-
1
-
-
0027756895
-
-
Spencer, D. M.; Wandless, T. J.; Schreiber, S. L.; Crabtree, G. R. Science 1993, 262, 1019
-
(1993)
Science
, vol.262
, pp. 1019
-
-
Spencer, D.M.1
Wandless, T.J.2
Schreiber, S.L.3
Crabtree, G.R.4
-
2
-
-
3242694003
-
-
Buskirk, A. R.; Ong, Y. C.; Gartner, Z. J.; Liu, D. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 10505
-
(2004)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.101
, pp. 10505
-
-
Buskirk, A.R.1
Ong, Y.C.2
Gartner, Z.J.3
Liu, D.R.4
-
3
-
-
33748195107
-
-
Banaszynski, L. A.; Chen, L. C.; Maynard-Smith, L. A.; Ooi, A. G.; Wandless, T. J. Cell 2006, 126, 995
-
(2006)
Cell
, vol.126
, pp. 995
-
-
Banaszynski, L.A.1
Chen, L.C.2
Maynard-Smith, L.A.3
Ooi, A.G.4
Wandless, T.J.5
-
4
-
-
34547406152
-
-
Pratt, M. R.; Schwartz, E. C.; Muir, T. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 11209
-
(2007)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.104
, pp. 11209
-
-
Pratt, M.R.1
Schwartz, E.C.2
Muir, T.W.3
-
5
-
-
54249105941
-
-
Lee, J.; Natarajan, M.; Nashine, V. C.; Socolich, M.; Vo, T.; Russ, W. P.; Benkovic, S. J.; Ranganathan, R. Science 2008, 322, 438
-
(2008)
Science
, vol.322
, pp. 438
-
-
Lee, J.1
Natarajan, M.2
Nashine, V.C.3
Socolich, M.4
Vo, T.5
Russ, W.P.6
Benkovic, S.J.7
Ranganathan, R.8
-
6
-
-
77954519891
-
-
Karginov, A. V.; Ding, F.; Kota, P.; Dokholyan, N. V.; Hahn, K. M. Nat. Biotechnol. 2010, 28, 743
-
(2010)
Nat. Biotechnol.
, vol.28
, pp. 743
-
-
Karginov, A.V.1
Ding, F.2
Kota, P.3
Dokholyan, N.V.4
Hahn, K.M.5
-
8
-
-
84862529699
-
-
Deckert, K.; Budiardjo, S. J.; Brunner, L. C.; Lovell, S.; Karanicolas, J. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 10055
-
(2012)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.134
, pp. 10055
-
-
Deckert, K.1
Budiardjo, S.J.2
Brunner, L.C.3
Lovell, S.4
Karanicolas, J.5
-
9
-
-
84874088415
-
-
Kanwar, M.; Wright, R. C.; Date, A.; Tullman, J.; Ostermeier, M. Methods Enzymol 2013, 523, 369
-
(2013)
Methods Enzymol
, vol.523
, pp. 369
-
-
Kanwar, M.1
Wright, R.C.2
Date, A.3
Tullman, J.4
Ostermeier, M.5
-
10
-
-
23844465160
-
-
Guntas, G.; Mansell, T. J.; Kim, J. R.; Ostermeier, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 11224
-
(2005)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.102
, pp. 11224
-
-
Guntas, G.1
Mansell, T.J.2
Kim, J.R.3
Ostermeier, M.4
-
12
-
-
0141757323
-
-
Dueber, J. E.; Yeh, B. J.; Chak, K.; Lim, W. A. Science 2003, 301, 1904
-
(2003)
Science
, vol.301
, pp. 1904
-
-
Dueber, J.E.1
Yeh, B.J.2
Chak, K.3
Lim, W.A.4
-
14
-
-
84876882853
-
-
Dagliyan, O.; Shirvanyants, D.; Karginov, A. V.; Ding, F.; Fee, L.; Chandrasekaran, S. N.; Freisinger, C. M.; Smolen, G. A.; Huttenlocher, A.; Hahn, K. M.; Dokholyan, N. V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 6800
-
(2013)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.110
, pp. 6800
-
-
Dagliyan, O.1
Shirvanyants, D.2
Karginov, A.V.3
Ding, F.4
Fee, L.5
Chandrasekaran, S.N.6
Freisinger, C.M.7
Smolen, G.A.8
Huttenlocher, A.9
Hahn, K.M.10
Dokholyan, N.V.11
-
15
-
-
0034705320
-
-
Bell, C. E.; Frescura, P.; Hochschild, A.; Lewis, M. Cell 2000, 101, 801
-
(2000)
Cell
, vol.101
, pp. 801
-
-
Bell, C.E.1
Frescura, P.2
Hochschild, A.3
Lewis, M.4
-
16
-
-
15744396343
-
-
Dodd, I. B.; Shearwin, K. E.; Egan, J. B. Curr. Opin. Genet. Dev. 2005, 15, 145
-
(2005)
Curr. Opin. Genet. Dev.
