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ChemPhysChem

Volumn 10, Issue 9-10, 2009, Pages 1369-1379

Structure, dynamics and optical properties of fluorescent proteins: Perspectives for marker development

(2) Nienhaus, G Ulrich a Wiedenmann, Jörg b

a UNIVERSITY OF ULM (Germany)

b UNIVERSITY OF SOUTHAMPTON (United Kingdom)

Author keywords

Fluorescence imaging; Fluorescence spectroscopy; Fluorescent probes; GFP like proteins; Protein structures

Indexed keywords

ANIMALS; CLONING; DYNAMICS; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; FLUOROPHORES; OPTICAL PROPERTIES; PROTEINS;

COVALENT STRUCTURES; FLUORESCENCE MARKERS; FLUORESCENT PROBES; INDISPENSABLE TOOLS; PROTEIN STRUCTURES; RED FLUORESCENT PROTEINS; STRUCTURAL DIVERSITY; STRUCTURE AND DYNAMICS;

FLUORESCENCE IMAGING;

BIOLOGICAL MARKER; FLUORESCENT DYE; GREEN FLUORESCENT PROTEIN; IMIDAZOLINE DERIVATIVE; PHOTOPROTEIN; RED FLUORESCENT PROTEIN;

CHEMISTRY; PROTEIN TERTIARY STRUCTURE; REVIEW;

BIOLOGICAL MARKERS; FLUORESCENT DYES; GREEN FLUORESCENT PROTEINS; IMIDAZOLINES; LUMINESCENT PROTEINS; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY;

EID: 66649103781 PISSN: 14394235 EISSN: 14397641 Source Type: Journal
DOI: 10.1002/cphc.200800839 Document Type: Review

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- Kredel, S.¹ Nienhaus, K.² Wolff, M.³ Oswald, F.⁴ Ivanchenko, S.⁵ Cymer, F.⁶ Jeromin, A.⁷ Michel, F.J.⁸ Spindler, K.-D.⁹ Heilker, R.¹⁰ Nienhaus, G.U.¹¹ Wiedenmann, J.¹²

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- L. Wang, W. C. Jackson, P. A. Steinbach, R. Y. Tsien, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 16745-16749.
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- Wang, L.¹ Jackson, W.C.² Steinbach, P.A.³ Tsien, R.Y.⁴

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- X. Shu, N. C. Shaner, C. A. Yarbrough, R.Y. Tsien, S.J. Remington, Biochemistry 2006, 45, 9639-9646.
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- Shu, X.¹ Shaner, N.C.² Yarbrough, C.A.³ Tsien, R.Y.⁴ Remington, S.J.⁵

81
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- S. J. Remington, R. M. Wachter, D. K. Yarbrough, B. Branchaud, D. C. Anderson, K. Kallio, K. A. Lukyanov, Biochemistry 2005, 44, 202-212.
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- Remington, S.J.¹ Wachter, R.M.² Yarbrough, D.K.³ Branchaud, B.⁴ Anderson, D.C.⁵ Kallio, K.⁶ Lukyanov, K.A.⁷

82
- 17144419645
- M. L. Quillin, D. M. Anstrom, X. Shu, S. O'Leary, K. Kallio, D. M. Chudakov, S. J. Remington, Biochemistry 2005, 44, 5774-5787.
- (2005) Biochemistry , vol.44 , pp. 5774-5787
- Quillin, M.L.¹ Anstrom, D.M.² Shu, X.³ O'Leary, S.⁴ Kallio, K.⁵ Chudakov, D.M.⁶ Remington, S.J.⁷

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- 13244299330
- P. G. Wilmann, J. Petersen, R. J. Devenish, M. Prescott, J. Rossjohn, J. Biol. Chem. 2005, 280, 2401-2404.
- (2005) J. Biol. Chem , vol.280 , pp. 2401-2404
- Wilmann, P.G.¹ Petersen, J.² Devenish, R.J.³ Prescott, M.⁴ Rossjohn, J.⁵

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- M. Andresen, M. C. Wahl, A. C. Stiel, F. Grater, L. V. Schafer, S. Trowitzsch, G. Weber, C. Eggeling, H. Grubmuller, S. W. Hell, S. Jakobs, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 13070-13074.
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- Andresen, M.¹ Wahl, M.C.² Stiel, A.C.³ Grater, F.⁴ Schafer, L.V.⁵ Trowitzsch, S.⁶ Weber, G.⁷ Eggeling, C.⁸ Grubmuller, H.⁹ Hell, S.W.¹⁰ Jakobs, S.¹¹

