Genomics and proteomics in solving brain complexity

Molecular BioSystems

Volumn 9, Issue 7, 2013, Pages 1807-1821

  Kadakkuzha, Beena M ^a   Puthanveettil, Sathyanarayanan V ^a  

^a SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANIMAL; BRAIN; GENOMICS; HUMAN; PHYSIOLOGY; PROTEOMICS; REVIEW;

ANIMALS; BRAIN; GENOMICS; HUMANS; PROTEOMICS;

EID: 84878714141     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3mb25391k     Document Type: Review

References (186)

1. D. H. Hubel T. N. Wiesel J. Physiol. 1959 148 574 591
2. D. N. Spinelli A. Starr T. W. Barrett Exp. Neurol. 1968 22 75 84
3. R. Nicoll Science 1988 241 545 551
4. G. M. Shepherd, Neurobiology of Aging, Oxford University Press, 1994
5. D. Brang V. S. Ramachandran PLoS Biol. 2011 9 e1001205
6. V. S. Ramachandran E. M. Hubbard Proc. R. Soc. London, Ser. B 2001 268 979 983
7. J. G. White E. Southgate J. N. Thomson S. Brenner Philos. Trans. R. Soc., B 1986 314 1 340
8. D. H. Yu D. B. G. Akalal R. L. Davis Neuron 2006 52 845 855
9. S. M. Tomchik R. L. Davis Neuron 2009 64 510 521
10. E. R. Kandel Science 2001 294 1030 1038
11. A. Barco C. H. Bailey E. R. Kandel J. Neurochem. 2006 97 1520 1533
12. A. C. Giles C. H. Rankin Neurobiol. Learn. Mem. 2009 92 139 146
13. J. Harrow A. Frankish J. M. Gonzalez E. Tapanari M. Diekhans F. Kokocinski B. L. Aken D. Barrell A. Zadissa S. Searle I. Barnes A. Bignell V. Boychenko T. Hunt M. Kay G. Mukherjee J. Rajan G. Despacio-Reyes G. Saunders C. Steward R. Harte M. Lin C. Howald A. Tanzer T. Derrien J. Chrast N. Walters S. Balasubramanian B. Pei M. Tress J. M. Rodriguez I. Ezkurdia J. van Baren M. Brent D. Haussler M. Kellis A. Valencia A. Reymond M. Gerstein R. Guigó T. J. Hubbard Genome Res. 2012 22 1760 1774
14. C. T. Walsh S. Garneau-Tsodikova G. J. Gatto Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 7342 7372
15. Y. Kanai N. Dohmae N. Hirokawa Neuron 2004 43 513 525
16. M. A. Kiebler L. DesGroseillers Neuron 2000 25 19 28
17. S. V. Puthanveettil F. J. Monje M. C. Miniaci Y. B. Choi K. A. Karl E. Khandros M. A. Gawinowicz M. P. Sheetz E. R. Kandel Cell 2008 135 960 973
18. K. C. Martin A. Casadio H. Zhu Y. E. J. C. Rose M. Chen C. H. Bailey E. R. Kandel Cell 1997 91 927 938
19. V. Lyles Y. L. Zhao K. C. Martin Neuron 2006 49 349 356
20. D. O. Wang S. M. Kim Y. L. Zhao H. Hwang S. K. Miura W. S. Sossin K. C. Martin Science 2009 324 1536 1540
21. C. M. Alberini M. Ghirardi R. Metz E. R. Kandel Cell 1994 76 1099 1114
22. P. Rajasethupathy I. Antonov R. Sheridan S. Frey C. Sander T. Tuschl E. R. Kandel Cell 2012 149 693 707