, vol.15
, pp. 145
-
-
Dodd, I.B.1
Shearwin, K.E.2
Egan, J.B.3
-
17
-
-
36049029967
-
-
Qian, B.; Raman, S.; Das, R.; Bradley, P.; McCoy, A. J.; Read, R. J.; Baker, D. Nature 2007, 450, 259
-
(2007)
Nature
, vol.450
, pp. 259
-
-
Qian, B.1
Raman, S.2
Das, R.3
Bradley, P.4
McCoy, A.J.5
Read, R.J.6
Baker, D.7
-
18
-
-
78650905964
-
-
Leaver-Fay, A.; Tyka, M.; Lewis, S. M.; Lange, O. F.; Thompson, J.; Jacak, R.; Kaufman, K.; Renfrew, P. D.; Smith, C. A.; Sheffler, W.; Davis, I. W.; Cooper, S.; Treuille, A.; Mandell, D. J.; Richter, F.; Ban, Y. E.; Fleishman, S. J.; COrn, J. E.; Kim, D. E.; Lyskov, S.; Berrondo, M.; Mentzer, S.; Popovic, Z.; Havranek, J. J.; Karanicolas, J.; Das, R.; Meiler, J.; Kortemme, T.; Gray, J. J.; Kuhlman, B.; Baker, D.; Bradley, P. Methods Enzymol. 2011, 487, 545
-
(2011)
Methods Enzymol.
, vol.487
, pp. 545
-
-
Leaver-Fay, A.1
Tyka, M.2
Lewis, S.M.3
Lange, O.F.4
Thompson, J.5
Jacak, R.6
Kaufman, K.7
Renfrew, P.D.8
Smith, C.A.9
Sheffler, W.10
Davis, I.W.11
Cooper, S.12
Treuille, A.13
Mandell, D.J.14
Richter, F.15
Ban, Y.E.16
Fleishman, S.J.17
Corn, J.E.18
Kim, D.E.19
Lyskov, S.20
Berrondo, M.21
Mentzer, S.22
Popovic, Z.23
Havranek, J.J.24
Karanicolas, J.25
Das, R.26
Meiler, J.27
Kortemme, T.28
Gray, J.J.29
Kuhlman, B.30
Baker, D.31
Bradley, P.32
more..
