Diversity, abundance and natural products of marine sponge-associated actinomycetes

Natural Product Reports

Volumn 31, Issue 3, 2014, Pages 381-399

  Abdelmohsen, Usama Ramadan ^a,b   Bayer, Kristina ^a   Hentschel, Ute ^a  

^a UNIVERSITY OF WÜRZBURG   (Germany)

^b Minia University   (Egypt)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL PRODUCT;

ACTINOBACTERIA; ANIMAL; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ISOLATION AND PURIFICATION; MARINE BIOLOGY; MICROBIOLOGY; REVIEW; SPONGE (PORIFERA);

ACTINOBACTERIA; ANIMALS; BIOLOGICAL PRODUCTS; MARINE BIOLOGY; MOLECULAR STRUCTURE; PORIFERA;

EID: 84893928918     PISSN: 02650568     EISSN: 14604752     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3np70111e     Document Type: Review

References (143)

1. N. Lane Nature 2008 453 583 585
2. J. W. Li J. C. Vederas Science 2009 325 161 165
3. M. E. Rateb R. Ebel Nat. Prod. Rep. 2011 28 290 344
4. U. Hentschel J. Piel S. M. Degnan M. W. Taylor Nat. Rev. Microbiol. 2012 10 641 654
5. S. Schmitt P. Tsai J. Bell J. Fromont M. Ilan N. Lindquist T. Perez A. Rodrigo P. J. Schupp J. Vacelet N. Webster U. Hentschel M. W. Taylor ISME J. 2012 6 564 576
6. J. J. Bell Estuarine, Coastal Shelf Sci. 2008 79 341 353
7. M. Wehrl M. Steinert U. Hentschel Microb. Ecol. 2007 53 355 365
8. R. W. Thacker C. J. Freeman Adv. Mar. Biol. 2012 62 57 111
9. N. S. Webster H. M. Luter R. M. Soo E. S. Botte R. L. Simister D. Abdo S. Whalan Front. Microbiol. 2013 3 444 454
10. U. Hentschel K. M. Usher M. W. Taylor FEMS Microbiol. Ecol. 2006 55 167 177
11. R. L. Simister P. Deines E. S. Botte N. S. Webster M. W. Taylor Environ. Microbiol. 2012 14 517 524
12. M. W. Taylor R. Radax D. Steger M. Wagner Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2007 71 295 347
13. U. Hentschel J. Piel S. M. Degnan M. W. Taylor Nature 2012 10 641 654
14. K. Bayer S. Schmitt U. Hentschel Environ. Microbiol. 2008 10 2942 2955
15. R. T. Hill, in Microbial diversity and bioprospecting, ed., A. T. Bull, ASM Press, Washington D.C. 2004, pp. 177-190
16. N. S. Webster M. W. Taylor Environ. Microbiol. 2012 14 335 346
17. M. W. Taylor P. J. Schupp H. J. Baillie T. S. Charlton R. de Nys S. Kjelleberg P. D. Steinberg Appl. Environ. Microbiol. 2004 70 4387 4389
18. R. T. Hill, M. Hamann, O. Peraud and N. Kasanah, 2005, Patent 20050244938A20050244931
19. P. Proksch A. Putz S. Ortlepp J. Kjer M. Bayer Phytochem. Rev. 2010 9 475 489
20. M. C. Wilson, T. Mori, C. Rückert, A. R. Uria, M. J. Helf, K. Takada, C. Gernert, U. A. E. Steffens, N. Heycke, S. Schmitt et al., Nature, 2004 10.1038/nature12959
21. P. Flatt J. Gautschi R. Thacker M. Musafija-Girt P. Crews W. Gerwick Mar. Biol. 2005 147 761 774
22. M. F. Freeman C. Gurgui M. J. Helf B. I. Morinaka A. R. Uria N. J. Oldham H. G. Sahl S. Matsunaga J. Piel Science 2012 338 387 390
23. J. Piel Nat. Prod. Rep. 2004 21 519 538
