Capillary electrophoresis for quantitative studies of biomolecular interactions

Analytical Chemistry

Volumn 87, Issue 1, 2015, Pages 157-171

  Galievsky, Victor A ^a   Stasheuski, Alexander S ^a   Krylov, Sergey N ^a  

^a YORK UNIVERSITY   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CARBOHYDRATE; DNA; PROTEIN; PROTEIN BINDING; RNA;

ANIMAL; CAPILLARY ELECTROPHORESIS; CHEMISTRY; DRUG INTERACTION; HUMAN; METABOLISM; PHYSIOLOGY; PROCEDURES;

ANIMALS; CARBOHYDRATES; DNA; DRUG INTERACTIONS; ELECTROPHORESIS, CAPILLARY; HUMANS; PROTEIN BINDING; PROTEINS; RNA;

EID: 84920482619     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac504219r     Document Type: Review

References (113)

1. Geiger, M.; Hogerton, A. L.; Bowser, M. T. Anal. Chem. 2012, 84, 577-596
2. Krylov, S. N. Electrophoresis 2007, 28, 69-88
3. Petrov, A. P.; Cherney, L. T.; Dodgson, B.; Okhonin, V.; Krylov, S. N. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 12486-12492
4. Cherney, L. T.; Okhonin, V.; Petrov, A. P.; Krylov, S. N. Anal. Chim. Acta 2012, 724, 111-118
5. Chu, Y. H.; Avila, L. Z.; Biebuyck, H. A.; Whitesides, G. M. J. Med. Chem. 1992, 35, 2915-2917
6. Song, K. M.; Lee, S.; Ban, C. Sensors (Basel) 2012, 12, 612-631
7. Smuc, T.; Ahn, I. Y.; Ulrich, H. J. Pharm. Biomed. Anal. 2013, 81-82, 210-217
8. Liu, J.; Morris, M. D.; Macazo, F. C.; Schoukroun-Barnes, L. R.; White, R. J. J. Electrochem. Soc. 2014, 161, H301-H313
9. Weng, C. H.; Huang, C. J.; Lee, G. B. Sensors (Basel) 2012, 12, 9514-9529
10. Berezovski, M. V.; Okhonin, V.; Petrov, A.; Krylov, S. N. In Photonic Applications in Biosensing and Imaging, Proc. SPIE; 5969, 2005; p 59690Y.
11. Okhonin, V.; Berezovski, M. V.; Krylov, S. N. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 7062-7068
12. Kanoatov, M.; Cherney, L. T.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2014, 86, 1298-1305
13. Girardot, M.; Li, H. Y.; Descroix, S.; Varenne, A. Chromatographia 2013, 76, 305-312
14. Girardot, M.; d'Orlye, F.; Varenne, A. Anal. Bioanal. Chem. 2014, 406, 1089-1098
15. Zhou, Z. M.; Zhou, J.; Chen, J.; Yu, R. N.; Zhang, M. Z.; Song, J. T.; Zhao, Y. D. Biosens. Bioelectron. 2014, 59, 397-403
16. Langan, T. J.; Nyakubaya, V. T.; Casto, L. D.; Dolan, T. D.; Archer-Hartmann, S. A.; Yedlapalli, S. L.; Sooter, L. J.; Holland, L. A. Electrophoresis 2012, 33, 866-869
17. Krylova, S. M.; Koshkin, V.; Bagg, E.; Schofield, C. J.; Krylov, S. N. J. Med. Chem. 2012, 55, 3546-3552
18. Kundu, L. M.; Tsukada, H.; Matsuoka, Y.; Kanayama, N.; Takarada, T.; Maeda, M. Anal. Chem. 2012, 84, 5204-5209
19. Tsukada, H.; Watanabe, T.; Kanayama, N.; Takarada, T.; Maeda, M. Electrophoresis 2012, 33, 2122-2129
20. Tsukada, H.; Kundu, L. M.; Matsuoka, Y.; Kanayama, N.; Takarada, T.; Maeda, M. Anal. Biochem. 2013, 433, 150-152
21. Takarada, T.; Maeda, M. Bull. Chem. Soc. Jpn. 2013, 86, 547-556
22. Yangyuoru, P. M.; Dhakal, S.; Yu, Z.; Koirala, D.; Mwongela, S. M.; Mao, H. Anal. Chem. 2012, 84, 5298-5303
