PNA-based artificial nucleases as antisense and anti-miRNA oligonucleotide agents

Molecular BioSystems

Volumn 7, Issue 8, 2011, Pages 2490-2499

  Gaglione, M ^a   Milano, G ^a   Chambery, A ^a   Moggio, L ^b   Romanelli, A ^b   Messere, A ^a  

^a SECOND UNIVERSITY OF NAPLES   (Italy)

^b UNIVERSITY OF NAPLES FEDERICO II   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPLEMENTARY RNA; MACROGOL DERIVATIVE; MICRORNA; PEPTIDE NUCLEIC ACID; RIBONUCLEASE;

ARTICLE; CHEMISTRY; GENETICS; MASS SPECTROMETRY; METABOLISM; MOLECULAR GENETICS; NUCLEOTIDE SEQUENCE; SPECTROFLUOROMETRY;

BASE SEQUENCE; MICRORNAS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PEPTIDE NUCLEIC ACIDS; POLYETHYLENE GLYCOLS; RIBONUCLEASES; RNA, ANTISENSE; SPECTROMETRY, FLUORESCENCE; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION;

EID: 79960378804     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1mb05131h     Document Type: Article

References (75)

1. S. Agrawal R. P. Iyer Curr. Biol. 1995 6 12 19
2. P. E. Nielsen M. Egholm R. H. Berg O. Buchardt Science 1991 254 1497 1500
3. M. Egholm P. E. Nielsen O. Buchardt R. H. Berg J. Am. Chem. Soc. 1992 114 9677 9678
4. M. Egholm O. Buchardt P. E. Nielsen R. H. Berg J. Am. Chem. Soc. 1992 114 1895 1897
5. M. Egholm O. Buchardt L. Christensen C. Behrens S. M. Freier D. A. Driver R. H. Berg S. K. Kim B. Norden P. E. Nielsen Nature 1993 365 566 568
6. L. Good P. E. Nielsen Antisense Nucleic Acid Drug Dev. 1997 7 431 437
7. M. Leijon A. Graslund P. E. Nielsen O. Buchardt B. Norden S. M. Kristensen M. Eriksson Biochemistry 1994 33 9820 9825
8. S. C. Brown S. A. Thomson J. M. Veal D. G. Davis Science 1994 265 777 780
9. K. K. Jensen H. Örum P. E. Nielsen B. Norden Biochemistry 1997 36 5072 5077
10. M. Eriksson P. E. Nielsen Nat. Struct. Biol. 1996 3 410 413
11. M. Eriksson P. E. Nielsen Q. Rev. Biophys. 1996 29 369 394
12. D. Y. Cherny B. P. Belotserkovskii M. D. Frank-Kamenetskii M. Egholm O. Buchardt R. Berg P. E. Nielsen Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1993 90 1667 1670
13. P. E. Nielsen M. Egholm O. Buchardt J. Mol. Recognit. 1994 7 165 170
14. K. K. Jensen H. Örum P. E. Nielsen B. Nordén Biochemistry 1997 36 5072 5077
15. C. Lu and A. W. Czanderna, in Applications of Piezoelectric Quartz Crystal Microbalances, Elsevier, Amsterdam, 1984
16. J. Wang P. E. Nielsen M. Jiang X. Cai J. R. Fernandes D. H. Grant M. Ozsoz A. Beglieter M. Mowat Anal. Chem. 1997 69 5200 5202
17. P. L. Ross K. Lee P. Belgrader Anal. Chem. 1997 69 4197 4202
18. J. Wang E. Palecek P. E. Nielsen G. Rivas X. Cai H. Shirashi N. Dontha D. Luo P. A. M. Farias J. Am. Chem. Soc. 1996 118 7667 7670
19. D. B. Demers E. T. Curry M. Egholm A. C. Sozer Nucleic Acids Res. 1995 23 3050 3055
