Characterization of malic enzyme and the regulation of its activity and metabolic engineering on lipid production

RSC Advances

Volumn 5, Issue 56, 2015, Pages 45558-45570

  Liang, Ying Jie ^a   Jiang, Jian Guo ^a  

^a SOUTH CHINA UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOCHEMISTRY; BIOSYNTHESIS; CARBOXYLATION; ENZYMES; FATTY ACIDS; GENES; LIPIDS;

BIOCHEMICAL PROPERTIES; BIODIESEL PRODUCTION; CONCOMITANT REDUCTION; FATTY ACID BIOSYNTHESIS; GENE TRANSFORMATION; MOLECULAR CHARACTERIZATION; OLEAGINOUS MICROORGANISMS; OXIDATIVE DECARBOXYLATION;

METABOLIC ENGINEERING;

EID: 84930224945     PISSN: None     EISSN: 20462069     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5ra04635a     Document Type: Review

References (98)

1. X. Meng J. M. Yang X. Xu L. Zhang Q. J. Nie M. Xian Renewable Energy 2009 34 1 5
2. C. Ratledge Biochimie 2004 86 807 815
3. G. F. Chang Z. L. Luo S. T. Gu Q. H. Wu M. Chang X. G. Wang Bioresour. Technol. 2013 142 255 260
4. A. A. Hamid N. F. Mokhtar E. M. Taha O. Omar W. M. W. Yusoff Ann. Microbiol. 2011 61 463 468
5. C. Ratledge S. Hopkins F. Gunstone Modif. Lipids Use Food 2006 80 113
6. B. E. Rittmann Biotechnol. Bioeng. 2008 100 203 212
7. G. Stephanopoulos Science 2007 315 801 804
8. Q. Li W. Du D. H. Liu Appl. Microbiol. Biotechnol. 2008 80 749 756
9. X. Y. Qv Y. Y. Guo J. G. Jiang RSC Adv. 2014 4 79 42202 42210
10. X. Y. Qv Q. F. Zhou J. G. Jiang J. Sep. Sci. 2014 4 79 2991 2999
11. C. Ratledge Biochem. Soc. Trans. 2002 30 1047 1049
12. H. Chen Y. Lu J. G. Jiang PLoS One 2012 7 e37578
13. M. H. Liang J. G. Jiang Prog. Lipid Res. 2013 52 395 408
14. O. Tehlivets K. Scheuringer S. D. Kohlwein Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Biol. Lipids 2007 1771 255 270
15. H. Chen S. L. Chen J. G. Jiang PLoS One 2011 6 e28613
16. G. G. Chang L. Tong Biochemistry 2003 42 12721 12733
17. P. Gourdon M.-F. Baucher N. D. Lindley A. Guyonvarch Appl. Environ. Microbiol. 2000 66 2981 2987
18. Y. H. Li I. P. Adams J. P. Wynn C. Ratledge Mycol. Res. 2005 109 461 468
19. Y. D. Song J. P. Wynn Y. H. Li D. Grantham C. Ratledge Microbiology 2001 147 1507 1515
20. R. T. Wedding Plant Physiol. 1989 90 367 371
21. A. Beopoulos J. Cescut R. Haddouche J.-L. Uribelarrea C. Molina-Jouve J.-M. Nicaud Prog. Lipid Res. 2009 48 375 387
22. J. P. Wynn C. Ratledge Microbiology 1997 143 253 257
23. J. P. Wynn A. bin Abdul Hamid C. Ratledge Microbiology 1999 145 1911 1917
24. A. Kendrick C. Ratledge Eur. J. Biochem. 1992 209 667 673
25. G. F. Hao H. Q. Chen L. Wang Z. N. Gu Y. D. Song H. Zhang W. Chen Y. Q. Chen Appl. Microbiol. Biotechnol. 2014 80 2672 2678
26. J. P. Wynn A. Kendrick C. Ratledge Lipids 1997 32 605 610
27. K. Laoteng M. Čertík S. Cheevadhanark Chem. Pap. 2011 65 97 103
28. C. T. Evans C. Ratledge Can. J. Microbiol. 1985 31 1000 1005
29. S. Ochoa A. H. Mehler A. Kornberg J. Biol. Chem. 1948 174 979
30. R. M. Zelle J. C. Harrison J. T. Pronk A. J. van Maris Appl. Microbiol. Biotechnol. 2011 77 732 738
31. W. Fukuda Y. Sari Ismail T. Fukui H. Atomi T. Imanaka Archaea 2005 1 293 301
