Discrimination of Single-Nucleotide Polymorphisms in Human DNA Using Peptide Nucleic Acid Probes Detected by MALDI-Tof Mass Spectrometry

Analytical Chemistry

Volumn 69, Issue 20, 1997, Pages 4197-4202

  Ross, Philip L ^a   Lee, Katherine ^a,b   Belgrader, Phillip ^a  

^a ARMED FORCES INSTITUTE OF PATHOLOGY   (United States)

^b UNIVERSITY OF MARYLAND BALTIMORE COUNTY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; NUCLEOTIDE; PEPTIDE;

ARTICLE; DNA PROBE; GENETIC POLYMORPHISM; GENETICS; HUMAN; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR PROBE; POLYMERASE CHAIN REACTION;

DNA; DNA PROBES; HUMANS; MOLECULAR PROBES; NUCLEOTIDES; PEPTIDES; POLYMERASE CHAIN REACTION; POLYMORPHISM, GENETIC; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION;

EID: 0031572434     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac9703966     Document Type: Article

References (32)

1. Guyer, M. S.; Collins, F. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 10841-10848.
2. Cooper, D. N.; Smith, B. A.; Cooke, H. J.; Niemann, S.; Schmidke, D. Hum. Genet. 1995, 69, 201-205.
3. Landegren, U.; Kaiser, R.; Caskey, C. T.; Hood, L. Science 1988, 242, 229-237.
4. Antonarakis, S. E. N. Engl. J. Med. 1989, 320, 153-163.
5. Wu, D. Y.; Ugozzoli, L.; Pal, B. K.; Wallace, R. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 2757-2760.
6. Saiki, R. K.; Bugawan, T. L.; Horn, G. T.; Mullis, K. B.; Erlich, H. A. Nature 1986, 324, 163-166.
7. Saiki, R. K.; Walsh, P. S.; Levenson, C. H.; Erlich, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 6230-6234.
8. Nikiforov, T. T.; Rendle, R. B.; Goelet, P.; Rogers, Y.-H.; Kotewicz, M. L.; Anderson, S.; Trainer, G. L.; Knapp, M. R. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 4167-4175.
9. Baron, H.; Fung, S.; Aydin, A.; Bahring, S.; Luft, F. C.; Schuster, H. Nature Biotechnol. 1996, 14, 1279-1282.
10. Barany, F. Proc. Natl. Acad. Sci. US.A. 1991, 88, 189-193.
11. Nickerson, D. A.; Kaiser, R.; Lappin, S.; Stewart, J.; Hood, L.; and Landegren U. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 8923-8927.
12. Belgrader, P.; Marino, M. A.; Lubin, M.; Barany, F. Genome Science and Technol. 1996, 1, 77-87.
13. Delahunty, C.; Ankener, W.; Deng, Q.; Eng, J.; Nickerson, D. A. Am. J. Hum. Genet. 1996, 58, 1239-1246.
14. Boehm, C. D. Clin. Chem. 1989, 35, 1843-1848.
15. Hillenkamp, F.;, Karas, M.; Beavis, R. C.; Chait, B. T. Anal. Chem. 1991, 63, 1193A-1202A.
16. Cotter, R. J. Anal. Chem. 1992, 64, 1027A-1039A.
17. Burlingame, A. L.; Boyd, R. K.; Gaskell, S. J. Anal. Chem. 1996, 68, 599R-651R.
18. Tang, W.; Zhu, L.; Smith, L. M. Anal. Chem. 1997, 69, 302-312.
19. Ch'ang, L. Y.; Tang, K.; Schell, M.; Ringelberg, C.; Matteson, K. J.; Allman, S. L.; Chen, C. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1995, 9, 772-774.
20. Jurinke, C.; van den Boom, D.; Jacob, A.; Tang, K.; Wörl, R.; Köster, H. Anal. Biochem. 1996, 237, 174-181.
21. Doktycz, M. J.; Hurst, G. B.; Habibi-Goudarzi, S.; McLuckey, S. A.; Tang, K.; Chen, C. H.; Uziel, M.; Jacobson, K. B.; Woychik, R. P.; Buchanan, M. V. Anal. Biochem. 1995, 230, 205-214.
22. Egholm, M.; Buchardt, O.; Christensen, L.; Behrens, C.; Freier, S.; Driver, D. A.; Berg, R. H.; Kim, S. K.; Norden, B.; Nielsen, P. E. Nature (London) 1993, 365, 566-568.
23. Theide, C.; Bayerdorffer, E.; Blasczyk, R.; Wittig, B.; Neubauer, A. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 983-984.
24. Carlsson, C.; Jonsson, M.; Nordén, B.; Dulay, M. T.; Zare, R. N.; Noolandi, J.; Nielsen, P. E.; Tsui, L-C.; Zielinski, J. Nature (London) 1996, 380, 207.
25. Perry-O'Keefe, H.; Yao, X-W.; Coull, J. M.; Fuchs, M.; Egholm, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 14670-14675.
26. Butler, J. M.; Jiang-Baucom, P.; Huang, M.; Belgrader, P.; Girard, J. Anal. Chem. 1996, 68, 3283-3287.
27. Tang, K.; Fu, D.; Kötter, S.; Cotter, R. J.; Cantor, C. R.; Köster, H. Nucleic Acids Res. 1995, 23, 3126-3131.
28. Stoneking, M.; Hedgecock, D.; Higuchi, R. G.; Vigilant, L.; Erlich, H. A. Am. J. Hum. Genet. 1991, 48, 370-382.
29. Vigilant, L.; Pennington, R.; Harpending, H.; Kocher, T. D.; Wilson, A. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 9350-9354.
30. Horai, S.; Hayasaka, K. Am. J. Hum. Genet. 1990, 46, 828-842.
31. Anderson, S.; Bankier, A. T.; Barrell, B. G.; de Bruijn, M. H. L.; Coulson, A. R.; Drouin, J.; Eperon, I. C.; Nierlich, D. P.; Roe, B. A.; Sanger, F.; Schreier, P. H.; Smith, A. J. H.; Staden, R.; Young, I. G. Nature 1981, 290, 457-465.
32. Roskey, M. T.; Juhasz, P.; Smirnov, I. P.; Takach, E.; Martin, S. A.; Haff, L. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 4724-4729.