Deconstructing the ONIOM hessian: Investigating method combinations for transition structures

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 8, Issue 12, 2012, Pages 4907-4914

  Vreven, Thom ^a,b   Thompson, Lee M ^c   Larkin, Susan M ^c   Kirker, Ian ^d   Bearpark, Michael J ^c  

^a GAUSSIAN INC   (United States)

^b UNIVERSITY OF MASSACHUSETTS MEDICAL SCHOOL   (United States)

^c IMPERIAL COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

^d UNIVERSITY COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84870952922     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct300612m     Document Type: Conference Paper

References (56)

1. Schlegel, H. B. J. Comput. Chem. 1982, 3, 214-218
2. Schlegel, H. B. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1514-27
3. Warshel, A.; Levitt, M. J. Mol. Biol. 1976, 103, 227-249
4. Singh, U. C.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1986, 7, 718-730
5. Field, M. J.; Bash, P. A.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1990, 11, 700-733
6. Gao, J. In Reviews in Computational Chemistry; Lipkowitz, K. B.; Boyd, D. B., Eds.; VCH Publishers, Inc.: New York, 1996; pp 119-186.
7. Riplinger, C.; Neese, F. ChemPhysChem 2011, 12, 3192-203
8. Kistler, K. A.; Matsika, S. J. Phys. Chem. A 2009, 113, 12396-403
9. Conti, I.; Altoè, P.; Stenta, M.; Garavelli, M.; Orlandi, G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 5016-23
10. Svensson, M.; Humbel, S.; Froese, R. D. J.; Matsubara, T.; Sieber, S.; Morokuma, K. J. Phys. Chem. 1996, 100, 19357-19363
11. Vreven, T.; Morokuma, K. J. Comput. Chem. 2000, 21, 1419-1432
12. Hratchian, H. P.; Parandekar, P. V.; Raghavachari, K.; Frisch, M. J.; Vreven, T. J. Chem. Phys. 2008, 128, 034107
13. Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Byun, K. S.; Komáromi, I.; Dapprich, S.; Morokuma, K.; Frisch, M. J. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 815-826
14. Morokuma, K.; Musaev, D. G.; Vreven, T.; Basch, H.; Torrent, M.; Khoroshun, D. V. IBM J. Res. Dev. 2001, 45, 367-395
15. Bearpark, M. J.; Larkin, S. M.; Vreven, T. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 7286-95
16. Dapprich, S.; Komáromi, I.; Byun, K. S.; Morokuma, K.; Frisch, M. J. J. Mol. Struct.: THEOCHEM 1999, 461, 1-21
17. Vreven, T.; Morokuma, K. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 6167-6170
18. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Scalmani, G.; Barone, V.; Mennucci, B.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Caricato, M.; Li, X.; Hratchian, H. P.; Izmaylov, A. F.; Bloino, J.; Zheng, G.; Sonnenberg, J. L.; Liang, W.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Vreven, T.; Montgomery, Jr., J. A.; Peralta, J. E.; Ogliaro, F.; Bearpark, M.; Heyd, J. J.; Brothers, E.; Kudin, K. N.; Staroverov, V.; Keith, T.N.; Kobayashi, R.; Normand, J.; Raghavachari, K.; Rendell, A.; Burant, J. C.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Cossi, M.; Rega, N.; Millam, J. M.; Klene, M.; Knox, J. E.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Martin, R. L.; Morokuma, K.; Zakrzewski, V. G.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Dapprich, S.; Pandekar, P. V.; Mayhall, N. J.; Daniels, A. D.; Farkas, Ö.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cioslowski, J.; Fox, D. J. Gaussian Development Version, Revision H.13; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2010.