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- Y. A. Tretyakova, A. A. Pakhomov, V. I. Martynov, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 7748-7749.
- (2007) J. Am. Chem. Soc , vol.129 , pp. 7748-7749
- Tretyakova, Y.A.¹ Pakhomov, A.A.² Martynov, V.I.³

86
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- T. Kogure, S. Karasawa, T. Araki, K. Saito, M. Kinjo, A. Miyawaki, Nat. Biotechnol. 2006, 24, 577-581.
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- Kogure, T.¹ Karasawa, S.² Araki, T.³ Saito, K.⁴ Kinjo, M.⁵ Miyawaki, A.⁶

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- M. A. Shkrob, Y. G. Yanushevich, D. M. Chudakov, N. G. Gurskaya, Y. A. Labas, S. Y. Poponov, N. N. Mudrik, S. Lukyanov, K. A. Lukyanov, Biochem. J. 2006, 392, 649-654.
- (2006) Biochem. J , vol.392 , pp. 649-654
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- A. Schenk, S. Ivanchenko, C. Röcker, J. Wiedenmann, G. U. Nienhaus, Biophys. J. 2004, 86, 384-394.
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- Schenk, A.¹ Ivanchenko, S.² Röcker, C.³ Wiedenmann, J.⁴ Nienhaus, G.U.⁵

89
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- R. Ando, H. Hama, M. Yamamoto-Hino, H. Mizuno, A. Miyawaki, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002, 99, 12651-12656.
- (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.99 , pp. 12651-12656
- Ando, R.¹ Hama, H.² Yamamoto-Hino, M.³ Mizuno, H.⁴ Miyawaki, A.⁵

90
- 21544445247
- K. Nienhaus, G. U. Nienhaus, J. Wiedenmann, H. Nar, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 9156-9159.
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91
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- N. G. Gurskaya, V. V. Verkhusha, A. S. Shcheglov, D. B. Staroverov, T. V. Chepurnykh, A. F. Fradkov, S. Lukyanov, K. A. Lukyanov, Nat. Biotechnol. 2006, 24, 461-465.
- (2006) Nat. Biotechnol , vol.24 , pp. 461-465
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92
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- Y. A. Labas, N. G. Gurskaya, Y. G. Yanushevich, A. F. Fradkov, K. A. Lukyanov, S. A. Lukyanov, M. V. Matz, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002, 99, 4256-4261.
- (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.99 , pp. 4256-4261
- Labas, Y.A.¹ Gurskaya, N.G.² Yanushevich, Y.G.³ Fradkov, A.F.⁴ Lukyanov, K.A.⁵ Lukyanov, S.A.⁶ Matz, M.V.⁷

93
- 33846794586
- F. Oswald, F. Schmitt, A. Leutenegger, S. Ivanchenko, C. D'Angelo, A. Salih, S. Maslakova, M. Bulina, R. Schirmbeck, G. U. Nienhaus, M.V. Matz, J. Wiedenmann, FEBS J. 2007, 274, 1102-1109.
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- Oswald, F.¹ Schmitt, F.² Leutenegger, A.³ Ivanchenko, S.⁴ D'Angelo, C.⁵ Salih, A.⁶ Maslakova, S.⁷ Bulina, M.⁸ Schirmbeck, R.⁹ Nienhaus, G.U.¹⁰ Matz, M.V.¹¹ Wiedenmann, J.¹²

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- J. J. van Thor, G.Y Georgiev, M. Towrie, J.T. Sage, J. Biol. Chem. 2005, 280, 33652-33659.
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- van Thor, J.J.¹ Georgiev, G.Y.² Towrie, M.³ Sage, J.T.⁴

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- G. U. Nienhaus, J. D. Müller, B. H. McMahon, H. Frauenfelder, Physica D 1997, 107, 297-311.
- (1997) Physica D , vol.107 , pp. 297-311
- Nienhaus, G.U.¹ Müller, J.D.² McMahon, B.H.³ Frauenfelder, H.⁴

106
- 0032506222
- U. Haupts, S. Maiti, P. Schwille, W.W. Webb, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1998, 95, 13573-13578.
- (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.95 , pp. 13573-13578
- Haupts, U.¹ Maiti, S.² Schwille, P.³ Webb, W.W.⁴

