Nucleosome structure and function

Chemical Reviews

Volumn 115, Issue 6, 2015, Pages 2255-2273

  McGinty, Robert K ^a   Tan, Song ^a  

^a PENNSYLVANIA STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; CHROMOSOMES; MASS SPECTROMETRY; YEAST;

CO-CRYSTALLIZATIONS; EM TECHNOLOGIES; HISTONE ACETYLTRANSFERASES; NMR ANALYSIS; NUCLEOSOME CORE PARTICLES; NUCLEOSOME STRUCTURE; NUCLEOSOMES; SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE;

MEDICAL IMAGING;

NUCLEOSOME;

CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; HUMAN; METABOLISM; NUCLEOSOME;

HUMANS; MODELS, MOLECULAR; NUCLEOSOMES;

EID: 84925743476     PISSN: 00092665     EISSN: 15206890     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr500373h     Document Type: Review

References (164)

1. McGhee, J. D.; Felsenfeld, G. Annu. Rev. Biochem. 1980, 49, 1115
2. Simpson, R. T. Biochemistry 1978, 17, 5524
3. Taverna, S. D.; Li, H.; Ruthenburg, A. J.; Allis, C. D.; Patel, D. J. Nat. Struct. Mol. Biol. 2007, 14, 1025
4. Luger, K.; Dechassa, M. L.; Tremethick, D. J. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2012, 13, 436
5. Shogren-Knaak, M.; Ishii, H.; Sun, J.-M.; Pazin, M. J.; Davie, J. R.; Peterson, C. L. Science 2006, 311, 844
6. Lu, X.; Simon, M. D.; Chodaparambil, J. V.; Hansen, J. C.; Shokat, K. M.; Luger, K. Nat. Struct. Mol. Biol. 2008, 15, 1122
7. Fierz, B.; Chatterjee, C.; McGinty, R. K.; Bar-Dagan, M.; Raleigh, D. P.; Muir, T. W. Nat. Chem. Biol. 2011, 7, 113
8. Robinson, P. J.; Rhodes, D. Curr. Opin. Struct. Biol. 2006, 16, 336
9. Luger, K.; Mäder, A. W.; Richmond, R. K.; Sargent, D. F.; Richmond, T. J. Nature 1997, 389, 251
10. Lowary, P. T.; Widom, J. J. Mol. Biol. 1998, 276, 19
11. Song, F.; Chen, P.; Sun, D.; Wang, M.; Dong, L.; Liang, D.; Xu, R.-M.; Zhu, P.; Li, G. Science 2014, 344, 376
12. Robinson, P. J. J.; Fairall, L.; Huynh, V. A. T.; Rhodes, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 6506
13. Schalch, T.; Duda, S.; Sargent, D. F.; Richmond, T. J. Nature 2005, 436, 138
14. Flaus, A.; Luger, K.; Tan, S.; Richmond, T. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 1370
15. Arents, G.; Burlingame, R. W.; Wang, B. C.; Love, W. E.; Moudrianakis, E. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 10148