19. Hall, K. F.; Vreven, T.; Frisch, M. J.; Bearpark, M. J. J. Mol. Biol. 2008, 383, 106-21
20. Vreven, T.; Morokuma, K.; Farkas, O.; Schlegel, H. B.; Frisch, M. J. J. Comput. Chem. 2003, 24, 760-9
21. Vreven, T.; Frisch, M. J.; Kudin, K. N.; Schlegel, H. B.; Morokuma, K. Mol. Phys. 2006, 104, 701-714
22. Larkin, S. M.; Vreven, T.; Bearpark, M. J.; Morokuma, K. Can. J. Chem. 2009, 87, 872-879
23. Ando, K.; Morokuma, K. Theor. Chem. Acc. 2011, 130, 323-331
24. Lu, X.; Tian, F.; Wang, N. Q.; Zhang, Q. N. Org. Lett. 2002, 4, 4313-5
25. Clemente, F. R.; Vreven, T.; Frisch, M. J. In Quantum Biochemistry; Matta, C. F., Ed.; Wiley-VCH: Weinheim, 2010; pp 61-83.
26. Osuna, S.; Morera, J.; Cases, M.; Morokuma, K.; Solà, M. J. Phys. Chem. A 2009, 113, 9721-6
27. Hratchian, H. P.; Schlegel, H. B. J. Chem. Phys. 2004, 120, 9918-24
28. Hratchian, H. P.; Schlegel, H. B. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 61-69
29. Hayashi, T.; Kim, Y. A.; Natsuki, T.; Endo, M. ChemPhysChem 2007, 8, 999-1004
30. Bandaru, P. R. J. Nanosci. Nanotechnol. 2007, 7, 1239-1267
31. Zhao, Y.-L.; Stoddart, J. F. Acc. Chem. Res. 2009, 42, 1161-71
32. Kumar, I.; Rana, S.; Cho, J. W. Chem.-Eur. J. 2011, 17, 11092-101
33. Hirsch, A. Angew Chem., Int. Ed. 2002, 41, 1853
34. Filippone, S.; Barroso, M. I.; Martín-Domenech, A.; Osuna, S.; Solà, M.; Martín, N. Chem.-Eur. J. 2008, 14, 5198-206
35. Delgado, J. L.; Osuna, S.; Bouit, P.-A.; Martínez-Alvarez, R.; Espíldora, E.; Solà, M.; Martín, N. J. Org. Chem. 2009, 74, 8174-8180
36. Izquierdo, M.; Osuna, S.; Filippone, S.; Martín-Domenech, A.; Solà, M.; Martín, N. J. Org. Chem. 2009, 74, 6253-9
37. Izquierdo, M.; Osuna, S.; Filippone, S.; Martín-Domenech, A.; Solà, M.; Martín, N. E. J. Org. Chem. 2009, 6231-6238
38. Osuna, S.; Houk, K. N. Chem.-Eur. J. 2009, 15, 13219-13231
39. Osuna, S.; Swart, M.; Solà, M. J. Phys. Chem. A 2011, 115, 3491-3496
40. Lu, X.; Tian, F.; Xu, X.; Wang, N. Q.; Zhang, Q. N. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 10459-64
41. Lu, X.; Yuan, Q.; Zhang, Q. N. Org. Lett. 2003, 5, 3527-3530
42. Montoya, A.; Mondragón, F.; Truong, T. N. Carbon 2002, 40, 1863-1872
43. Wang, H.; Xu, J. Chem. Phys. Lett. 2009, 477, 176-178
44. Chu, Y.-Y.; Su, M.-D. Chem. Phys. Lett. 2004, 394, 231-237
45. Wanno, B.; Du, A. J.; Ruangpornvisuti, V.; Smith, S. C. Chem. Phys. Lett. 2007, 436, 218-223
46. Basiuk, V. A. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 8890-8897
47. Basiuk, V. A. J. Comput. Theor. Nanosci. 2004, 1, 7
48. Basiuk, V. A. J. Nanosci. Nanotechnol. 2004, 4, 1095-1101
49. Liu, L. V.; Tian, W. Q.; Wang, Y. A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 1999-2005
50. Castillo, Á.; Lee, L.; Greer, A. J. Phys. Org. Chem. 2012, 25, 42-49
51. Trzaskowski, B.; Adamowicz, L. Theor. Chem. Acc. 2009, 124, 95-103
52. Wang, L.; Yi, C.; Zou, H.; Gan, H.; Xu, J.; Xu, W. J. Mol. Model. 2011, 17, 2751-2758
53. Cao, Y.; Houk, K. N. J. Mater. Chem. 2011, 21, 1503
54. Yuan, Y.; Chen, P.; Ren, X.; Wang, H. ChemPhysChem 2012, 13, 741-50
55. Hine, N. D. M.; Robinson, M.; Haynes, P. D.; Skylaris, C. K.; Payne, M. C.; Mostofi, A. A. Phys. Rev. B 2011, 83, 195102
56. Bearpark, M. J.; Ogliaro, F.; Vreven, T.; Boggio-Pasqua, M.; Frisch, M. J.; Larkin, S. M.; Morrison, M.; Robb, M. A. J. Photochem. Photobiol., A 2007, 190, 207-227