Control of noise in chemical and biochemical information processing

Israel Journal of Chemistry

Volumn 51, Issue 1, 2011, Pages 118-131

  Privman, Vladimir ^a  

^a CLARKSON UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

biocomputing; biomedical; biomolecular; computing; digital; sensor

Indexed keywords

EID: 79951649303     PISSN: 00212148     EISSN: 18695868     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/ijch.201000066     Document Type: Review

References (225)

1. A. Credi, Angew. Chem. 2007, 119, 5568-5572
2. Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 5472-5475.
3. A. P. de Silva, S. Uchiyama, T. P. Vance, B. Wannalerse, Coord. Chem. Rev. 2007, 251, 1623-1632.
4. A. P. de Silva, S. Uchiyama, Nature Nanotechnol. 2007, 2, 399-410.
5. K. Szacilowski, Chem. Rev. 2008, 108, 3481-3548.
6. X. G. Shao, H. Y. Jiang, W. S. Cai, Prog. Chem. 2002, 14, 37-46.
7. A. Saghatelian, N. H. Volcker, K. M. Guckian, V. S. Y. Lin, M. R. Ghadiri, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 346-347.
8. G. Ashkenasy, M. R. Ghadiri, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 11140-11141.
9. R. Baron, O. Lioubashevski, E. Katz, T. Niazov, I. Willner, J. Phys. Chem. A 2006, 110, 8548-8553.
10. R. Baron, O. Lioubashevski, E. Katz, T. Niazov, I. Willner, Angew. Chem. 2006, 118, 1602-1606
11. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 1572-1576.
12. V. Privman, G. Strack, D. Solenov, M. Pita, E. Katz, J. Phys. Chem. B 2008, 112, 11777-11784.
13. G. Strack, M. Pita, M. Ornatska, E. Katz, ChemBioChem 2008, 9, 1260-1266.
14. D. Melnikov, G. Strack, M. Pita, V. Privman, E. Katz, J. Phys. Chem. B 2009, 113, 10472-10479.
15. A. H. Flood, R. J. A. Ramirez, W. Q. Deng, R. P. Muller, W. A. Goddard, J. F. Stoddart, Aust. J. Chem. 2004, 57, 301-322.
16. V. Privman, V. Pedrosa, D. Melnikov, M. Pita, A. Simonian, E. Katz, Biosens. Bioelectron. 2009, 25, 695-701.
17. E. Katz, V. Privman, J. Wang, in Proc. Conf. ICQNM 2010 (Eds.:, V. Ovchinnikov, V. Privman,), IEEE Comp. Soc., Los Alamitos, CA, 2010, pp. 1-9.
18. M. Privman, T. K. Tam, M. Pita, E. Katz, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1314-1321.
19. E. Katz, V. Privman, Chem. Soc. Rev. 2010, 39, 1835-1857.
20. N. Wagner, G. Ashkenasy, Chem. Eur. J. 2009, 15, 1765-1775.
21. V. Privman, M. A. Arugula, J. Halamek, M. Pita, E. Katz, J. Phys. Chem. B 2009, 113, 5301-5310.
22. M. A. Arugula, J. Halamek, E. Katz, D. Melnikov, M. Pita, V. Privman, G. Strack, in Proc. Conf. CENICS 2009 (Eds.:, K. B. Kent, P. Dini, O. Franza, T. Palacios, C. Reig, J. E. Maranon, A. Rostami, D. Zammit-Mangion, W. C. Hasenplaugh, F. Toran, Y. Zafar,), IEEE Comp. Soc., Los Alamitos, CA, 2009, pp. 1-7.
23. G. J. Brown, A. P. de Silva, S. Pagliari, Chem. Commun. 2002, 2461-2463.
24. U. Pischel, Angew. Chem. 2007, 119, 4100-4115
25. Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 4026-4040.