24. A. Grein S. P. Meyers J. Bacteriol. 1958 76 457 463
25. H. Weyland Nature 1969 223 858
26. E. Helmke H. Weyland Int. J. Syst. Bacteriol. 1984 34 127 138
27. M. A. Moran L. T. Rutherford R. E. Hodson Appl. Environ. Microbiol. 1995 61 3695 3700
28. P. R. Jensen R. Dwight W. Fenical Appl. Environ. Microbiol. 1991 57 1102 1108
29. L. M. Zhang L. J. Xi J. S. Ruan Y. Huang Syst. Appl. Microbiol. 2012 35 81 85
30. A. Becerril-Espinosa K. C. Freel P. R. Jensen I. E. Soria-Mercado Antonie van Leeuwenhoek 2012 3 809 819
31. J. Xiao Y. X. Luo J. Xu J. Bacteriol. 2011 193 6413 6413
32. W. Sun C. S. Peng Y. Y. Zhao Z. Y. Li PLoS One 2012 7 42847 42857
33. U. R. Abdelmohsen S. M. Pimentel-Elardo A. Hanora M. Radwan S. H. Abou-El-Ela S. Ahmed U. Hentschel Mar. Drugs 2010 8 399 412
34. T. P. Wyche Y. P. Hou E. Vazquez-Rivera D. Braun T. S. Bugni J. Nat. Prod. 2012 75 735 740
35. A. T. Bull J. E. Stach A. C. Ward M. Goodfellow Antonie van Leeuwenhoek 2005 87 65 79
36. U. Hentschel L. Fieseler M. Wehrl C. Gernert M. Steinert J. Hacker M. Horn Prog. Mol. Subcell. Biol. 2003 37 59 88
37. J. Selvin A. S. Ninawe G. S. Kiran A. P. Lipton Crit. Rev. Microbiol. 2010 36 82 90
38. H. Zhang Y. K. Lee W. Zhang H. K. Lee Antonie van Leeuwenhoek 2006 90 159 169
39. V. V. Bultel-Ponce C. Debitus J. P. Berge C. Cerceau M. Guyot J. Mar. Biotechnol. 1998 6 233 236
40. S. Lang W. Beil H. Tokuda C. Wicke V. Lurtz Mar. Biotechnol. 2004 6 152 156
41. I. Letunic P. Bork Nucleic Acids Res. 2011 39 W475 W478
42. K. Supong C. Suriyachadkun K. Suwanborirux P. Pittayakhajonwut C. Thawai Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2013 63 3970 3974
43. E. E. Hames-Kocabas A. Uzel J. Microbiol. Methods 2012 88 342 347
44. K. Supong C. Suriyachadkun P. Pittayakhajonwut K. Suwanborirux C. Thawai J. Antibiot. 2013 66 505 509
45. H. C. Kwon C. A. Kauffman P. R. Jensen W. Fenical J. Am. Chem. Soc. 2006 128 1622 1632
46. L. A. Maldonado W. Fenical P. R. Jensen C. A. Kauffman T. J. Mincer A. C. Ward A. T. Bull M. Goodfellow Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005 55 1759 1766
47. T. K. Kim M. J. Garson J. A. Fuerst Environ. Microbiol. 2005 7 509 518
48. S. M. Pimentel-Elardo M. Scheuermayer S. Kozytska U. Hentschel Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009 59 1433 1437
49. S. M. Pimentel-Elardo L. P. Tiro L. Grozdanov U. Hentschel Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 58 628 632
50. L. M. Zhang L. J. Xi J. S. Ruan Y. Huang Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2012 62 272 278
51. J. B. Olson D. K. Harmody A. K. Bej P. J. McCarthy Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007 57 1478 1481
52. S. T. Khan T. Tamura M. Takagi K. Shin-Ya Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2010 60 2775 2779
53. T. Kaeberlein K. Lewis S. S. Epstein Science 2002 296 1127 1129
54. M. Takizawa R. R. Colwell R. T. Hill Appl. Environ. Microbiol. 1993 59 997 1002
