A new ion mobility-linear ion trap instrument for complex mixture analysis

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 16, 2014, Pages 8121-8128

  Donohoe, Gregory C ^a   Maleki, Hossein ^a   Arndt, James R ^a   Khakinejad, Mahdiar ^a   Yi, Jinghai ^b   McBride, Carroll ^b   Nurkiewicz, Timothy R ^b   Valentine, Stephen J ^a  

^a WEST VIRGINIA UNIVERSITY   (United States)

^b WEST VIRGINIA UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DISSOCIATION; DRIFT CHAMBERS; MASS SPECTROMETRY; MIXTURES; MOLECULAR BIOLOGY; PHASE SEPARATION; PIXELS; TUBES (COMPONENTS);

COLLISION-INDUCED DISSOCIATION; COMPLEX MIXTURE ANALYSIS; ELECTRON-TRANSFER DISSOCIATION; GAS-PHASE SEPARATIONS; HIGH REPRODUCIBILITY; ION MOBILITY SPECTROMETRY; ION TRAP INSTRUMENTS; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

IONS;

EID: 84906240810     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac501527y     Document Type: Article

References (71)

1. Valentine, S. J.; Counterman, A. E.; Hoaglund, C. S.; Reilly, J. P.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1998, 9, 1213-1216
2. Gillig, K. J.; Ruotolo, B.; Stone, E. G.; Russell, D. H.; Fuhrer, K.; Gonin, M.; Schultz, A. J. Anal. Chem. 2000, 72, 3965-3971
3. Ruotolo, B. T.; Gillig, K. J.; Stone, E. G.; Russell, D. H. J. Chromatogr. B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2002, 782, 385-392
4. Wu, C.; Siems, W. F.; Klasmeier, J.; Hill, H. H., Jr. Anal. Chem. 2000, 72, 391-395
5. Clowers, B. H.; Dwivedi, P.; Steiner, W. E.; Hill, H. H.; Bendiak, B. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005, 16, 660-669
6. McLean, J. A.; Ruotolo, B. T.; Gillig, K. J.; Russell, D. H. Int. J. Mass Spectrom. 2005, 240, 301-315
7. Valentine, S. J.; Plasencia, M. D.; Liu, X.; Krishnan, M.; Naylor, S.; Udseth, H. R.; Smith, R. D.; Clemmer, D. E. J. Proteome Res. 2006, 5, 2977-2984
8. Becker, C.; Fernandez-Lima, F. A.; Russell, D. H. Spectroscopy 2009, 24, 38-42
9. Dwivedi, P.; Wu, P.; Klopsch, S. J.; Puzon, G. J.; Xun, L.; Hill, H. H. Metabolomics 2008, 4, 63-80
10. Isailovic, D.; Kurulugama, R. T.; Plasencia, M. D.; Stokes, S. T.; Kyselova, Z.; Goldman, R.; Mechref, Y.; Novotny, M. V.; Clemmer, D. E. J. Proteome Res. 2008, 7, 1109-1117
11. McLean, J. A. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2009, 20, 1775-1781
12. Kliman, M.; May, J. C.; McLean, J. A. Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Biol. Lipids 2011, 1811, 935-945
13. Baker, E. S.; Clowers, B. H.; Li, F.; Tang, K.; Tolmachev, A. V.; Prior, D. C.; Belov, M. E.; Smith, R. D. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 1176-1187
14. Dwivedi, P.; Schultz, A. J.; Hill, H. H. Int. J. Mass Spectrom. 2010, 298, 78-90
15. Zinnel, N. F.; Pai, P. J.; Russell, D. H. Anal. Chem. 2012, 84, 3390-3397
16. Counterman, A. E.; Hilderbrand, A. E.; Barnes, C. A. S.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2001, 12, 1020-1035
17. Kurulugama, R. T. I. K; Taylor, L. Agilent Technologies, 2014.