26. F. M. Raymo, S. Giordani, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4651-4652.
27. X. Guo, D. Zhang, G. Zhang, D. Zhu, J. Phys. Chem. B 2004, 108, 11942-11945.
28. Y. Liu, W. Jiang, H.-Y. Zhang, C.-J. Li, J. Phys. Chem. B 2006, 110, 14231-14235.
29. M. N. Stojanovic, D. Stefanovic, Nature Biotechnol. 2003, 21, 1069-1074.
30. J. Macdonald, Y. Li, M. Sutovic, H. Lederman, K. Pendri, W. H. Lu, B. L. Andrews, D. Stefanovic, M. N. Stojanovic, Nano Lett. 2006, 6, 2598-2603.
31. T. Niazov, R. Baron, E. Katz, O. Lioubashevski, I. Willner, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006, 103, 17160-17163.
32. G. Strack, M. Ornatska, M. Pita, E. Katz, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 4234-4235.
33. L. Fedichkin, E. Katz, V. Privman, J. Comput. Theor. Nanosci. 2008, 5, 36-43.
34. O. Feinerman, E. Moses, J. Neurosci. 2005, 26, 4526-4534.
35. O. Feinerman, A. Rotem, E. Moses, Nature Physics 2008, 4, 967-973.
36. Y. Benenson, T. Paz-Elizur, R. Adar, E. Keinan, Z. Livneh, E. Shapiro, Nature 2001, 414, 430-434.
37. P. Fu, Biotechnol. J. 2007, 2, 91-101.
38. P. Dittrich, Lect. Notes Computer Sci. 2005, 3566, 19-32.
39. A. N. Shipway, E. Katz, I. Willner, in Molecular Machines and Motors (Ed.:, J.-P. Sauvage,), Structure and Bonding, Vol. 99, Springer, Berlin, 2001, pp. 237-281.
40. D. A. Weinberger, T. B. Higgins, C. A. Mirkin, C. L. Stern, L. M. Liable-Sands, A. L. Rheingold, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 2503-2516.
41. H. R. Tseng, S. A. Vignon, P. C. Celestre, J. Perkins, J. O. Jeppesen, A. Di Fabio, R. Ballardini, M. T. Gandolfi, M. Venturi, V. Balzani, J. F. Stoddart, Chem. Eur. J. 2004, 10, 155-172.
42. Y. L. Zhao, W. R. Dichtel, A. Trabolsi, S. Saha, I. Aprahamian, J. F. Stoddart, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 11294-11295.
43. M. Suresh, A. Ghosh, A. Das, Tetrahedron Lett. 2007, 48, 8205-8208.
44. J. D. Crowley, D. A. Leigh, P. J. Lusby, R. T. McBurney, L. E. Perret-Aebi, C. Petzold, A. M. Z. Slawin, M. D. Symes, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 15085-15090.
45. S. Iwata, K. Tanaka, J. Chem. Soc. Chem. Commun. 1995, 1491-1492.
46. S. H. Lee, J. Y. Kim, S. K. Kim, J. H. Leed, J. S. Kim, Tetrahedron 2004, 60, 5171-5176.
47. D. C. Magri, G. J. Brown, G. D. McClean, A. P. de Silva, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4950-4951.
48. K. K. Sadhu, B. Bag, P. K. Bharadwaj, J. Photochem. Photobiol. A 2007, 185, 231-238.
49. E. Katz, A. N. Shipway, I. Willner, in Photoreactive Organic Thin Films (Ed.:, S. Sekkat, W. Knoll,), Elsevier, San Diego, 2002, pp. 219-268.
50. V. Balzani, Photochem. Photobiol. Sci. 2003, 2, 459-476.
51. S. Giordani, M. A. Cejas, F. M. Raymo, Tetrahedron 2004, 60, 10973-10981.
52. M. Lion-Dagan, E. Katz, I. Willner, J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 7913-7914.
53. I. Willner, M. Lion-Dagan, S. Marx-Tibbon, E. Katz, J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 6581-6592.