55. H. Bredholdt O. A. Galatenko K. Engelhardt E. Fjaervik L. P. Terekhova S. B. Zotchev Environ. Microbiol. 2007 9 2756 2764
56. N. S. Webster K. J. Wilson L. L. Blackall R. T. Hill Appl. Environ. Microbiol. 2001 67 434 444
57. J. B. Olson C. C. Lord P. J. McCarthy Microb. Ecol. 2000 40 139 147
58. P. Kämpfer S. P. Glaeser H.-J. Busse U. R. Abdelmohsen U. Hentschel Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2013 10.1099/ijs.0.055152-0
59. S. Jiang X. Li L. Zhang W. Sun S. Dai L. Xie Y. Liu K. J. Lee Mar. Biol. 2008 153 945 952
60. K. Zengler G. Toledo M. Rappe J. Elkins E. J. Mathur J. M. Short M. Keller Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 15681 15686
61. K. Lewis S. Epstein A. D'Onofrio L. L. Ling J. Antibiot. 2010 63 468 476
62. E. Gavrish A. Bollmann S. Epstein K. Lewis J. Microbiol. Methods 2008 72 257 262
63. S. Pahlow S. Kloss V. Blattel K. Kirsch U. Hubner D. Cialla P. Rosch K. Weber J. Popp ChemPhysChem 2013 14 3600 3605
64. J. Vicente A. Stewart B. Song R. Hill J. Wright Mar. Biotechnol. 2013 15 413 424
65. P. Tabares S. M. Pimentel-Elardo T. Schirmeister T. Hunig U. Hentschel Mar. Biotechnol. 2011 13 883 892
66. L. Xi J. Ruan Y. Huang Int. J. Mol. Sci. 2012 13 5917 5932
67. S. T. Khan M. Takagi K. Shin-ya Microbes Environ. 2012 27 99 104
68. H. Zhang W. Zhang Y. Jin M. Jin X. Yu Antonie van Leeuwenhoek 2008 93 241 248
69. C. Q. Li W. C. Liu P. Zhu J. L. Yang K. D. Cheng Microb. Ecol. 2011 62 800 812
70. I. Schneemann K. Nagel I. Kajahn A. Labes J. Wiese J. F. Imhoff Appl. Environ. Microbiol. 2010 76 3702 3714
71. W. Sun S. Dai S. Jiang G. Wang G. Liu H. Wu X. Li Antonie van Leeuwenhoek 2010 98 65 75
72. M. Radwan A. Hanora J. Zan N. M. Mohamed D. M. Abo-Elmatty S. H. Abou-El-Ela R. T. Hill Mar. Biotechnol. 2009 12 350 360
73. C. Noyer A. Hamilton O. Sacristan-Soriano M. A. Becerro Symbiosis 2010 51 239 243
74. E. Fattorusso O. Taglialatela-Scafati Mar. Drugs 2009 7 130 152
75. T. R. A. Thomas D. P. Kavlekar P. A. LokaBharathi Mar. Drugs 2010 8 1417 1468
76. Z. Q. Xiong J. F. Wang Y. Y. Hao Y. Wang Mar. Drugs 2013 11 700 717
77. M. Takagi K. Shin-ya J. Antibiot. 2012 65 443 447
78. J. W. Blunt B. R. Copp R. A. Keyzers M. H. G. Munro M. R. Prinsep Nat. Prod. Rep. 2013 30 237 323
79. D. J. Newman R. T. Hill J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2006 33 539 544
80. S. M. Pimentel-Elardo S. Kozytska T. S. Bugni C. M. Ireland H. Moll U. Hentschel Mar. Drugs 2010 8 373 380
81. A. M. Mayer M. T. Hamann Comp. Biochem. Physiol., Part C: Toxicol. Pharmacol. 2005 140 265 286
82. J. W. Blunt B. R. Copp R. A. Keyzers M. H. Munro M. R. Prinsep Nat. Prod. Rep. 2013 30 237 323
83. U. R. Abdelmohsen M. Szesny E. M. Othman T. Schirmeister S. Grond H. Stopper U. Hentschel Mar. Drugs 2012 10 2208 2221
84. A. T. Bull J. E. Stach Trends Microbiol. 2007 15 491 499
