Quantitative affinity determination by fluorescence anisotropy measurements of individual nanoliter droplets

Analytical Chemistry

Volumn 89, Issue 2, 2017, Pages 1092-1101

  Gelen, Fabrice ^a,e   Butz, Maren ^a,f   Rees, Eric J ^b   Erdelyi, Miklos ^b,c   Moschetti, Tommaso ^a   Hyvonen, Marko ^a   Edel, Joshua B ^d   Kaminski, Clemens F ^b   Hollfelder, Florian ^a  

^a UNIVERSITY OF CAMBRIDGE   (United Kingdom)

^b New Museums Site ^*  (United Kingdom)

^c UNIVERSITY OF SZEGED   (Hungary)

^d IMPERIAL COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

^e UNIVERSITY OF EXETER   (United Kingdom)

^f ASTRAZENECA   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANISOTROPY; DISSOCIATION; FLUORESCENCE IMAGING; PROTEINS; PURIFICATION; REAGENTS;

AFFINITY MEASUREMENT; BIOMOLECULAR INTERACTIONS; DISSOCIATION CONSTANT; FLUORESCENCE ANISOTROPY; FLUORESCENCE ANISOTROPY MEASUREMENTS; PROTEIN-PEPTIDE INTERACTIONS; QUANTITATIVE CHARACTERIZATION; QUANTITATIVE TECHNIQUES;

DROPS;

EID: 85016974870     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.analchem.6b02528     Document Type: Article

References (42)

