A peptide probe for detection of various beta-amyloid oligomers

Molecular BioSystems

Volumn 8, Issue 10, 2012, Pages 2741-2752

  Hu, Yang ^a   Su, Baihao ^a   Zheng, Heqiu ^a   Kim, Jin Ryoun ^a  

^a POLYTECHNIC UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMYLOID BETA PROTEIN; FLUORESCENT DYE; OLIGOPEPTIDE;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CHEMISTRY; CIRCULAR DICHROISM; HUMAN; MOLECULAR GENETICS; MOLECULAR PROBE; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; SOLUTION AND SOLUBILITY; SPECTROFLUOROMETRY; TRANSMISSION ELECTRON MICROSCOPY;

AMINO ACID SEQUENCE; AMYLOID BETA-PEPTIDES; CIRCULAR DICHROISM; FLUORESCENT DYES; HUMANS; MICROSCOPY, ELECTRON, TRANSMISSION; MOLECULAR PROBES; MOLECULAR SEQUENCE DATA; OLIGOPEPTIDES; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; SOLUTIONS; SPECTROMETRY, FLUORESCENCE;

EID: 84865731444     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2mb25148e     Document Type: Article

References (98)

1. J. Kang H. G. Lemaire A. Unterbeck J. M. Salbaum C. L. Masters K. H. Grzeschik G. Multhaup K. Beyreuther B. Muller-Hill Nature 1987 325 733 736
2. R. Wang D. Sweeney S. E. Gandy S. S. Sisodia J. Biol. Chem. 1996 271 31894 31902
3. J. T. Jarrett E. P. Berger P. T. Lansbury, Jr. Biochemistry 1993 32 4693 4697
4. L. O. Tjernberg J. Naslund F. Lindqvist J. Johansson A. R. Karlstrom J. Thyberg L. Terenius C. Nordstedt J. Biol. Chem. 1996 271 8545 8548
5. C. Soto E. M. Sigurdsson L. Morelli R. A. Kumar E. M. Castano B. Frangione Nat. Med. 1998 4 822 826
6. R. Liu C. McAllister Y. Lyubchenko M. R. Sierks J. Neurosci. Res. 2004 75 162 171
7. T. Christopeit P. Hortschansky V. Schroeckh K. Guhrs G. Zandomeneghi M. Fandrich Protein Sci. 2005 14 2125 2131
8. N. D. Lazo M. A. Grant M. C. Condron A. C. Rigby D. B. Teplow Protein Sci. 2005 14 1581 1596
9. I. Daidone F. Simona D. Roccatano R. A. Broglia G. Tiana G. Colombo A. Di Nola Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2004 57 198 204
10. W. Hoyer C. Gronwall A. Jonsson S. Stahl T. Hard Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 5099 5104
11. J. Zheng X. Yu J. Wang J. C. Yang Q. Wang J. Phys. Chem. B 2010 114 463 470
12. Y. Miller B. Ma R. Nussinov Chem. Rev. 2010 110 4820 4838
13. A. T. Petkova Y. Ishii J. J. Balbach O. N. Antzutkin R. D. Leapman F. Delaglio R. Tycko Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 16742 16747
14. M. Ahmed J. Davis D. Aucoin T. Sato S. Ahuja S. Aimoto J. I. Elliott W. E. Van Nostrand S. O. Smith Nat. Struct. Mol. Biol. 2010 17 561 567
15. R. Wetzel S. Shivaprasad A. D. Williams Biochemistry 2007 46 1 10
16. D. B. Teplow N. D. Lazo G. Bitan S. Bernstein T. Wyttenbach M. T. Bowers A. Baumketner J. E. Shea B. Urbanc L. Cruz J. Borreguero H. E. Stanley Acc. Chem. Res. 2006 39 635 645
17. J. P. Lee E. R. Stimson J. R. Ghilardi P. W. Mantyh Y. A. Lu A. M. Felix W. Llanos A. Behbin M. Cummings M. Van Criekinge W. Timms J. E. Maggio Biochemistry 1995 34 5191 5200
18. L. Hou H. Shao Y. Zhang H. Li N. K. Menon E. B. Neuhaus J. M. Brewer I. J. Byeon D. G. Ray M. P. Vitek T. Iwashita R. A. Makula A. B. Przybyla M. G. Zagorski J. Am. Chem. Soc. 2004 126 1992 2005