23. P. Rajasethupathy F. Fiumara R. Sheridan D. Betel S. V. Puthanveettil J. J. Russo C. Sander T. Tuschl E. Kandel Neuron 2009 63 803 817
24. K. Si M. Giustetto A. Etkin R. Hsu A. M. Janisiewicz M. C. Miniaci J. H. Kim H. X. Zhu E. R. Kandel Cell 2003 115 893 904
25. B. L. Raveendra A. Siemer S. V. Puthanveettil K. Si J. Ju W. A. Hendrickson A. McDermot E. R. Kandel Nat. Struct. Mol. Biol. 2013 20 495 501
26. K. Si Y. B. Choi E. White-Grindley A. Majumdar E. R. Kandel Cell 2010 140 421 453
27. S. Katayama Y. Tomaru T. Kasukawa K. Waki M. Nakanishi M. Nakamura H. Nishida C. C. Yap M. Suzuki J. Kawai H. Suzuki P. Carninci Y. Hayashizaki C. Wells M. Frith T. Ravasi K. C. Pang J. Hallinan J. Mattick D. A. Hume L. Lipovich S. Batalov P. G. Engstrom Y. Mizuno M. A. Faghihi A. Sandelin A. M. Chalk S. Mottagui-Tabar Z. Liang B. Lenhard C. Wahlestedt R. G. N. P. Core G. S. Grp F. Consortium Science 2005 309 1564 1566
28. F. C. Carninci et al., RIKEN Genome Explorat Res Grp S Science 2005 309 1559 1563
29. Y. Okazaki F. Consurtium R. G. E. R. Grp et al. Nature 2002 420 563 573
30. C. Barrandon B. Spiluttini O. Bensaude Biol. Cell 2008 100 83 95
31. S. Vasudevan Y. C. Tong J. A. Steitz Science 2007 318 1931 1934
32. T. W. Nilsen Trends Genet. 2007 23 243 249
33. H. H. Zhou H. Hu M. D. Lai Biol. Cell 2010 102 645 655
34. M. S. Weinberg M. J. Wood Hum. Mol. Genet. 2009 18 R27 R39
35. S. Bian T. Sun Mol. Neurobiol. 2011 44 359 373
36. C. D. Malone J. Brennecke M. Dus A. Stark W. R. McCombie R. Sachidanandam G. J. Hannon Cell 2009 137 522 535
37. E. J. Lee S. Banerjee H. Zhou A. Jammalamadaka M. Arcila B. S. Manjunath K. S. Kosik RNA 2011 17 1090 1099
38. H. Yin H. Lin Nature 2007 450 304 308
39. R. Y. Tweedie-Cullen A. M. Brunner J. Grossmann S. Mohanna D. Sichau P. Nanni C. Panse I. M. Mansuy PLoS One 2012 7 e36980
40. B. Sunyer W. F. Diao G. Lubec Electrophoresis 2008 29 2593 2602
41. C. Janke M. Kneussel Trends Neurosci. 2010 33 362 372
42. R. A. Nixon B. A. Brown C. A. Marotta J. Cell Biol. 1982 94 150 158
43. Z. H. Guan M. Giustetto S. Lomvardas J. H. Kim M. C. Miniaci J. H. Schwartz D. Thanos E. R. Kandel Cell 2002 111 483 493
44. P. Liang A. B. Pardee Science 1992 257 967 971
45. T. P. Flanigan R. A. Leslie Mol. Psychiatry 1997 2 451 456
46. K. L. Gilby and E. M. Denovan-Wright, in Handbook of Neurochemistry and Molecular Neurobiology, ed., A. Lajtha, G. Baker, S. Dunn, and, A. Holt, Springer, US, 2007, ch. 17, pp. 371-385
47. W. Yu B. Andersson K. C. Worley D. M. Muzny Y. Ding W. Liu J. Y. Ricafrente M. A. Wentland G. Lennon R. A. Gibbs Genome Res. 1997 7 353 358