54. F. M. Raymo, S. Giordani, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002, 99, 4941-4944.
55. Z. F. Liu, K. Hashimoto, A. Fujishima, Nature 1990, 347, 658-660.
56. A. Doron, M. Portnoy, M. Lion-Dagan, E. Katz, I. Willner, J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 8937-8944.
57. N. G. Liu, D. R. Dunphy, P. Atanassov, S. D. Bunge, Z. Chen, G. P. Lopez, T. J. Boyle, C. J. Brinker, Nano Lett. 2004, 4, 551-554.
58. P. R. Ashton, R. Ballardini, V. Balzani, A. Credi, K. R. Dress, E. Ishow, C. J. Kleverlaan, O. Kocian, J. A. Preece, N. Spencer, J. F. Stoddart, M. Venturi, S. Wenger, Chem. Eur. J. 2000, 6, 3558-3574.
59. E. Katz, A. N. Shipway, in Bioelectronics: From Theory to Applications (Ed.:, I. Willner, E. Katz,), Wiley-VCH, Weinheim, 2005, pp. 309-338.
60. S. Bonnet, J. P. Collin, Chem. Soc. Rev. 2008, 37, 1207-1217.
61. I. Thanopulos, P. Kral, M. Shapiro, E. Paspalakis, J. Mod. Opt. 2009, 56, 686-703.
62. E. Katz, L. Sheeney-Haj-Ichia, B. Basnar, I. Felner, I. Willner, Langmuir 2004, 20, 9714-9719.
63. E. Katz, R. Baron, I. Willner, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 4060-4070.
64. I. M. Hsing, Y. Xu, W. T. Zhao, Electroanalysis 2007, 19, 755-768.
65. R. Hirsch, E. Katz, I. Willner, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 12053-12054.
66. E. Katz, L. Sheeney-Haj-Ichia, I. Willner, Chem. Eur. J. 2002, 8, 4138-4148.
67. I. Willner, E. Katz, Angew. Chem. 2003, 115, 4724-4737
68. Angew. Chem. Int. Ed. 2003, 42, 4576-4588.
69. J. Wang, A. N. Kawde, Electrochem. Commun. 2002, 4, 349-352.
70. R. Laocharoensuk, A. Bulbarello, S. Mannino, J. Wang, Chem. Commun. 2007, 3362-3364.
71. J. Wang, Electroanalysis 2008, 20, 611-615.
72. J. Lee, D. Lee, E. Oh, J. Kim, Y. P. Kim, S. Jin, H. S. Kim, Y. Hwang, J. H. Kwak, J. G. Park, C. H. Shin, J. Kim, T. Hyeon, Angew. Chem. 2005, 117, 7593-7598
73. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 7427-7432.
74. J. Wang, M. Scampicchio, R. Laocharoensuk, F. Valentini, O. Gonzalez-Garcia, J. Burdick, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4562-4563.
75. O. A. Loaiza, R. Laocharoensuk, J. Burdick, M. C. Rodriguez, J. M. Pingarron, M. Pedrero, J. Wang, Angew. Chem. 2007, 119, 1530-1533
76. Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 1508-1511.
77. L. Zheng, L. Xiong, Colloids Surf. A 2006, 289, 179-184.
78. M. Riskin, B. Basnar, E. Katz, I. Willner, Chem. Eur. J. 2006, 12, 8549-8557.
79. M. Riskin, B. Basnar, V. I. Chegel, E. Katz, I. Willner, F. Shi, X. Zhang, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 1253-1260.
80. V. I. Chegel, O. A. Raitman, O. Lioubashevski, Y. Shirshov, E. Katz, I. Willner, Adv. Mater. 2002, 14, 1549-1553.
81. I. Poleschak, J. M. Kern, J. P. Sauvage, Chem. Commun. 2004, 474-476.
82. X. T. Le, P. Jégou, P. Viel, S. Palacin, Electrochem. Commun. 2008, 10, 699-703.
83. P. R. Ashton, R. Ballardini, V. Balzani, I. Baxter, A. Credi, M. C. T. Fyfe, M. T. Gandolfi, M. Gomez-Lopez, M. V. Martinez-Diaz, A. Piersanti, N. Spencer, J. F. Stoddart, M. Venturi, A. J. P. White, D. J. Williams, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 11932-11942.