23. Meng, C.; Zhao, X.; Qu, F.; Mei, F.; Gu, L. J. Chromatogr., A 2014, 1358, 269-276
24. Mendonsa, S. D.; Bowser, M. T. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 20-21
25. Berezovski, M.; Musheev, M.; Drabovich, A.; Krylov, S. N. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 1410-1411
26. Ashley, J.; Ji, K.; Li, S. F. Electrophoresis 2012, 33, 2783-2789
27. Ashley, J.; Li, S. F. Anal. Biochem. 2013, 434, 146-152
28. Kasahara, Y.; Irisawa, Y.; Ozaki, H.; Obika, S.; Kuwahara, M. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2013, 23, 1288-1292
29. Kasahara, Y.; Irisawa, Y.; Fujita, H.; Yahara, A.; Ozaki, H.; Obika, S.; Kuwahara, M. Anal. Chem. 2013, 85, 4961-4967
30. Tran, D. T.; Knez, K.; Janssen, K. P.; Pollet, J.; Spasic, D.; Lammertyn, J. Biosens. Bioelectron. 2013, 43, 245-251
31. Jing, M.; Bowser, M. T. Anal. Chem. 2013, 85, 10761-10770
32. Nie, H.; Chen, Y.; Lu, C.; Liu, Z. Anal. Chem. 2013, 85, 8277-8283
33. Yu, X.; Yu, Y. Appl. Biochem. Biotechnol. 2014, 173, 2019-2027
34. Kim, S. E.; Su, W.; Cho, M.; Lee, Y.; Choe, W. S. Anal. Biochem. 2012, 424, 12-20
35. Gotti, R.; Parma, B.; Spelta, F.; Liverani, L. Talanta 2013, 105, 366-371
36. Lipponen, K.; Liu, Y.; Stege, P. W.; Oorni, K.; Kovanen, P. T.; Riekkola, M. L. Anal. Biochem. 2012, 424, 71-78
37. Dinges, M. M.; Solakyildirim, K.; Larive, C. K. Electrophoresis 2014, 35, 1469-1477
38. Rafols, C.; Zarza, S.; Bosch, E. Talanta 2014, 130, 241-250
39. Gonciarz, A.; Kus, K.; Szafarz, M.; Walczak, M.; Zakrzewska, A.; Szymura-Oleksiak, J. Electrophoresis 2012, 33, 3323-3330
40. El-Hady, D. A.; Albishri, H. M. J. Chromatogr., B 2012, 911, 180-185
41. Liu, C. Y.; Wei, Y. M.; Miao, Y. Q.; Zhang, Y. Y. Pharmazie 2012, 67, 839-843
42. Ye, F. B.; Xie, Y. Y.; Jensen, H.; Larsen, S. W.; Yaghmur, A.; Larsen, C.; Ostergaard, J. Chromatographia 2013, 76, 49-57
43. Cilpa-Karhu, G.; Lipponen, K.; Samuelsson, J.; Oorni, K.; Fornstedt, T.; Riekkola, M. L. Anal. Biochem. 2013, 443, 139-147
44. Risley, J. M.; Soliman, L. C.; Donkor, K. K. Chromatographia 2013, 76, 1773-1777
45. Ruzicka, M.; Cizkova, M.; Jirasek, M.; Teply, F.; Koval, D.; Kasicka, V. J. Chromatogr., A 2014, 1349, 116-121
46. Escuder-Gilabert, L.; Martin-Biosca, Y.; Medina-Hernandez, M. J.; Sagrado, S. J. Chromatogr., A 2014, 1357, 2-23
47. Danel, C.; Azaroual, N.; Chavaria, C.; Odou, P.; Martel, B.; Vaccher, C. Carbohydr. Polym. 2013, 92, 2282-2292
48. Boonleang, J.; Stobaugh, J. F. Electrophoresis 2013, 34, 1232-1240
49. Darwish, K. A.; Mrestani, Y.; Neubert, R. H. H. Chromatographia 2013, 76, 1767-1771
50. Benes, M.; Zuskova, I.; Svobodova, J.; Gas, B. Electrophoresis 2012, 33, 1032-1039
51. Ostergaard, J.; Jensen, H.; Holm, R. J. Sep. Sci. 2012, 35, 2764-2772
52. Flaherty, R. J.; Nshime, B.; Delamarre, M.; Dejong, S.; Scott, P.; Lantz, A. W. Chemosphere 2013, 91, 912-920
53. Rauch, J. N.; Nie, J.; Buchholz, T. J.; Gestwicki, J. E.; Kennedy, R. T. Anal. Chem. 2013, 85, 9824-9831