48. M. D. Adams M. Dubnick A. R. Kerlavage R. Moreno J. M. Kelley T. R. Utterback J. W. Nagle C. Fields J. C. Venter Nature 1992 355 632 634
49. M. D. Adams M. B. Soares A. R. Kerlavage C. Fields J. C. Venter Nat. Genet. 1993 4 373 386
50. V. E. Velculescu L. Zhang B. Vogelstein K. W. Kinzler Science 1995 270 484 487
51. N. A. Datson J. van der Perk E. R. de Kloet E. Vreugdenhil Hippocampus 2001 11 430 444
52. R. Chrast H. S. Scott M. P. Papasavvas C. Rossier E. S. Antonarakis C. Barras M. T. Davisson C. Schmidt X. Estivill M. Dierssen M. Pritchard S. E. Antonarakis Genome Res. 2000 10 2006 2021
53. Y. Sun L. Zhang N. L. Johnston E. F. Torrey R. H. Yolken Br. J. Psychiatry 2001 178 s137 s141
54. H. Potschka E. Krupp U. Ebert C. Gumbel M. J. Rossner C. Leichtlein B. Lorch A. Pickert S. Kramps K. Young U. Grune A. Keller M. Welschof G. Vogt B. Xiao P. F. Worley W. Loscher H. Hiemisch Eur. J. Neurosci. 2003 18 2101
55. S. L. Karsten and D. H. Geshwind, in Current Protocols in Neuroscience, John Wiley & Sons, Inc., 2001
56. C.-C. Chou C.-H. Chen T.-T. Lee K. Peck Nucleic Acids Res. 2004 32 e99
57. G. A. Churchill Nat. Genet. 2002 32 490 495
58. E. R. Marcotte L. K. Srivastava R. Quirion Trends Pharmacol. Sci. 2001 22 426 436
59. S. Amatschek U. Koenig H. Auer P. Steinlein M. Pacher A. Gruenfelder G. Dekan S. Vogl E. Kubista K. H. Heider C. Stratowa M. Schreiber W. Sommergruber Cancer Res. 2004 64 844 856
60. P. Van Hummelen Am. J. Med. Genet. 2002 114 701 702
61. M. M. Gooldy D. E. McQuaid N. J. Nowak J. L. Slack Blood 2001 98 158B 158B
62. A. M. Joussen S. Huang Ophthalmologe 2001 98 568 573
63. D. J. Duggan M. Bittner Y. D. Chen P. Meltzer J. M. Trent Nat. Genet. 1999 21 10 14
64. S. Mandel O. Weinreb M. B. H. Youdim Trends Pharmacol. Sci. 2003 24 184 191
65. G. M. Pasinetti J. Neurosci. Res. 2001 65 471 476
66. M. P. Vawter J. M. Crook T. M. Hyde J. E. Kleinman D. R. Weinberger K. G. Becker W. J. Freed Schizophr. Res. 2002 58 11 20
67. D. J. Lockhart H. L. Dong M. C. Byrne M. T. Follettie M. V. Gallo M. S. Chee M. Mittmann C. W. Wang M. Kobayashi H. Horton E. L. Brown Nat. Biotechnol. 1996 14 1675 1680
68. A. Fernández-Medarde A. Porteros J. de las Rivas A. Núñez J. J. Fuster E. Santos Neuroscience 2007 146 272 285
69. M. Marvanová J. Ménager E. Bezard R. E. Bontrop L. Pradier G. Wong FASEB J. 2003 17 929 931
70. Z. Guan L. K. Buhl W. G. Quinn J. T. Littleton Learn. Mem. 2011 18 191 206
71. J. M. Kramer K. Kochinke M. A. W. Oortveld H. Marks D. Kramer E. K. de Jong Z. Asztalos J. T. Westwood H. G. Stunnenberg M. B. Sokolowski K. Keleman H. Zhou H. van Bokhoven A. Schenck PLoS Biol. 2011 9 e1000569