84. C. J. Richmond, A. D. C. Parenty, Y. F. Song, G. Cooke, L. Cronin, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 13059-13065.
85. Y. Shiraishi, Y. Tokitoh, G. Nishimura, T. Hirai, Org. Lett. 2005, 7, 2611-2614.
86. F. Coutrot, C. Romuald, E. Busseron, Org. Lett. 2008, 10, 3741-3744.
87. G. Nishimura, K. Ishizumi, Y. Shiraishi, T. Hirai, J. Phys. Chem. B 2006, 110, 21596-21602.
88. W. D. Zhou, J. B. Li, X. R. He, C. H. Li, J. Lv, Y. L. Li, S. Wang, H. B. Liu, D. B. Zhu, Chem. Eur. J. 2008, 14, 754-763.
89. R. P. Fahlman, M. Hsing, C. S. Sporer-Tuhten, D. Sen, Nano Lett. 2003, 3, 1073-1078.
90. Y. Shiraishi, Y. Tokitoh, T. Hirai, Chem. Commun. 2005, 5316-5318.
91. R. Baron, A. Onopriyenko, E. Katz, O. Lioubashevski, I. Willner, S. Wang, H. Tian, Chem. Commun. 2006, 2147-2149.
92. I Katz, B. Willner, I. Willner, Biosens. Bioelectron. 1997, 12, 703-719.
93. M. Biancardo, C. Bignozzi, H. Doyle, G. Redmond, Chem. Commun. 2005, 3918-3920.
94. S. Giordani, F. M. Raymo, Org. Lett. 2003, 5, 3559-3562.
95. B. Raychaudhuri, S. Bhattacharyya, Appl. Phys. B 2008, 91, 545-550.
96. S. D. Straight, J. Andrasson, G. Kodis, S. Bandyopadhyay, R. H. Mitchell, T. A. Moore, A. L. Moore, D. Gust, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 9403-9409.
97. Z. Wang, G. Zheng, P. Lu, Org. Lett. 2005, 7, 3669-3672.
98. C.-J. Fang, Z. Zhu, W. Sun, C.-H. Xu, C.-H. Yan, New J. Chem. 2007, 31, 580-586.
99. S. D. Straight, P. A. Liddell, Y. Terazono, T. A. Moore, A. L. Moore, D. Gust, Adv. Funct. Mater. 2007, 17, 777-785.
100. F. Li, M. Shi, C. Huang, L. Jin, J. Mater. Chem. 2005, 15, 3015-3020.
101. G. Wen, J. Yan, Y. Zhou, D. Zhang, L. Mao, D. Zhu, Chem. Commun. 2006, 3016-3018.
102. K. Szaciłowski, W. Macyk, G. Stochel, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4550-4551.
103. J. H. Qian, Y. F. Xu, X. H. Qian, S. Y. Zhang, ChemPhysChem 2008, 9, 1891-1898.
104. G. Fioravanti, N. Haraszkiewicz, E. R. Kay, S. M. Mendoza, C. Bruno, M. Marcaccio, P. G. Wiering, F. Paolucci, P. Rudolf, A. M. Brouwer, D. A. Leigh, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 2593-2601.
105. S. Nitahara, N. Terasaki, T. Akiyama, S. Yamada, Thin Solid Films 2006, 499, 354-358.
106. A. P. de Silva, Nature 2008, 454, 417-418.
107. P. M. Mendes, Chem. Soc. Rev. 2008, 37, 2512-2529.
108. T. Gupta, M. E. van der Boom, Angew. Chem. 2008, 120, 5402-5406
109. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 5322-5326.
110. A. Credi, V. Balzani, S. J. Langford, J. F. Stoddart, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2679-2681.