20. H. Perry-O'Keefe X.-W. Yao J. M. Coull M. Fuchs M. Egholm Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996 93 14670 14675
21. A. G. Veselkov V. Demidov P. E. Nielsen M. D. Frank-Kamenetskii Nucleic Acids Res. 1996 24 2483 2487
22. P. M. Lansdorp N. P. Verwoerd F. M. van de Rijke V. Dragowska M. T. Little R. W. Dirks A. K. Raap H. J. Tanke Hum. Mol. Genet. 1996 5 685 691
23. H. Örum P. E. Nielsen M. Jorgensen C. Larsson C. Stanley T. Koch BioTechniques 1995 19 472 480
24. V. Demidov M. D. Frank-Kamenetskii M. Egholm O. Buchardt P. E. Nielsen Nucleic Acids Res. 1993 21 2103 2107
25. H. Knudsen P. E. Nielsen Anti-Cancer Drugs 1997 8 113 118
26. A. Pession R. Tonelli R. Fronza E. Sciamanna R. Corradini S. Sforza T. Tedeschi R. Marchelli L. Montanaro C. Camerin M. Franzoni G. Paolucci Int. J. Oncol. 2004 24 265 272
27. R. Tonelli S. Purgato C. Camerin R. Fronza F. Bologna S. Alboresi M. Franzoni R. Corradini S. Sforza A. Faccini J. M. Shohet R. Marchelli A. Pession Mol. Cancer Ther. 2005 4 779 786
28. M. A. Garcia-Blanco A. P. Baraniak E. L. Lasda Nat. Biotechnol. 2004 22 535 546
29. R. Kole M. Vacek T. Williams Oligonucleotides 2004 14 65 74
30. J. Summerton Biochim. Biophys. Acta 1999 1489 141 158
31. S. Abes D. Williams P. Prevot A. Thierry M. J. Gait B. Lebleu J. Controlled Release 2006 10 110595 110604
32. S. Pankratova B. Nielsen T. Shiraishi P. E. Nielsen Int. J. Oncol. 2010 36 29 38
33. V. Ambros Nature 2004 431 350 355
34. R. Garzon G. Marcucci C. M. Croce Nat. Rev. Drug Discovery 2010 9 775 789
35. A. Boutla C. Delidakis M. Tabler Nucleic Acids Res. 2003 31 4973 4980
36. D. Leaman P. Y. Chen J. Fak A. Yalcin M. Pearce U. Unnerstall D. S. Marks C. Sander T. Tuschl U. Gaul Cell 2005 121 1097 1108
37. G. Hutvagner M. J. Simard C. C. Mello P. D. Zamore PLoS Biol. 2004 2 465 475
38. C. Esau X. Kang E. Peralta E. Hanson E. G. Marcusson L. V. Ravichandran Y. Sun S. Koo R. J. Perera R. Jain N. M. Dean S. M. Freier C. F. Bennett B. Lollo R. Griffey J. Biol. Chem. 2004 279 52361 52365
39. M. N. Poy L. Eliasson J. Krutzfeldt S. Kuwajima X. Ma P. E. MacDonald S. Pfeffer T. Tuschl N. Rajewsky P. Rorsman M. Stoffel Nature 2004 432 226 230
40. Y. S. Lee H. K. Kim S. Chung K. S. Kim A. Dutta J. Biol. Chem. 2005 280 16635 16641
41. A. M. Cheng M. W. Byrom J. Shelton L. P. Ford Nucleic Acids Res. 2005 33 1290 1297
42. J. A. Chan A. M. Krichevsky K. S. Kosik Cancer Res. 2005 65 6029 6033
43. G. M. Schratt F. Tuebing E. A. Nigh C. G. Kane M. E. Sabatini M. Kiebler M. E. Greenberg Nature 2006 439 283 289
44. J. Krutzfeldt N. Rajewsky R. Braich K. G. Rajeev T. Tuschl M. Manoharan M. Stoffel Nature 2005 438 685 689