1. Popleteeva, M.; Haas, K. T.; Stoppa, D.; Pancheri, L.; Gasparini, L.; Kaminski, C. F.; Cassidy, L. D.; Venkitaraman, A. R.; Esposito, A. Opt. Express 2015, 23, 23511-25.
2. Chen, W. Y.; Avezov, E.; Schlachter, S. C.; Gielen, F.; Laine, R. F.; Harding, H. P.; Hollfelder, F.; Ron, D.; Kaminski, C. F. Biophys. J. 2015, 108, 999-1002.
3. Erdelyi, M.; Simon, J.; Barnard, E. A.; Kaminski, C. F. PLoS One 2014, 9, e100526.
4. Sota, H.; Hasegawa, Y.; Iwakura, M. Anal. Chem. 1998, 70, 2019-2024.
5. Zhang, T.; Johansson, J. S. Biophys. J. 2003, 85, 3279-85.
6. (a) Kintses, B.; van Vliet, L. D.; Devenish, S. R.; Hollfelder, F. Curr. Opin. Chem. Biol. 2010, 14, 548-55.
7. (b) Schneider, T.; Kreutz, J.; Chiu, D. T. Anal. Chem. 2013, 85, 3476-82.
8. (c) van Vliet, L. D.; Colin, P. Y.; Hollfelder, F. Interface Focus 2015, 5, 20150035.
9. (a) Joensson, H. N.; Zhang, C.; Uhlen, M.; Andersson-Svahn, H. Electrophoresis 2012, 33, 436-439.
10. (b) Choi, J. W.; Kang, D. K.; Park, H.; deMello, A. J.; Chang, S. I. Anal. Chem. 2012, 84, 3849-3854.
11. (a) Huebner, A.; Srisa-Art, M.; Holt, D.; Abell, C.; Hollfelder, F.; deMello, A. J.; Edel, J. B. Chem. Commun. 2007, 1218-20.
12. (b) Kintses, B.; Hein, C.; Mohamed, M. F.; Fischlechner, M.; Courtois, F.; Laine, C.; Hollfelder, F. Chem. Biol. 2012, 19, 1001-9.
13. (c) Colin, P. Y.; Kintses, B.; Gielen, F.; Miton, C. M.; Fischer, G.; Mohamed, M. F.; Hyvonen, M.; Morgavi, D. P.; Janssen, D. B.; Hollfelder, F. Nat. Commun. 2015, 6, 10008.
14. (d) Huebner, A.; Olguin, L. F.; Bratton, D.; Whyte, G.; Huck, W. T.; de Mello, A. J.; Edel, J. B.; Abell, C.; Hollfelder, F. Anal. Chem. 2008, 80, 3890-6.
15. Basova, E. Y.; Foret, F. Analyst 2015, 140, 22-38.
16. Pellegrini, L.; Yu, D. S.; Lo, T.; Anand, S.; Lee, M.; Blundell, T. L.; Venkitaraman, A. R. Nature 2002, 420, 287-293.
17. (a) Jeyasekharan, A. D.; Liu, Y.; Hattori, H.; Pisupati, V.; Jonsdottir, A. B.; Rajendra, E.; Lee, M.; Sundaramoorthy, E.; Schlachter, S.; Kaminski, C. F.; Rosenfeld, Y.; Sato, K.; Savill, J.; Ayoub, N.; Venkitaraman, A. R. Nat. Struct. Mol. Biol. 2013, 20, 1191.
18. (b) Nomme, J.; Renodon-Corniere, A.; Asanomi, Y.; Sakaguchi, K.; Stasiak, A. Z.; Stasiak, A.; Norden, B.; Tran, V.; Takahashi, M. J. Med. Chem. 2010, 53, 5782-5791.
19. Cole, D. J.; Rajendra, E.; Roberts-Thomson, M.; Hardwick, B.; McKenzie, G. J.; Payne, M. C.; Venkitaraman, A. R.; Skylaris, C. K. PLoS Comput. Biol. 2011, 7, e1002096.
20. Scott, D. E.; Ehebauer, M. T.; Pukala, T.; Marsh, M.; Blundell, T. L.; Venkitaraman, A. R.; Abell, C.; Hyvonen, M. ChemBioChem 2013, 14, 332-42.
21. Chan, F. T. S.; Kaminski, C. F.; Schierle, G. S. K. ChemPhysChem 2011, 12, 500-509.
22. Gielen, F.; Buryska, T.; Van Vliet, L.; Butz, M.; Damborsky, J.; Prokop, Z.; Hollfelder, F. Anal. Chem. 2015, 87, 624-632.
23. Zinchenko, A.; Devenish, S. R.; Kintses, B.; Colin, P. Y.; Fischlechner, M.; Hollfelder, F. Anal. Chem. 2014, 86, 2526-2533.
24. Moschetti, T.; Longo, M. A.; Pellegrini, L. 2016, Manuscript in preparation.
25. Roehrl, M. H. A.; Wang, J. Y.; Wagner, G. Biochemistry 2004, 43, 16056-16066.
26. Moschetti, T.; Sharpe, T.; Fischer, G.; Marsh, M. E.; Ng, H.; Morgan, M.; Scott, D.; Blundell, T. L.; Venkitaraman, A.; Skidmore, J.; Abell, C.; Hyvonen, M. J. Mol. Biol. 2016, 428 (23), 4589-4607.
27. Gruner, P.; Riechers, B.; Semin, B.; Lim, J.; Johnston, A.; Short, K.; Baret, J. C. Nat. Commun. 2016, 7, 10392.
28. Bornhop, D. J.; Latham, J. C.; Kussrow, A.; Markov, D. A.; Jones, R. D.; Sorensen, H. S. Science 2007, 317, 1732-6.
29. (a) Gielen, F.; van Vliet, L.; Koprowski, B. T.; Devenish, S. R.; Fischlechner, M.; Edel, J. B.; Niu, X.; deMello, A. J.; Hollfelder, F. Anal. Chem. 2013, 85, 4761-9.
30. (b) Niu, X.; Gielen, F.; Edel, J. B.; deMello, A. J. Nat. Chem. 2011, 3, 437-42.
31. (a) Theberge, A. B.; Courtois, F.; Schaerli, Y.; Fischlechner, M.; Abell, C.; Hollfelder, F.; Huck, W. T. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 5846-68.
32. (b) Seemann, R.; Brinkmann, M.; Pfohl, T.; Herminghaus, S. Rep. Prog. Phys. 2012, 75, 016601.
33. Cheow, L. F.; Viswanathan, R.; Chin, C. S.; Jennifer, N.; Jones, R. C.; Guccione, E.; Quake, S. R.; Burkholder, W. F. Anal. Chem. 2014, 86, 9901-9908.
34. Choi, K.; Mudrik, J. M.; Wheeler, A. R. Anal. Bioanal. Chem. 2015, 407, 7467-7475.
35. Leemhuis, H.; Stein, V.; Griffiths, A. D.; Hollfelder, F. Curr. Opin. Struct. Biol. 2005, 15, 472-8.
36. Colin, P. Y.; Zinchenko, A.; Hollfelder, F. Curr. Opin. Struct. Biol. 2015, 33, 42-51.
37. Nieto, L.; Tharun, I. M.; Balk, M.; Wienk, H.; Boelens, R.; Ottmann, C.; Milroy, L. G.; Brunsveld, L. ACS Chem. Biol. 2015, 10, 2624-32.
38. Leung, K. H.; Liu, L. J.; Lin, S.; Lu, L. H.; Zhong, H. J.; Susanti, D.; Rao, W. D.; Wang, M. D.; Che, W. I.; Chan, D. S. H.; Leung, C. H.; Chan, P. W. H.; Ma, D. L. Methods 2015, 71, 38-43.
39. Zhai, D. Y.; Godoi, P.; Sergienko, E.; Dahl, R.; Chan, X.; Brown, B.; Rascon, J.; Hurder, A.; Su, Y.; Chung, T. D. Y.; Jin, C. F.; Diaz, P.; Reed, J. C. J. Biomol. Screening 2012, 17, 350-360.
40. Mathias, U.; Jung, M. Anal. Bioanal. Chem. 2007, 388, 1147-1156.
41. Schaerli, Y.; Hollfelder, F. Mol. BioSyst. 2009, 5, 1392-404.
42. Lach, S.; Yoon, S. M.; Grzybowski, B. A. Chem. Soc. Rev. 2016, 45, 4766-96.