111. A. P. de Silva, H. Q. N. Gunaratne, C. P. McCoy, Nature 1993, 364, 42-44.
112. A. P. de Silva, H. Q. N. Gunaratne, C. P. McCoy, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 7891-7892.
113. A. P. de Silva, H. Q. N. Gunaratne, G. E. M. Maguire, J. Chem. Soc. Chem. Commun. 1994, 1213-1214.
114. A. P. de Silva, N. D. McClenaghan, Chem. Eur. J. 2002, 8, 4935-4945.
115. A. P. de Silva, I. M. Dixon, H. Q. N. Gunaratne, T. Gunnlaugsson, P. R. S. Maxwell, T. E. Rice, J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1393-1394.
116. B. Turfan, E. U. Akkaya, Org. Lett. 2002, 4, 2857-2859.
117. P.-N. Cheng, P.-T. Chiang, S.-H. Chiu, Chem. Commun. 2005, 1285-1287.
118. J. Zhou, M. A. Arugula, J. Halámek, M. Pita, E. Katz, J. Phys. Chem. B 2009, 113, 16065-16070.
119. H. T. Baytekin, E. U. Akkaya, Org. Lett. 2000, 2, 1725-1727.
120. G. Zong, L. Xiana, G. Lua, Tetrahedron Lett. 2007, 48, 3891-3894.
121. T. Gunnlaugsson, D. A. Mac Dõnaill, D. Parker, Chem. Commun. 2000, 93-94.
122. T. Gunnlaugsson, D. A. Mac Dõnaill, D. Parker, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 12866-12876.
123. M. de Sousa, B. de Castro, S. Abad, M. A. Miranda, U. Pischel, Chem. Commun. 2006, 2051-2053.
124. L. Li, M.-X. Yu, F. Y. Li, T. Yi, C. H. Huang, Colloids Surf. A 2007, 304, 49-53.
125. V. Luxami, S. Kumar, New J. Chem. 2008, 32, 2074-2079.
126. J. H. Qian, X. H. Qian, Y. F. Xu, S. Y. Zhang, Chem. Commun. 2008, 4141-4143.
127. E. Pérez-Inestrosa, J.-M. Montenegro, D. Collado, R. Suau, J. Casado, J. Phys. Chem. C 2007, 111, 6904-6909.
128. P. Remõn, R. Ferreira, J.-M. Montenegro, R. Suau, E. Pérez-Inestrosa, U. Pischel, ChemPhysChem 2009, 10, 2004-2007.
129. A. Coskun, E. Deniz, E. U. Akkaya, Org. Lett. 2005, 7, 5187-5189.
130. D. Jiménez, R. Martínez-Máñez, F. Sancenõn, J. V. Ros-Lis, J. Soto, A. Benito, E. García-Breijo, Eur. J. Inorg. Chem. 2005, 2393-2403.
131. W. Sun, C. H. Xu, Z. Zhu, C. J. Fang, C. H. Yan, J. Phys. Chem. C 2008, 112, 16973-16983.
132. Z. X. Li, L. Y. Liao, W. Sun, C. H. Xu, C. Zhang, C. J. Fang, C. H. Yan, J. Phys. Chem. C 2008, 112, 5190-5196.
133. Y. Zhou, H. Wu, L. Qu, D. Zhang, D. Zhu, J. Phys. Chem. B 2006, 110, 15676-15679.
134. W. Sun, Y.-R. Zheng, C.-H. Xu, C.-J. Fang, C.-H. Yan, J. Phys. Chem. C 2007, 111, 11706-11711.
135. U. Pischel, B. Heller, New J. Chem. 2008, 32, 395-400.
136. J. Andreasson, S. D. Straight, S. Bandyopadhyay, R. H. Mitchell, T. A. Moore, A. L. Moore, D. Gust, J. Phys. Chem. C 2007, 111, 14274-14278.
137. M. Amelia, M. Baroncini, A. Credi, Angew. Chem. 2008, 120, 6336-6339
138. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 6240-6243.