-
19
-
-
67849110427
-
-
Raman, S.; Vernon, R.; Thompson, J.; Tyka, M.; Sadreyev, R.; Pei, J.; Kim, D.; Kellogg, E.; DiMaio, F.; Lange, O.; Kinch, L.; Sheffler, W.; Kim, B. H.; Das, R.; Grishin, N. V.; Baker, D. Proteins 2009, 77 (Suppl 9) 89
-
(2009)
Proteins
, vol.77
, Issue.SUPPL. 9
, pp. 89
-
-
Raman, S.1
Vernon, R.2
Thompson, J.3
Tyka, M.4
Sadreyev, R.5
Pei, J.6
Kim, D.7
Kellogg, E.8
Dimaio, F.9
Lange, O.10
Kinch, L.11
Sheffler, W.12
Kim, B.H.13
Das, R.14
Grishin, N.V.15
Baker, D.16
-
20
-
-
0026509036
-
-
Eriksson, A. E.; Baase, W. A.; Wozniak, J. A.; Matthews, B. W. Nature 1992, 355, 371
-
(1992)
Nature
, vol.355
, pp. 371
-
-
Eriksson, A.E.1
Baase, W.A.2
Wozniak, J.A.3
Matthews, B.W.4
-
21
-
-
0026567907
-
-
Eriksson, A. E.; Baase, W. A.; Zhang, X. J.; Heinz, D. W.; Blaber, M.; Baldwin, E. P.; Matthews, B. W. Science 1992, 255, 178
-
(1992)
Science
, vol.255
, pp. 178
-
-
Eriksson, A.E.1
Baase, W.A.2
Zhang, X.J.3
Heinz, D.W.4
Blaber, M.5
Baldwin, E.P.6
Matthews, B.W.7
-
22
-
-
0036137007
-
-
Xu, B.; Hua, Q. X.; Nakagawa, S. H.; Jia, W.; Chu, Y. C.; Katsoyannis, P. G.; Weiss, M. A. Protein Sci. 2002, 11, 104
-
(2002)
Protein Sci.
, vol.11
, pp. 104
-
-
Xu, B.1
Hua, Q.X.2
Nakagawa, S.H.3
Jia, W.4
Chu, Y.C.5
Katsoyannis, P.G.6
Weiss, M.A.7
-
23
-
-
0031893269
-
-
Xu, J.; Baase, W. A.; Baldwin, E.; Matthews, B. W. Protein Sci. 1998, 7, 158
-
(1998)
Protein Sci.
, vol.7
, pp. 158
-
-
Xu, J.1
Baase, W.A.2
Baldwin, E.3
Matthews, B.W.4
-
24
-
-
30544433196
-
-
Pedelacq, J. D.; Cabantous, S.; Tran, T.; Terwilliger, T. C.; Waldo, G. S. Nat. Biotechnol. 2006, 24, 79
-
(2006)
Nat. Biotechnol.
, vol.24
, pp. 79
-
-
Pedelacq, J.D.1
Cabantous, S.2
Tran, T.3
Terwilliger, T.C.4
Waldo, G.S.5
-
25
-
-
0029061274
-
-
Ehrig, T.; O'Kane, D. J.; Prendergast, F. G. FEBS Lett. 1995, 367, 163
-
(1995)
FEBS Lett.
, vol.367
, pp. 163
-
-
Ehrig, T.1
O'Kane, D.J.2
Prendergast, F.G.3
-
26
-
-
0031134224
-
-
Palm, G. J.; Zdanov, A.; Gaitanaris, G. A.; Stauber, R.; Pavlakis, G. N.; Wlodawer, A. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 361
-
(1997)
Nat. Struct. Biol.
, vol.4
, pp. 361
-
-
Palm, G.J.1
Zdanov, A.2
Gaitanaris, G.A.3
Stauber, R.4
Pavlakis, G.N.5
Wlodawer, A.6
-
28
-
-
78149295964
-
-
Wallace, B. D.; Wang, H.; Lane, K. T.; Scott, J. E.; Orans, J.; Koo, J. S.; Venkatesh, M.; Jobin, C.; Yeh, L. A.; Mani, S.; Redinbo, M. R. Science 2010, 330, 831
-
(2010)
Science
, vol.330
, pp. 831
-
-
Wallace, B.D.1
Wang, H.2
Lane, K.T.3
Scott, J.E.4
Orans, J.5
Koo, J.S.6
Venkatesh, M.7
Jobin, C.8
Yeh, L.A.9
Mani, S.10
Redinbo, M.R.11
-
31
-
-
84862564042
-
-
Skinner, J. J.; Lim, W. K.; Bedard, S.; Black, B. E.; Englander, S. W. Protein Sci. 2012, 21, 996
-
(2012)
Protein Sci.
