine A ^a,b   Tralau Stewart, Catherine J ^a   Low, Caroline M R ^a  

^a CHARING CROSS HOSPITAL   (United Kingdom)

^b IMPERIAL COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PROTEIN TYROSINE PHOSPHATASE; PROTEIN TYROSINE PHOSPHATASE INHIBITOR;

CONCENTRATION RESPONSE; DRUG CONFORMATION; DRUG IDENTIFICATION; DRUG MECHANISM; DRUG SCREENING; MOLECULAR FIELD ANALYSIS; PHARMACOPHORE; PRIORITY JOURNAL; PROSPECTIVE STUDY; REVIEW; STRUCTURE ACTIVITY RELATION; STRUCTURE ANALYSIS;

EID: 84880876875     PISSN: 20402503     EISSN: 20402511     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3md00047h     Document Type: Review

References (71)

1. K. L. Jeffrey M. Camps C. Rommel C. R. Mackay Nat. Rev. Drug Discovery 2007 6 391 403
2. P. Russell P. Nurse Cell 1986 45 145
3. U. Strausfeld J. C. Labbe D. Fesquet J. C. Cavadore A. Picard K. Sadhu P. Russell M. Doree Nature 1991 351 242
4. H. Zhao J. L. Watkins H. Piwnica-Worms Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 14795
5. B. Aressy B. Ducommun Anti-Cancer Agents Med. Chem. 2008 8 818
6. B. Aressy B. Bugler A. Valette D. Biard B. Ducommun Cell Cycle 2008 7 2234
7. P. Bansal J. S. Lazo Cancer Res. 2007 67 3356 3363
8. S. K. Srivastava P. Bansal T. Oguri J. S. Lazo S. V. Singh Cancer Res. 2007 67 9150
9. S. Varmeh J. J. Manfredi Mol. Cancer Ther. 2008 7 3789
10. M. Molinari C. Mercurio J. Dominguez F. Goubin G. F. Draetta EMBO Rep. 2000 1 71
11. R. Boutros V. Lobjois B. Ducommun Cancer Res. 2007 67 11557 11564
12. Z. Ma Z. Liu E. S. W. Ngan S. Y. Tsai Mol. Cell. Biol. 2001 21 8056
13. K. Galaktionov X. C. Chen D. Beach Nature 1996 382 511 517
14. D. Ray H. Kiyokawa Cancer Res. 2008 68 1251 1253
15. K. Galaktionov C. Jessus D. Beach Genes Dev. 1995 9 1046 1058
16. K. Rother R. Kirschner K. Saenger L. Boehlig J. Moessner K. Engeland Oncogene 2007 26 1949
17. S. L. Ruppenthal A. Noll C. Goetz M. Montenarh Int. J. Oncol. 2007 31 345
18. M. Cangi B. Cukor P. Soung S. Signoretti G. Moreira, Jr M. Ranashinge B. Cady M. Pagano M. Loda J. Clin. Invest. 2000 106 753
19. E. S. Ngan Y. Hashimoto Z.-Q. Ma M.-J. Tsai S. Y. Tsai Oncogene 2003 22 734
20. I. Takemasa H. Yamamoto M. Sekimoto M. Ohue S. Noura Y. Miyake T. Matsumoto T. Aihara N. Tomita Y. Tamaki I. Sakita N. Kikkawa N. Matsuura H. Shiozaki M. Monden Cancer Res. 2000 60 3043
21. R. Boutros V. Lobjois B. Ducommun Nat. Rev. Cancer 2007 7 495 507
22. H. Kiyokawa D. Ray Anti-Cancer Agents Med. Chem. 2008 8 832
23. Z. Wang S. Kar B. I. Carr Anti-Cancer Agents Med. Chem. 2008 8 863