139. E. Perez-Inestrosa, J. M. Montenegro, D. Collado, R. Suau, Chem. Commun. 2008, 1085-1087.
140. J. Andreasson, S. D. Straight, T. A. Moore, A. L. Moore, D. Gust, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 11122-11128.
141. D. Margulies, C. E. Felder, G. Melman, A. Shanzer, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 347-354.
142. M. Suresh, A. Ghosh, A. Das, Chem. Commun. 2008, 3906-3908.
143. E. Katz, I. Willner, Chem. Commun. 2005, 5641-5643.
144. M. N. Chatterjee, E. R. Kay, D. A. Leigh, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4058-4073.
145. M. Pita, G. Strack, K. MacVittie, J. Zhou, E. Katz, J. Phys. Chem. B 2009, 113, 16071-16076.
146. E. Katz, I. Willner, Electrochem. Commun. 2006, 8, 879-882.
147. F. Galindo, J. C. Lima, S. V. Luis, A. J. Parola, F. Pina, Adv. Funct. Mater. 2005, 15, 541-545.
148. A. Bandyopadhyay, A. J. Pal, J. Phys. Chem. B 2005, 109, 6084-6088.
149. D. Fernandez, A. J. Parola, L. C. Branco, C. A. M. Afonso, F. Pina, J. Photochem. Photobiol. A 2004, 168, 185-189.
150. F. Pina, A. Roque, M. J. Melo, I. Maestri, L. Belladelli, V. Balzani, Chem. Eur. J. 1998, 4, 1184-1191.
151. G. Will, J. S. S. N. Rao, D. Fitzmaurice, J. Mater. Chem. 1999, 9, 2297-2299.
152. J. Hiller, M. F. Rubner, Macromolecules 2003, 36, 4078-4083.
153. F. Pina, J. C. Lima, A. J. Parola, C. A. M. Afonso, Angew. Chem. 2004, 116, 1551-1553
154. Angew. Chem. Int. Ed. 2004, 43, 1525-1527.
155. R. Stadler, S. Ami, C. Joachim, M. Forshaw, Nanotechnology 2004, 15, S 115-S 121.
156. A. P. De Silva, Y. Leydet, C. Lincheneau, N. D. McClenaghan, J. Phys. Condens. Matter J. Phys. Cond. Mater. 2006, 18, S 1847-S 1872.
157. A. Adamatzky, IEICE Trans. Electron. 2004, E87 C, 1748-1756.
158. G. Bell, J. N. Gray, in Beyond Calculation: The Next Fifty Years of Computing (Eds.:, P. J. Denning, R. M. Metcalfe,), Copernicus/Springer, NY, 1997, pp. 5-32.
159. L. Fu, L. C. Cao, Y. Q. Liu, D. B. Zhu, Adv. Colloid Interface Sci. 2004, 111, 133-157.
160. K. P. Zauner, Crit. Rev. Solid State Mater. Sci. 2005, 30, 33-69.
161. C. S. Calude, J. F. Costa, N. Dershowitz, E. Freire, G. Rozenberg, Unconventional Computation, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 5715, Springer, Berlin, 2009.
162. S. G. Shiva, Introduction to Logic Design, 2nd ed., Marcel Dekker, New York, 1998.
163. D.-H. Qu, Q.-C. Wang, H. Tian, Angew. Chem. 2005, 117, 5430-5433
164. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 5296-5299.
165. J. Andréasson, S. D. Straight, G. Kodis, C.-D. Park, M. Hambourger, M. Gervaldo, B. Albinsson, T. A. Moore, A. L. Moore, D. Gust, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 16259-16265.
166. J. Andréasson, G. Kodis, Y. Terazono, P. A. Liddell, S. Bandyopadhyay, R. H. Mitchell, T. A. Moore, A. L. Moore, D. Gust, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 15926-15927.
