Real-time monitoring of protein conformational dynamics in solution using kinetic capillary electrophoresis

Angewandte Chemie - International Edition

Volumn 51, Issue 50, 2012, Pages 12464-12468

  Clouthier, Christopher M ^a   Mironov, Gleb G ^a   Okhonin, Victor ^a   Berezovski, Maxim V ^a   Keillor, Jeffrey W ^a  

^a UNIVERSITY OF OTTAWA   (Canada)

Author keywords

allosteric regulation; capillary electrophoresis; conformational analysis; proteins

Indexed keywords

ALLOSTERIC REGULATION; CONFORMATIONAL ANALYSIS; CONFORMATIONAL CHANGE; CONFORMATIONAL DYNAMICS; ELECTROPHEROGRAMS; KINETIC ANALYSIS; KINETIC CAPILLARY ELECTROPHORESIS; LIGAND BINDING; RAPID SEPARATION; REAL TIME MONITORING; THERMODYNAMIC CONSTANTS;

KINETICS; LIGANDS; PROTEINS;

CAPILLARY ELECTROPHORESIS;

CALCIUM; GUANINE NUCLEOTIDE BINDING PROTEIN; GUANOSINE DIPHOSPHATE; LIGAND; PROTEIN; PROTEIN GLUTAMINE GAMMA GLUTAMYLTRANSFERASE; PROTEIN GLUTAMINE GAMMA GLUTAMYLTRANSFERASE 2;

ALLOSTERISM; ARTICLE; CAPILLARY ELECTROPHORESIS; CHEMISTRY; HUMAN; KINETICS; METABOLISM; PROTEIN TERTIARY STRUCTURE; SOLUTION AND SOLUBILITY; THERMODYNAMICS;

ALLOSTERIC REGULATION; CALCIUM; ELECTROPHORESIS, CAPILLARY; GTP-BINDING PROTEINS; GUANOSINE DIPHOSPHATE; HUMANS; KINETICS; LIGANDS; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; PROTEINS; SOLUTIONS; THERMODYNAMICS; TRANSGLUTAMINASES;

EID: 84870578970     PISSN: 14337851     EISSN: 15213773     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/anie.201205575     Document Type: Article

References (41)

