The druggable genome and support for target identification and validation in drug development

Science Translational Medicine

Volumn 9, Issue 383, 2017, Pages

  Finan, Chris ^a   Gaulton, Anna ^b   Kruger, Felix A ^a,c   Lumbers, R Thomas ^a   Shah, Tina ^a   Engmann, Jorgen ^a   Galver, Luana ^d   Kelley, Ryan ^d   Karlsson, Anneli ^b   Santos, Rita ^b,e   Overington, John P ^b,c   Hingorani, Aroon D ^a   Casas, Juan P ^a  

^a UNIVERSITY COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

^b EUROPEAN BIOINFORMATICS INSTITUTE   (United Kingdom)

^c BenevolentAI   (United Kingdom)

^d ILLUMINA INC   (United States)

^e GLAXOSMITHKLINE   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ARTICLE; DRUG TARGETING; GENE FREQUENCY; GENE LINKAGE DISEQUILIBRIUM; GENE LOCUS; GENETIC ASSOCIATION; GENETIC VARIABILITY; GENOME; GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY; GENOTYPING ARRAY; MICROARRAY ANALYSIS; MOLECULARLY TARGETED THERAPY; RNA TRANSLATION; SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM; DRUG DEVELOPMENT; DRUG REPOSITIONING; GENETICS; HUMAN; HUMAN GENOME; PHENOTYPE; REPRODUCIBILITY; TRANSLATIONAL RESEARCH;

DRUG DISCOVERY; DRUG REPOSITIONING; GENETIC LOCI; GENOME, HUMAN; GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY; HUMANS; LINKAGE DISEQUILIBRIUM; MOLECULAR TARGETED THERAPY; PHENOTYPE; POLYMORPHISM, SINGLE NUCLEOTIDE; REPRODUCIBILITY OF RESULTS; TRANSLATIONAL MEDICAL RESEARCH;

EID: 85017477447     PISSN: 19466234     EISSN: 19466242     Source Type: Journal    
DOI: 10.1126/scitranslmed.aag1166     Document Type: Article

References (75)

1. B. Munos, Lessons from 60 years of pharmaceutical innovation. Nat. Rev. Drug Discov. 8, 959-968 (2009).
2. S. M. Paul, D. S. Mytelka, C. T. Dunwiddie, C. C. Persinger, B. H. Munos, S. R. Lindborg, A. L. Schacht, How to improve R&D productivity: The pharmaceutical industry's grand challenge. Nat. Rev. Drug Discov. 9, 203-214 (2010).
3. M. R. Macleod, A. Lawson McLean, A. Kyriakopoulou, S. Serghiou, A. de Wilde, N. Sherratt, T. Hirst, R. Hemblade, Z. Bahor, C. Nunes-Fonseca, A. Potluru, A. Thomson, J. Baginskaite, K. Egan, H. Vesterinen, G. L. Currie, L. Churilov, D. W. Howells, E. S. Sena, Risk of bias in reports of in vivo research: A focus for improvement. PLOS Biol. 13, e1002273 (2015).
4. P. Perel, I. Roberts, E. Sena, P. Wheble, C. Briscoe, P. Sandercock, M. Macleod, L. E. Mignini, P. Jayaram, K. S. Khan, Comparison of treatment effects between animal experiments and clinical trials: Systematic review. BMJ 334, 197 (2007).
5. H. B. van der Worp, D. W. Howells, E. S. Sena, M. J. Porritt, S. Rewell, V. O'Collins, M. R. Macleod, Can animal models of disease reliably inform human studies? PLOS Med. 7, e1000245 (2010).
6. J. P. A. Ioannidis, Why most published research findings are false. PLOS Med. 2, e124 (2005).
7. D. Colquhoun, An investigation of the false discovery rate and the misinterpretation of p-values. R. Soc. Open Sci. 1, 140216 (2014).
8. L. G. Halsey, D. Curran-Everett, S. L. Vowler, G. B. Drummond, The fickle P value generates irreproducible results. Nat. Methods 12, 179-185 (2015).
9. H. Naci, J. P. A. Ioannidis, How good is "evidence" from Clinical Studies of drug effects and why might such evidence fail in the prediction of the clinical utility of drugs? Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 55, 169-189 (2015).
10. J. Arrowsmith, P. Miller, Trial watch: Phase II and phase III attrition rates 2011-2012. Nat. Rev. Drug Discov. 12, 569 (2013).
11. A. Hingorani, J. P. Casas, Interleukin-6 receptor pathways in coronary heart disease: A collaborative meta-analysis of 82 studies. Lancet 379, 1205-1213 (2012).
12. IL6R Genetics Consortium Emerging Risk Factors Collaboration, N. Sarwar, A. S. Butterworth, D. F. Freitag, J. Gregson, P. Willeit, D. N. Gorman, P. Gao, D. Saleheen, A. Rendon, C. P. Nelson, P. S. Braund, A. S. Hall, D. I. Chasman, A. Tybjærg-Hansen, J. C. Chambers, E. J. Benjamin, P. W. Franks, R. Clarke, A. A. Wilde, M. D. Trip, M. Steri, J. C. Witteman, L. Qi, C. E. van der Schoot, U. de Faire, J. Erdmann, H. M. Stringham, W. Koenig, D. J. Rader, D. Melzer, D. Reich, B. M. Psaty, M. E. Kleber, D. B. Panagiotakos, J. Willeit, P. Wennberg, M. Woodward, S. Adamovic, E. B. Rimm, T. W. Meade, R. F. Gillum, J. A. Shaffer, A. Hofman, A. Onat, J. Sundström, S. Wassertheil-Smoller, D. Mellström, J. Gallacher, M. Cushman, R. P. Tracy, J. Kauhanen, M. Karlsson, J. T. Salonen, L. Wilhelmsen, P. Amouyel, B. Cantin, L. G. Best, Y. Ben-Shlomo, J. E. Manson, G. Davey-Smith, P. I. De Bakker, C. J. Odonnell, J. F. Wilson, A. G. Wilson, T. L. Assimes, J. O. Jansson, C. Ohlsson, Å. Tivesten, Ö. Ljunggren, M. P. Reilly, A. Hamsten, E. Ingelsson, F. Cambien, J. Hung, G. N. Thomas, M. Boehnke, H. Schunkert, F. W. Asselbergs, J. J. Kastelein, V. Gudnason, V. Salomaa, T. B. Harris, J. S. Kooner, K. H. Allin, B. G. Nordestgaard, J. C. Hopewell, A. H. Goodall, P. M. Ridker, H. Hólm, H. Watkins, W. H. Ouwehand, N. J. Samani, S. Kaptoge, E. Di Angelantonio, O. Harari, J. Danesh, Nature's randomised trials. Lancet 366, 1906-1908 (2005).