167. M. V. Lopez, M. E. Vazquez, C. Gomez-Reino, R. Pedrido, M. R. Bermejo, New J. Chem. 2008, 32, 1473-1477.
168. D. Margulies, G. Melman, A. Shanzer, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4865-4871.
169. O. Kuznetz, H. Salman, N. Shakkour, Y. Eichen, S. Speiser, Chem. Phys. Lett. 2008, 451, 63-67.
170. F. Pina, M. J. Melo, M. Maestri, P. Passaniti, V. Balzani, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 4496-4498.
171. G. Ashkenazi, D. R. Ripoll, N. Lotan, H. A. Scheraga, Biosens. Bioelectron. 1997, 12, 85-95.
172. S. Sivan, N. Lotan, Biotechnol. Prog. 1999, 15, 964-970.
173. S. Sivan, S. Tuchman, N. Lotan, Biosystems 2003, 70, 21-33.
174. A. S. Deonarine, S. M. Clark, L. Konermann, Future Generation Computer Systems, 2003, 19, 87-97.
175. R. Unger, J. Moult, Proteins Struct. Funct. Bioinf. 2006, 63, 53-64.
176. M. N. Stojanovic, D. Stefanovic, T. LaBean, H. Yan, in Bioelectronics: From Theory to Applications (Eds.:, I. Willner, E. Katz,) Wiley-VCH, Weinheim, 2005, pp. 427-455.
177. D. I. Lewin, Computing in Science & Engineering 2002, 4, 5-8.
178. Y. Benenson, B. Gil, U. Ben-Dor, R. Adar, E. Shapiro, Nature 2004, 429, 423-429.
179. Z. Ezziane, Nanotechnology 2006, 17, R 27-R 39.
180. K. Rinaudo, L. Bleris, R. Maddamsetti, S. Subramanian, R. Weiss, Y. Benenson, Nature Biotechnol. 2007, 25, 795-801.
181. M. N. Win, C. D. Smolke, Science 2008, 322, 456-460.
182. A. Ogawa, M. Maeda, Chem. Commun. 2009, 4666-4668.
183. M. N. Stojanovic, T. E. Mitchell, D. Stefanovic, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 3555-3561.
184. Y. Benenson, Curr. Opin. Biotechnol. 2009, 20, 471-478.
185. H. Lederman, J. Macdonald, D. Stefanovic, M. N. Stojanovic, Biochemistry 2006, 45, 1194-1199.
186. K. Schlosser, Y. Li, Chem. Biol. 2009, 16, 311-322.
187. J. Elbaz, B. Shlyahovsky, D. Li, I. Willner, ChemBioChem 2008, 9, 232-239.
188. T. Li, E. Wang, S. Dong, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 15082-15083.
189. M. Moshe, J. Elbaz, I. Willner, Nano Lett. 2009, 9, 1196-1200.
190. I. Willner, B. Shlyahovsky, M. Zayats, B. Willner, Chem. Soc. Rev. 2008, 37, 1153-1165.
191. M. Soreni, S. Yogev, E. Kossoy, Y. Shoham, E. Keinan, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 3935-3943.
192. J. Xu, G. J. Tan, J. Comput. Theor. Nanosci. 2007, 4, 1219-1230.
193. M. Kahan, B. Gil, R. Adar, E. Shapiro, Physica D: Nonlinear Phenomena 2008, 237, 1165-1172.
194. N. H. E. Weste, D. Harris, CMOS VLSI Design: A Circuits and Systems Perspective, Pearson/Addison-Wesley, Boston, 2004.
195. J. Wakerly, Digital Design: Principles and Practices, Pearson/Prentice Hall, Upper Saddle River, NJ, 2005.
196. U. Alon, An Introduction to Systems Biology. Design Principles of Biological Circuits, Chapman & Hall/CRC Press, Boca Raton, FL, 2007.
197. R. S. Braich, N. Chelyapov, C. Johnson, P. W. K. Rothemund, L. Adleman, Science 2002, 296, 499-502.
198. V. Privman, J. Comput. Theor. Nanosci., 2010, in press: e-print http://www.arxiv.org/abs/1004.4666 available online.