19. S. Zhang K. Iwata M. J. Lachenmann J. W. Peng S. Li E. R. Stimson Y. Lu A. M. Felix J. E. Maggio J. P. Lee J. Struct. Biol. 2000 130 130 141
20. R. Riek P. Guntert H. Dobeli B. Wipf K. Wuthrich Eur. J. Biochem. 2001 268 5930 5936
21. J. D. Harper S. S. Wong C. M. Lieber P. T. Lansbury Chem. Biol. 1997 4 119 125
22. D. M. Walsh D. M. Hartley Y. Kusumoto Y. Fezoui M. M. Condron A. Lomakin G. B. Benedek D. J. Selkoe D. B. Teplow J. Biol. Chem. 1999 274 25945 25952
23. S. Barghorn V. Nimmrich A. Striebinger C. Krantz P. Keller B. Janson M. Bahr M. Schmidt R. S. Bitner J. Harlan E. Barlow U. Ebert H. Hillen J. Neurochem. 2005 95 834 847
24. R. W. Hepler K. M. Grimm D. D. Nahas R. Breese E. C. Dodson P. Acton P. M. Keller M. Yeager H. Wang P. Shughrue G. Kinney J. G. Joyce Biochemistry 2006 45 15157 15167
25. D. Losic L. L. Martin A. Mechler M. I. Aguilar D. H. Small J. Struct. Biol. 2006 155 104 110
26. I. A. Mastrangelo M. Ahmed T. Sato W. Liu C. Wang P. Hough S. O. Smith J. Mol. Biol. 2006 358 106 119
27. S. Chimon M. A. Shaibat C. R. Jones D. C. Calero B. Aizezi Y. Ishii Nat. Struct. Mol. Biol. 2007 14 1157 1164
28. K. Ono M. M. Condron D. B. Teplow Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 14745 14750
29. L. Yu R. Edalji J. E. Harlan T. F. Holzman A. P. Lopez B. Labkovsky H. Hillen S. Barghorn U. Ebert P. L. Richardson L. Miesbauer L. Solomon D. Bartley K. Walter R. W. Johnson P. J. Hajduk E. T. Olejniczak Biochemistry 2009 48 1870 1877
30. M. R. Nichols M. A. Moss D. K. Reed W. L. Lin R. Mukhopadhyay J. H. Hoh T. L. Rosenberry Biochemistry 2002 41 6115 6127
31. G. P. Gellermann H. Byrnes A. Striebinger K. Ullrich R. Mueller H. Hillen S. Barghorn Neurobiol. Dis. 2008 30 212 220
32. A. D. Williams S. Shivaprasad R. Wetzel J. Mol. Biol. 2006 357 1283 1294
33. T. Luhrs C. Ritter M. Adrian D. Riek-Loher B. Bohrmann H. Dobeli D. Schubert R. Riek Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 17342 17347
34. G. Habicht C. Haupt R. P. Friedrich P. Hortschansky C. Sachse J. Meinhardt K. Wieligmann G. P. Gellermann M. Brodhun J. Gotz K. J. Halbhuber C. Rocken U. Horn M. Fandrich Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 19232 19237
35. E. Cerf R. Sarroukh S. Tamamizu-Kato L. Breydo S. Derclaye Y. F. Dufrene V. Narayanaswami E. Goormaghtigh J. M. Ruysschaert V. Raussens Biochem. J. 2009 421 415 423
36. A. Sandberg L. M. Luheshi S. Sollvander T. Pereira de Barros B. Macao T. P. Knowles H. Biverstal C. Lendel F. Ekholm-Petterson A. Dubnovitsky L. Lannfelt C. M. Dobson T. Hard Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 15595 15600
37. R. Kayed E. Head J. L. Thompson T. M. McIntire S. C. Milton C. W. Cotman C. G. Glabe Science 2003 300 486 489
38. C. Haass D. J. Selkoe Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2007 8 101 112
39. M. Citron Nat. Rev. Drug Discovery 2010 9 387 398
40. A. Aguzzi T. O'Connor Nat. Rev. Drug Discovery 2010 9 237 248
41. A. A. Reinke J. E. Gestwicki Chem. Biol. Drug Des. 2011 77 399 411
42. M. Lindgren P. Hammarstrom FEBS J. 2010 277 1380 1388
43. A. Kapurniotu ChemBioChem 2012 13 27 29