13. R. Sofat, A. D. Hingorani, L. Smeeth, S. E. Humphries, P. J. Talmud, J. Cooper, T. Shah, M. S. Sandhu, S. L. Ricketts, S. M. Boekholdt, N. Wareham, K. T. Khaw, M. Kumari, M. Kivimaki, M. Marmot, F. W. Asselbergs, P. van der Harst, R. P. F. Dullaart, G. Navis, D. J. van Veldhuisen, W. H. Van Gilst, J. F. Thompson, P. McCaskie, L. J. Palmer, M. Arca, F. Quagliarini, C. Gaudio, F. Cambien, V. Nicaud, O. Poirer, V. Gudnason, A. Isaacs, J. C. M. Witteman, C. M. van Duijn, M. Pencina, R. S. Vasan, R. B. D'Agostino, J. Ordovas, T. Y. Li, S. Kakko, H. Kauma, M. J. Savolainen, Y. A. Kesäniemi, A. Sandhofer, B. Paulweber, J. V. Sorli, A. Goto, S. Yokoyama, K. Okumura, B. D. Horne, C. Packard, D. Freeman, I. Ford, N. Sattar, V. McCormack, D. A. Lawlor, S. Ebrahim, G. D. Smith, J. J. P. Kastelein, J. Deanfield, J. P. Casas, Separating the mechanism-based and off-target actions of cholesteryl ester transfer protein inhibitors with CETP gene polymorphisms. Circulation 121, 52-62 (2010).
14. G. Davey Smith, Capitalizing on Mendelian randomization to assess the effects of treatments. J. R. Soc. Med. 100, 432-435 (2007).
15. J. P. Casas, E. Ninio, A. Panayiotou, J. Palmen, J. A. Cooper, S. L. Ricketts, R. Sofat, A. N. Nicolaides, J. P. Corsetti, F. G. R. Fowkes, I. Tzoulaki, M. Kumari, E. J. Brunner, M. Kivimaki, M. G. Marmot, M. M. Hoffmann, K. Winkler, W. März, S. Ye, H. A. Stirnadel, K.-T. Khaw, S. E. Humphries, M. S. Sandhu, A. D. Hingorani, P. J. Talmud, PLA2G7 genotype, lipoprotein-associated phospholipase A2 activity, and coronary heart disease risk in 10 494 cases and 15 624 controls of European Ancestry. Circulation 121, 2284-2293 (2010).
16. C Reactive Protein Coronary Heart Disease Genetics Collaboration, Association between C reactive protein and coronary heart disease: Mendelian randomisation analysis based on individual participant data. BMJ 342, d548 (2011).
17. M. V. Holmes, T. Simon, H. J. Exeter, L. Folkersen, F. W. Asselbergs, M. Guardiola, J. A. Cooper, J. Palmen, J. A. Hubacek, K. F. Carruthers, B. D. Horne, K. D. Brunisholz, J. L. Mega, E. P. A. van Iperen, M. Li, M. Leusink, S. Trompet, J. J. W. Verschuren, G. K. Hovingh, A. Dehghan, C. P. Nelson, S. Kotti, N. Danchin, M. Scholz, C. L. Haase, D. Rothenbacher, D. I. Swerdlow, K. B. Kuchenbaecker, E. Staines-Urias, A. Goel, F. Van 't Hooft, K. Gertow, U. de Faire, A. G. Panayiotou, E. Tremoli, D. Baldassarre, F. Veglia, L. M. Holdt, F. Beutner, R. T. Gansevoort, G. J. Navis, I. Mateo Leach, L. P. Breitling, H. Brenner, J. Thiery, D. Dallmeier, A. Franco-Cereceda, J. M. A. Boer, J. W. Stephens, M. H. Hofker, A. Tedgui, A. Hofman, A. G. Uitterlinden, V. Adamkova, J. Pitha, N. C. Onland-Moret, M. J. Cramer, H. M. Nathoe, W. Spiering, O. H. Klungel, M. Kumari, P. H. Whincup, D. A. Morrow, P. S. Braund, A. S. Hall, A. G. Olsson, P. A. Doevendans, M. D. Trip, M. D. Tobin, A. Hamsten, H. Watkins, W. Koenig, A. N. Nicolaides, D. Teupser, I. N. M. Day, J. F. Carlquist, T. R. Gaunt, I. Ford, N. Sattar, S. Tsimikas, G. G. Schwartz, D. A. Lawlor, R. W. Morris, M. S. Sandhu, R. Poledne, A. H. Maitland-van der Zee, K.-T. Khaw, B. J. Keating, P. van der Harst, J. F. Price, S. R. Mehta, S. Yusuf, J. C. M. Witteman, O. H. Franco, J. W. Jukema, P. de Knijff, A. Tybjaerg-Hansen, D. J. Rader, M. Farrall, N. J. Samani, M. Kivimaki, K. A. A. Fox, S. E. Humphries, J. L. Anderson, S. M. Boekholdt, T. M. Palmer, P. Eriksson, G. Paré, A. D. Hingorani, M. S. Sabatine, Z. Mallat, J. P. Casas, P. J. Talmud, Secretory phospholipase A2-IIA and cardiovascular disease: A mendelian randomization study. J. Am. Coll. Cardiol. 62, 1966-1976 (2013).