72. J. E. Zimmerman W. Rizzo K. R. Shockley D. M. Raizen N. Naidoo M. Mackiewicz G. A. Churchill A. I. Pack Physiol. Genomics 2006 27 337 350
73. J. Takayama S. Faumont H. Kunitomo S. R. Lockery Y. Iino Nucleic Acids Res. 2010 38 131 142
74. M. B. Johnson Y. I. Kawasawa C. E. Mason Ž. Krsnik G. Coppola D. Bogdanović D. H. Geschwind S. M. Mane M. W. State N. Šestan Neuron 2009 62 494 509
75. K. Sugino C. M. Hempel M. N. Miller A. M. Hattox P. Shapiro C. Wu Z. J. Huang S. B. Nelson Nat. Neurosci. 2006 9 99 107
76. A. Mortazavi B. A. Williams K. McCue L. Schaeffer B. Wold Nat. Methods 2008 5 621 628
77. U. Nagalakshmi Z. Wang K. Waern C. Shou D. Raha M. Gerstein M. Snyder Science 2008 320 1344 1349
78. A. Mortazavi B. A. Williams K. Mccue L. Schaeffer B. Wold Nat. Methods 2008 5 621 628
79. N. Cloonan A. R. R. Forrest G. Kolle B. B. A. Gardiner G. J. Faulkner M. K. Brown D. F. Taylor A. L. Steptoe S. Wani G. Bethel A. J. Robertson A. C. Perkins S. J. Bruce C. C. Lee S. S. Ranade H. E. Peckham J. M. Manning K. J. McKernan S. M. Grimmond Nat. Methods 2008 5 613 619
80. W. B. Barbazuk S. J. Emrich H. D. Chen L. Li P. S. Schnable Plant J. 2007 51 910 918
81. S. J. Emrich W. B. Barbazuk L. Li P. S. Schnable Genome Res. 2007 17 69 73
82. F. Ozsolak A. Goren M. Gymrek M. Guttman A. Regev B. E. Bernstein P. M. Milos Genome Res. 2010 20 519 525
83. L. T. Sam D. Lipson T. Raz X. H. Cao J. Thompson P. M. Milos D. Robinson A. M. Chinnaiyan C. Kumar-Sinha C. A. Maher PLoS One 2011 6 e17305
84. T. Raz P. Kapranov D. Lipson S. Letovsky P. M. Milos J. F. Thompson PLoS One 2011 6 e19287
85. N. A. Twine K. Janitz M. R. Wilkins M. Janitz PLoS One 2011 6 e16266
86. G. Chen K. P. Yin L. M. Shi Y. Z. Fang Y. Qi P. Li J. Luo B. He M. Y. Liu T. L. Shi PLoS One 2011 6 e28318
87. M. Y. Lin E. Pedrosa A. Shah A. Hrabovsky S. Maqbool D. Y. Zheng H. M. Lachman PLoS One 2011 6 e23356
88. G. Konopka T. Friedrich J. Davis-Turak K. Winden M. C. Oldham F. Gao L. Chen G.-Z. Wang R. Luo T. M. Preuss D. H. Geschwind Neuron 2012 75 601 617
89. J. C. Marioni C. E. Mason S. M. Mane M. Stephens Y. Gilad Genome Res. 2008 18 1509 1517
90. Z. Wang M. Gerstein M. Snyder Nat. Rev. Genet. 2009 10 57 63
91. J. G. Gall M. L. Pardue Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1969 63 378 383
92. H. A. John M. L. Birnstiel K. W. Jones Nature 1969 223 582 587
93. M. Hofer S. R. Pagliusi A. Hohn J. Leibrock Y. A. Barde EMBO J. 1990 9 2459 2464
94. R. L. Gannon M. A. Rea Mol. Brain Res. 1994 23 338 344
95. R. Pinaud C. V. Mello T. A. Velho R. D. Wynne L. A. Tremere Nat. Protoc. 2008 3 1370 1379