44. T. Takahashi H. Mihara Chem. Commun. 2012 48 1568 1570
45. T. Hard FEBS J. 2011 278 3884 3892
46. A. Noguchi S. Matsumura M. Dezawa M. Tada M. Yanazawa A. Ito M. Akioka S. Kikuchi M. Sato S. Ideno M. Noda A. Fukunari S. Muramatsu Y. Itokazu K. Sato H. Takahashi D. B. Teplow Y. Nabeshima A. Kakita K. Imahori M. Hoshi J. Biol. Chem. 2009 284 32895 32905
47. B. A. Chromy R. J. Nowak M. P. Lambert K. L. Viola L. Chang P. T. Velasco B. W. Jones S. J. Fernandez P. N. Lacor P. Horowitz C. E. Finch G. A. Krafft W. L. Klein Biochemistry 2003 42 12749 12760
48. S. Baglioni F. Casamenti M. Bucciantini L. M. Luheshi N. Taddei F. Chiti C. M. Dobson M. Stefani J. Neurosci. 2006 26 8160 8167
49. Y. Hu B. Su C. S. Kim M. Hernandez A. Rostagno J. Ghiso J. R. Kim ChemBioChem 2010 11 2409 2418
50. S. R. Adams R. E. Campbell L. A. Gross B. R. Martin G. K. Walkup Y. Yao J. Llopis R. Y. Tsien J. Am. Chem. Soc. 2002 124 6063 6076
51. Z. Ignatova L. M. Gierasch Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 523 528
52. F. Madani J. Lind P. Damberg S. R. Adams R. Y. Tsien A. O. Graslund J. Am. Chem. Soc. 2009 131 4613 4615
53. B. R. Martin B. N. Giepmans S. R. Adams R. Y. Tsien Nat. Biotechnol. 2005 23 1308 1314
54. P. H. Nguyen M. S. Li G. Stock J. E. Straub D. Thirumalai Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 111 116
55. T. Takeda D. K. Klimov Biophys. J. 2009 96 442 452
56. Y. Miller B. Ma R. Nussinov Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 9490 9495
57. J. W. Wu L. Breydo J. M. Isas J. Lee Y. G. Kuznetsov R. Langen C. Glabe J. Biol. Chem. 2010 285 6071 6079
58. R. Kayed I. Canto L. Breydo S. Rasool T. Lukacsovich J. Wu R. Albay, 3rd A. Pensalfini S. Yeung E. Head J. L. Marsh C. Glabe Mol. Neurodegener. 2010 5 57
59. C. G. Glabe J. Biol. Chem. 2008 283 29639 29643
60. P. J. Shughrue P. J. Acton R. S. Breese W. Q. Zhao E. Chen-Dodson R. W. Hepler A. L. Wolfe M. Matthews G. J. Heidecker J. G. Joyce S. A. Villarreal G. G. Kinney Neurobiol. Aging 2010 31 189 202
61. B. Urbanc L. Cruz S. Yun S. V. Buldyrev G. Bitan D. B. Teplow H. E. Stanley Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 17345 17350
62. N. G. Sgourakis Y. Yan S. A. McCallum C. Wang A. E. Garcia J. Mol. Biol. 2007 368 1448 1457
63. Y. Yan C. Wang J. Mol. Biol. 2006 364 853 862
64. H. Li B. H. Monien E. A. Fradinger B. Urbanc G. Bitan Biochemistry 2010 49 1259 1267
65. C. J. Pike A. J. Walencewicz-Wasserman J. Kosmoski D. H. Cribbs C. G. Glabe C. W. Cotman J. Neurochem. 1995 64 253 265
66. G. G. Tartaglia M. Vendruscolo Chem. Soc. Rev. 2008 37 1395 1401
67. J. D. Harper S. S. Wong C. M. Lieber P. T. Lansbury, Jr. Biochemistry 1999 38 8972 8980
68. P. Sengupta K. Garai B. Sahoo Y. Shi D. J. Callaway S. Maiti Biochemistry 2003 42 10506 10513
69. H. LeVine, 3rd Anal. Biochem. 2004 335 81 90
70. B. Krishnan L. M. Gierasch Chem. Biol. 2008 15 1104 1115
71. A. Jan O. Gokce R. Luthi-Carter H. A. Lashuel J. Biol. Chem. 2008 283 28176 28189
72. A. D. Williams M. Sega M. Chen I. Kheterpal M. Geva V. Berthelier D. T. Kaleta K. D. Cook R. Wetzel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 7115 7120
73. H. LeVine, 3rd Methods Enzymol. 1999 309 274 284