18. D. I. Swerdlow, D. Preiss, K. B. Kuchenbaecker, M. V. Holmes, J. E. L. Engmann, T. Shah, R. Sofat, S. Stender, P. C. D. Johnson, R. A. Scott, M. Leusink, N. Verweij, S. J. Sharp, Y. Guo, C. Giambartolomei, C. Chung, A. Peasey, A. Amuzu, K. Li, J. Palmen, P. Howard, J. A. Cooper, F. Drenos, Y. R. Li, G. Lowe, J. Gallacher, M. C. W. Stewart, I. Tzoulaki, S. G. Buxbaum, D. L. van der A, N. G. Forouhi, N. C. Onland-Moret, Y. T. van der Schouw, R. B. Schnabel, J. A. Hubacek, R. Kubinova, M. Baceviciene, A. Tamosiunas, A. Pajak, R. Topor-Madry, U. Stepaniak, S. Malyutina, D. Baldassarre, B. Sennblad, E. Tremoli, U. de Faire, F. Veglia, I. Ford, J. W. Jukema, R. G. J. Westendorp, G. J. de Borst, P. A. de Jong, A. Algra, W. Spiering, A. H. M. der Zee, O. H. Klungel, A. de Boer, P. A. Doevendans, C. B. Eaton, J. G. Robinson, D. Duggan, J. Kjekshus, J. R. Downs, A. M. Gotto, A. C. Keech, R. Marchioli, G. Tognoni, P. S. Sever, N. R. Poulter, D. D. Waters, T. R. Pedersen, P. Amarenco, H. Nakamura, J. J. V. McMurray, J. D. Lewsey, D. I. Chasman, P. M. Ridker, A. P. Maggioni, L. Tavazzi, K. K. Ray, S. R. K. Seshasai, J. E. Manson, J. F. Price, P. H. Whincup, R. W. Morris, D. A. Lawlor, G. D. Smith, Y. Ben-Shlomo, P. J. Schreiner, M. Fornage, D. S. Siscovick, M. Cushman, M. Kumari, N. J. Wareham, W. M. M. Verschuren, S. Redline, S. R. Patel, J. C. Whittaker, A. Hamsten, J. A. Delaney, C. Dale, T. R. Gaunt, A. Wong, D. Kuh, R. Hardy, S. Kathiresan, B. A. Castillo, P. van der Harst, E. J. Brunner, A. Tybjaerg-Hansen, M. G. Marmot, R. M. Krauss, M. Tsai, J. Coresh, R. C. Hoogeveen, B. M. Psaty, L. A. Lange, H. Hakonarson, F. Dudbridge, S. E. Humphries, P. J. Talmud, M. Kivimäki, N. J. Timpson, C. Langenberg, F. W. Asselbergs, M. Voevoda, M. Bobak, H. Pikhart, J. G. Wilson, A. P. Reiner, B. J. Keating, A. D. Hingorani, N. Sattar, HMG-coenzyme A reductase inhibition, type 2 diabetes, and bodyweight: Evidence from genetic analysis and randomised trials. Lancet 385, 351-361 (2014).
19. R. A. Scott, D. F. Freitag, L. Li, A. Y. Chu, P. Surendran, R. Young, N. Grarup, A. Stancáková, Y. Chen, T. V. Varga, H. Yaghootkar, J. Luan, J. H. Zhao, S. M. Willems, J. Wessel, S. Wang, N. Maruthur, K. Michailidou, A. Pirie, S. J. van der Lee, C. Gillson, A. Amin Al Olama, P. Amouyel, L. Arriola, D. Arveiler, I. Aviles-Olmos, B. Balkau, A. Barricarte, I. Barroso, S. Benlloch Garcia, J. C. Bis, S. Blankenberg, M. Boehnke, H. Boeing, E. Boerwinkle, I. B. Borecki, J. Bork-Jensen, S. Bowden, C. Caldas, M. Caslake; The CVD consortium, L. Adrienne Cupples, C. Cruchaga, J. Czajkowski, M. den Hoed, J. A. Dunn, H. M. Earl, G. B. Ehret, E. Ferrannini, J. Ferrieres, T. Foltynie, I. Ford, N. G. Forouhi, F. Gianfagna, C. Gonzalez, S. Grioni, L. Hiller, J.-H. Jansson, M. E. Jørgensen, J. Wouter Jukema, R. Kaaks, F. Kee, N. D. Kerrison, T. J. Key, J. Kontto, Z. Kote-Jarai, A. T. Kraja, K. Kuulasmaa, J. Kuusisto, A. Linneberg, C. Liu, G. Marenne, K. L. Mohlke, A. P. Morris, K. Muir, M. Müller-Nurasyid, P. B. Munroe, C. Navarro, S. F. Nielsen, P. M. Nilsson, B. G. Nordestgaard, C. J. Packard, D. Palli, S. Panico, G. M. Peloso, M. Perola, A. Peters, C. J. Poole, J. Ramón Quirós, O. Rolandsson, C. Sacerdote, V. Salomaa, M.-J. Sánchez, N. Sattar, S. J. Sharp, R. Sims, N. Slimani, J. A. Smith, D. J. Thompson, S. Trompet, R. Tumino, D. L. van der A, Y. T. van der Schouw, J. Virtamo, M. Walker, K. Walter; GERAD-EC Consortium; Neurology working group Cohorts for Heart; Aging Research in Genomic Epidemiology (CHARGE); Alzheimer's Disease Genetics Consortium; Pancreatic Cancer Cohort Consortium; EPIC-CVD; EPIC-InterAct, J. E. Abraham, L. T. Amundadottir, J. L. Aponte, A. S. Butterworth, J. Dupuis, D. F. Easton, R. A. Eeles, J. Erdmann, P. W. Franks, T. M. Frayling, T. Hansen, J. M. M. Howson, T. Jørgensen, J. Kooner, M. Laakso, C. Langenberg, M. I. McCarthy, J. S. Pankow, O. Pedersen, E. Riboli, J. I. Rotter, D. Saleheen, N. J. Samani, H. Schunkert, P. Vollenweider, S. O'Rahilly; CHARGE consortium; The CHD Exome+ consortium; CARDIOGRAM Exome consortium, P. Deloukas, J. Danesh, M. O. Goodarzi, S. Kathiresan, J. B. Meigs, M. G. Ehm, N. J. Wareham, D. M. Waterworth, A genomic approach to therapeutic target validation identifies a glucose-lowering GLP1R variant protective for coronary heart disease. Sci. Transl. Med. 8, 341 ra76 (2016).
20. P. Würtz, Q. Wang, P. Soininen, A. J. Kangas, G. Fatemifar, T. Tynkkynen, M. Tiainen, M. Perola, T. Tillin, A. D. Hughes, P. Mäntyselkä, M. Kähönen, T. Lehtimäki, N. Sattar, A. D. Hingorani, J.-P. Casas, V. Salomaa, M. Kivimäki, M.-R. Järvelin, G. Davey Smith, M. Vanhala, D. A. Lawlor, O. T. Raitakari, N. Chaturvedi, J. Kettunen, M. Ala-Korpela, Metabolomic profiling of statin use and genetic inhibition of HMG-CoA reductase. J. Am. Coll. Cardiol. 67, 1200-1210 (2016).