, vol.21
, pp. 996
-
-
Skinner, J.J.1
Lim, W.K.2
Bedard, S.3
Black, B.E.4
Englander, S.W.5
-
32
-
-
84862520497
-
-
Skinner, J. J.; Lim, W. K.; Bedard, S.; Black, B. E.; Englander, S. W. Protein Sci. 2012, 21, 987
-
(2012)
Protein Sci.
, vol.21
, pp. 987
-
-
Skinner, J.J.1
Lim, W.K.2
Bedard, S.3
Black, B.E.4
Englander, S.W.5
-
34
-
-
0036700035
-
-
Machicado, C.; Bueno, M.; Sancho, J. Protein Eng. 2002, 15, 669
-
(2002)
Protein Eng.
, vol.15
, pp. 669
-
-
Machicado, C.1
Bueno, M.2
Sancho, J.3
-
35
-
-
73349121291
-
-
Demerdash, O. N.; Daily, M. D.; Mitchell, J. C. PLoS Comput. Biol. 2009, 5, e1000531
-
(2009)
PLoS Comput. Biol.
, vol.5
, pp. 1000531
-
-
Demerdash, O.N.1
Daily, M.D.2
Mitchell, J.C.3
-
37
-
-
70149109136
-
-
Kidd, B. A.; Baker, D.; Thomas, W. E. PLoS Comput. Biol. 2009, 5, e1000484
-
(2009)
PLoS Comput. Biol.
, vol.5
, pp. 1000484
-
-
Kidd, B.A.1
Baker, D.2
Thomas, W.E.3
-
38
-
-
77954913405
-
-
Laine, E.; Goncalves, C.; Karst, J. C.; Lesnard, A.; Rault, S.; Tang, W. J.; Malliavin, T. E.; Ladant, D.; Blondel, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 11277
-
(2010)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.107
, pp. 11277
-
-
Laine, E.1
Goncalves, C.2
Karst, J.C.3
Lesnard, A.4
Rault, S.5
Tang, W.J.6
Malliavin, T.E.7
Ladant, D.8
Blondel, A.9
-
39
-
-
84883468084
-
-
Huang, W.; Lu, S.; Huang, Z.; Liu, X.; Mou, L.; Luo, Y.; Zhao, Y.; Liu, Y.; Chen, Z.; Hou, T.; Zhang, J. Bioinformatics 2013, 29, 2357
-
(2013)
Bioinformatics
, vol.29
, pp. 2357
-
-
Huang, W.1
Lu, S.2
Huang, Z.3
Liu, X.4
Mou, L.5
Luo, Y.6
Zhao, Y.7
Liu, Y.8
Chen, Z.9
Hou, T.10
Zhang, J.11
-
40
-
-
84883568730
-
-
Goncearenco, A.; Mitternacht, S.; Yong, T.; Eisenhaber, B.; Eisenhaber, F.; Berezovsky, I. N. Nucleic Acids Res. 2013, 41, W266
-
(2013)
Nucleic Acids Res.
, vol.41
, pp. 266
-
-
Goncearenco, A.1
Mitternacht, S.2
Yong, T.3
Eisenhaber, B.4
Eisenhaber, F.5
Berezovsky, I.N.6
-
41
-
-
84882769258
-
-
Cho, U.; Zimmerman, S. M.; Chen, L. C.; Owen, E.; Kim, J. V.; Kim, S. K.; Wandless, T. J. PLoS One 2013, 8, e72393
-
(2013)
PLoS One
, vol.8
, pp. 72393
-
-
Cho, U.1
Zimmerman, S.M.2
Chen, L.C.3
Owen, E.4
Kim, J.V.5
Kim, S.K.6
Wandless, T.J.7
-
42
-
-
79953905577
-
-
Amemiya, T.; Koike, R.; Fuchigami, S.; Ikeguchi, M.; Kidera, A. J. Mol. Biol. 2011, 408, 568
-
(2011)
J. Mol. Biol.
, vol.408
, pp. 568
-
-
Amemiya, T.1
Koike, R.2
Fuchigami, S.3
Ikeguchi, M.4
Kidera, A.5
-
43
-
-
33644873452
-
-
Flores, S.; Echols, N.; Milburn, D.; Hespenheide, B.; Keating, K.; Lu, J.; Wells, S.; Yu, E. Z.; Thorpe, M.; Gerstein, M. Nucleic Acids Res. 2006, 34, D296
-
(2006)
Nucleic Acids Res.