16. Arents, G.; Moudrianakis, E. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 11170
17. Davey, C. A.; Sargent, D. F.; Luger, K.; Maeder, A. W.; Richmond, T. J. J. Mol. Biol. 2002, 319, 1097
18. McGinty, R. K.; Tan, S. In Fundamentals of Chromatin; Springer: New York: New York, NY, 2013; pp 1-28.
19. Preez, du L. L.; Patterton, H.-G. Subcell. Biochem. 2013, 61, 37
20. Zheng, C.; Hayes, J. J. J. Biol. Chem. 2003, 278, 24217
21. Kan, P. Y.; Lu, X.; Hansen, J. C.; Hayes, J. J. Mol. Cell. Biol. 2007, 27, 2084
22. Kan, P. Y.; Caterino, T. L.; Hayes, J. J. Mol. Cell. Biol. 2009, 29, 538
23. White, C. L.; Suto, R. K.; Luger, K. EMBO J. 2001, 20, 5207
24. Clapier, C. R.; Chakravarthy, S.; Petosa, C.; Fernández-Tornero, C.; Luger, K.; Müller, C. W. Proteins 2008, 71, 1
25. Tsunaka, Y.; Kajimura, N.; Tate, S.-I.; Morikawa, K. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 3424
26. Sugiyama, M.; Arimura, Y.; Shirayama, K.; Fujita, R.; Oba, Y.; Sato, N.; Inoue, R.; Oda, T.; Sato, M.; Heenan, R. K.; Kurumizaka, H. Biophys. J. 2014, 106, 2206
27. Urahama, T.; Horikoshi, N.; Osakabe, A.; Tachiwana, H.; Kurumizaka, H. Acta Crystallogr., Sect. F: Struct. Biol. Cryst. Commun. 2014, 70, 444
28. Tachiwana, H.; Kagawa, W.; Shiga, T.; Osakabe, A.; Miya, Y.; Saito, K.; Hayashi-Takanaka, Y.; Oda, T.; Sato, M.; Park, S.-Y.; Kimura, H.; Kurumizaka, H. Nature 2011, 476, 232
29. Tachiwana, H.; Osakabe, A.; Shiga, T.; Miya, Y.; Kimura, H.; Kagawa, W.; Kurumizaka, H. Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2011, 67, 578
30. Tachiwana, H.; Kagawa, W.; Osakabe, A.; Kawaguchi, K.; Shiga, T.; Hayashi-Takanaka, Y.; Kimura, H.; Kurumizaka, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 10454
31. Arimura, Y.; Kimura, H.; Oda, T.; Sato, K.; Osakabe, A.; Tachiwana, H.; Sato, Y.; Kinugasa, Y.; Ikura, T.; Sugiyama, M.; Sato, M.; Kurumizaka, H. Sci. Rep. 2013, 3, 3510
32. Chakravarthy, S.; Bao, Y.; Roberts, V. A.; Tremethick, D.; Luger, K. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 2004, 69, 227
33. Chakravarthy, S.; Gundimella, S. K. Y.; Caron, C.; Perche, P.-Y.; Pehrson, J. R.; Khochbin, S.; Luger, K. Mol. Cell. Biol. 2005, 25, 7616
34. Chakravarthy, S.; Luger, K. J. Biol. Chem. 2006, 281, 25522
35. Abbott, D. W.; Laszczak, M.; Lewis, J. D.; Su, H.; Moore, S. C.; Hills, M.; Dimitrov, S.; Ausio, J. Biochemistry 2004, 43, 1352
36. Eirín-López, J. M.; Ishibashi, T.; Ausio, J. FASEB J. 2008, 22, 316
37. Horikoshi, N.; Sato, K.; Shimada, K.; Arimura, Y.; Osakabe, A.; Tachiwana, H.; Hayashi-Takanaka, Y.; Iwasaki, W.; Kagawa, W.; Harata, M.; Kimura, H.; Kurumizaka, H. Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2013, 69, 2431
38. Suto, R. K.; Clarkson, M. J.; Tremethick, D. J.; Luger, K. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 1121
39. Dechassa, M. L.; Wyns, K.; Li, M.; Hall, M. A.; Wang, M. D.; Luger, K. Nat. Commun. 2011, 2, 313
40. Conde e Silva, N.; Black, B. E.; Sivolob, A.; Filipski, J.; Cleveland, D. W.; Prunell, A. J. Mol. Biol. 2007, 370, 555
41. Sekulic, N.; Bassett, E. A.; Rogers, D. J.; Black, B. E. Nature 2010, 467, 347
42. Kingston, I. J.; Yung, J. S. Y.; Singleton, M. R. J. Biol. Chem. 2011, 286, 4021
43. Panchenko, T.; Sorensen, T. C.; Woodcock, C. L.; Kan, Z.-Y.; Wood, S.; Resch, M. G.; Luger, K.; Englander, S. W.; Hansen, J. C.; Black, B. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 16588