21. D. Melzer, J. R. B. Perry, D. Hernandez, A.-M. Corsi, K. Stevens, I. Rafferty, F. Lauretani, A. Murray, J. R. Gibbs, G. Paolisso, S. Rafiq, J. Simon-Sanchez, H. Lango, S. Scholz, M. N. Weedon, S. Arepalli, N. Rice, N. Washecka, A. Hurst, A. Britton, W. Henley, J. van de Leemput, R. Li, A. B. Newman, G. Tranah, T. Harris, V. Panicker, C. Dayan, A. Bennett, M. I. McCarthy, A. Ruokonen, M.-R. Jarvelin, J. Guralnik, S. Bandinelli, T. M. Frayling, A. Singleton, L. Ferrucci, A genome-wide association study identifies protein quantitative trait loci (pQTLs). PLOS Genet. 4, e1000072 (2008).
22. Diabetes Genetics Initiative of Broad Institute of Harvard and MIT; Lund University; Novartis Institutes of BioMedical Research, R. Saxena, B. F. Voight, V. Lyssenko, N. P. Burtt, P. I. W. de Bakker, H. Chen, J. J. Roix, S. Kathiresan, J. N. Hirschhorn, M. J. Daly, T. E. Hughes, L. Groop, D. Altshuler, P. Almgren, J. C. Florez, J. Meyer, K. Ardlie, K. B. Boström, B. Isomaa, G. Lettre, U. Lindblad, H. N. Lyon, O. Melander, C. Newton-Cheh, P. Nilsson, M. Orho-Melander, L. Råstam, E. K. Speliotes, M.-R. Taskinen, T. Tuomi, C. Guiducci, A. Berglund, J. Carlson, L. Gianniny, R. Hackett, L. Hall, J. Holmkvist, E. Laurila, M. Sjögren, M. Sterner, A. Surti, M. Svensson, M. Svensson, R. Tewhey, B. Blumenstiel, M. Parkin, M. DeFelice, R. Barry, W. Brodeur, J. Camarata, N. Chia, M. Fava, J. Gibbons, B. Handsaker, C. Healy, K. Nguyen, C. Gates, C. Sougnez, D. Gage, M. Nizzari, S. B. Gabriel, G.-W. Chirn, Q. Ma, H. Parikh, D. Richardson, D. Ricke, S. Purcell, Genome-wide association analysis identifies loci for type 2 diabetes and triglyceride levels. Science 316, 1331-1336 (2007).
23. L. J. Scott, K. L. Mohlke, L. L. Bonnycastle, C. J. Willer, Y. Li, W. L. Duren, M. R. Erdos, H. M. Stringham, P. S. Chines, A. U. Jackson, L. Prokunina-Olsson, C.-J. Ding, A. J. Swift, N. Narisu, T. Hu, R. Pruim, R. Xiao, X.-Y. Li, K. N. Conneely, N. L. Riebow, A. G. Sprau, M. Tong, P. P. White, K. N. Hetrick, M. W. Barnhart, C. W. Bark, J. L. Goldstein, L. Watkins, F. Xiang, J. Saramies, T. A. Buchanan, R. M. Watanabe, T. T. Valle, L. Kinnunen, G. R. Abecasis, E. W. Pugh, K. F. Doheny, R. N. Bergman, J. Tuomilehto, F. S. Collins, M. Boehnke, A genome-wide association study of type 2 diabetes in Finns detects multiple susceptibility variants. Science 316, 1341-1345 (2007).
24. D. Cook, D. Brown, R. Alexander, R. March, P. Morgan, G. Satterthwaite, M. N. Pangalos, Lessons learned from the fate of AstraZeneca's drug pipeline: A five-dimensional framework. Nat. Rev. Drug Discov. 13, 419-431 (2014).
25. M. R. Nelson, H. Tipney, J. L. Painter, J. Shen, P. Nicoletti, Y. Shen, A. Floratos, P. C. Sham, M. J. Li, J. Wang, L. R. Cardon, J. C. Whittaker, P. Sanseau, The support of human genetic evidence for approved drug indications. Nat. Genet. 47, 856-860 (2015).
26. R. M. Plenge, E. M. Scolnick, D. Altshuler, Validating therapeutic targets through human genetics. Nat. Rev. Drug Discov. 12, 581-594 (2013).
27. P. Sanseau, P. Agarwal, M. R. Barnes, T. Pastinen, J. B. Richards, L. R. Cardon, V. Mooser, Use of genome-wide association studies for drug repositioning. Nat. Biotechnol. 30, 317-320 (2012).
28. A. L. Hopkins, C. R. Groom, The druggable genome. Nat. Rev. Drug Discov. 1, 727-730 (2002).
29. A. P. Russ, S. Lampel, The druggable genome: An update. Drug Discov. Today 10, 1607-1610 (2005).
30. R. D. Kumar, L.-W. Chang, M. J. Ellis, R. Bose, Prioritizing potentially druggable mutations with dGene: An annotation tool for cancer genome sequencing data. PLOS ONE 8, e67980 (2013).
31. A. H. Wagner, A. C. Coffman, B. J. Ainscough, N. C. Spies, Z. L. Skidmore, K. M. Campbell, K. Krysiak, D. Pan, J. F. McMichael, J. M. Eldred, J. R. Walker, R. K. Wilson, E. R. Mardis, M. Griffith, O. L. Griffith, DGIdb 2.0: Mining clinically relevant drug-gene interactions. Nucleic Acids Res. 44, D1036-D1044 (2016).
32. M. Rask-Andersen, S. Masuram, H. B. Schiöth, The druggable genome: Evaluation of drug targets in clinical trials suggests major shifts in molecular class and indication. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 54, 9-26 (2014).
33. M. Whirl-Carrillo, E. M. McDonagh, J. M. Hebert, L. Gong, K. Sangkuhl, C. F. Thorn, R. B. Altman, T. E. Klein, Pharmacogenomics knowledge for personalized medicine. Clin. Pharmacol. Ther. 92, 414-417 (2012).
34. F. Zhu, Z. Shi, C. Qin, L. Tao, X. Liu, F. Xu, L. Zhang, Y. Song, X. Liu, J. Zhang, B. Han, P. Zhang, Y. Chen, Therapeutic target database update 2012: A resource for facilitating target-oriented drug discovery. Nucleic Acids Res. 40, D1128-D1136 (2012).
