Interaction between experiments, analytical theories, and computation

Journal of Physical Chemistry C

Volumn 113, Issue 33, 2009, Pages 14598-14608

  Marcus, R A ^a  

^a CALIFORNIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANALYTICAL THEORY; BREAKPOINT; DE-TRAPPING; FLUORESCENCE INTERMITTENCY; GREEN CHEMISTRY; ISOTOPE EFFECT; ISOTOPIC EFFECTS; MASS-INDEPENDENT FRACTIONATION; ORGANIC REACTION; PHILADELPHIA; QUANTUM DOT; SEMICONDUCTOR NANOPARTICLES; SENSOR APPLICATIONS; THERMOPHILIC ENZYMES;

COMPUTATION THEORY; ENZYMES; ISOTOPES; SURFACE CHEMISTRY;

SEMICONDUCTOR QUANTUM DOTS;

EID: 69049120438     PISSN: 19327447     EISSN: 19327455     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp811456b     Document Type: Article

References (89)

1. Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1956, 24, 966.
2. Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1956, 24, 979.
3. Marcus, R. A.; Sutin, N. Biochim. Biophys. Acta 1985, 811, 265.
4. Libby, W. F. J. Phys. Chem. 1952, 56, 863.
5. Marcus, R. A. Trans. N.Y. Acad. Sci. 1957, 19, 423.
6. Marcus, R. A. Discuss. Faraday Soc. 1960, 29, 21.
7. Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1965, 43, 679.
8. Bigeleisen, J.; Mayer, J. G. J. Chem. Phys. 1947, 15, 261.
9. Thiemens, M. H. Science 1983, 219, 1073.
10. Thiemens, M. H.; Heidenreich, H. E. Science 1999, 283, 341.
11. Mauersberger, K.; Morton, J.; Schueler, B.; Stehr, J.; Anderson, S. M. Geophys. Res. Lett. 1993, 20, 1031.
12. Gao, Y. Q.; Marcus, R. A. Science 2001, 293, 259.
13. Gao, Y. Q.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 2002, 116, 137.
14. Hathorn, B. C.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1999, 111, 4087.
15. Hathorn, B. C.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 2000, 113, 9497.
16. Gao, Y. Q.; Chen, W.-C.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 2002, 117, 1536.
17. Gao, Y. Q.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 2007, 127, 244316.
18. Marcus, R. A. Adv. Quantum Chem. 2008, 55, 5.
19. Nagel, Z. D.; Klinman, J. P. Chem. Rev. 2006, 106, 3095.
20. Warshel, A.; Sharma, P. K.; Kato, M.; Xiang, Y.; Liu, H. B.; Olsson, M. H. M. Chem. Rev. 2006, 106, 3210.
21. Pu, J. Z.; Gao, J. L.; Truhlar, D. G. Chem. Rev. 2006, 106, 3140.
22. Hammes-Schiffer, S. Acc. Chem. Res. 2006, 39, 93.
23. Gao, J. L.; Ma, S. H.; Major, D. T.; Nam, K.; Pu, J. Z.; Truhlar, D. G. Chem. Rev. 2006, 106, 3188.
24. Kohen, A.; Cannio, R.; Bartolucci, S.; Klinman, J. P. Nature 1999, 399, 496.
25. Liang, Z. X.; Klinman, J. P. Curr. Opin. Struct. Biol. 2004, 14, 648.
26. Liang, Z.-X.; Tsigos, I.; Bouriotis, V.; Klinman, J. P. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 9500.
27. Liang, Z. X.; Lee, T.; Resing, K. A.; Ahn, N. G.; Klinman, J. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 9556.
28. Harris, R. J.; Meskys, R.; Sutcliffe, M. J.; Scrutton, N. S. Biochemistry 2000, 39, 1189.
29. Basran, J.; Sutcliffe, M. J.; Scrutton, N. S. J. Biol. Chem. 2001, 276, 24581.
30. Abad, J. L.; Camps, F.; Fabrias, G. Angew. Chem., Int. Ed. 2000, 39, 3279.
31. Maglia, G.; Allemann, R. K. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13372.
32. Agarwal, N.; Hong, B.; Mihai, C.; Kohen, A. Biochemistry 2004, 43, 1998.
33. Sikorski, R. S.; Wang, L.; Markham, K. A.; Rajagopalan, P. T. R.; Benkovic, S. J.; Kohen, A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 4778.
34. Hong, B. Y.; Maley, F.; Kohen, A. Biochemistry 2007, 46, 14188.
35. Knapp, M. J.; Rickert, K.; Klinman, J. P. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 3865.
36. Marcus, R. A. In Quantum Tunnelling in Enzyme-Catalyzed Reactions; Allemann, R. K., Scrutton, N. S., Eds.; RSC Publishing: Cambridge, 2009; pp.v-xiv.
37. Marcus, R. A. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 6643.
38. Doremus, R. H. J. Appl. Phys. 2002, 92, 7619.
39. Early references are (a) Agmon, N.; Hopfield, J. J. J. Chem. Phys. 1983, 78, 6947.
40. Agmon, N.; Hopfield, J. J. J. Chem. Phys. 1983, 79, 2042.
41. Sumi, H.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1986, 84, 4272.
42. Nadler, W.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1987, 86, 3906.
43. Lu, H. P.; Xun, L. Y.; Xie, X. S. Science 1998, 282, 1877.