44. Doyen, C.-M.; Montel, F.; Gautier, T.; Menoni, H.; Claudet, C.; Delacour-Larose, M.; Angelov, D.; Hamiche, A.; Bednar, J.; Faivre-Moskalenko, C.; Bouvet, P.; Dimitrov, S. EMBO J. 2006, 25, 4234
45. Cosgrove, M. S.; Wolberger, C. Biochem. Cell Biol. 2005, 83, 468
46. Cosgrove, M. S.; Boeke, J. D.; Wolberger, C. Nat. Struct. Mol. Biol. 2004, 11, 1037
47. Mersfelder, E. L.; Parthun, M. R. Nucleic Acids Res. 2006, 34, 2653
48. North, J. A.; Šimon, M.; Ferdinand, M. B.; Shoffner, M. A.; Picking, J. W.; Howard, C. J.; Mooney, A. M.; van Noort, J.; Poirier, M. G.; Ottesen, J. J. Nucleic Acids Res. 2014, 42, 4922
49. North, J. A.; Javaid, S.; Ferdinand, M. B.; Chatterjee, N.; Picking, J. W.; Shoffner, M.; Nakkula, R. J.; Bartholomew, B.; Ottesen, J. J.; Fishel, R.; Poirier, M. G. Nucleic Acids Res. 2011, 39, 6465
50. Manohar, M.; Mooney, A. M.; North, J. A.; Nakkula, R. J.; Picking, J. W.; Edon, A.; Fishel, R.; Poirier, M. G.; Ottesen, J. J. J. Biol. Chem. 2009, 284, 23312
51. Šimon, M.; North, J. A.; Shimko, J. C.; Forties, R. A.; Ferdinand, M. B.; Manohar, M.; Zhang, M.; Fishel, R.; Ottesen, J. J.; Poirier, M. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 12711
52. Makde, R. D.; England, J. R.; Yennawar, H. P.; Tan, S. Nature 2010, 467, 562
53. Vasudevan, D.; Chua, E. Y. D.; Davey, C. A. J. Mol. Biol. 2010, 403, 1
54. Finch, J. T.; Brown, R. S.; Richmond, T.; Rushton, B.; Lutter, L. C.; Klug, A. J. Mol. Biol. 1981, 145, 757
55. Richmond, T. J.; Finch, J. T.; Rushton, B.; Rhodes, D.; Klug, A. Nature 1984, 311, 532
56. Richmond, T. J.; Finch, J. T.; Klug, A. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1983, 47, 493
57. Richmond, T. J.; Searles, M. A.; Simpson, R. T. J. Mol. Biol. 1988, 199, 161
58. Simpson, R. T.; Stafford, D. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1983, 80, 51
59. Harp, J. M.; Palmer, E. L.; York, M. H.; Gewiess, A.; Davis, M.; Bunick, G. J. Electrophoresis 1995, 16, 1861
60. Satchwell, S. C.; Drew, H. R.; Travers, A. A. J. Mol. Biol. 1986, 191, 659
61. Chua, E. Y. D.; Vasudevan, D.; Davey, G. E.; Wu, B.; Davey, C. A. Nucleic Acids Res. 2012, 40, 6338
62. Kulaeva, O. I.; Gaykalova, D. A.; Pestov, N. A.; Golovastov, V. V.; Vassylyev, D. G.; Artsimovitch, I.; Studitsky, V. M. Nat. Struct. Mol. Biol. 2009, 16, 1272
63. Cui, F.; Zhurkin, V. B. J. Biomol. Struct. Dyn. 2010, 27, 821
64. Tolstorukov, M. Y.; Colasanti, A. V.; McCandlish, D. M.; Olson, W. K.; Zhurkin, V. B. J. Mol. Biol. 2007, 371, 725
65. Travers, A. A. Philos. Trans. R. Soc., A 2004, 362, 1423
66. Travers, A. A.; Muskhelishvili, G.; Thompson, J. M. T. Philos. Trans. R. Soc., A 2012, 370, 2960
67. Olson, W. K.; Zhurkin, V. B. Curr. Opin. Struct. Biol. 2011, 21, 348
68. Richmond, T. J.; Davey, C. A. Nature 2003, 423, 145
69. Juo, Z. S.; Chiu, T. K.; Leiberman, P. M.; Baikalov, I.; Berk, A. J.; Dickerson, R. E. J. Mol. Biol. 1996, 261, 239
70. Kim, Y.; Geiger, J. H.; Hahn, S.; Sigler, P. B. Nature 1993, 365, 512
71. Kim, J. L.; Nikolov, D. B.; Burley, S. K. Nature 1993, 365, 520
72. Olson, W. K.; Gorin, A. A.; Lu, X.-J.; Hock, L. M.; Zhurkin, V. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 11163
73. Bondarenko, V. A.; Steele, L. M.; Ujvári, A.; Gaykalova, D. A.; Kulaeva, O. I.; Polikanov, Y. S.; Luse, D. S.; Studitsky, V. M. Mol. Cell 2006, 24, 469