35. V. Law, C. Knox, Y. Djoumbou, T. Jewison, A. C. Guo, Y. Liu, A. Maciejewski, D. Arndt, M. Wilson, V. Neveu, A. Tang, G. Gabriel, C. Ly, S. Adamjee, Z. T. Dame, B. Han, Y. Zhou, D. S. Wishart, DrugBank 4.0: Shedding new light on drug metabolism. Nucleic Acids Res. 42, D1091-D1097 (2014).
36. A. Mullard, 2015 FDA drug approvals. Nat. Rev. Drug Discov. 15, 73-76 (2016).
37. L. A. Hindorff, P. Sethupathy, H. A. Junkins, E. M. Ramos, J. P. Mehta, F. S. Collins, T. A. Manolio, Potential etiologic and functional implications of genome-wide association loci for human diseases and traits. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106, 9362-9367 (2009).
38. A. P. Bento, A. Gaulton, A. Hersey, L. J. Bellis, J. Chambers, M. Davies, F. A. Krüger, Y. Light, L. Mak, S. McGlinchey, M. Nowotka, G. Papadatos, R. Santos, J. P. Overington, The ChEMBL bioactivity database: An update. Nucleic Acids Res. 42, D1083-D1090 (2014).
39. First Databank Europe Ltd., Drug Data | FDB (First Databank); www.fdbhealth.co.uk/.
40. A. J. Barr, Protein tyrosine phosphatases as drug targets: Strategies and challenges of inhibitor development. Future Med. Chem. 2, 1563-1576 (2010).
41. S. Knapp, Emerging target families: Intractable targets. Handb. Exp. Pharmacol. 232, 43-58 (2015).
42. K. Eilbeck, S. E. Lewis, C. J. Mungall, M. Yandell, L. Stein, R. Durbin, M. Ashburner, The sequence ontology: A tool for the unification of genome annotations. Genome Biol. 6, R44 (2005).
43. The Interleukin-6 Mendelian Randomisation Analysis Consortium, D. I. Swerdlow, M. V. Holmes, K. B. Kuchenbaecker, J. E. Engmann, T. Shah, R. Sofat, Y. Guo, C. Chung, A. Peasey, R. Pfister, S. P. Mooijaart, H. A. Ireland, M. Leusink, C. Langenberg, K. W. Li, J. Palmen, P. Howard, J. A. Cooper, F. Drenos, J. Hardy, M. A. Nalls, Y. R. Li, G. Lowe, M. Stewart, S. J. Bielinski, J. Peto, N. J. Timpson, J. Gallacher, M. Dunlop, R. Houlston, I. Tomlinson, I. Tzoulaki, J. Luan, J. M. Boer, N. G. Forouhi, N. C. Onland-Moret, Y. T. van der Schouw, R. B. Schnabel, J. A. Hubacek, R. Kubinova, M. Baceviciene, A. Tamosiunas, A. Pajak, R. Topor-Madry, S. Malyutina, D. Baldassarre, B. Sennblad, E. Tremoli, U. de Faire, L. Ferrucci, S. Bandenelli, T. Tanaka, J. F. Meschia, A. Singleton, G. Navis, I. Mateo Leach, S. J. Bakker, R. T. Gansevoort, I. Ford, S. E. Epstein, M. S. Burnett, J. M. Devaney, J. W. Jukema, R. G. Westendorp, G. Jan de Borst, Y. van der Graaf, P. A. de Jong, A. H. Mailand-van der Zee, O. H. Klungel, A. de Boer, P. A. Doevendans, J. W. Stephens, C. B. Eaton, J. G. Robinson, J. E. Manson, F. G. Fowkes, T. M. Frayling, J. F. Price, P. H. Whincup, R. W. Morris, D. A. Lawlor, G. D. Smith, Y. Ben-Shlomo, S. Redline, L. A. Lange, M. Kumari, N. J. Wareham, W. M. Verschuren, E. J. Benjamin, J. C. Whittaker, A. Hamsten, F. Dudbridge, J. A. Delaney, A. Wong, D. Kuh, R. Hardy, B. A. Castillo, J. J. Connolly, P. Van der Harst, E. J. Brunner, M. G. Marmot, C. L. Wassel, S. E. Humphries, P. J. Talmud, M. Kivimaki, F. W. Asselbergs, M. Voevoda, M. Bobak, H. Pikhart, J. G. Wilson, H. Hakonarson, A. P. Reiner, B. J. Keating, N. Sattar, A. D. Hingorani, J. P. Casas, The interleukin-6 receptor as a target for prevention of coronary heart disease: A mendelian randomisation analysis. Lancet 379, 1214-1224 (2012).
44. M. Eijgelsheim, C. Newton-Cheh, N. Sotoodehnia, P. I. W. de Bakker, M. Müller, A. C. Morrison, A. V. Smith, A. Isaacs, S. Sanna, M. Dörr, P. Navarro, C. Fuchsberger, I. M. Nolte, E. J. C. de Geus, K. Estrada, S.-J. Hwang, J. C. Bis, I.-M. Rückert, A. Alonso, L. J. Launer, J. J. Hottenga, F. Rivadeneira, P. A. Noseworthy, K. M. Rice, S. Perz, D. E. Arking, T. D. Spector, J. A. Kors, Y. S. Aulchenko, K. V. Tarasov, G. Homuth, S. H. Wild, F. Marroni, C. Gieger, C. M. Licht, R. J. Prineas, A. Hofman, J. I. Rotter, A. A. Hicks, F. Ernst, S. S. Najjar, A. F. Wright, A. Peters, E. R. Fox, B. A. Oostra, H. K. Kroemer, D. Couper, H. Völzke, H. Campbell, T. Meitinger, M. Uda, J. C. M. Witteman, B. M. Psaty, H.-E. Wichmann, T. B. Harris, S. Kääb, D. S. Siscovick, Y. Jamshidi, A. G. Uitterlinden, A. R. Folsom, M. G. Larson, J. F. Wilson, B. W. Penninx, H. Snieder, P. P. Pramstaller, C. M. Van Duijn, E. G. Lakatta, S. B. Felix, V. Gudnason, A. Pfeufer, S. R. Heckbert, B. H. C. Stricker, E. Boerwinkle, C. J. O'Donnell, Genome-wide association analysis identifies multiple loci related to resting heart rate. Hum. Mol. Genet. 19, 3885-3894 (2010).
45. The 1000 Genomes Project Consortium, A. Auton, L. D. Brooks, R. M. Durbin, E. P. Garrison, H. M. Kang, J. O. Korbel, J. L. Marchini, S. McCarthy, G. A. McVean, G. R. Abecasis, A global reference for human genetic variation. Nature 526, 68-74 (2015).