18. Hernandez, D. R.; DeBord, J. D.; Ridgeway, M. E.; Kaplan, D. A.; Park, M. A.; Fernandez-Lima, F. Analyst 2014, 139, 1913-1921
19. Waters, 2014.
20. Steiner, W. E.; Clowers, B. H.; English, W. A.; Hill, H. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2004, 18, 882-888
21. Hoaglund, C. S.; Valentine, S. J.; Sporleder, C. R.; Reilly, J. P.; Clemmer, D. E. Anal. Chem. 1998, 70, 2236-2242
22. Scheubert, K.; Hufsky, F.; Rasche, F.; Bocker, S. J. Comput. Biol. 2011, 18, 1383-1397
23. Cao, M.; Fraser, K.; Rasmussen, S. Metabolites 2013, 3, 1036-1050
24. Prien, J. M.; Ashline, D. J.; Lapadula, A. J.; Zhang, H.; Reinhold, V. N. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2009, 20, 539-556
25. Jiao, J.; Zhang, H.; Reinhold, V. N. Int. J. Mass Spectrom. 2011, 303, 109-117
26. Bluhm, B. K.; Gillig, K. J.; Russell, D. H. Rev. Sci. Instrum. 2000, 71, 4078-4086
27. Clowers, B. H.; Hill, H. H. Anal. Chem. 2005, 77, 5877-5885
28. Tang, X.; Bruce, J. E.; Hill, H. H., Jr. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2007, 21, 1115-1122
29. Zucker, S. M.; Lee, S.; Webber, N.; Valentine, S. J.; Reilly, J. P.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 1477-1485
30. Li, H. L.; Bendiak, B.; Siems, W. F.; Gang, D. R.; Hill, H. H. Anal. Chem. 2013, 85, 2760-2769
31. Knorr, F. J.; Eatherton, R. L.; Siems, W. F.; Hill, H. H. Anal. Chem. 1985, 57, 402-406
32. Clowers, B. H.; Siems, W. F.; Hill, H. H.; Massick, S. M. Anal. Chem. 2006, 78, 44-51
33. Szumlas, A. W.; Ray, S. J.; Hieftje, G. M. Anal. Chem. 2006, 78, 4474-4481
34. Tang, K.; Shvartsburg, A. A.; Lee, H. N.; Prior, D. C.; Buschbach, M. A.; Li, F. M.; Tolmachev, A. V.; Anderson, G. A.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2005, 77, 3330-3339
35. Koeniger, S. L.; Merenbloom, S. I.; Valentine, S. J.; Jarrold, M. F.; Udseth, H. R.; Smith, R. D.; Clemmer, D. E. Anal. Chem. 2006, 78, 4161-4174
36. Valentine, S. J.; Koeniger, S. L.; Clemmer, D. E. Anal. Chem. 2003, 75, 6202-6208
37. Koeniger, S. L.; Valentine, S. J.; Myung, S.; Plasencia, M.; Lee, Y. J.; Clemmer, D. E. J. Proteome Res. 2005, 4, 25-35
38. Merenbloom, S. I.; Koeniger, S. L.; Valentine, S. J.; Plasencia, M. D.; Clemmer, D. E. Anal. Chem. 2006, 78, 2802-2809
39. Syka, J. E. P.; Coon, J. J.; Schroeder, M. J.; Shabanowitz, J.; Hunt, D. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 9528-9533
40. Beausoleil, S. A.; Jedrychowski, M.; Schwartz, D.; Elias, J. E.; Villen, J.; Li, J.; Cohn, M. A.; Cantley, L. C.; Gygi, S. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004, 101, 12130-12135
41. Schroeder, M. J.; Shabanowitz, J.; Schwartz, J. C.; Hunt, D. F.; Coon, J. J. Anal. Chem. 2004, 76, 3590-3598
42. Lee, S.; Li, Z. Y.; Valentine, S. J.; Zucker, S. M.; Webber, N.; Reilly, J. P.; Clemmer, D. E. Int. J. Mass Spectrom. 2012, 309, 154-160
43. Hoadlund-Hyzer, C. S.; Li, J. W.; Clemmer, D. E. Anal. Chem. 2000, 72, 2737-2740
44. Stone, E.; Gillig, K. J.; Ruotolo, B.; Fuhrer, K.; Gonin, M.; Schultz, A.; Russell, D. H. Anal. Chem. 2001, 73, 2233-2238
