X-ray crystallographic structures of trimers and higher-order oligomeric assemblies of a peptide derived from Aβ17-36

Journal of the American Chemical Society

Volumn 136, Issue 15, 2014, Pages 5595-5598

  Spencer, Ryan K ^a   Li, Hao ^a   Nowick, James S ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PEPTIDES; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

ALZHEIMER'S DISEASE; CAVITY FORM; HIGHER-ORDER; NEURODEGENERATION; TETRAHEDRAL ARRANGEMENT; TRIANGULAR ARRANGEMENTS; WORKING MODELS; X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURES;

OLIGOMERS;

AMYLOID BETA PROTEIN; BIOPOLYMER; PEPTIDE;

CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; PROTEIN CONFORMATION; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

AMYLOID BETA-PEPTIDES; BIOPOLYMERS; CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; MODELS, MOLECULAR; PEPTIDES; PROTEIN CONFORMATION;

EID: 84898947037     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja5017409     Document Type: Article

References (38)

1. Lambert, M. P.; Barlow, A. K.; Chromy, B. A.; Edwards, C.; Freed, R.; Liosatos, M.; Morgan, T. E.; Rozovsky, I.; Trommer, B.; Viola, K. L.; Wals, P.; Zhang, C.; Finch, C. E.; Krafft, G. A.; Klein, W. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 6448
2. Selkoe, D. J. Science 2002, 298, 789
3. Nagele, R. G.; D'Andrea, M. R.; Anderson, W. J.; Wang, H. Y. Neuroscience 2002, 110, 199
4. Walsh, D. M.; Klyubin, I.; Fadeeva, J. V.; Cullen, W. K.; Anwyl, R.; Wolfe, M. S.; Rowan, M. J.; Selkoe, D. J. Nature 2002, 416, 535
5. Kayed, R.; Head, E.; Thompson, J. L.; McIntire, T. M.; Milton, S. C.; Cotman, C. W.; Glabe, C. G. Science 2003, 300, 486
6. Lesné, S.; Koh, M. T.; Kotilinek, L.; Kayed, R.; Glabe, C. G.; Yang, A.; Gallagher, M.; Ashe, K. H. Nature 2006, 440, 352
7. Townsend, M.; Shankar, G. M.; Mehta, T.; Walsh, D. M.; Selkoe, D. J. J. Physiol. 2006, 572, 477
8. Haass, C.; Selkoe, D. J. Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 2007, 8, 101
9. Shankar, G. M.; Li, S. M.; Mehta, T. H.; Garcia-Munoz, A.; Shepardson, N. E.; Smith, I.; Brett, F. M.; Farrell, M. A.; Rowan, M. J.; Lemere, C. A.; Regan, C. M.; Walsh, D. M.; Sabatini, B. L.; Selkoe, D. J. Nat. Med. 2008, 14, 837
10. Zhao, W.-Q.; De Felice, F. G.; Fernandez, S.; Chen, H.; Lambert, M. P.; Quon, M. J.; Krafft, G. A.; Klein, W. L. FASEB J. 2008, 22, 246
11. Querfurth, H. W.; LaFerla, F. M. N. Engl. J. Med. 2010, 362, 329
12. Fändrich, M. J. Mol. Biol. 2012, 421, 427
13. Thirumalai, D.; Klimov, D. K.; Dima, R. I. Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 146
14. Liu, R.; McAllister, C.; Lyubchenko, Y.; Sierks, M. R. J. Neurosci. Res. 2004, 75, 162
15. Hoyer, W.; Gronwall, C.; Jonsson, A.; Stahl, S.; Härd, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 5099
16. Sandberg, A.; Luheshi, L. M.; Söllvander, S.; Pereira de Barros, T.; Macao, B.; Knowles, T. P.; Biverstål, H.; Lendel, C.; Ekholm-Petterson, F.; Dubnovitsky, A.; Lannfelt, L.; Dobson, C. M.; Härd, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 15595
17. Yu, L.; Edalji, R.; Harlan, J. E.; Holzman, T. F.; Lopez, A. P.; Labkovsky, B.; Hillen, H.; Barghorn, S.; Ebert, U.; Richardson, P. L.; Miesbauer, L.; Solomon, L.; Bartley, D.; Walter, K.; Johnson, R. W.; Hajduk, P. J.; Olejniczak, E. T. Biochemistry 2009, 48, 1870