107
- 0034710922
- A. A. Heikal, S.T. Hess, G. S. Baird, R.Y Tsien, W.W. Webb, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 11996-12001.
- (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.97 , pp. 11996-12001
- Heikal, A.A.¹ Hess, S.T.² Baird, G.S.³ Tsien, R.Y.⁴ Webb, W.W.⁵

108
- 0034602653
- P. Schwille, S. Kummer, A. A. Heikal, W. E. Moerner, W.W. Webb, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 151-156.
- (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.97 , pp. 151-156
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109
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- P. S. Dittrich, S. P. Schäfer, P. Schwille, Biophys. J. 2005, 89, 3446-3455.
- (2005) Biophys. J , vol.89 , pp. 3446-3455
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110
- 0043141513
- G. Jung, S. Mais, A. Zumbusch, C. Bräuchle, J. Phys. Chem. A 2000, 104, 873-877.
- (2000) J. Phys. Chem. A , vol.104 , pp. 873-877
- Jung, G.¹ Mais, S.² Zumbusch, A.³ Bräuchle, C.⁴

111
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- J. Widengren, R. Rigler, Cell. Mol. Biol. 1998, 44, 857-879.
- (1998) Cell. Mol. Biol , vol.44 , pp. 857-879
- Widengren, J.¹ Rigler, R.²

112
- 43849083731
- J. Hendrix, C. Flors, P. Dedecker, J. Hofkens, Y. Engelborghs, Biophys. J. 2008, 94, 4103-4113.
- (2008) Biophys. J , vol.94 , pp. 4103-4113
- Hendrix, J.¹ Flors, C.² Dedecker, P.³ Hofkens, J.⁴ Engelborghs, Y.⁵

113
- 0034877121
- F. Malvezzi-Campeggi, M. Jahnz, K. G. Heinze, P. Dittrich, P. Schwille, Biophys. J. 2001, 81, 1776-1785.
- (2001) Biophys. J , vol.81 , pp. 1776-1785
- Malvezzi-Campeggi, F.¹ Jahnz, M.² Heinze, K.G.³ Dittrich, P.⁴ Schwille, P.⁵

114
- 33646587400
- D. C. Loos, S. Habuchi, C. Flors, J. Hotta, J. Wiedenmann, G. U. Nienhaus, J. Hofkens, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 6270-6271.
- (2006) J. Am. Chem. Soc , vol.128 , pp. 6270-6271
- Loos, D.C.¹ Habuchi, S.² Flors, C.³ Hotta, J.⁴ Wiedenmann, J.⁵ Nienhaus, G.U.⁶ Hofkens, J.⁷

115
- 38049170544
- P. Abbyad, W. Childs, X. Shi, S. G. Boxer, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 20189-20194.
- (2007) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.104 , pp. 20189-20194
- Abbyad, P.¹ Childs, W.² Shi, X.³ Boxer, S.G.⁴

116
- 22144438295
- S. Habuchi, R. Ando, P. Dedecker, W. Verheijen, H. Mizuno, A. Miyawaki, J. Hofkens, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 9511-9516.
- (2005) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.102 , pp. 9511-9516
- Habuchi, S.¹ Ando, R.² Dedecker, P.³ Verheijen, W.⁴ Mizuno, H.⁵ Miyawaki, A.⁶ Hofkens, J.⁷

117
- 0347928662
- D. M. Chudakov, V. V. Belousov, A. G. Zaraisky, V. V. Novoselov, D. B. Staroverov, D. B. Zorov, S. Lukyanov, K. A. Lukyanov, Nat. Biotechnol. 2003, 27, 191-194.
- (2003) Nat. Biotechnol , vol.27 , pp. 191-194
- Chudakov, D.M.¹ Belousov, V.V.² Zaraisky, A.G.³ Novoselov, V.V.⁴ Staroverov, D.B.⁵ Zorov, D.B.⁶ Lukyanov, S.⁷ Lukyanov, K.A.⁸

118
- 53249129686
- A. C. Stiel, M. Andresen, H. Bock, M. Hilbert, J. Schilde, A. Schonle, C. Eggeling, A. Egner, S. W. Hell, S. Jakobs, Biophys. J. 2008, 95, 2989-2997.
- (2008) Biophys. J , vol.95 , pp. 2989-2997
- Stiel, A.C.¹ Andresen, M.² Bock, H.³ Hilbert, M.⁴ Schilde, J.⁵ Schonle, A.⁶ Eggeling, C.⁷ Egner, A.⁸ Hell, S.W.⁹ Jakobs, S.¹⁰