74. Abbott, E. A. Flatland: A romance of many dimensions; Seely & Co.: UK, 1884.
75. Makde, R. D.; Tan, S. Anal. Biochem. 2013, 442, 138
76. Hock, R.; Furusawa, T.; Ueda, T.; Bustin, M. Trends Cell Biol. 2007, 17, 72
77. Canzio, D.; Liao, M.; Naber, N.; Pate, E.; Larson, A.; Wu, S.; Marina, D. B.; Garcia, J. F.; Madhani, H. D.; Cooke, R.; Schuck, P.; Cheng, Y.; Narlikar, G. J. Nature 2013, 496, 377
78. Armache, K. J.; Garlick, J. D.; Canzio, D.; Narlikar, G. J.; Kingston, R. E. Science 2011, 334, 977
79. Barbera, A. J.; Chodaparambil, J. V.; Kelley-Clarke, B.; Joukov, V.; Walter, J. C.; Luger, K.; Kaye, K. M. Science 2006, 311, 856
80. Marmorstein, R.; Trievel, R. C. Biochim. Biophys. Acta, Gene Regul. Mech. 2009, 1789, 58
81. Musselman, C. A.; Lalonde, M.-E.; Côté, J.; Kutateladze, T. G. Nat. Struct. Mol. Biol. 2012, 19, 1218
82. Ruthenburg, A. J.; Li, H.; Patel, D. J.; Allis, C. D. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2007, 8, 983
83. Zhou, B.-R.; Feng, H.; Ghirlando, R.; Kato, H.; Gruschus, J.; Bai, Y. J. Mol. Biol. 2012, 421, 30
84. Dorigo, B.; Schalch, T.; Bystricky, K.; Richmond, T. J. J. Mol. Biol. 2003, 327, 85
85. Robinson, P. J. J.; An, W.; Routh, A.; Martino, F.; Chapman, L.; Roeder, R. G.; Rhodes, D. J. Mol. Biol. 2008, 381, 816
86. Allahverdi, A.; Yang, R.; Korolev, N.; Fan, Y.; Davey, C. A.; Liu, C. F.; Nordenskiold, L. Nucleic Acids Res. 2011, 39, 1680
87. Dorigo, B.; Schalch, T.; Kulangara, A.; Duda, S.; Schroeder, R. R.; Richmond, T. J. Science 2004, 306, 1571
88. Sinha, D.; Shogren-Knaak, M. A. J. Biol. Chem. 2010, 285, 16572
89. Yang, D.; Arya, G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 2911
90. Barbera, A. J.; Ballestas, M. E.; Kaye, K. M. J. Virol. 2004, 78, 294
91. Clarke, P. R.; Zhang, C. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2008, 9, 464
92. Carazo-Salas, R. E.; Guarguaglini, G.; Gruss, O. J.; Segref, A.; Karsenti, E.; Mattaj, I. W. Nature 1999, 400, 178
93. Kalab, P.; Heald, R. J. Cell Sci. 2008, 121, 1577
94. Nemergut, M. E.; Mizzen, C. A.; Stukenberg, T.; Allis, C. D.; Macara, I. G. Science 2001, 292, 1540
95. England, J. R.; Huang, J.; Jennings, M. J.; Makde, R. D.; Tan, S. J. Mol. Biol. 2010, 398, 518
96. Rusche, L. N.; Kirchmaier, A. L.; Rine, J. Annu. Rev. Biochem. 2003, 72, 481
97. McBryant, S. J.; Krause, C.; Woodcock, C. L.; Hansen, J. C. Mol. Cell. Biol. 2008, 28, 3563
98. Johnson, A.; Li, G.; Sikorski, T. W.; Buratowski, S.; Woodcock, C. L.; Moazed, D. Mol. Cell 2009, 35, 769
99. Martino, F.; Kueng, S.; Robinson, P.; Tsai-Pflugfelder, M.; van Leeuwen, F.; Ziegler, M.; Cubizolles, F.; Cockell, M. M.; Rhodes, D.; Gasser, S. M. Mol. Cell 2009, 33, 323