74. A. D. Williams E. Portelius I. Kheterpal J. T. Guo K. D. Cook Y. Xu R. Wetzel J. Mol. Biol. 2004 335 833 842
75. J. D. Harper P. T. Lansbury Jr. Annu. Rev. Biochem. 1997 66 385 407
76. Y. Yoshiike D. H. Chui T. Akagi N. Tanaka A. Takashima J. Biol. Chem. 2003 278 23648 23655
77. R. Kayed A. Pensalfini L. Margol Y. Sokolov F. Sarsoza E. Head J. Hall C. Glabe J. Biol. Chem. 2009 284 4230 4237
78. S. Matsumura K. Shinoda M. Yamada S. Yokojima M. Inoue T. Ohnishi T. Shimada K. Kikuchi D. Masui S. Hashimoto M. Sato A. Ito M. Akioka S. Takagi Y. Nakamura K. Nemoto Y. Hasegawa H. Takamoto H. Inoue S. Nakamura Y. Nabeshima D. B. Teplow M. Kinjo M. Hoshi J. Biol. Chem. 2011 286 11555 11562
79. B. Bolognesi J. R. Kumita T. P. Barros E. K. Esbjorner L. M. Luheshi D. C. Crowther M. R. Wilson C. M. Dobson G. Favrin J. J. Yerbury ACS Chem. Biol. 2010 5 735 740
80. A. Zhang W. Qi T. A. Good E. J. Fernandez Biophys. J. 2009 96 1091 1104
81. G. D. Rose L. M. Gierasch J. A. Smith Adv. Protein Chem. 1985 37 1 109
82. B. Urbanc M. Betnel L. Cruz G. Bitan D. B. Teplow J. Am. Chem. Soc. 2010 132 4266 4280
83. S. L. Bernstein N. F. Dupuis N. D. Lazo T. Wyttenbach M. M. Condron G. Bitan D. B. Teplow J. E. Shea B. T. Ruotolo C. V. Robinson M. T. Bowers Nat. Chem. 2009 1 326 331
84. Y. R. Chen C. G. Glabe J. Biol. Chem. 2006 281 24414 24422
85. M. H. Viet S. T. Ngo N. S. Lam M. S. Li J. Phys. Chem. B 2011 115 7433 7446
86. E. A. Fradinger B. H. Monien B. Urbanc A. Lomakin M. Tan H. Li S. M. Spring M. M. Condron L. Cruz C. W. Xie G. B. Benedek G. Bitan Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 14175 14180
87. Z. Ignatova L. M. Gierasch Biochemistry 2005 44 7266 7274
88. R. A. Scheck A. Schepartz Acc. Chem. Res. 2011 44 654 665
89. B. A. Griffin S. R. Adams R. Y. Tsien Science 1998 281 269 272
90. C. L. Teoh C. L. Pham N. Todorova A. Hung C. N. Lincoln E. Lees Y. H. Lam K. J. Binger N. H. Thomson S. E. Radford T. A. Smith S. A. Muller A. Engel M. D. Griffin I. Yarovsky P. R. Gooley G. J. Howlett J. Mol. Biol. 2011 405 1246 1266
91. N. Ferguson J. Becker H. Tidow S. Tremmel T. D. Sharpe G. Krause J. Flinders M. Petrovich J. Berriman H. Oschkinat A. R. Fersht Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 16248 16253
92. K. Iwata T. Fujiwara Y. Matsuki H. Akutsu S. Takahashi H. Naiki Y. Goto Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 18119 18124
93. M. Vilar H. T. Chou T. Luhrs S. K. Maji D. Riek-Loher R. Verel G. Manning H. Stahlberg R. Riek Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 8637 8642
94. K. N. Dahlgren A. M. Manelli W. B. Stine, Jr. L. K. Baker G. A. Krafft M. J. LaDu J. Biol. Chem. 2002 277 32046 32053
95. D. B. Teplow Methods Enzymol. 2006 413 20 33
96. M. P. Lambert A. K. Barlow B. A. Chromy C. Edwards R. Freed M. Liosatos T. E. Morgan I. Rozovsky B. Trommer K. L. Viola P. Wals C. Zhang C. E. Finch G. A. Krafft W. L. Klein Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 6448 6453
97. E. W. Mina C. Lasagna-Reeves C. G. Glabe R. Kayed J. Mol. Biol. 2009 391 577 585
98. J. Lee E. K. Culyba E. T. Powers J. W. Kelly Nat. Chem. Biol. 2011 7 602 609