85. R. Solanki M. Khanna R. Lal Indian J. Microbiol. 2008 48 410 431
86. R. Subramani W. Aalbersberg Microbiol. Res. 2012 167 571 580
87. W. Fenical P. R. Jensen Nat. Chem. Biol. 2006 2 666 673
88. K. Tiwari R. K. Gupta Crit. Rev. Biotechnol. 2012 32 108 132
89. C. Wicke M. Huners V. Wray M. Nimtz U. Bilitewski S. Lang J. Nat. Prod. 2000 63 621 626
90. N. Imamura M. Nishijima K. Adachi H. Sano J. Antibiot. 1993 46 241 246
91. C. B. F. Yao M. Schiebel E. Helmke H. Anke H. Laatsch Z. Naturforsch. 2006 61b 320 325
92. K. Li Q. L. Li N. Y. Ji B. Liu W. Zhang X. P. Cao Mar. Drugs 2011 9 690 695
93. G. Lidgren L. Bohlin C. Christophersen J. Nat. Prod. 1988 51 1277 1280
94. T. K. Kim A. K. Hewavitharana P. N. Shaw J. A. Fuerst Appl. Environ. Microbiol. 2006 72 2118 2125
95. U. R. Abdelmohsen G. L. Zhang A. Philippe W. Schmitz S. M. Pimentel-Elardo B. Hertlein-Amslinger U. Hentschel G. Bringmann Tetrahedron Lett. 2012 53 23 29
96. K. W. Cho H. S. Lee J. R. Rho T. S. Kim S. J. Mo J. Shin J. Nat. Prod. 2001 64 664 667
97. S. S. Mitchell M. K. Harper D. J. Faulkner Tetrahedron 1999 55 10887 10892
98. H. Shi S. Yu D. Liu L. van Ofwegen P. Proksch W. Lin Mar. Drugs 2012 10 1331 1344
99. V. J. Mukku M. Speitling H. Laatsch E. Helmke J. Nat. Prod. 2000 63 1570 1572
100. R. R. Parvatkar C. D'Souza A. Tripathi C. G. Naik Phytochemistry 2009 70 128 132
101. H. Otsuka E. Hirata A. Takushi T. Shinzato Y. Takeda M. Bando M. Kido Chem. Pharm. Bull. 2000 48 547 551
102. P. Nuclear D. Sommit N. Boonyuen K. Pudhom Chem. Pharm. Bull. 2010 58 1221 1223
103. A. Husain M. M. Alam M. Shaharyar S. Lal J. Enzyme Inhib. Med. Chem. 2010 25 54 61
104. J. L. Michel Y. Chen H. Zhang Y. Huang A. Krunic J. Orjala M. Veliz K. K. Soni D. D. Soejarto A. Caceres A. Perez G. B. Mahady J. Ethnopharmacol. 2010 129 220 226
105. H. Brockmann G. Schmidt-Kastner Chem. Ber. 1955 88 57 61
106. S. M. Pimentel-Elardo V. Buback T. A. Gulder T. S. Bugni J. Reppart G. Bringmann C. M. Ireland T. Schirmeister U. Hentschel Mar. Drugs 2011 9 1682 1697
107. T. Takeuchi, M. Hamada, H. Nanagawa, Y. Takahashi and S. Ryuichi, JP96-216484, 1996
108. R. B. Wei T. Xi J. Li P. Wang F. C. Li Y. C. Lin S. Qin Mar. Drugs 2011 9 359 368
109. S. Omura Y. Iwai A. Hirano A. Nakagawa J. Awaya H. Tsuchya Y. Takahashi R. Masuma J. Antibiot. 1977 30 275 282
110. M. W. Karaman S. Herrgard D. K. Treiber P. Gallant C. E. Atteridge B. T. Campbell K. W. Chan P. Ciceri M. I. Davis P. T. Edeen R. Faraoni M. Floyd J. P. Hunt D. J. Lockhart Z. V. Milanov M. J. Morrison G. Pallares H. K. Patel S. Pritchard L. M. Wodicka P. P. Zarrinkar Nat. Biotechnol. 2008 26 127 132
111. L. M. Hernandez J. A. Blanco J. P. Baz J. L. Puentes F. R. Millan F. E. Vazquez R. I. Fernandez-Chimeno D. G. Gravalos J. Antibiot. 2000 53 895 902
112. L. M. Canedo J. L. Fernandez-Puentes J. P. Baz J. Antibiot. 2000 53 479 483