119
- 57449111689
- V. Adam, M. Lelimousin, S. Boehme, G. Desfonds, K. Nienhaus, M.J. Field, J. Wiedenmann, S. McSweeney, G. U. Nienhaus, D. Bourgeois, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 18343-18348.
- (2008) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.105 , pp. 18343-18348
- Adam, V.¹ Lelimousin, M.² Boehme, S.³ Desfonds, G.⁴ Nienhaus, K.⁵ Field, M.J.⁶ Wiedenmann, J.⁷ McSweeney, S.⁸ Nienhaus, G.U.⁹ Bourgeois, D.¹⁰

120
- 33749026335
- M. J. Rust, M. Bates, X. Zhuang, Nat. Methods 2006, 3, 793-795.
- (2006) Nat. Methods , vol.3 , pp. 793-795
- Rust, M.J.¹ Bates, M.² Zhuang, X.³

121
- 35948950088
- A. Egner, C. Geisler, C. von Middendorff, H. Bock, D. Wenzel, R. Medda, M. Andresen, A. C. Stiel, S. Jakobs, C. Eggeling, A. Schonle, S.W. Hell, Biophys. J. 2007, 93, 3285-3290.
- (2007) Biophys. J , vol.93 , pp. 3285-3290
- Egner, A.¹ Geisler, C.² von Middendorff, C.³ Bock, H.⁴ Wenzel, D.⁵ Medda, R.⁶ Andresen, M.⁷ Stiel, A.C.⁸ Jakobs, S.⁹ Eggeling, C.¹⁰ Schonle, A.¹¹ Hell, S.W.¹²

122
- 0043269811
- M. A. Marques, X. Lopez, D. Varsano, A. Castro, A. Rubio, Phys. Rev. Lett. 2003, 90, 258101.
- (2003) Phys. Rev. Lett , vol.90 , pp. 258101
- Marques, M.A.¹ Lopez, X.² Varsano, D.³ Castro, A.⁴ Rubio, A.⁵

123
- 0035928131
- V. Tozzini, R. Nifosi, J. Phys. Chem. B 2001, 105, 5797-5803.
- (2001) J. Phys. Chem. B , vol.105 , pp. 5797-5803
- Tozzini, V.¹ Nifosi, R.²

124
- 0037449124
- J. H. Bae, M. Rubini, G. Jung, G. Wiegand, M. H. Seifert, M. K. Azim, J. S. Kim, A. Zumbusch, T. A. Holak, L. Moroder, R. Huber, N. Budisa, J. Mol. Biol. 2003, 328, 1071-1081.
- (2003) J. Mol. Biol , vol.328 , pp. 1071-1081
- Bae, J.H.¹ Rubini, M.² Jung, G.³ Wiegand, G.⁴ Seifert, M.H.⁵ Azim, M.K.⁶ Kim, J.S.⁷ Zumbusch, A.⁸ Holak, T.A.⁹ Moroder, L.¹⁰ Huber, R.¹¹ Budisa, N.¹²

125
- 38049110263
- H. Shroff, C. G. Galbraith, J.A. Galbraith, H. White, J. Gillette, S. Olenych, M. W. Davidson, E. Betzig, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 20308-20313.
- (2007) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.104 , pp. 20308-20313
- Shroff, H.¹ Galbraith, C.G.² Galbraith, J.A.³ White, H.⁴ Gillette, J.⁵ Olenych, S.⁶ Davidson, M.W.⁷ Betzig, E.⁸

126
- 41449104141
- T. Matsuda, A. Miyawaki, T. Nagai, Nat. Methods 2008, 5, 339-345.
- (2008) Nat. Methods , vol.5 , pp. 339-345
- Matsuda, T.¹ Miyawaki, A.² Nagai, T.³

127
- 34250304369
- S. Ivanchenko, S. Glaschick, C. Rocker, F. Oswald, J. Wiedenmann, G. U. Nienhaus, Biophys. J. 2007, 92, 4451-4457.
- (2007) Biophys. J , vol.92 , pp. 4451-4457
- Ivanchenko, S.¹ Glaschick, S.² Rocker, C.³ Oswald, F.⁴ Wiedenmann, J.⁵ Nienhaus, G.U.⁶

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.