54. Giovannoli, C.; Baggiani, C.; Passini, C.; Biagioli, F.; Anfossi, L.; Giraudi, G. Talanta 2012, 94, 65-69
55. Wang, J.; Jiang, P.; Qiu, L.; Wang, C.; Xia, J. Talanta 2013, 115, 394-400
56. Haselberg, R.; Oliveira, S.; van der Meel, R.; Somsen, G. W.; de Jong, G. J. Anal. Chim. Acta 2014, 818, 1-6
57. Sisavath, N.; Leclercq, L.; Le Saux, T.; Oukacine, F.; Cottet, H. J. Chromatogr., A 2013, 1289, 127-132
58. Sisavath, N.; Le Saux, T.; Leclercq, L.; Cottet, H. Langmuir 2014, 30, 4450-4457
59. Li, M.; Lei, L.; Jia, L.; Ling, X.; Zhang, J.; Zhao, Y.; Wang, K. Anal. Biochem. 2014, 449, 99-105
60. Clouthier, C. M.; Mironov, G. G.; Okhonin, V.; Berezovski, M. V.; Keillor, J. W. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2012, 51, 12464-12468
61. Zou, D.; Zhang, D.; Liu, S.; Zhao, B.; Wang, H. Anal. Chem. 2014, 86, 1775-1782
62. Lu, C.; Li, H.; Wang, H.; Liu, Z. Anal. Chem. 2013, 85, 2361-2369
63. Saito, S.; Massie, T. L.; Maeda, T.; Nakazumi, H.; Colyer, C. L. Anal. Chem. 2012, 84, 2452-2458
64. Guo, M.; He, L.; Strong, P. J.; Wang, H. Chemosphere 2014, 112, 472-480
65. Redweik, S.; Xu, Y.; Watzig, H. Electrophoresis 2012, 33, 3316-3322
66. Redweik, S.; Cianciulli, C.; Hara, M.; Xu, Y.; Watzig, H. Electrophoresis 2013, 34, 1812-1819
67. Ehala, S.; Toman, P.; Makrlik, E.; Rathore, R.; Kasicka, V. J. Solution Chem. 2012, 41, 1812-1824
68. Lu, N.; Yi, L.; Deng, Q.; Li, J.; Gao, Z.; Li, H. Toxicol. In Vitro 2012, 26, 732-735
69. Jia, Z.; Choi, D. S.; Chokshi, H. J. Pharm. Sci. 2013, 102, 960-966
70. Fukushima, E.; Yagi, Y.; Yamamoto, S.; Nakatani, Y.; Kakehi, K.; Hayakawa, T.; Suzuki, S. J. Chromatogr., A 2012, 1246, 84-89
71. Fukushima, Y.; Naito, T.; Sueyoshi, K.; Kubo, T.; Kitagawa, F.; Otsuka, K. Anal. Chem. 2014, 86, 5977-5982
72. Gao, C.; Sun, X.; Woolley, A. T. J. Chromatogr., A 2013, 1291, 92-96
73. Yakufu, P.; Qi, H.; Li, M.; Ling, X.; Chen, W.; Wang, Y. Electrophoresis 2013, 34, 531-540
74. Mesbah, K.; Verpillot, R.; de L'Escaille, F.; Falmagne, J. B.; Taverna, M. In Capillary Electrophoresis of Biomolecules; Volpi, N.; Maccari, F., Eds.; Humana Press: New York, 2013; pp 167-190.
75. de Jong, S.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2012, 84, 453-458
76. Liyanage, R.; Krylova, S. M.; Krylov, S. N. J. Chromatogr., A 2013, 1322, 90-96
77. de Jong, S.; Epelbaum, N.; Liyanage, R.; Krylov, S. N. Electrophoresis 2012, 33, 2584-2590
78. Liu, C.; Kang, J. J. Chromatogr., A 2012, 1238, 146-151
79. Bao, J.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2012, 84, 6944-6947
80. Vuignier, K.; Veuthey, J. L.; Carrupt, P. A.; Schappler, J. Electrophoresis 2012, 33, 3306-3315
81. Mironov, G. G.; Logie, J.; Okhonin, V.; Renaud, J. B.; Mayer, P. M.; Berezovski, M. V. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2012, 23, 1232-1240
82. Mironov, G. G.; Okhonin, V.; Khan, N.; Clouthier, C. M.; Berezovski, M. V. ChemistryOpen 2014, 3, 58-64
83. Sun, J.; He, B.; Liu, Q.; Ruan, T.; Jiang, G. Talanta 2012, 93, 239-244