32. J. Y. Hsieh S. H. Chen H. C. Hung J. Biol. Chem. 2009 284 18096 18105
33. D. E. Coleman G. J. Rao E. Goldsmith P. F. Cook B. G. Harris Biochemistry 2002 41 6928 6938
34. Y. W. Xu G. Bhargava H. Wu G. Loeber L. Tong Structure 1999 7 877 889
35. Z. R. Yang H. L. Zhang H. C. Hung C. C. Kuo L. C. Tsai H. N. S. Yuan W. Y. Chou G. G. Chang L. Tong Protein Sci. 2002 11 332 341
36. Z. R. Yang L. Tong Protein Pept. Lett. 2000 7 287 296
37. S. Bartolucci R. Rella A. Guagliardi C. Raia A. Gambacorta M. De Rosa M. Rossi J. Biol. Chem. 1987 262 7725 7731
38. M. C. G. Wheeler M. A. Tronconi M. F. Drincovich C. S. Andreo U.-I. Flügge V. G. Maurino Plant Physiol. 2005 139 39 51
39. I. Sato J. Yoshikawa A. Furusawa K. Chiku S. Amachi T. Fujii Biosci., Biotechnol., Biochem. 2010 74 75 81
40. M. J. Mitsch R. T. Voegele A. Cowie M. Osteras T. M. Finan J. Biol. Chem. 1998 273 9330 9336
41. F. P. Bologna C. S. Andreo M. F. Drincovich J. Bacteriol. 2007 189 5937 5946
42. R. K. Wierenga P. Terpstra W. G. Hol J. Mol. Biol. 1986 187 101 107
43. T. Vorapreeda C. Thammarongtham S. Cheevadhanarak K. Laoteng Microbiology 2013 159 2548 2557
44. Y. Zhang I. P. Adams C. Ratledge Microbiology 2007 153 2013 2025
45. J. Y. Yang X. J. Hu H. Y. Zhang H. Q. Chen J. X. Zhao Y. D. Song Y. Q. Chen H. Zhang W. Chen Appl. Microbiol. Biotechnol. 2014 1 9
46. J. H. Li H. Y. Zhang Y. D. Song Adv. Biomed. Eng. 2011 3 5
47. Y. Zhang C. Ratledge Mycol. Res. 2008 112 725 730
48. W. Vongsangnak Y. T. Zhang W. Chen C. Ratledge Y. D. Song Biotechnol. Lett. 2012 34 941 947
49. A. Abdul Hamid S. Shuib E. M Taha O. Omar M. S. Khalil A. J. Abdul Kader M. H. Mohd Isa Jurnal Teknologi 2014 67 1 1 5
50. B. Dujon D. Sherman G. Fischer P. Durrens S. Casaregola I. Lafontaine J. De Montigny C. Marck C. Neuvéglise E. Talla Nature 2004 430 35 44
51. H. Y. Zhang L. N. Zhang H. Q. Chen Y. Q. Chen C. Ratledge Y. D. Song W. Chen Biotechnol. Lett. 2013 35 2091 2098
52. W. Tang S. F. Zhang H. D. Tan Z. K. Zhao Mol. Biotechnol. 2010 45 121 128
53. L. Wang W. Chen Y. Feng Y. Ren Z. N. Gu H. Q. Chen H. C. Wang M. J. Thomas B. Zhang I. M. Berquin PLoS One 2011 6 e28319
54. Y. M. Zhu P. P. Zhou J. R. Hu R. J. Zhang L. Ren M. T. Li F. Ning W. Chen L. J. Yu PLoS One 2013 8 e65552
55. C. H. Shang S. N. Zhu Z. H. Yuan Z. M. Wang Adv. Mater. Res. 2012 347 2536 2540
56. M. Saayman, PhD thesis, University of Stellenbosch, 2011
57. J. Savitha J. Wynn C. Ratledge World J. Microbiol. Biotechnol. 1997 13 7 9
58. W. Y. Chou W. P. Tsai C. C. Lin G. G. Chang J. Biol. Chem. 1995 270 25935 25941
59. D. A. Brown R. A. Cook Biochemistry 1981 20 2503 2512
60. K. Jernejc M. LegiŠa FEMS Microbiol. Lett. 2002 217 185 190
61. B. T. Driscoll T. M. Finan Microbiology 1997 143 489 498
62. H. C. Hung G. G. Chang Z. R. Yang L. Tong Biochemistry 2000 39 14095 14102
63. K. L. Su K. Y. Chang H. C. Hung Bioorg. Med. Chem. 2009 17 5414 5419
64. L. J. Ren H. Huang A. H. Xiao M. Lian L. J. Jin X. J. Ji Bioprocess Biosyst. Eng. 2009 32 837 843
65. L. J. Ren Y. Feng J. Li L. Qu H. Huang Bioprocess Biosyst. Eng. 2013 36 1177 1183
66. F. Muhid W. N. W. Nawi A. J. Kader W. M. W. Yusoff A. A. Hamid OnLine J. Biol. Sci. 2008 8 62