45. Nurkiewicz, T.; Porter, D.; Hubbs, A.; Cumpston, J.; Chen, B.; Frazer, D.; Castranova, V. Part. Fibre Toxicol. 2008, 5, 1
46. Knuckles, T. L.; Yi, J. H.; Frazer, D. G.; Leonard, H. D.; Chen, B. T.; Castranova, V.; Nurkiewicz, T. R. Nanotoxicology 2012, 6, 724-735
47. Revercomb, H. E.; Mason, E. A. Anal. Chem. 1975, 47, 970-983
48. Shvartsburg, A. A.; Jarrold, M. F. Chem. Phys. Lett. 1996, 261, 86-91
49. Mesleh, M. F.; Hunter, J. M.; Shvartsburg, A. A.; Schatz, G. C.; Jarrold, M. F. J. Phys. Chem. 1996, 100, 16082-16086
50. Wyttenbach, T.; vonHelden, G.; Batka, J. J.; Carlat, D.; Bowers, M. T. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1997, 8, 275-282
51. Wittmer, D.; Luckenbill, B. K.; Hill, H. H.; Chen, Y. H. Anal. Chem. 1994, 66, 2348-2355
52. Clemmer, D. E.; Hudgins, R. R.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10141-10142
53. von Helden, G.; Wyttenbach, T.; Bowers, M. T. Science 1995, 267, 1483-1485
54. Hoaglund-Hyzer, C. S.; Clemmer, D. E. Anal. Chem. 2001, 73, 177-184
55. Merenbloom, S. I.; Glaskin, R. S.; Henson, Z. B.; Clemmer, D. E. Anal. Chem. 2009, 81, 1482-1487
56. Kurulugama, R. T.; Nachtigall, F. M.; Lee, S.; Valentine, S. J.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2009, 20, 729-737
57. Blase, R. C.; Silveira, J. A.; Gillig, K. J.; Gamage, C. M.; Russell, D. H. Int. J. Mass Spectrom. 2011, 301, 166-173
58. Stlouis, R. H.; Hill, H. H. Crit. Rev. Anal. Chem. 1990, 21, 321-355
59. Clemmer, D. E.; Jarrold, M. F. J. Mass Spectrom. 1997, 32, 577-592
60. Collins, D. C.; Lee, M. L. Anal. Bioanal. Chem. 2002, 372, 66-73
61. Bohrer, B. C.; Mererbloom, S. I.; Koeniger, S. L.; Hilderbrand, A. E.; Clemmer, D. E. Annu. Rev. Anal. Chem. 2008, 293-327
62. Shaffer, S. A.; Tang, K. Q.; Anderson, G. A.; Prior, D. C.; Udseth, H. R.; Smith, R. D. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1997, 11, 1813-1817
63. Kurulugama, R. T.; Valentine, S. J.; Sowell, R. A.; Clemmer, D. E. Journal of Proteomics 2008, 71, 318-331
64. Ruotolo, B. T.; Verbeck, G. F. t.; Thomson, L. M.; Woods, A. S.; Gillig, K. J.; Russell, D. H. J. Proteome Res. 2002, 1, 303-306
65. Ruotolo, B. T.; Gillig, K. J.; Woods, A. S.; Egan, T. F.; Ugarov, M. V.; Schultz, J. A.; Russell, D. H. Anal. Chem. 2004, 76, 6727-6733
66. Palumbo, A. M.; Tepe, J. J.; Reid, G. E. J. Proteome Res. 2008, 7, 771-779
67. Palumbo, A. M.; Smith, S. A.; Kalcic, C. L.; Dantus, M.; Stemmer, P. M.; Reid, G. E. Mass Spectrom Rev. 2011, 30, 600-625
68. Wishart, D. S.; Jewison, T.; Guo, A. C.; Wilson, M.; Knox, C.; Liu, Y. F.; Djoumbou, Y.; Mandal, R.; Aziat, F.; Dong, E.; Bouatra, S.; Sinelnikov, I.; Arndt, D.; Xia, J. G.; Liu, P.; Yallou, F.; Bjorndahl, T.; Perez-Pineiro, R.; Eisner, R.; Allen, F.; Neveu, V.; Greiner, R.; Scalbert, A. Nucleic Acids Res. 2013, 41, D801-D807
69. Fang, N.; Yu, S.; Badger, T. M. J. Agric. Food Chem. 2003, 51, 6676-6682
70. Barroso, B.; Bischoff, R. J. Chromatogr., B 2005, 814, 21-28
71. Liu, X. Y.; Valentine, S. J.; Plasencia, M. D.; Trimpin, S.; Naylor, S.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 1249-1264