84. Stern, J. C.; Foustoukos, D. I.; Sonke, J. E.; Salters, V. J. M. Chem. Geol. 2014, 363, 241-249
85. Krizek, T.; Kubickova, A.; Hladilkova, J.; Coufal, P.; Heyda, J.; Jungwirth, P. Electrophoresis 2014, 35, 617-624
86. Reminek, R.; Zeisbergerova, M.; Langmajerova, M.; Glatz, Z. Electrophoresis 2013, 34, 2705-2711
87. Okhonin, V.; Liu, X.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2005, 77, 5925-5929
88. Hruska, V.; Benes, M.; Svobodova, J.; Zuskova, I.; Gas, B. Electrophoresis 2012, 33, 938-947
89. Svobodova, J.; Benes, M.; Hruska, V.; Uselova, K.; Gas, B. Electrophoresis 2012, 33, 948-957
90. Svobodova, J.; Benes, M.; Dubsky, P.; Vigh, G.; Gas, B. Electrophoresis 2012, 33, 3012-3020
91. Dvorak, M.; Svobodova, J.; Benes, M.; Gas, B. Electrophoresis 2013, 34, 761-767
92. Cherney, L. T.; Krylov, S. N. Analyst 2012, 137, 1649-1655
93. Guidance for Industry: Bioanalytical Method Validation; Food and Drug Administration: Rockville, MD, 2001.
94. Guideline on Bioanalytical Method Validation; Committee for Medicinal Products for Human Use, 2011.
95. Maher, H. M. Biomed. Chromatogr. 2014, 28, 573-582
96. Tamizi, E.; Jouyban, A. Chromatographia 2014, 77, 1347-1357
97. Timerbaev, A. R.; Pawlak, K.; Aleksenko, S. S.; Foteeva, L. S.; Matczuk, M.; Jarosz, M. Talanta 2012, 102, 164-170
98. Musheev, M. U.; Kanoatov, M.; Krylov, S. N. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 8041-8046
99. Musheev, M. U.; Kanoatov, M.; Retif, C.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2013, 85, 10004-10007
100. Lipponen, K.; Tahka, S.; Samuelsson, J.; Jauhiainen, M.; Metso, J.; Cilpa-Karhu, G.; Fornstedt, T.; Kostiainen, M.; Riekkola, M. L. Anal. Bioanal. Chem. 2014, 406, 4137-4146
101. Cherney, L. T.; Kanoatov, M.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2011, 83, 8617-8622
102. Evenhuis, C. J.; Musheev, M. U.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2010, 82, 8398-8401
103. Evenhuis, C. J.; Musheev, M. U.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2011, 83, 1808-1814
104. Patel, K. H.; Evenhuis, C. J.; Cherney, L. T.; Krylov, S. N. Electrophoresis 2012, 33, 1079-1085
105. Sladkov, V. J. Chromatogr., A 2012, 1263, 189-193
106. Sladkov, V. J. Chromatogr., A 2013, 1289, 133-138
107. Sladkov, V. J. Chromatogr., A 2013, 1276, 120-125
108. Sladkov, V. J. Chem. Thermodyn. 2014, 71, 148-154
109. Holm, R.; Ostergaard, J.; Schonbeck, C.; Jensen, H.; Shi, W.; Peters, G. H.; Westh, P. J. Inclusion Phenom. Macrocyclic Chem. 2014, 78, 185-194
110. Abromeit, H.; Kannan, S.; Sippl, W.; Scriba, G. K. Electrophoresis 2012, 33, 1652-1659
111. Kanoatov, M.; Retif, C.; Cherney, L. T.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2012, 84, 149-154
112. Kanoatov, M.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2011, 83, 8041-8045
113. Bao, J.; Krylova, S. M.; Cherney, L. T.; LeBlanc, J. C.; Pribil, P.; Johnson, P. E.; Wilson, D. J.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2014, 86, 10016-10020