Label-free in-flow detection of single DNA molecules using glass nanopipettes

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 1, 2014, Pages 835-841

  Gong, Xiuqing ^c   Patil, Amol V ^a   Ivanov, Aleksandar P ^a   Kong, Qingyuan ^a   Gibb, Thomas ^a   Dogan, Fatma ^a   Demello, Andrew J ^b   Edel, Joshua B ^a  

^a IMPERIAL COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

^b ETH ZURICH   (Switzerland)

^c NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANALYTE CONCENTRATION; FLUID-FLOW PROPERTIES; GEOMETRICAL CONSTRAINTS; MICRO-FLUIDIC DEVICES; MICROFLUIDIC CHANNEL; SINGLE-MOLECULE DETECTION; SOLID-STATE NANOPORE; VOLUMETRIC FLOW RATE;

MOLECULES; NANOPORES;

FLUIDIC DEVICES;

DNA; GLASS;

ARTICLE; CHEMISTRY; EQUIPMENT; METHODOLOGY; MICROFLUIDIC ANALYSIS; NANOTECHNOLOGY;

DNA; GLASS; MICROFLUIDIC ANALYTICAL TECHNIQUES; NANOTECHNOLOGY;

EID: 84891781526     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac403391q     Document Type: Article

References (53)