, vol.34
, pp. 296
-
-
Flores, S.1
Echols, N.2
Milburn, D.3
Hespenheide, B.4
Keating, K.5
Lu, J.6
Wells, S.7
Yu, E.Z.8
Thorpe, M.9
Gerstein, M.10
-
44
-
-
0034710950
-
-
Pan, H.; Lee, J. C.; Hilser, V. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 12020
-
(2000)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.97
, pp. 12020
-
-
Pan, H.1
Lee, J.C.2
Hilser, V.J.3
-
46
-
-
77958157879
-
-
Bruning, J. B.; Parent, A. A.; Gil, G.; Zhao, M.; Nowak, J.; Pace, M. C.; Smith, C. L.; Afonine, P. V.; Adams, P. D.; Katzenellenbogen, J. A.; Nettles, K. W. Nat. Chem. Biol. 2010, 6, 837
-
(2010)
Nat. Chem. Biol.
, vol.6
, pp. 837
-
-
Bruning, J.B.1
Parent, A.A.2
Gil, G.3
Zhao, M.4
Nowak, J.5
Pace, M.C.6
Smith, C.L.7
Afonine, P.V.8
Adams, P.D.9
Katzenellenbogen, J.A.10
Nettles, K.W.11
-
47
-
-
80052340812
-
-
Wrabl, J. O.; Gu, J.; Liu, T.; Schrank, T. P.; Whitten, S. T.; Hilser, V. J. Biophys. Chem. 2011, 159, 129
-
(2011)
Biophys. Chem.
, vol.159
, pp. 129
-
-
Wrabl, J.O.1
Gu, J.2
Liu, T.3
Schrank, T.P.4
Whitten, S.T.5
Hilser, V.J.6
-
49
-
-
84866720054
-
-
Motlagh, H. N.; Li, J.; Thompson, E. B.; Hilser, V. J. Biochem. Soc. Trans. 2012, 40, 975
-
(2012)
Biochem. Soc. Trans.
, vol.40
, pp. 975
-
-
Motlagh, H.N.1
Li, J.2
Thompson, E.B.3
Hilser, V.J.4
-
50
-
-
79958072421
-
-
Babu, M. M.; van der Lee, R.; de Groot, N. S.; Gsponer, J. Curr. Opin. Struct. Biol. 2011, 21, 432
-
(2011)
Curr. Opin. Struct. Biol.
, vol.21
, pp. 432
-
-
Babu, M.M.1
Van Der Lee, R.2
De Groot, N.S.3
Gsponer, J.4
-
52
-
-
84856834769
-
-
Vallee-Belisle, A.; Ricci, F.; Plaxco, K. W. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 2876
-
(2012)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.134
, pp. 2876
-
-
Vallee-Belisle, A.1
Ricci, F.2
Plaxco, K.W.3
-
56
-
-
84878323463
-
-
Choi, J. H.; San, A.; Ostermeier, M. Protein Sci. 2013, 22, 475
-
(2013)
Protein Sci.
, vol.22
, pp. 475
-
-
Choi, J.H.1
San, A.2
Ostermeier, M.3
-
57
-
-
79960569987
-
-
Kittleson, J. T.; Cheung, S.; Anderson, J. C. J. Biol. Eng. 2011, 5, 10
-
(2011)
J. Biol. Eng.
, vol.5
, pp. 10
-
-
Kittleson, J.T.1
Cheung, S.2
Anderson, J.C.3
-
58
-
-
84863205849
-
-
Schneider, C. A.; Rasband, W. S.; Eliceiri, K. W. Nat. Methods 2012, 9, 671
-
(2012)
Nat. Methods
, vol.9
, pp. 671
-
-
Schneider, C.A.1
Rasband, W.S.2
Eliceiri, K.W.3
|