18. Cerf, E.; Sarroukh, R.; Tamamizu-Kato, S.; Breydo, L.; Derclaye, S.; Dufrêne, Y. F.; Narayanaswami, V.; Goormaghtigh, E.; Ruysschaert, J. M.; Raussens, V. Biochem. J. 2009, 421, 415
19. Lührs, T.; Ritter, C.; Adrian, M.; Riek-Loher, D.; Bohrmann, B.; Döbeli, H.; Schubert, D.; Riek, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 17342
20. Petkova, A. T.; Yau, W.-M.; Tycko, R. Biochemistry 2006, 45, 498
21. Lu, J.-X.; Qiang, W.; Yau, W.-M.; Schwieters, C. D.; Meredith, S. C.; Tycko, R. Cell 2013, 154, 1257
22. Nelson, R.; Sawaya, M. R.; Balbirnie, M.; Madsen, A. Ø.; Riekel, C.; Grothe, R.; Eisenberg, D. Nature 2005, 435, 773
23. Sawaya, M. R.; Sambashivan, S.; Nelson, R.; Ivanova, M. I.; Sievers, S. A.; Apostol, M. I.; Thompson, M. J.; Balbirnie, M.; Wiltzius, J. J.; McFarlane, H. T.; Madsen, A. Ø.; Riekel, C.; Eisenberg, D. Nature 2007, 447, 453
24. Laganowsky, A.; Liu, C.; Sawaya, M. R.; Whitelegge, J. P.; Park, J.; Zhao, M.; Pensalfini, A.; Soriaga, A. B.; Landau, M.; Teng, P. K.; Cascio, D.; Glabe, C.; Eisenberg, D. Science 2012, 335, 1228
25. Liu, C.; Sawaya, M. R.; Cheng, P.-N.; Zheng, J.; Nowick, J. S.; Eisenberg, D. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 6736
26. Liu, C.; Zhao, M.; Jiang, L.; Cheng, P.-N.; Park, J.; Sawaya, M. R.; Pensalfini, A.; Gou, D.; Berk, A. J.; Glabe, C. G.; Nowick, J. S.; Eisenberg, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 20913
27. Cheng, P.-N.; Pham, J. D.; Nowick, J. S. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 5477
28. Pham, J. D.; Chim, N.; Goulding, C. W.; Nowick, J. S. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 12460
29. Streltsov, V. A.; Varghese, J. N.; Masters, C. L.; Nuttall, S. D. J. Neurosci. 2011, 31, 1419
30. Apostol, M. I.; Perry, K.; Surewicz, W. K. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 10202
31. Spencer, R.; Chen, K. H.; Manuel, G.; Nowick, J. S. Eur. J. Org. Chem. 2013, 3523
32. Kabsch, W. Acta Crystallogr., D: Biol. Crystallogr. 2010, 66, 125
33. Adams, P. D.; Afonine, P. V.; Bunkoczi, G.; Chen, V. B.; Davis, I. W.; Echols, N.; Headd, J. J.; Hung, L. W.; Kapral, G. J.; Grosse-Kunstleve, R. W.; McCoy, A. J.; Moriarty, N. W.; Oeffner, R.; Read, R. J.; Richardson, D. C.; Richardson, J. S.; Terwilliger, T. C.; Zwart, P. H. Acta Crystallogr., D: Biol. Crystallogr. 2010, 66, 213
34. Twisted two-stranded β-hairpins - termed β-ribbons - are common in protein structure. For details, see: Richardson, J. S. Adv. Protein Chem. 1981, 34, 167
35. Tanaka, H.; Chiba, H.; Inokoshi, J.; Kuno, A.; Sugai, T.; Takahashi, A.; Ito, Y.; Tsunoda, M.; Suzuki, K.; Takénaka, A.; Sekiguchi, T.; Umeyama, H.; Hirabayashi, J.; Ōmura, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 15633
36. Suzuki, K.; Tsunoda, M.; Hoque, M. M.; Zhang, F.; Jiang, J.; Zhang, X.; Ohbayashi, N.; Tanaka, H.; Takénaka, A. Acta Crystallogr., D: Biol. Crystallogr. 2013, 69, 1818
37. Sugita, Y.; Okamoto, Y. Chem. Phys. Lett. 1999, 314, 141
38. Phillips, J. C.; Braun, R.; Wang, W.; Gumbart, J.; Tajkhorshid, E.; Villa, E.; Chipot, C.; Skeel, R. D.; Kalé, L.; Schulten, K. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1781