24. X.-L. Ding J. Husseman A. Tomashevski D. Nochlin L.-W. Jin I. Vincent Am. J. Pathol. 2000 157 1983 1990
25. Y. J. Arnoldussen P. I. Lorenzo M. E. Pretorius H. Waehre B. Risberg G. M. Maelandsmo H. E. Danielsen F. Saatcioglu Cancer Res. 2008 68 9255 9264
26. R. Henkens P. Delvenne M. Arafa M. Moutschen M. Zeddou L. Tautz J. Boniver T. Mustelin S. Rahmouni BMC Cancer 2008 8 147
27. F. Cerignoli S. Rahmouni Z. Ronai T. Mustelin Cell Cycle 2006 5 2210 2215
28. A. J. Barr S. Knapp Trends Pharmacol. Sci. 2006 27 525
29. S. Rahmouni F. Cerignoli A. Alonso T. Tsutji R. Henkens C. Zhu C. Louis-dit-Sully M. Moutschen W. Jiang T. Mustelin Nat. Cell Biol. 2006 8 524 531
30. G. Hirai A. Tsuchiya Y. Koyama Y. Otani K. Oonuma K. Dodo S. Simizu H. Osada M. Sodeoka ChemMedChem 2011 6 617 622
31. E. B. Fauman J. P. Cogswell B. Lovejoy W. J. Rocque W. Holmes V. G. Montana H. Piwnica-Worms M. J. Rink M. A. Saper Cell 1998 93 617 625
32. R. A. Reynolds A. W. Yem C. L. Wolfe M. R. Deibel C. G. Chidester K. D. Watenpaugh J. Mol. Biol. 1999 293 559 568
33. M. C. Brezak M. Quaranta O. Mondesert M. O. Galcera O. Lavergne F. Alby M. Cazales V. Baldin C. Thurieau J. Harnett C. Lanco P. G. Kasprzyk G. P. Prevost B. Ducommun Cancer Res. 2004 64 3320 3325
34. J. S. Lazo K. Nemoto K. E. Pestell K. Cooley E. C. Southwick D. A. Mitchell W. Furey R. Gussio D. W. Zaharevitz B. Joo P. Wipf Mol. Pharmacol. 2002 61 720 728
35. J. Sohn B. Kiburz Z. Li L. Deng A. Safi M. C. Pirrung J. Rudolph J. Med. Chem. 2003 46 2580 2588
36. R. Boutros C. Dozier B. Ducommun Curr. Opin. Cell Biol. 2006 18 185 191
37. J. Rudolph Biochemistry 2007 46 3595 3604
38. A. Fernandez-Vidal A. Mazars S. Manenti Anti-Cancer Agents Med. Chem. 2008 8 825
39. M. S. Chen J. Hurov L. S. White T. Woodford-Thomas H. Piwnica-Worms Mol. Cell. Biol. 2001 21 3853 3861
40. A. M. Ferguson L. S. White P. J. Donovan H. Piwnica-Worms Mol. Cell. Biol. 2005 25 2853 2860
41. A. Lavecchia C. Di Giovanni E. Novellino Expert Opin. Ther. Pat. 2010 20 405 425
42. A. Lavecchia C. Di Giovanni E. Novellino Mini-Rev. Med. Chem. 2012 12 62 73
43. V. V. Vintonyak H. Waldmann D. Rauh Bioorg. Med. Chem. 2011 19 2145 2155
44. M. C. Brezak A. Valette M. Quaranta M. O. Contour-Galcera D. Jullien O. Lavergne C. Frongia D. Bigg P. G. Kasprzyk G. P. Prevost B. Ducommun Int. J. Cancer 2009 124 1449 1456
45. M. Brisson T. Nguyen P. Wipf B. Joo B. W. Day J. S. Skoko E. M. Schreiber C. Foster P. Bansal J. S. Lazo Mol. Pharmacol. 2005 68 1810 1820
46. Y. B. Zhou X. Feng L. N. Wang J. Q. Du Y. Y. Zhou H. P. Yu Y. Zang J. Y. Li J. Li Acta Pharmacol. Sin. 2009 30 1359 1368