1. K. Arora, C. L. Brooks 3rd, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 18496.
2. N. Haspel, M. Moll, M. L. Baker, W. Chiu, L. E. Kavraki, BMC Struct. Biol. 2010, 10 Suppl 1, S 1.
3. D. D. Boehr, H. J. Dyson, P. E. Wright, Chem. Rev. 2006, 106, 3055.
4. D. D. Boehr, D. McElheny, H. J. Dyson, P. E. Wright, Science 2006, 313, 1638.
5. D. D. Boehr, R. Nussinov, P. E. Wright, Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 789.
6. G. E. Fanucci, D. S. Cafiso, Curr. Opin. Struct. Biol. 2006, 16, 644.
7. B. J. Grant, A. A. Gorfe, J. A. McCammon, Curr. Opin. Struct. Biol. 2010, 20, 142.
8. Y. Imamoto, H. Kamikubo, M. Harigai, N. Shimizu, M. Kataoka, Biochemistry 2002, 41, 13595.
9. D. Kajihara, R. Abe, I. Iijima, C. Komiyama, M. Sisido, T. Hohsaka, Nat. Methods 2006, 3, 923.
10. M. Taraban, H. Zhan, A. E. Whitten, D. B. Langley, K. S. Matthews, L. Swint-Kruse, J. Trewhella, J. Mol. Biol. 2008, 376, 466.
11. M. Berezovski, S. N. Krylov, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 13674.
12. A. Petrov, V. Okhonin, M. Berezovski, S. N. Krylov, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 17104.
13. B. J. de Kort, G. J. de Jong, G. W. Somsen, Electrophoresis 2010, 31, 2861.
14. B. J. de Kort, G. A. ten Kate, G. J. de Jong, G. W. Somsen, Anal. Chem. 2011, 83, 6060.
15. G. E. Begg, L. Carrington, P. H. Stokes, J. M. Matthews, M. A. Wouters, A. Husain, L. Lorand, S. E. Iismaa, R. M. Graham, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006, 103, 19683.
16. G. E. Begg, S. R. Holman, P. H. Stokes, J. M. Matthews, R. M. Graham, S. E. Iismaa, J. Biol. Chem. 2006, 281, 12603.
17. A. Di Venere, A. Rossi, F. De Matteis, N. Rosato, A. F. Agro, G. Mei, J. Biol. Chem. 2000, 275, 3915.
18. G. Colak, J. W. Keillor, G. V. Johnson, PLOS One 2011, 6, e 16665.
19. M. Griffin, R. Casadio, C. M. Bergamini, Biochem. J. 2002, 368, 377.
20. S. Gundemir, G. Colak, J. Tucholski, G. V. Johnson, Biochim. Biophys. Acta Mol. Cell Res. 2012, 1823, 406.
21. L. Lorand, R. M. Graham, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2003, 4, 140.
22. P. G. Mastroberardino, M. Piacentini, J. Intern. Med. 2010, 268, 419.
23. L. Munsie, N. Caron, R. S. Atwal, I. Marsden, E. J. Wild, J. R. Bamburg, S. J. Tabrizi, R. Truant, Hum. Mol. Genet. 2011, 20, 1937.
24. M. A. Norlund, J. M. Lee, G. M. Zainelli, N. A. Muma, Brain Res. 1999, 851, 154.
25. D. J. Selkoe, C. Abraham, Y. Ihara, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1982, 79, 6070.
26. J. L. Piper, G. M. Gray, C. Khosla, Biochemistry 2002, 41, 386.
27. A. Chhabra, A. Verma, K. Mehta, Anticancer Res. 2009, 29, 1909.
28. K. Choi, M. Siegel, J. L. Piper, L. Yuan, E. Cho, P. Strnad, B. Omary, K. M. Rich, C. Khosla, Chem. Biol. 2005, 12, 469.
29. K. Mehta, Amino Acids 2009, 36, 709.
30. D. M. Pinkas, P. Strop, A. T. Brunger, C. Khosla, PLOS Biol. 2007, 5, e 327.
31. P. Mariani, F. Carsughi, F. Spinozzi, S. Romanzetti, G. Meier, R. Casadio, C. M. Bergamini, Biophys. J. 2000, 78, 3240.
32. C. Pardin, I. Roy, R. A. Chica, E. Bonneil, P. Thibault, W. D. Lubell, J. N. Pelletier, J. W. Keillor, Biochemistry 2009, 48, 3346.
33. G. G. Mironov, V. Okhonin, S. I. Gorelsky, M. V. Berezovski, Anal. Chem. 2011, 83, 2364.
34. Y. H. Chu, L. Z. Avila, H. A. Biebuyck, G. M. Whitesides, J. Med. Chem. 1992, 35, 2915.
35. S. Liu, R. A. Cerione, J. Clardy, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002, 99, 2743.
36. J. W. Keillor, R. A. Chica, N. Chabot, V. Vinci, C. Pardin, E. Fortin, S. M. F. G. Gillet, Y. Nakano, M. T. Kaartinen, J. P. Pelletier, W. D. Lubell, Can. J. Chem. 2008, 86, 271.
37. N. S. Caron, L. N. Munsie, J. W. Keillor, R. Truant, PLOS One 2012, 7, e 44159.
38. M. S. Pavlyukov, N. V. Antipova, M. V. Balashova, M. I. Shakhparonov, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2012, 421, 773.
39. R. Király, E. Csosz, T. Kurtan, S. Antus, K. Szigeti, Z. Simon-Vecsei, I. R. Korponay-Szabo, Z. Keresztessy, L. Fesus, FEBS J. 2009, 276, 7083.
40. H. Lortat-Jacob, I. Burhan, A. Scarpellini, A. Thomas, A. Imberty, R. R. Vives, T. Johnson, A. Gutierrez, E. A. M. Verderio, J. Biol. Chem. 2012, 287, 18005.
41. V. Okhonin, M. V. Berezovski, S. N. Krylov, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 7062.