100. Norris, A.; Bianchet, M. A.; Boeke, J. D. PLoS Genet. 2008, 4, e1000301
101. Singer, M. S.; Kahana, A.; Wolf, A. J.; Meisinger, L. L.; Peterson, S. E.; Goggin, C.; Mahowald, M.; Gottschling, D. E. Genetics 1998, 150, 613
102. Ng, H. H.; Ciccone, D. N.; Morshead, K. B.; Oettinger, M. A.; Struhl, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 1820
103. van Leeuwen, F.; Gafken, P. R.; Gottschling, D. E. Cell 2002, 109, 745
104. Arnaudo, N.; Fernández, I. S.; McLaughlin, S. H.; Peak-Chew, S. Y.; Rhodes, D.; Martino, F. Nat. Struct. Mol. Biol. 2013, 20, 1119
105. Yang, D.; Fang, Q.; Wang, M.; Ren, R.; Wang, H.; He, M.; Sun, Y.; Yang, N.; Xu, R.-M. Nat. Struct. Mol. Biol. 2013, 20, 1116
106. Connelly, J. J.; Yuan, P.; Hsu, H.-C.; Li, Z.; Xu, R.-M.; Sternglanz, R. Mol. Cell. Biol. 2006, 26, 3256
107. Kato, H.; Jiang, J.; Zhou, B.-R.; Rozendaal, M.; Feng, H.; Ghirlando, R.; Xiao, T. S.; Straight, A. F.; Bai, Y. Science 2013, 340, 1110
108. Henikoff, S.; Ahmad, K.; Malik, H. S. Science 2001, 293, 1098
109. Verdaasdonk, J. S.; Bloom, K. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2011, 12, 320
110. Hori, T.; Amano, M.; Suzuki, A.; Backer, C. B.; Welburn, J. P.; Dong, Y.; McEwen, B. F.; Shang, W.-H.; Suzuki, E.; Okawa, K.; Cheeseman, I. M.; Fukagawa, T. Cell 2008, 135, 1039
111. McGinty, R. K.; Henrici, R. C.; Tan, S. Nature 2014, 514, 591
112. Cao, R.; Tsukada, Y.-I.; Zhang, Y. Mol. Cell 2005, 20, 845
113. Grau, D. J.; Chapman, B. A.; Garlick, J. D.; Borowsky, M.; Francis, N. J.; Kingston, R. E. Genes Dev. 2011, 25, 2210
114. Simon, J. A.; Kingston, R. E. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2009, 10, 697
115. Buchwald, G.; van der Stoop, P.; Weichenrieder, O.; Perrakis, A.; van Lohuizen, M.; Sixma, T. K. EMBO J. 2006, 25, 2465
116. Bentley, M. L.; Corn, J. E.; Dong, K. C.; Phung, Q.; Cheung, T. K.; Cochran, A. G. EMBO J. 2011, 30, 3285
117. Leung, J. W.; Agarwal, P.; Canny, M. D.; Gong, F.; Robison, A. D.; Finkelstein, I. J.; Durocher, D.; Miller, K. M. PLoS Genet. 2014, 10, e1004178
118. Kato, H.; van Ingen, H.; Zhou, B.-R.; Feng, H.; Bustin, M.; Kay, L. E.; Bai, Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 12283
119. Zhou, B.-R.; Feng, H.; Kato, H.; Dai, L.; Yang, Y.; Zhou, Y.; Bai, Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 19390
120. Rattner, B. P.; Yusufzai, T.; Kadonaga, J. T. Mol. Cell 2009, 34, 620
121. Lim, J.-H.; West, K. L.; Rubinstein, Y.; Bergel, M.; Postnikov, Y. V.; Bustin, M. EMBO J. 2005, 24, 3038