96. H. Nagaso T. Murata N. Day K. K. Yokoyama J. Histochem. Cytochem. 2001 49 1177 1182
97. D. E. Pellegrini-Giampietro M. V. Bennett R. S. Zukin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991 88 4157 4161
98. T. C. D. Burazin A. L. Gundlach Mol. Brain Res. 1999 73 151 171
99. J. J. Palop E. D. Roberson I. Cobos Alzheimer's Disease and Frontotemporal Dementia 2011 670 207 230
100. S. M. Sunkin J. G. Hohmann Hum. Mol. Genet. 2007 16 R209 R219
101. M. P. Vawter S. Evans P. Choudary H. Tomita J. Meador-Woodruff M. Molnar J. Li J. F. Lopez R. Myers D. Cox S. J. Watson H. Akil E. G. Jones W. E. Bunney Neuropsychopharmacology 2003 29 373 384
102. S. L. Eastwood P. W. J. Burnet B. McDonald J. Clinton P. J. Harrison Neuroscience 1994 59 881 892
103. J. Yip J. J. Soghomonian G. J. Blatt Autism Res. 2009 2 50 59
104. N. Abasolo H. Torrell B. Roig S. Moyano E. Vilella L. Martorell J. Psychiatr. Res. 2011 45 1411 1418
105. S. Bahari-Javan A. Maddalena C. Kerimoglu J. Wittnam T. Held M. Bahr S. Burkhardt I. Delalle S. Kugler A. Fischer F. Sananbenesi J. Neurosci. 2012 32 5062 5073
106. Y. Jiang A. Matevossian H.-S. Huang J. Straubhaar S. Akbarian BMC Neurosci. 2008 9 42
107. B. S. Sailaja T. Takizawa E. Meshorer Methods Mol. Biol. 2012 809 353 364
108. H. Cha-Molstad D. M. Keller G. S. Yochum S. Impey R. H. Goodman Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 13572 13577
109. S. Cohen H. W. Gabel M. Hemberg A. N. Hutchinson L. A. Sadacca D. H. Ebert D. A. Harmin R. S. Greenberg V. K. Verdine Z. Zhou W. C. Wetsel A. E. West M. E. Greenberg Neuron 2011 72 72 85
110. R. Gupta P. Wikramasinghe A. Bhattacharyya F. A. Perez S. Pal R. V. Davuluri BMC Bioinf. 2010 11 S65
111. K. N. McFarland S. Das T. T. Sun D. Leyfer E. Xia G. R. Sangrey A. Kuhn R. Luthi-Carter T. W. Clark G. Sadri-Vakili J.-H. J. Cha PLoS One 2012 7 e41423
112. C. Murgatroyd, A. Hoffmann and D. Spengler, in Transcriptional Regulation, ed., A. Vancura, Springer, New York, 2012, vol. 809, ch. 9, pp. 135-148
113. E. Pedrosa A. Shah C. Tenore M. Capogna C. Villa X. Guo D. Zheng H. M. Lachman J. Neurogenet. 2010 24 182 193
114. A. R. Pfenning T.-K. Kim J. M. Spotts M. Hemberg D. Su A. E. West PLoS One 2010 5 e10870
115. W. X. Wang B. R. Wilfred Y. L. Hu A. J. Stromberg P. T. Nelson RNA 2010 16 394 404
116. H. Wu J. Tao P. J. Chen A. Shahab W. Ge R. P. Hart X. Ruan Y. Ruan Y. E. Sun Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 18161 18166
117. T. Ye A. R. Krebs M.-A. Choukrallah C. Keime F. Plewniak I. Davidson L. Tora Nucleic Acids Res. 2011 39 e35
118. E. Scarano M. Iaccarino P. Grippo D. Winckelmans J. Mol. Biol. 1965 603 607