45. C. Esau S. Davis S. F. Murray X. X. Yu S. K. Pandey M. Pear L. Watts S. L. Booten M. Graham R. McKay A. Subramaniam S. Propp B. A. Lollo S. Freier C. F. Bennett S. Bhanot B. P. Monia Cell Metab. 2006 3 87 98
46. C. L. Jopling M. Yi A. M. Lancaster S. M. Lemon P. Sarnow Science 2005 309 1577 1581
47. J. Weiler J. Hunziker J. Hall Gene Ther. 2005 13 496 502
48. C. C. Esau Methods 2008 44 55 60
49. S. Davis B. Lollo S. Freier C. Esau Nucleic Acids Res. 2006 34 2294 2304
50. I. Naguibneva M. Ameyar-Zazoua N. Nonne A. Polesskaya S. Ait-Si-Ali R. Groisman M. Souidi L. L. Pritchard A. Harel-Bellan Biomed. Pharm. 2006 60 633 638
51. U. A. Orom S. Kauppinen A. H. Lund Gene 2006 372 137 141
52. M. M. Fabani C. Abreu-Goodger D. Williams P. A. Lyons A. G. Torres K. G. C. Smith A. J. Enright M. J. Gait1 E. Vigorito Nucleic Acids Res. 2010 38 4466 4475
53. M. M. Fabani M. J. Gait RNA 2008 14 336 346
54. S. Young Oh Y. Ju H. Park Mol. Cells 2009 28 341 345
55. W. Rong Z. Gang C. Jing Z. Yufen Chin. Sci. Bull. 45 2000 22 2017 2028
56. R. Breslow M. Labelle J. Am. Chem. Soc. 1986 108 2655 2659
57. D. A. Konevetz I. E. Beck N. G. Beloglazova I. V. Sulimenkov V. N. Sil'nikov M. A. Zenkova G. V. Shishkin V. V. Vlassov Tetrahedron 1999 55 503 512
58. D. P. Mack B. L. Iverson P. B. Dervan J. Am. Chem. Soc. 1988 110 7572 7574
59. Y. Jin J. A. Cowan J. Am. Chem. Soc. 2006 128 410 411
60. M. Komiyama K. Yoshinari J. Org. Chem. 1997 62 2155 2160
61. M. Komiyama T. Inokawa K. Yoshinari J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1995 77 78
62. M. Footer M. Egholm S. Kron J. M. Coull P. Matsudaira Biochemistry 1996 35 10673 10679
63. J. C. Verheijen B. A. L. M. Deiman E. Yeheskiely G. A. van der Marel J. H. van Boom Angew. Chem., Int. Ed. 2000 39 369 372
64. L. Petersen M. C. de Koning P. van Kuik-Romeijn J. Weterings C. J. Pol G. Platenburg M. Overhand G. A. van der Marel J. H. van Boom Bioconjugate Chem. 2004 15 576 582
65. M. Murtola R. Strömberg Org. Biomol. Chem. 2008 6 3837 3842
66. M. Murtola M. Wenska R. Strömberg J. Am. Chem. Soc. 2010 132 8984 8990
67. P. E. Nielsen, in Peptide Nucleic Acids Protocols and applications, Horizon Bioscience, Wymondham, 2004
68. C. H. Tung Z. Wei M. J. Leibowitz S. Stein Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992 89 7114 7118
69. E. A. Afanasyeva A. Hotz-Wagenblatt K. H. Glatting F. Westermann BMC Genomics 2008 9 52 58
70. D. C. A. John K. T. Douglas Transition Met. Chem. 1996 21 460 463
71. Y. Jin J. A. Cowan J. Am. Chem. Soc. 2005 127 8408 8415
72. H. Åström N. H. Williams R. Strömberg Org. Biomol. Chem. 2003 1 1461 1465
73. M. Murtola R. Strömberg ARKIVOC 2009 21 4 94
74. M. Murtola R. Strömberg Org. Biomol. Chem. 2008 6 3837 3842
75. P. D. Cook Anticancer Drug Des. 1991 6 585 607