122. Lim, J.-H.; Catez, F.; Birger, Y.; West, K. L.; Prymakowska-Bosak, M.; Postnikov, Y. V.; Bustin, M. Mol. Cell 2004, 15, 573
123. Postnikov, Y.; Bustin, M. Biochim. Biophys. Acta, Gene Regul. Mech. 2010, 1799, 62
124. Prymakowska-Bosak, M.; Misteli, T.; Herrera, J. E.; Shirakawa, H.; Birger, Y.; Garfield, S.; Bustin, M. Mol. Cell. Biol. 2001, 21, 5169
125. Mattiroli, F.; Uckelmann, M.; Sahtoe, D. D.; van Dijk, W. J.; Sixma, T. K. Nat. Commun. 2014, 5, 3291
126. Carriere, V.; Roussel, L.; Ortega, N.; Lacorre, D.-A.; Americh, L.; Aguilar, L.; Bouche, G.; Girard, J.-P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 282
127. Kalashnikova, A. A.; Porter-Goff, M. E.; Muthurajan, U. M.; Luger, K.; Hansen, J. C. J. R. Soc., Interface 2013, 10, 20121022
128. Clapier, C. R.; Cairns, B. R. Annu. Rev. Biochem. 2009, 78, 273
129. Chaban, Y.; Ezeokonkwo, C.; Chung, W.-H.; Zhang, F.; Kornberg, R. D.; Maier-Davis, B.; Lorch, Y.; Asturias, F. J. Nat. Struct. Mol. Biol. 2008, 15, 1272
130. Asturias, F. J.; Chung, W.-H.; Kornberg, R. D.; Lorch, Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 13477
131. Saha, A.; Wittmeyer, J.; Cairns, B. R. Nat. Struct. Mol. Biol. 2005, 12, 747
132. Leschziner, A. E.; Saha, A.; Wittmeyer, J.; Zhang, Y.; Bustamante, C.; Cairns, B. R.; Nogales, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 4913
133. Racki, L. R.; Yang, J. G.; Naber, N.; Partensky, P. D.; Acevedo, A.; Purcell, T. J.; Cooke, R.; Cheng, Y.; Narlikar, G. J. Nature 2009, 462, 1016
134. Yamada, K.; Frouws, T. D.; Angst, B.; Fitzgerald, D. J.; DeLuca, C.; Schimmele, K.; Sargent, D. F.; Richmond, T. J. Nature 2011, 472, 448
135. Saravanan, M.; Wuerges, J.; Bose, D.; McCormack, E. A.; Cook, N. J.; Zhang, X.; Wigley, D. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 20883
136. Tosi, A.; Haas, C.; Herzog, F.; Gilmozzi, A.; Berninghausen, O.; Ungewickell, C.; Gerhold, C. B.; Lakomek, K.; Aebersold, R.; Beckmann, R.; Hopfner, K.-P. Cell 2013, 154, 1207
137. Chittuluru, J. R.; Chaban, Y.; Monnet-Saksouk, J.; Carrozza, M. J.; Sapountzi, V.; Selleck, W.; Huang, J.; Utley, R. T.; Cramet, M.; Allard, S.; Cai, G.; Workman, J. L.; Fried, M. G.; Tan, S.; Côté, J.; Asturias, F. J. Nat. Struct. Mol. Biol. 2011, 18, 1196
138. Boudreault, A. A.; Cronier, D.; Selleck, W.; Lacoste, N.; Utley, R. T.; Allard, S.; Savard, J.; Lane, W. S.; Tan, S.; Côté, J. Genes Dev. 2003, 17, 1415
139. Huang, J.; Tan, S. Mol. Cell. Biol. 2013, 33, 159
140. Harshman, S. W.; Young, N. L.; Parthun, M. R.; Freitas, M. A. Nucleic Acids Res. 2013, 41, 9593
141. Allan, J.; Hartman, P. G.; Crane-Robinson, C.; Aviles, F. X. Nature 1980, 288, 675