46. S. Sivakumaran, F. Agakov, E. Theodoratou, J. G. Prendergast, L. Zgaga, T. Manolio, I. Rudan, P. McKeigue, J. F. Wilson, H. Campbell, Abundant pleiotropy in human complex diseases and traits. Am. J. Hum. Genet. 89, 607-618 (2011).
47. R. Santos, O. Ursu, A. Gaulton, A. P. Bento, R. S. Donadi, C. G. Bologa, A. Karlsson, B. Al-Lazikani, A. Hersey, T. I. Oprea, J. P. Overington, A comprehensive map of molecular drug targets. Nat. Rev. Drug Discov. 16, 19-34 (2017).
48. B. J. Keating, S. Tischfield, S. S. Murray, T. Bhangale, T. S. Price, J. T. Glessner, L. Galver, J. C. Barrett, S. F. A. Grant, D. N. Farlow, H. R. Chandrupatla, M. Hansen, S. Ajmal, G. J. Papanicolaou, Y. Guo, M. Li, S. DerOhannessian, P. I. W. de Bakker, S. D. Bailey, A. Montpetit, A. C. Edmondson, K. Taylor, X. Gai, S. S. Wang, M. Fornage, T. Shaikh, L. Groop, M. Boehnke, A. S. Hall, A. T. Hattersley, E. Frackelton, N. Patterson, C. W. K. Chiang, C. E. Kim, R. R. Fabsitz, W. Ouwehand, A. L. Price, P. Munroe, M. Caulfield, T. Drake, E. Boerwinkle, D. Reich, A. S. Whitehead, T. P. Cappola, N. J. Samani, A. J. Lusis, E. Schadt, J. G. Wilson, W. Koenig, M. I. McCarthy, S. Kathiresan, S. B. Gabriel, H. Hakonarson, S. S. Anand, M. Reilly, J. C. Engert, D. A. Nickerson, D. J. Rader, J. N. Hirschhorn, G. A. FitzGerald, Concept, design and implementation of a cardiovascular gene-centric 50 k SNP array for large-scale genomic association studies. PLOS ONE 3, e3583 (2008).
49. B. F. Voight, H. M. Kang, J. Ding, C. D. Palmer, C. Sidore, P. S. Chines, N. P. Burtt, C. Fuchsberger, Y. Li, J. Erdmann, T. M. Frayling, I. M. Heid, A. U. Jackson, T. Johnson, T. O. Kilpeläinen, C. M. Lindgren, A. P. Morris, I. Prokopenko, J. C. Randall, R. Saxena, N. Soranzo, E. K. Speliotes, T. M. Teslovich, E. Wheeler, J. Maguire, M. Parkin, S. Potter, N. W. Rayner, N. Robertson, K. Stirrups, W. Winckler, S. Sanna, A. Mulas, R. Nagaraja, F. Cucca, I. Barroso, P. Deloukas, R. J. F. Loos, S. Kathiresan, P. B. Munroe, C. Newton-Cheh, A. Pfeufer, N. J. Samani, H. Schunkert, J. N. Hirschhorn, D. Altshuler, M. I. McCarthy, G. R. Abecasis, M. Boehnke, The metabochip, a custom genotyping array for genetic studies of metabolic, cardiovascular, and anthropometric traits. PLOS Genet. 8, e1002793 (2012).
50. A. Cortes, M. A. Brown, Promise and pitfalls of the Immunochip. Arthritis Res. Ther. 13, 101 (2011).
51. F. B. Rogers, Communications to the Editor. Bull. Med. Libr. Assoc. 51, 114-116 (1963).
52. L. M. Schriml, C. Arze, S. Nadendla, Y.-W. W. Chang, M. Mazaitis, V. Felix, G. Feng, W. A. Kibbe, Disease Ontology: A backbone for disease semantic integration. Nucleic Acids Res. 40, D940-D946 (2012).
53. P. Robinson, S. Mundlos, The human phenotype ontology. Clin. Genet. 77, 525-534 (2010).
54. I. Dunham, A. Kundaje, S. F. Aldred, P. J. Collins, C. A. Davis, F. Doyle, C. B. Epstein, S. Frietze, J. Harrow, R. Kaul, J. Khatun, B. R. Lajoie, S. G. Landt, B.-K. Lee, F. Pauli, K. R. Rosenbloom, P. Sabo, A. Safi, A. Sanyal, N. Shoresh, J. M. Simon, L. Song, N. D. Trinklein, R. C. Altshuler, E. Birney, J. B. Brown, C. Cheng, S. Djebali, X. Dong, J. Ernst, T. S. Furey, M. Gerstein, B. Giardine, M. Greven, R. C. Hardison, R. S. Harris, J. Herrero, M. M. Hoffman, S. Iyer, M. Kelllis, P. Kheradpour, T. Lassman, Q. Li, X. Lin, G. K. Marinov, A. Merkel, A. Mortazavi, S. C. J. Parker, T. E. Reddy, J. Rozowsky, F. Schlesinger, R. E. Thurman, J. Wang, L. D. Ward, T. W. Whitfield, S. P. Wilder, W. Wu, H. S. Xi, K. Y. Yip, J. Zhuang, B. E. Bernstein, E. D. Green, C. Gunter, M. Snyder, M. J. Pazin, R. F. Lowdon, L. A. L. Dillon, L. B. Adams, C. J. Kelly, J. Zhang, J. R. Wexler, P. J. Good, E. A. Feingold, G. E. Crawford, J. Dekker, L. Elinitski, P. J. Farnham, M. C. Giddings, T. R. Gingeras, R. Guigó, T. J. Hubbard, M. Kellis, W. J. Kent, J. D. Lieb, E. H. Margulies, R. M. Myers, J. A. Starnatoyannopoulos, S. A. Tennebaum, Z. Weng, K. P. White, B. Wold, Y. Yu, J. Wrobel, B. A. Risk, H. P. Gunawardena, H. C. Kuiper, C. W. Maier, L. Xie, X. Chen, T. S. Mikkelsen, S. Gillespie, A. Goren, O. Ram, X. Zhang, L. Wang, R. Issner, M. J. Coyne, T. Durham, M. Ku, T. Truong, M. L. Eaton, A. Dobin, T. Lassmann, A. Tanzer, J. Lagarde, W. Lin, C. Xue, B. A. Williams, C. Zaleski, M. Röder, F. Kokocinski, R. F. Abdelhamid, T. Alioto, I. Antoshechkin, M. T. Baer, P. Batut, I. Bell, K. Bell, S. Chakrabortty, J. Chrast, J. Curado, T. Derrien, J. Drenkow, E. Dumais, J. Dumais, R. Duttagupta, M. Fastuca, K. Fejes-Toth, P. Ferreira, S. Foissac, M. J. Fullwood, H. Gao, D. Gonzalez, A. Gordon, C. Howald, S. Jha, R. Johnson, P. Kapranov, B. King, C. Kingswood, G. Li, O. J. Luo, E. Park, J. B. Preall, K. Presaud, P. Ribeca, D. Robyr, X. Ruan, M. Sammeth, K. S. Sandu, L. Schaeffer, L.