47. T. Cheeseright M. Mackey S. Rose A. Vinter J. Chem. Inf. Model. 2006 46 665 676
48. FieldTemplater, Cresset BioMolecular Discovery Ltd., 2008
49. FieldScreen software, Cresset BioMolecular Discovery Ltd., 2008
50. T. J. Cheeseright M. Holm F. Lehmann S. Luik M. Gottert J. L. Melville S. Laufer J. Med. Chem. 2009 52 4200 4209
51. G. Tresadern D. Bemporad T. Howe J. Mol. Graphics Modell. 2009 27 860 870
52. B. R. Bellenie N. P. Barton A. J. Emmons J. P. Heer C. Salvagno Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009 19 990 994
53. M. Montes E. Braud M. A. Miteva M.-L. Goddard O. Mondesert S. Kolb M.-P. Brun B. Ducommun C. Garbay B. O. Villoutreix J. Chem. Inf. Model. 2008 48 157 165
54. H. R. Kim, J. No, M. J. Seo, B. G. Song, B. S. Son, J. K. Kim, K.-R. Kim, H. G. Cheon and G. H. Lee, WO 2006101307, 2006
55. M. Brisson T. Nguyen A. Vogt J. Yalowich A. Giorgianni D. Tobi I. Bahar C. R. J. Stephenson P. Wipf J. S. Lazo Mol. Pharmacol. 2004 66 824 833
56. C. M. R. Low J. G. Vinter J. Med. Chem. 2008 51 565 573
57. T. J. Cheeseright M. D. Mackey R. A. Scoffin Curr. Comput.-Aided Drug Des. 2011 7 190 205
58. T. J. Cheeseright M. D. Mackey J. L. Melville J. G. Vinter J. Chem. Inf. Model. 2008 48 2108 2117
59. R. L. Rice J. M. Rusnak F. Yokokawa S. Yokokawa D. J. Messner A. L. Boynton P. Wipf J. S. Lazo Biochemistry 1997 36 15965 15974
60. A. Jadhav R. S. Ferreira C. Klumpp B. T. Mott C. P. Austin J. Inglese C. J. Thomas D. J. Maloney B. K. Shoichet A. Simeonov J. Med. Chem. 2010 53 37 51
61. J. B. Baell G. A. Holloway J. Med. Chem. 2010 53 2719 2740
62. I. V. Tetko V. Y. Tanchuk T. N. Kasheva A. E. Villa J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2001 41 1488 1493
63. In house compound collection, Cancer Research Technology, 2010
64. StarDrop 4.0, Optibrium Ltd., Cambridge UK, 2009
65. A. L. Hopkins C. R. Groom A. Alex Drug Discovery Today 2004 9 430 431
66. P. D. Leeson B. Springthorpe Nat. Rev. Drug Discovery 2007 6 881 890
67. Z. Shi S. Tabassum W. Jiang J. Zhang S. Mathur J. Wu Y. Shi ChemBioChem 2007 8 2092 2099
68. H. Park S.-K. Jung D. G. Jeong S. E. Ryu S. J. Kim ChemMedChem 2008 3 877 880
69. S. Wu S. Vossius S. Rahmouni A. V. Miletic T. Vang J. Vazquez-Rodriguez F. Cerignoli Y. Arimura S. Williams T. Hayes M. Moutschen S. Vasile M. Pellecchia T. Mustelin L. Tautz J. Med. Chem. 2009 52 6716 6723
70. M. Sodeoka R. Sampe S. Kojima Y. Baba T. Usui K. Ueda H. Osada J. Med. Chem. 2001 44 3216 3222
71. A. Tsuchiya G. Hirai Y. Koyama K. Oonuma Y. Otani H. Osada M. Sodeoka ACS Med. Chem. Lett. 2012 3 294 298