142. Syed, S. H.; Goutte-Gattat, D.; Becker, N.; Meyer, S.; Shukla, M. S.; Hayes, J. J.; Everaers, R.; Angelov, D.; Bednar, J.; Dimitrov, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 9620
143. Fan, L.; Roberts, V. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 8384
144. Meyer, S.; Becker, N. B.; Syed, S. H.; Goutte-Gattat, D.; Shukla, M. S.; Hayes, J. J.; Angelov, D.; Bednar, J.; Dimitrov, S.; Everaers, R. Nucleic Acids Res. 2011, 39, 9139
145. Zhou, Y. B.; Gerchman, S. E.; Ramakrishnan, V.; Travers, A.; Muyldermans, S. Nature 1998, 395, 402
146. Bharath, M. M. S.; Chandra, N. R.; Rao, M. R. S. Nucleic Acids Res. 2003, 31, 4264
147. Wong, J.; Li, Q.; Levi, B. Z.; Shi, Y. B.; Wolffe, A. P. EMBO J. 1997, 16, 7130
148. Pachov, G. V.; Gabdoulline, R. R.; Wade, R. C. Nucleic Acids Res. 2011, 39, 5255
149. An, W.; Leuba, S. H.; van Holde, K.; Zlatanova, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 3396
150. Vogler, C.; Huber, C.; Waldmann, T.; Ettig, R.; Braun, L.; Izzo, A.; Daujat, S.; Chassignet, I.; Lopez-Contreras, A. J.; Fernandez-Capetillo, O.; Dundr, M.; Rippe, K.; Längst, G.; Schneider, R. PLoS Genet. 2010, 6, e1001234
151. Thakar, A.; Gupta, P.; Ishibashi, T.; Finn, R.; Silva-Moreno, B.; Uchiyama, S.; Fukui, K.; Tomschik, M.; Ausio, J.; Zlatanova, J. Biochemistry 2009, 48, 10852
152. McGhee, J. D.; Nickol, J. M.; Felsenfeld, G.; Rau, D. C. Cell 1983, 33, 831
153. Widom, J.; Klug, A. Cell 1985, 43, 207
154. Thoma, F.; Koller, T.; Klug, A. J. Cell Biol. 2003, 83, 403
155. Worcel, A.; Strogatz, S.; Riley, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1981, 78, 1461
156. Woodcock, C. L.; Frado, L. L.; Rattner, J. B. J. Cell Biol. 2002, 99, 42
157. Williams, S. P.; Athey, B. D.; Muglia, L. J.; Schappe, R. S.; Gough, A. H.; Langmore, J. P. Biophys. J. 1986, 49, 233
158. Wong, H.; Victor, J.-M.; Mozziconacci, J. PLoS One 2007, 2, e877
159. Eltsov, M.; MacLellan, K. M.; Maeshima, K.; Frangakis, A. S.; Dubochet, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 19732
160. Maeshima, K.; Hihara, S.; Eltsov, M. Curr. Opin. Cell Biol. 2010, 22, 291
161. Joti, Y.; Hikima, T.; Nishino, Y.; Kamada, F.; Hihara, S.; Takata, H.; Ishikawa, T.; Maeshima, K. Nucleus 2012, 3, 404
162. Nishino, Y.; Eltsov, M.; Joti, Y.; Ito, K.; Takata, H.; Takahashi, Y.; Hihara, S.; Frangakis, A. S.; Imamoto, N.; Ishikawa, T.; Maeshima, K. EMBO J. 2012, 31, 1644
163. Hansen, J. C. EMBO J. 2012, 31, 1621
164. Baker, N. A.; Sept, D.; Joseph, S.; Holst, M. J.; McCammon, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 10037