-H. See, A. Shahab, J. Skancke, A. M. Suzuki, H. Takahashi, H. Tilgner, D. Trout, N. Walters, H. Wang, Y. Hayashizaki, T. J. Hubbard, A. Reymond, S. E. Antonarakis, G. J. Hannon, Y. Ruan, P. Carninci, C. A. Sloan, K. Learned, V. S. Malladi, M. C. Wong, G. P. Barber, M. S. Cline, T. R. Dreszer, S. G. Heitner, D. Karolchik, V. M. Kirkup, L. R. Meyer, J. C. Long, M. Maddren, B. J. Raney, L. L. Grasfeder, P. G. Giresi, B.-K. Lee, A. Battenhouse, N. C. Sheffield, K. A. Showers, D. London, A. A. Bhinge, C. Shestak, M. R. Schaner, S. K. Kim, Z. Z. Zhang, P. A. Mieczkowski, J. O. Mieczkowska, Z. Liu, R. M. McDaniell, Y. Ni, N. U. Rashid, M. J. Kim, S. Adar, Z. Zhang, T. Wang, D. Winter, D. Keefe, V. R. Iyer, K. S. Sandhu, M. Zheng, P. Wang, J. Gertz, J. Vielmetter, E. C. Partridge, K. E. Varley, C. Gasper, A. Bansal, S. Pepke, P. Jain, H. Amrhein, K. M. Bowling, M. Anaya, M. K. Cross, M. A. Muratet, K. M. Newberry, K. McCue, A. S. Nesmith, K. I. Fisher-Aylor, B. Pusey, G. DeSalvo, S. L. Parker, S. Balasubramanian, N. S. Davis, S. K. Meadows, T. Eggleston, J. S. Newberry, S. E. Levy, D. M. Absher, W. H. Wong, M. J. Blow, A. Visel, L. A. Pennachio, L. Elnitski, H. M. Petrykowska, A. Abyzov, B. Aken, D. Barrell, G. Barson, A. Berry, A. Bignell, V. Boychenko, G. Bussotti, C. Davidson, G. Despacio-Reyes, M. Diekhans, I. Ezkurdia, A. Frankish, J. Gilbert, J. M. Gonzalez, E. Griffiths, R. Harte, D. A. Hendrix, T. Hunt, I. Jungreis, M. Kay, E. Khurana, J. Leng, M. F. Lin, J. Loveland, Z. Lu, D. Manthravadi, M. Mariotti, J. Mudge, G. Mukherjee, C. Notredame, B. Pei, J. M. Rodriguez, G. Saunders, A. Sboner, S. Searle, C. Sisu, C. Snow, C. Steward, E. Tapanan, M. L. Tress, M. J. van Baren, S. Washieti, L. Wilming, A. Zadissa, Z. Zhengdong, M. Brent, D. Haussler, A. Valencia, A. Raymond, N. Addleman, R. P. Alexander, R. K. Auerbach, S. Balasubramanian, K. Bettinger, N. Bhardwaj, A. P. Boyle, A. R. Cao, P. Cayting, A. Charos, Y. Cheng, C. Eastman, G. Euskirchen, J. D. Fleming, F. Grubert, L. Habegger, M. Hariharan, A. Harmanci, S. Iyenger, V. X. Jin, K. J. Karczewski, M. Kasowski, P. Lacroute, H. Lam, N. Larnarre-Vincent, J. Lian, M. Lindahl-Allen, R. Min, B. Miotto, H. Monahan, Z. Moqtaderi, X. J. Mu, H. O'Geen, Z. Ouyang, D. Patacsil, D. Raha, L. Ramirez, B. Reed, M. Shi, T. Slifer, H. Witt, L. Wu, X. Xu, K.-K. Yan, X. Yang, Z. Zhang, K. Struhl, S. M. Weissman, S. A. Tenebaum, L. O. Penalva, S. Karmakar, R. R. Bhanvadia, A. Choudhury, M. Domanus, L. Ma, J. Moran, A. Victorsen, T. Auer, L. Centarin, M. Eichenlaub, F. Gruhl, S. Heerman, B. Hoeckendorf, D. Inoue, T. Kellner, S. Kirchmaier, C. Mueller, R. Reinhardt, L. Schertel, S. Schneider, R. Sinn, B. Wittbrodt, J. Wittbrodt, G. Jain, G. Balasundaram, D. L. Bates, R. Byron, T. K. Canfield, M. J. Diegel, D. Dunn, A. K. Ebersol, T. Frum, K. Garg, E. Gist, R. S. Hansen, L. Boatman, E. Haugen, R. Humbert, A. K. Johnson, E. M. Johnson, T. M. Kutyavin, K. Lee, D. Lotakis, M. T. Maurano, S. J. Neph, F. V. Neri, E. D. Nguyen, H. Qu, A. P. Reynolds, V. Roach, E. Rynes, M. E. Sanchez, R. S. Sandstrom, A. O. Shafer, A. B. Stergachis, S. Thomas, B. Vernot, J. Vierstra, S. Vong, H. Wang, M. A. Weaver, Y. Yan, M. Zhang, J. A. Akey, M. Bender, M. O. Dorschner, M. Groudine, M. J. MacCoss, P. Navas, G. Stamatoyannopoulos, J. A. Stamatoyannopoulos, K. Beal, A. Brazma, P. Flicek, N. Johnson, M. Lukk, N. M. Luscombe, D. Sobral, J. M. Vaquerizas, S. Batzoglou, A. Sidow, N. Hussami, S. Kyriazopoulou-Panagiotopoulou, M.W. Libbrecht, M. A. Schaub, W. Miller, P. J. Bickel, B. Banfai, N. P. Boley, H. Huang, J. J. Li, W. S. Noble, J. A. Bilmes, O. J. Buske, A. O. Sahu, P. V. Kharchenko, P. J. Park, D. Baker, J. Taylor, L. Lochovsky, An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome. Nature 489, 57-74 (2012).