119. M. Gold J. Hurwitz M. Anders Biochem. Biophys. Res. Commun. 1963 107 114
120. R. H. Burdon Nature 1966 210 797 799
121. O. M. Friedman G. N. Mahapatra R. Stevenson Biochim. Biophys. Acta 1963 144 146
122. J. J. U. Guo D. K. K. Ma H. Mo M. P. Ball M. H. Jang M. A. Bonaguidi J. A. Balazer H. L. Eaves B. Xie E. Ford K. Zhang G. L. Ming Y. Gao H. J. Song Nat. Neurosci. 2011 14 1345 1351
123. M. B. Stadler R. Murr L. Burger R. Ivanek F. Lienert A. Scholer C. Wirbelauer E. J. Oakeley D. Gaidatzis V. K. Tiwari D. Schubeler Nature 2011 480 490 495
124. J. M. LaSalle Epigenetics 2011 6 862 869
125. M. Davies M. Volta R. Pidsley K. Lunnon A. Dixit S. Lovestone C. Coarfa R. A. Harris A. Milosavljevic C. Troakes S. Al-Sarraj R. Dobson L. Schalkwyk J. Mill Genome Biol. 2012 13 R43
126. T. Shimogori D. A. Lee A. Miranda-Angulo Y. Yang H. Wang L. Jiang A. C. Yoshida A. Kataoka H. Mashiko M. Avetisyan L. Qi J. Qian S. Blackshaw Nat. Neurosci. 2010 13 767 775
127. P. A. Gray H. Fu P. Luo Q. Zhao J. Yu A. Ferrari T. Tenzen D.-i. Yuk E. F. Tsung Z. Cai J. A. Alberta L.-p. Cheng Y. Liu J. M. Stenman M. T. Valerius N. Billings H. A. Kim M. E. Greenberg A. P. McMahon D. H. Rowitch C. D. Stiles Q. Ma Science 2004 306 2255 2257
128. M. Bota H.-W. Dong L. W. Swanson Nat. Neurosci. 2003 6 795 799
129. V. Castellucci T. Carew E. Kandel Science 1978 202 1306 1308
130. I. Kupfermann V. Castellucci H. Pinsker E. Kandel Science 1970 167 1743 1745
131. H. Pinsker I. Kupfermann V. Castellucci E. Kandel Science 1970 1740 1742
132. E. S. Hill S. K. Vasireddi A. M. Bruno J. Wang W. N. Frost PLoS One 2012 7 e40579
133. I. R. Popescu W. N. Frost J. Neurosci. 2002 22 1985 1993
134. J. Eberwine B. Belt J. E. Kacharmina K. Miyashiro Neurochem. Res. 2002 27 1065 1077
135. R. Moccia D. Chen V. Lyles E. Kapuya Y. P. E. S. Kalachikov C. M. T. Spahn J. Frank E. R. Kandel M. Barad K. C. Martin J. Neurosci. 2003 23 9409 9417
136. L. L. Moroz J. R. Edwards S. V. Puthanveettil A. B. Kohn T. Hla A. Heyland L. Knudsen A. Sahni F. H. Yu L. Liu S. Jezzini P. Lovell W. Iannucculli M. C. Chen T. Nguyen H. T. Sheng R. Shaw S. Kalachikov Y. V. Panchin W. Farmerie J. J. Russo J. Y. Ju E. R. Kandel Cell 2006 127 1453 1467
137. L. L. Moroz A. B. Kohn Front. Aging Neurosci. 2010 10.3389/neuro.24.006. 2010
138. S. Esumi S.-X. Wu Y. Yanagawa K. Obata Y. Sugimoto N. Tamamaki Neurosci. Res. 2008 60 439 451
139. F. Kamme R. Salunga J. Yu D.-T. Tran J. Zhu L. Luo A. Bittner H.-Q. Guo N. Miller J. Wan M. Erlander J. Neurosci. 2003 23 3607 3615
140. J. Eberwine T. Bartfai Pharmacol. Ther. 2011 129 241 259