44. Flomenbom, O.; Velonia, K.; Loos, D.; Masuo, S.; Cotlet, M.; Engelborghs, Y.; Hofkens, J.; Rowan, A. E.; Nolte, R. J. M.; Van der Auweraer, M.; de Schryver, F. C.; Klafter, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 2368.
45. English, B. P.; Min, W.; van Oijen, A. M.; Lee, K. T.; Luo, G. B.; Sun, H. Y.; Cherayil, B. J.; Kou, S. C.; Xie, X. S. Nat. Chem. Biol. 2006, 2, 87.
46. Prakash, M. K.; Marcus, R. A. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 399.
47. Prakash, M. K.; Marcus, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 15982.
48. E.g.; Warshel, A.; Sharma, P. K.; Kato, M.; Xiang, Y.; Liu, H. B.; Olsson, M. H. M. Chem. Rev. 2006, 106, 3210.
49. Yang, H.; Luo, G. B.; Karnchanaphanurach, P.; Louie, T. M.; Rech, I.; Cova, S.; Xun, L. Y.; Xie, X. S. Science 2003, 302, 262.
50. Min, W.; Luo, G. B.; Cherayil, B. J.; Kou, S. C.; Xie, X. S. Phys. Rev. Lett. 2005, 94, 198302.
51. Havriliak, S.; Nagami, S. Polymer 1967, 8, 161.
52. Hsu, C.-P.; Song, X. Y.; Marcus, R. A. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 2546.
53. E.g., (a) Efros, A. L.; Rosen, M. Annu. Rev. Mater. Sci. 2000, 30, 475.
54. Van Sark, W. G. J. H. M.; Frederix, P. L. T. M.; Bol, A. A.; Gerritsen, H. C.; Meijerink, A. ChemPhysChem 2002, 3, 871.
55. Margolin, G.; Protasenko, V,; Kuno, M.; Barkai, E. Adv. Chem. Phys. 2006, 133, 327.
56. Barkai, E.; Margolin, G. Israel J. Chem. 2004, 44, 353.
57. Banin, U.; Bruchez, M.; Alivisatos, A. P.; Ha, T.; Weiss, S.; Chemla, D. S. J. Chem. Phys. 1999, 110, 1195.
58. Chung, I. H.; Bawendi, M. G. Phys. Rev. B 2004, 70, 165304.
59. The original trapping reference is Efros, A. L.; Rosen, M. Phys. Rev. Lett. 1997, 78, 1110.
60. Shimizu, K. T.; Neuhauser, R. G.; Leatherdale, C. A.; Empedocles, S. A.; Woo, W. K.; Bawendi, M. G. Phys. Rev. B 2001, 63, 205316.
61. Tang, J.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 2005, 123, 054704.
62. Tang, J.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 2005, 123, 204511.
63. Knappenberger, K. L.; Wong, D. B.; Romanyuk, Y. E.; Leone, S. R. Nano Lett. 2007, 7, 3869.
64. Neuhauser, R. G.; Shimizu, K. T.; Woo, W. K.; Empedocles, S. A.; Bawendi, M. G. Phys. Rev. Lett. 2000, 85, 3301.
65. Pelton, M.; Smith, G.; Scherer, N. F.; Marcus, R. A. Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 14249.
66. Frantsuzov, P. A.; Marcus, R. A. Phys. Rev. B 2005, 72, 155321.
67. Shim, M.; Guyot-Sionnest, P. Nature 2000, 407, 981.
68. Park, S.-J.; Link, S.; Miller, W. L.; Gesquiere, A.; Barbara, P. F. Chem. Phys. 2007, 341, 169.
69. Hohng, S.; Ha, T. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1324.
70. Efros, A. L. Nat. Mater. 2008, 7, 612.
71. Narayan, S.; Muldoon, J.; Finn, M. G.; Fokin, V. V.; Kolb, H. C.; Sharpless, K. B. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 3275.
72. Klijn, J. E.; Engberts, J. B. F. N. Nature 2005, 435, 746.
73. Jung, Y. S.; Marcus, R. A. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 5492.
74. Shen, Y. R.; Ostroverkhov, V. Chem. Rev. 2006, 106, 1140.
75. Du, Q.; Superfine, R.; Freysz, E.; Shen, Y. R. Phys. Rev. Lett. 1993, 70, 2313.
76. Moore, F. G.; Richmond, G. L. Acc. Chem. Res. 2008, 41, 739.
77. Gao, X. H.; Cui, Y. Y.; Levenson, R. M.; Chung, L. W. K.; Nie, S. M. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 969.
78. Mahler, B.; Spinicelli, P. A.; Buil, S.; Quelin, X.; Hermier, J.-P.; Dubertret, B. Nat. Mater. 2008, 7, 659.
79. Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1965, 43, 1598.
80. Mortensen, E. M.; Pitzer, K. S. Chem. Soc. (London) Spec. Publ. 1962, 16, 57.
81. Wall, F. T.; Hiller, L. A., Jr.; Mazur, J. J. Chem. Phys. 1958, 29, 255.
82. Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1964, 41, 610.
83. Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1966, 45, 4493.
84. Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1966, 45, 4500.
85. Jimenez, R.; Fleming, G. R.; Kumar, P. V.; Maroncelli, M. Nature 1994, 369, 471.
86. Prakash, M. K.; Weibel, J. D.; Marcus, R. A. J. Geophys. Res.- Atmos. 2005, 110, D21315.
87. Chen, W.-C.; Prakash, M. K.; Marcus, R. A. J. Geophys. Res.-Atmos. 2008, 113, D05309.
88. Chen, W.-C.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 2005, 123, 094307.
89. Dejong P.H.K., Wilson J.E., Neilson G.W., Buckingham A.D.:Mol. Phys., 1997, 91, 99.