1. Ingebrandt, S.; Han, Y.; Nakamura, F.; Poghossian, A.; Schoning, M. J.; Offenhausser, A. Biosens. Bioelectron. 2007, 22, 2834
2. Lipman, E. A.; Schuler, B.; Bakajin, O.; Eaton, W. A. Science (New York, N.Y.) 2003, 301, 1233
3. Japrung, D.; Dogan, J.; Freedman, K.; Nadzeyka, A.; Bauerdick, S.; Albrecht, T.; Kim, M. J.; Jemth, P.; Edel, J. B. Anal. Chem. 2013, 85, 2449
4. Ziegler, C. Anal. Bioanal. Chem. 2004, 379, 946
5. Bunimovich, Y. L.; Shin, Y. S.; Yeo, W.-S.; Amori, M.; Kwong, G.; Heath, J. R. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 16323
6. Dekker, C. Nat. Nano 2007, 2, 209
7. Miles, B. N.; Ivanov, A. P.; Wilson, K. A.; Dogan, F.; Japrung, D.; Edel, J. B. Chem. Soc. Rev. 2013, 42, 15
8. Soni, G. V.; Dekker, C. Nano Lett. 2012, 12, 3180
9. Raillon, C.; Cousin, P.; Traversi, F.; Garcia-Cordero, E.; Hernandez, N.; Radenovic, A. Nano Lett. 2012, 12, 1157-1164
10. Cressiot, B.; Oukhaled, A.; Patriarche, G.; Pastoriza-Gallego, M.; Betton, J.-M.; Auvray, L.; Muthukumar, M.; Bacri, L.; Pelta, J. ACS Nano 2012, 6, 6236
11. Rotem, D.; Jayasinghe, L.; Salichou, M.; Bayley, H. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 2781
12. Hong, J. Nanotechnology 2008, 19, 165205
13. McNally, B.; Singer, A.; Yu, Z.; Sun, Y.; Weng, Z.; Meller, A. Nano Lett. 2010, 10, 2237
14. Cecchini, M. P.; Wiener, A.; Turek, V. A.; Chon, H.; Lee, S.; Ivanov, A. P.; McComb, D. W.; Choo, J.; Albrecht, T.; Maier, S. A.; Edel, J. B. Nano Lett. 2013, 13, 4602
15. van den Hout, M.; Vilfan, I. D.; Hage, S.; Dekker, N. H. Nano Lett. 2010, 10, 701
16. Ivanov, A. P.; Instuli, E.; McGilvery, C. M.; Baldwin, G.; McComb, D. W.; Albrecht, T.; Edel, J. B. Nano Lett. 2011, 11, 279
17. Tsutsui, M.; Rahong, S.; Iizumi, Y.; Okazaki, T.; Taniguchi, M.; Kawai, T. Sci. Rep. 2011, 1, 46.
18. Storm, A. J.; Chen, J. H.; Zandbergen, H. W.; Dekker, C. Phys. Rev. E 2005, 71, 051903
19. Chang, H.; Kosari, F.; Andreadakis, G.; Alam, M. A.; Vasmatzis, G.; Bashir, R. Nano Lett. 2004, 4, 1551
20. Schneider, G. g. F.; Kowalczyk, S. W.; Calado, V. E.; Pandraud, G. g.; Zandbergen, H. W.; Vandersypen, L. M. K.; Dekker, C. Nano Lett. 2010, 10, 3163
21. Merchant, C. A.; Healy, K.; Wanunu, M.; Ray, V.; Peterman, N.; Bartel, J.; Fischbein, M. D.; Venta, K.; Luo, Z.; Johnson, A. T. C.; Drndić, M. Nano Lett. 2010, 10, 2915
22. Wanunu, M.; Dadosh, T.; Ray, V.; Jin, J.; McReynolds, L.; Drndic, M. Nat. Nano 2010, 5, 807
23. Wei, R.; Gatterdam, V.; Wieneke, R.; Tampe, R.; Rant, U. Nat. Nano 2012, 7, 257
24. Kowalczyk, S. W.; Kapinos, L.; Blosser, T. R.; Magalhaes, T.; van Nies, P.; LimRoderick, Y. H.; Dekker, C. Nat. Nano 2011, 6, 433
25. Wanunu, M.; Morrison, W.; Rabin, Y.; Grosberg, A. Y.; Meller, A. Nat. Nano 2010, 5, 160
26. Niu, X.; Gielen, F.; Edel, J. B.; deMello, A. J. Nat. Chem 2011, 3, 437
27. Jain, T.; Guerrero, R. J. S.; Aguilar, C. A.; Karnik, R. Anal. Chem. 2013, 85, 3871
28. Kawano, R.; Osaki, T.; Sasaki, H.; Takeuchi, S. Small 2010, 6, 2100
29. Actis, P.; Mak, A.; Pourmand, N. Bioanal. Rev. 2010, 1, 177
30. Morris, C. A.; Friedman, A. K.; Baker, L. A. Analyst 2010, 135, 2190
31. Rodolfa, K. T.; Bruckbauer, A.; Zhou, D.; Korchev, Y. E.; Klenerman, D. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 117, 7014
32. Ying, L.; Bruckbauer, A.; Zhou, D.; Gorelik, J.; Shevchuk, A.; Lab, M.; Korchev, Y.; Klenerman, D. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 2859
33. Bruckbauer, A.; James, P.; Zhou, D.; Yoon, J. W.; Excell, D.; Korchev, Y.; Jones, R.; Klenerman, D. Biophys. J. 2007, 93, 3120
34. Piper, J. D.; Li, C.; Lo, C.-J.; Berry, R.; Korchev, Y.; Ying, L.; Klenerman, D. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10386
35. Karhanek, M.; Kemp, J. T.; Pourmand, N.; Davis, R. W.; Webb, C. D. Nano Lett. 2005, 5, 403
36. Gao, C.; Ding, S.; Tan, Q.; Gu, L.-Q. Anal. Chem. 2009, 81, 80
37. Zhang, B.; Wood, M.; Lee, H. Anal. Chem. 2009, 81, 5541
38. Umehara, S.; Karhanek, M.; Davis, R. W.; Pourmand, N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 4611
39. Steinbock, L. J.; Otto, O.; Chimerel, C.; Gornall, J.; Keyser, U. F. Nano Lett. 2010, 10, 2493
40. Wei, C.; Bard, A. J.; Feldberg, S. W. Anal. Chem. 1997, 69, 4627
41. Tabard-Cossa, V.; Trivedi, D.; Wiggin, M.; Jetha, N. N.; Marziali, A. Nanotechnology 2007, 18, 305505
42. Lubensky, D. K.; Nelson, D. R. Biophys. J. 1999, 77, 1824
43. Ling, D.; Ling, X. S. J. Phys: Condens. Matter 2013, 25, 375102
44. Smeets, R. M. M.; Keyser, U. F.; Krapf, D.; Wu, M.-Y.; Dekker, N. H.; Dekker, C. Nano Lett. 2006, 6, 89
45. Chen, P.; Mitsui, T.; Framer, D. B.; Golovchenko, J.; Gordon, R. G.; Branton, D. Nano Lett. 2004, 4, 1333
46. Li, J.; Gershow, M.; Stein, D.; Brandin, E.; Golovchenko, J. A. Nat. Mater. 2003, 2, 611
47. Henrickson, S. E.; Misakian, M.; Robertson, B.; Kasianowicz, J. J. Phys. Rev. Lett. 2000, 85, 3057
48. Zhang, J.; Shklovskii, B. I. Phys. Rev. E: Stat. Phys., Plasmas, Fluids, Relat. Interdiscip. Top. 2007, 75, 021906
49. Meller, A.; Branton, D. Electrophoresis 2002, 23, 2583
50. Wanunu, M.; Sutin, J.; McNally, B.; Chow, A.; Meller, A. Biophys. J. 2008, 95, 4716
51. Fologea, D.; Uplinger, J.; Thomas, B.; McNabb, D. S.; Li, J. Nano 2005, 5, 1734
52. Brewer, L. R.; Bianco, P. R. Nat. Methods 2008, 5, 517
53. Ismagilov, R. F.; Stroock, A. D.; Kenis, P. J. A.; Whitesides, G.; Stone, H. A. Appl. Phys. Lett. 2000, 76, 2376