141. D. Ramskold S. Luo Y.-C. Wang R. Li Q. Deng O. R. Faridani G. A. Daniels I. Khrebtukova J. F. Loring L. C. Laurent G. P. Schroth R. Sandberg Nat. Biotechnol. 2012 30 777 782
142. D. Hebenstreit Biology 2012 1 658 667
143. M. M. Poon S. H. Choi C. A. M. Jamieson D. H. Geschwind K. C. Martin J. Neurosci. 2006 26 13390 13399
144. I. J. Cajigas G. Tushev T. J. Will S. T. Dieck N. Fuerst E. M. Schuman Neuron 2012 74 453 466
145. G. Polidoro C. Diilio P. Sacchetta G. Delboccio G. Federici Int. J. Biochem. 1984 16 741 746
146. P. Davidsson S. Folkesson M. Christiansson M. Lindbjer B. Dellheden K. Blennow A. Westman-Brinkmalm Rapid Commun. Mass Spectrom. 2002 16 2083 2088
147. M. Yun W. Wu L. Hood M. Harrington Electrophoresis 1992 13 1002 1013
148. P. H. O'Farrell J. Biol. Chem. 1975 250 4007 4021
149. D. Goldman C. R. Merril M. H. Ebert Clin. Chem. 1980 26 1317 1322
150. X. Li C. Xie Q. Jin M. Liu Q. He R. Cao Y. Lin J. Li Y. Li P. Chen S. Liang J. Proteome Res. 2009 8 3475 3486
151. R. S. Walikonis O. N. Jensen M. Mann D. W. Provance J. A. Mercer M. B. Kennedy J. Neurosci. 2000 20 4069 4080
152. K. w. Li M. P. Hornshaw J. van Minnen K.-H. Smalla E. D. Gundelfinger A. B. Smit J. Proteome Res. 2005 4 725 733
153. D. B. McClatchy L. Liao J. H. Lee S. K. Park J. R. Yates J. Proteome Res. 2012 11 2467 2479
154. S. Pan D. Zhu J. F. Quinn E. R. Peskind T. J. Montjne B. Y. Lin D. R. Goodlett G. Taylor J. Eng J. Zhang Proteomics 2007 7 469 473
155. L. J. Liao D. B. McClatchy J. R. Yates Neuron 2009 63 12 26
156. N. H. Moore L. G. Costa S. A. Shaffer D. R. Goodlett M. Guizzetti J. Neurochem. 2009 108 891 908
157. F. A. Witzmann R. J. Arnold F. J. Bai P. Hrncirova M. W. Kimpel Y. S. Mechref W. J. McBride M. V. Novotny N. M. Pedrick H. N. Ringham J. R. Simon Proteomics 2005 5 2177 2201
158. A. Ishii R. Dutta G. M. Wark S.-I. Hwang D. K. Han B. D. Trapp S. E. Pfeiffer R. Bansal Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 14605 14610
159. D. Martins-de-Souza W. Gattaz A. Schmitt C. Rewerts G. Maccarrone E. Dias-Neto C. Turck European Archives of Psychiatry and Clinical Neuroscience 2009 259 151 163
160. D. Martins-De-Souza W. F. Gattaz A. Schmitt C. Rewerts G. Maccarrone E. Dias-Neto C. W. Turck J. Sep. Sci. 2008 31 3122 3126
161. S. P. Gygi B. Rist S. A. Gerber F. Turecek M. H. Gelb R. Aebersold Nat. Biotechnol. 1999 17 994 999
162. M. D. Johnson L. R. Yu T. P. Conrads Y. Kinoshita T. Uo J. D. Matthews S. W. Lee R. D. Smith T. D. Veenstra R. S. Morrison J. Biol. Chem. 2004 279 26685 26697
163. J. A. Morón N. S. Abul-Husn R. Rozenfeld G. Dolios R. Wang L. A. Devi Mol. Cell. Proteomics 2007 6 29 42