199. Y. Setty, A. E. Mayo, M. G. Surette, U. Alon, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 7702-7707.
200. N. E. Buchler, U. Gerland, T. Hwa, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 9559-9564.
201. V. Privman, J. Halamek, M. A. Arugula, D. Melnikov, V. Bocharova, E. Katz, J. Phys. Chem. B 2010, 114, 14103-14109.
202. O. Pretzel, Error-Correcting Codes and Finite Fields, Oxford Univ. Press, Oxford, UK, 1992.
203. B. Arazi, A Commonsense Approach to the Theory of Error Correcting Codes, MIT Press, Cambridge, MA, 1988.
204. J. Bernoulli, Acta Eruditorum (Lipsiae), 1695, pp. 537-553.
205. K. Glinel, C. Dejugnat, M. Prevot, B. Scholer, M. Schonhoff, R. V. Klitzing, Colloids Surf. A 2007, 303, 3-13.
206. S. K. Ahn, R. M. Kasi, S. C. Kim, N. Sharma, Y. X. Zhou, Soft Matter 2008, 4, 1151-1157.
207. I. Tokarev, S. Minko, Soft Matter 2009, 5, 511-524.
208. M. Pita, S. Minko, E. Katz, J. Mater. Sci.: Materials in Medicine 2009, 20, 457-462.
209. I. Willner, A. Doron, E. Katz, J. Phys. Org. Chem. 1998, 11, 546-560.
210. X. Wang, Z. Gershman, A. B. Kharitonov, E. Katz, I. Willner, Langmuir 2003, 19, 5413-5420.
211. I. Luzinov, S. Minko, V. V. Tsukruk, Prog. Polym. Sci. 2004, 29, 635-698.
212. S. Minko, Polym. Rev. 2006, 46, 397-420.
213. I. Tokarev, V. Gopishetty, J. Zhou, M. Pita, M. Motornov, E. Katz, S. Minko, ACS Appl. Mater. Interfaces 2009, 1, 532-536.
214. M. Motornov, J. Zhou, M. Pita, V. Gopishetty, I. Tokarev, E. Katz, S. Minko, Nano Lett. 2008, 8, 2993-2997.
215. M. Motornov, J. Zhou, M. Pita, I. Tokarev, V. Gopishetty, E. Katz, S. Minko, Small 2009, 5, 817-820.
216. M. Krämer, M. Pita, J. Zhou, M. Ornatska, A. Poghossian, M. J. Schöning, E. Katz, J. Phys. Chem. B 2009, 113, 2573-2579.
217. J. Zhou, T. K. Tam, M. Pita, M. Ornatska, S. Minko, E. Katz, ACS Appl. Mater. Interfaces 2009, 1, 144-149.
218. X. Wang, J. Zhou, T. K. Tam, E. Katz, M. Pita, Bioelectrochemistry 2009, 77, 69-73.
219. T. K. Tam, J. Zhou, M. Pita, M. Ornatska, S. Minko, E. Katz, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10888-10889.
220. T. K. Tam, M. Ornatska, M. Pita, S. Minko, E. Katz, J. Phys. Chem. C 2008, 112, 8438-8445.
221. L. Amir, T. K. Tam, M. Pita, M. M. Meijler, L. Alfonta, E. Katz, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 826-832.
222. T. K. Tam, M. Pita, M. Ornatska, E. Katz, Bioelectrochemistry 2006, 76, 4-9.
223. Y. Shirokane, K. Ichikawa, M. Suzuki, Carbohydr. Res. 2000, 329, 699-702.
224. V. Privman, J. Zhou, J. Halamek, E. Katz, J. Phys. Chem. B 2010, 114, 13601-13608.
225. D. Melnikov, G. Strack, J. Zhou, J. R. Windmiller, J. Halamek, V. Bocharova, M.-C. Chuang, P. Santhosh, V. Privman, J. Wang, E. Katz, J. Phys. Chem. B 2010, 114, 12166-12174.