113. R. I. Fernandez-Chimeno L. Canedo F. Espliego D. Gravalos F. De La Calle J. L. Fernandez-Puentes F. Romero J. Antibiot. 2000 53 474 478
114. R. Liu C. B. Cui L. Duan Q. Q. Gu W. M. Zhu Arch. Pharmacal Res. 2005 28 1341 1344
115. B. Montaner R. Perez-Tomas Toxicol. Lett. 2002 129 93 98
116. A. Furstner J. Grabowski C. W. Lehmann T. Kataoka K. Nagai ChemBioChem 2001 2 60 68
117. M. Isaka A. Jaturapat J. Kramyu M. Tanticharoen Y. Thebtaranonth Antimicrob. Agents Chemother. 2002 46 1112 1113
118. T. Shomura S. Gomi M. Ito J. Yoshida E. Tanaka S. Amano H. Watabe S. Ohuchi J. Itoh M. Sezaki et al. J. Antibiot. 1987 40 732 739
119. S. M. Pimentel-Elardo T. A. M. Gulder U. Hentschel G. Bringmann Tetrahedron Lett. 2008 49 6889 6892
120. A. C. Stierle J. H. Cardellina F. L. Singleton Experientia 1988 44 1021 1021
121. L. Simmons K. Kaufmann R. Garcia G. Schwar V. Huch R. Muller Bioorg. Med. Chem. 2011 19 6570 6575
122. E. J. Choi H. C. Kwon J. Ham H. O. Yang J. Antibiot. 2009 62 621 624
123. C. Campas Drugs Future 2009 34 349 351
124. M. Radwan A. Hanora S. Khalifa S. H. Abou-El-Ela Cell Cycle 2012 11 1765 1772
125. T. Kubota Y. Kamijyo A. Takahashi-Nakaguchi J. Fromont T. Gonoi J. Kobayashi Org. Lett. 2013 15 610 612
126. X. L. Huang Y. Gao D. Q. Xue H. L. Liu C. S. Peng F. L. Zhang Z. Y. Li Y. W. Gu Helv. Chim. Acta 2011 94 1838 1842
127. I. Schneemann B. Ohlendorf H. Zinecker K. Nagel J. Wiese J. F. Imhoff J. Nat. Prod. 2010 73 1444 1447
128. J. Perez Baz L. M. Canedo J. L. Fernandez Puentes M. V. Silva Elipe J. Antibiot. 1997 50 738 741
129. T. P. Wyche Y. Hou D. Braun H. C. Cohen M. P. Xiong T. S. Bugni J. Org. Chem. 2011 76 6542 6547
130. H. S. Lee H. J. Shin K. H. Jang T. S. Kim K. B. Oh J. Shin J. Nat. Prod. 2005 68 623 625
131. M. Perez C. Schleissner P. Rodriguez P. Zuniga G. Benedit F. Sanchez-Sancho F. de la Calle J. Antibiot. 2009 62 167 169
132. K. Motohashi M. Takagi K. Shin-Ya J. Nat. Prod. 2010 73 755 758
133. I. Schneemann I. Kajahn B. Ohlendorf H. Zinecker A. Erhard K. Nagel J. Wiese J. F. Imhoff J. Nat. Prod. 2010 73 1309 1312
134. M. Izumikawa S. T. Khan H. Komaki M. Takagi K. Shin-Ya J. Antibiot. 2010 63 33 36
135. K. Motohashi M. Takagi K. Shin-ya J. Nat. Prod. 2010 73 226 228
136. M. Izumikawa S. T. Khan M. Takagi K. Shin-ya J. Nat. Prod. 2010 73 208 212
137. K. Motohashi K. Inaba S. Fuse T. Doi M. Izumikawa S. T. Khan M. Takagi T. Takahashi K. Shin-ya J. Nat. Prod. 2011 74 1630 1635
138. J. Y. Ueda S. T. Khan M. Takagi K. Shin-ya J. Antibiot. 2010 63 267 269
139. M. Takagi K. Motohashi S. T. Khan J. Hashimoto K. Shin-Ya J. Antibiot. 2010 63 401 403
140. T. Hosoya T. Hirokawa M. Takagi K. Shin-ya J. Nat. Prod. 2012 75 285 289
141. Y. Gao L. L. Yu C. S. Peng Z. Y. Li Y. W. Guo Biochem. Syst. Ecol. 2010 38 931 934
142. H. K. Lee D. S. Lee J. Lim J. S. Kim K. S. Im J. H. Jung Arch. Pharmacal Res. 1998 21 729 733
143. Y. Han B. J. Yang F. L. Zhang X. L. Miao Z. Y. Li Mar. Biotechnol. 2009 11 132 140