164. M. A. Lovell S. Xiong W. R. Markesbery B. C. Lynn Neurochem. Res. 2005 30 113 122
165. Y. Yoshimura Y. Yamauchi T. Shinkawa M. Taoka H. Donai N. Takahashi T. Isobe T. Yamauchi J. Neurochem. 2004 88 759 768
166. Y. Fukata M. Fukata Nat. Rev. Neurosci. 2010 11 161 175
167. M. Heiman A. Schaefer S. Gong J. D. Peterson M. Day K. E. Ramsey M. Suarez-Farinas C. Schwarz D. A. Stephan D. J. Surmeier P. Greengard N. Heintz Cell 2008 135 738 748
168. L. Bai E. V. Romanova J. V. Sweedler Anal. Chem. 2011 83 2794 2800
169. S. S. Rubakhin E. V. Romanova P. Nemes J. V. Sweedler Nat. Methods 2011 8 S20 S29
170. S. S. Rubakhin J. V. Sweedler Anal. Chem. 2008 80 7128 7136
171. Q. H. Shi L. D. Qin W. Wei F. Geng R. Fan Y. S. Shin D. L. Guo L. Hood P. S. Mischel J. R. Heath Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 109 419 424
172. A. Salehi-Reyhani J. Kaplinsky E. Burgin M. Novakova A. J. Demello R. H. Templer P. Parker M. A. A. Neil O. Ces P. French K. R. Willison D. Klug Lab Chip 2011 11 1256 1261
173. J. R. S. Newman S. Ghaemmaghami J. Ihmels D. K. Breslow M. Noble J. L. DeRisi J. S. Weissman Nature 2006 441 840 846
174. Y. Taniguchi P. J. Choi G.-W. Li H. Chen M. Babu J. Hearn A. Emili X. S. Xie Science 2010 329 533 538
175. A. F. M. Altelaar A. J. R. Heck Curr. Opin. Chem. Biol. 2011 16 206 213
176. S. C. Bendall E. F. Simonds P. Qiu E. A. D. Amir P. O. Krutzik R. Finck R. V. Bruggner R. Melamed A. Trejo O. I. Ornatsky R. S. Balderas S. K. Plevritis K. Sachs D. Pe'er S. D. Tanner G. P. Nolan Science 2011 332 687 696
177. C. A. Luber J. Cox H. Lauterbach B. Fancke M. Selbach J. Tschopp S. Akira M. Wiegand H. Hochrein M. O'Keeffe M. Mann Immunity 2010 32 279 289
178. M. Y. Wu A. K. Singh Curr. Opin. Biotechnol. 2011 23 83 88
179. A. Jain R. J. Liu B. Ramani E. Arauz Y. Ishitsuka K. Ragunathan J. Park J. Chen Y. K. Xiang T. Ha Nature 2011 473 484 U322
180. A. Jain R. J. Liu Y. K. Xiang T. Ha Nat. Protoc. 2012 7 445 452
181. N. Srivastava J. S. Brennan R. F. Renzi M. Y. Wu S. S. Branda A. K. Singh A. E. Herr Anal. Chem. 2009 81 3261 3269
182. D. Parkhomchuk T. Borodina V. Amstislavskiy M. Banaru L. Hallen S. Krobitsch H. Lehrach A. Soldatov Nucleic Acids Res. 2009 37 e123
183. J. Z. Levin M. Yassour X. Adiconis C. Nusbaum D. A. Thompson N. Friedman A. Gnirke A. Regev Nat. Methods 2010 7 709 715
184. R. Yamashita N. P. Sathira A. Kanai K. Tanimoto T. Arauchi Y. Tanaka S. Hashimoto S. Sugano K. Nakai Y. Suzuki Genome Res. 2011 21 775 789
185. D. Josic J. G. Clifton Proteomics 2007 7 3010 3029
186. M. Mann O. N. Jensen Nat. Biotechnol. 2003 21 255 261