67. C. Huang H. Wu L. P. Liu W. Y. Lou M. H. Zong PLoS One 2012 7 e46975
68. C. Huang H. Wu Z. J. Liu J. Cai W. Y. Lou M. H. Zong Biotechnol. Biofuels 2012 5 4 4 10
69. C. Huang H. Wu Q. P. Liu Y. Y. Li M. H. Zong J. Agric. Food Chem. 2011 59 4606 4613
70. M. Certik J. Megova R. Horenitzky J. Gen. Appl. Microbiol. 1999 45 289 293
71. Y. Zeng X. J. Ji S. M. Chang Z. K. Nie H. Huang Bioprocess Biosyst. Eng. 2012 35 683 688
72. X. J. Song Y. Z. Tan Y. J. Liu J. T. Zhang G. L. Liu Y. G. Feng Q. Cui J. Agric. Food Chem. 2013 61 9876 9881
73. Q. Fei H. N. Chang L. Shang Biotechnol. Bioprocess Eng. 2011 16 482 487
74. P. Fontanille V. Kumar G. Christophe R. Nouaille C. Larroche Bioresour. Technol. 2012 114 443 449
75. X. Xu J. Y. Kim H. U. Cho H. R. Park J. M. Park Chem. Eng. J. 2015 264 735 743
76. E. R. Easterling W. T. French R. Hernandez M. Licha Bioresour. Technol. 2009 100 356 361
77. D. Gao J. Zeng Y. Zheng X. Yu S. Chen Bioresour. Technol. 2013 133 315 321
78. Q. Fei S. J. Wewetzer K. Kurosawa C. Rha A. J. Sinskey Process Biochem. 2015 18 2 500 506
79. N. M. D. Courchesne A. Parisien B. Wang C. Q. Lan J. Biotechnol. 2009 141 31 41
80. J. H. Fan Y. B. Cui M. X. Wan W. L. Wang Y. G. Li Biotechnol. Biofuels 2014 7 17
81. Y. Li J. Mu D. Chen H. Xu F. Han World J. Microbiol. Biotechnol. 2015 1 11
82. M. T. Guarnieri A. Nag S. H. Yang P. T. Pienkos J. Proteomics 2013 93 245 253
83. Z.-K. Yang Y.-F. Niu Y.-H. Ma J. Xue M.-H. Zhang W.-D. Yang J.-S. Liu S.-H. Lu Y. Guan H.-Y. Li Biotechnol. Biofuels 2013 6 1 67
84. J. Xue Y.-F. Niu T. Huang W.-D. Yang J.-S. Liu H.-Y. Li Mebab. Eng. 2015 27 1 9
85. C. Ratledge J. P. Wynn Adv. Appl. Microbiol. 2002 51 1 51
86. M. Moreira dos Santos V. Raghevendran P. Kötter L. Olsson J. Nielsen Metab. Eng. 2004 6 352 363
87. W. Runguphan J. D. Keasling Mebab. Eng. 2014 21 103 113
88. R. A. Rodríguez-Frómeta A. Gutiérrez S. Torres-Martínez V. Garre Appl. Microbiol. Biotechnol. 2013 97 3063 3072
89. G. F. Hao H. Q. Chen K. Du X. Y. Huang Y. D. Song Z. N. Gu L. Wang H. Zhang W. Chen Y. Q. Chen Biotechnol. Lett. 2014 1 8
90. Z. Li H. X. Sun X. M. Mo X. Y. Li B. Xu P. Tian Appl. Microbiol. Biotechnol. 2013 97 4927 4936
91. Z. W. Zhu S. F. Zhang H. W. Liu H. W. Shen X. P. Lin F. Yang Y. J. Zhou G. J. Jin M. L. Ye H. F. Zou Nat. Commun. 2012 3 1112
92. X. Meng J. M. Yang Y. J. Cao L. Z. Li X. L. Jiang X. Xu W. Liu M. Xian Y. W. Zhang J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2011 38 919 925
93. Y. S. Zhou, H. Y. Zhang, H. Q. Chen, Y. D. Song, Y. Q. Chen, H. Zhang and W. Chen, Sciencepaper online http://www.paper.edu.cn/html/releasepaper/2013/03/716/, 2013
94. K. Tamano K. S. Bruno S. A. Karagiosis D. E. Culley S. Deng J. R. Collett M. Umemura H. Koike S. E. Baker M. Machida Appl. Microbiol. Biotechnol. 2013 97 269 281
95. A. Beopoulos J.-M. Nicaud C. Gaillardin Appl. Microbiol. Biotechnol. 2011 90 1193 1206
96. C. Ratledge Biotechnol. Lett. 2014 1 12
97. T. M. Wasylenko W. S. Ahn G. Stephanopoulos Mebab. Eng. 2015 30 1 27 39
98. A. Ochoa-Estopier S. E. Guillouet J. Biotechnol. 2014 170 35 41