55. B. E. Bernstein, J. A. Stamatoyannopoulos, J. F. Costello, B. Ren, A. Milosavljevic, A. Meissner, M. Kellis, M. A. Marra, A. L. Beaudet, J. R. Ecker, P. J. Farnham, M. Hirst, E. S. Lander, T. S. Mikkelsen, J. A. Thomson, The NIH Roadmap Epigenomics Mapping Consortium. Nat. Biotechnol. 28, 1045-1048 (2010).
56. N. S. Al-Numair, A. C. Martin, The SAAP pipeline and database: Tools to analyze the impact and predict the pathogenicity of mutations. BMC Genomics 14 (suppl. 3), S4 (2013).
57. A. Lourdusamy, S. Newhouse, K. Lunnon, P. Proitsi, J. Powell, A. Hodges, S. K. Nelson, A. Stewart, S. Williams, I. Kloszewska, P. Mecocci, H. Soininen, M. Tsolaki, B. Vellas, S. Lovestone, R. Dobson; AddNeuroMed Consortium, R. Dobson; Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative, Identification of cis-regulatory variation influencing protein abundance levels in human plasma. Hum. Mol. Genet. 21, 3719-3726 (2012).
58. K. Suhre, S.-Y. Shin, A.-K. Petersen, R. P. Mohney, D. Meredith, B. Wägele, E. Altmaier, P. Deloukas, J. Erdmann, E. Grundberg, C. J. Hammond, M. H. de Angelis, G. Kastenmüller, A. Köttgen, F. Kronenberg, M. Mangino, C. Meisinger, T. Meitinger, H.-W. Mewes, M. V. Milburn, C. Prehn, J. Raffler, J. S. Ried, W. Römisch-Margl, N. J. Samani, K. S. Small, H.-E. Wichmann, G. Zhai, T. Illig, T. D. Spector, J. Adamski, N. Soranzo, C. Gieger, Human metabolic individuality in biomedical and pharmaceutical research. Nature 477, 54-60 (2011).
59. C. Giambartolomei, D. Vukcevic, E. E. Schadt, L. Franke, A. D. Hingorani, C. Wallace, V. Plagnol, S. M. Williams, Bayesian test for colocalisation between pairs of genetic association studies using summary statistics. PLOS Genet. 10, e1004383 (2014).
60. F. S. Collins, Reengineering translational science: The time is right. Sci. Transl. Med. 3, 90 cm17 (2011).
61. A. Gaulton, L. J. Bellis, A. P. Bento, J. Chambers, M. Davies, A. Hersey, Y. Light, S. McGlinchey, D. Michalovich, B. Al-Lazikani, J. P. Overington, ChEMBL: A large-scale bioactivity database for drug discovery. Nucleic Acids Res. 40, D1100-D1107 (2012).
62. National Institute of Health, ClinicalTrials.gov; https://clinicaltrials.gov/.
63. Montreal Heart Institute Pharmacogenomics Center; http://pharmaadme.org/joomla/ index.php?option=com-frontpage&Itemid=1.
64. EMBL-EBI, Kinase SARfari; www.ebi.ac.uk/chembl/sarfari/kinasesarfari/.
65. EMBL-EBI, GPCR SARfari; www.ebi.ac.uk/chembl/sarfari/gpcrsarfari.
66. A. J. Pawson, J. L. Sharman, H. E. Benson, E. Faccenda, S. P. H. Alexander, O. P. Buneman, A. P. Davenport, J. C. McGrath, J. A. Peters, C. Southan, M. Spedding, W. Yu, A. J. Harmar; NC-IUPHAR, The IUPHAR/BPS guide to pharmacology: An expert-driven knowledgebase of drug targets and their ligands. Nucleic Acids Res. 42, D1098-D1106 (2014).
67. Uniprot Consortium, UniProt: A hub for protein information. Nucleic Acids Res. 43, D204-D212 (2015).
68. M. Ashburner, C. A. Ball, J. A. Blake, D. Botstein, H. Butler, J. M. Cherry, A. P. Davis, K. Dolinski, S. S. Dwight, J. T. Eppig, M. A. Harris, D. P. Hill, L. Issel-Tarver, A. Kasarskis, S. Lewis, J. C. Matese, J. E. Richardson, M. Ringwald, G. M. Rubin, G. Sherlock, Gene ontology: Tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium. Nat. Genet. 25, 25-29 (2000).
69. R. D. Finn, A. Bateman, J. Clements, P. Coggill, R. Y. Eberhardt, S. R. Eddy, A. Heger, K. Hetherington, L. Holm, J. Mistry, E. L. L. Sonnhammer, J. Tate, M. Punta, Pfam: The protein families database. Nucleic Acids Res. 42, D222-D230 (2014).
70. A. Yates, K. Beal, S. Keenan, W. McLaren, M. Pignatelli, G. R. S. Ritchie, M. Ruffier, K. Taylor, A. Vullo, P. Flicek, The Ensembl REST API: Ensembl data for any language. Bioinformatics 31, 143-145 (2015).
71. P. Danecek, A. Auton, G. Abecasis, C. A. Albers, E. Banks, M. A. DePristo, R. E. Handsaker, G. Lunter, G. T. Marth, S. T. Sherry, G. McVean, R. Durbin; 1000 Genomes Project Analysis Group, The variant call format and VCFtools. Bioinformatics 27, 2156-2158 (2011).
72. S. Purcell, B. Neale, K. Todd-Brown, L. Thomas, M. A. R. Ferreira, D. Bender, J. Maller, P. Sklar, P. I. W. de Bakker, M. J. Daly, P. C. Sham, PLINK: A tool set for whole-genome association and population-based linkage analyses. Am. J. Hum. Genet. 81, 559-575 (2007).
73. C. C. Chang, C. C. Chow, L. C. A. M. Tellier, S. Vattikuti, S. M. Purcell, J. J. Lee, Second-generation PLINK: Rising to the challenge of larger and richer datasets. GigaScience 4 (2015).
74. O. Bodenreider, The Unified Medical Language System (UMLS): Integrating biomedical terminology. Nucleic Acids Res. 32, D267-D270 (2004).
75. M. Kuhn, I. Letunic, L. J. Jensen, P. Bork, The SIDER database of drugs and side effects. Nucleic Acids Res. 44, D1075-D1079 (2016).