Effect of dehydration on the aggregation kinetics of two amyloid peptides

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 2, 2009, Pages 531-535

  Mukherjee, Smita ^a   Chowdhury, Pramit ^a   Gai, Feng ^a  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINES; FORMING; GLYCOPROTEINS; HYDRATION; INFRARED SPECTROSCOPY; PEPTIDES; PROTEIN FOLDING; SPECTROSCOPIC ANALYSIS; TRANSMISSION ELECTRON MICROSCOPY;

AGGREGATE FORMATIONS; AGGREGATION KINETICS; AMYLOID FORMATIONS; AMYLOID PEPTIDES; IN-VIVO; INTERFACIAL WATER MOLECULES; MOLECULAR CROWDING; REVERSE MICELLES; WATER MOLECULES;

MOLECULES;

EID: 61949248657     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp809817s     Document Type: Article

References (62)

1. Soto, C. FEBS Lett. 2001, 498, 204.
2. Chiti, F.; Dobson, C. M. Annu. Rev. Biochem. 2006, 75, 333.
3. Kelly, J. W. Curr. Opin. Chem. Biol. 1998, 8, 101.
4. Dobson, C. M. Nature (London) 2003, 426, 884.
5. Thirumalai, D.; Kliraov, D. K.; Dima, R. I. Curr. Opin. Chem. Biol. 2003, 13, 146.
6. Tycko, R. Biochemistry 2003, 42, 3151.
7. Teplow, D. B.; Lazo, N. D.; Bitan, G.; Bernstein, S.; Wyttenbach, T.; Bowers, M. T.; Baumketner, A.; Shea, J. E.; Urbanc, B.; Cruz, L.; Borreguero, J.; Stanley, H. E. Acc. Chem. Res. 2006, 39, 635.
8. Chen, M.; Margittai, M.; Chen, J.; Langen, R. J. Biol. Chem. 2007, 282, 24970.
9. Haass, C.; Selkoe, D. J. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2007, 8, 101.
10. Bieschke, J.; Siegel, S. J.; Fu, Y. W.; Kelly, J. W. Biochemistry 2008, 47, 50.
11. Kim, Y. S.; Liu, L.; Axelsen, P. H.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 7720.
12. Shashilov, V. A.; Lednev, I. K. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 309.
13. Strasfeld, D. B.; Ling, Y. L.; Shim, S. H.; Zanni, M. T. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 3762.
14. Jarrett, J. T.; Berger, E. P.; Lansbury, P. T. Biochemistry 1993, 32, 4693.
15. Shen, C. L.; Murphy, R. M. Biophys. J. 1995, 69, 640.
16. Wood, S. J.; Maleeff, B.; Hart, T.; Wetzel, R. J. Mol. Biol. 1996, 5, 870.
17. Harper, J. D.; Lansbury, P. T. Annu. Rev. Biochem. 1997, 66, 385.
18. Nielsen, L.; Khurana, R.; Coats, A.; Frokjaer, S.; Brange, J.; Vyas, S.; Uversky, V. N.; Fink, A. L. Biochemistry 2001, 40, 6036.
19. Gorman, P. M.; Yip, C. M.; Fraser, P. E.; Chakrabartty, A. J. Mol. Biol. 2003, 325, 743.
20. Pedersen, J. S.; Dikov, D.; Flink, J. L.; Hjuler, H. A.; Christiansen, G.; Otzen, D. J. Mol. Biol. 2005, 355, 501.
21. Marek, P.; Abedini, A.; Song, B. B.; Kanungo, M.; Johnson, M. E.; Gupta, R.; Zaman, W.; Wong, S. S.; Raleigh, D. P. Biochemistry 2007, 46, 3255.
22. Wolf, M. G.; Jongejan, J. A.; Laman, J. D.; de Leeuw., S. W. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 15772.
23. Balbach, J. J.; Ishii, Y.; Antzutkin, O. N.; Leapman, R. D.; Rizzo, N. W.; Dyda, F.; Reed, J.; Tycko, R. Biochemistry 2000, 39, 13748.
24. Balbirnie, M.; Grothe, R.; Eisenberg, D. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 2375.
25. Klimov, D.; Thirumalai, D. Structure 2003, 11, 295.
26. Lipfert, J.; Franklin, J.; Wu, F.; Doniach, S. J. Mol. Biol. 2005, 349, 648.
27. Zheng, J.; Ma, B.; Tsai, C. J.; Nussinov, R. Biophys. J. 2006, 91, 824.
28. Esposito, L.; Pedone, C.; Vitagliano, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 11533.
29. Luisi, L. P. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1985, 24, 439.
30. Mukherjee, S.; Chowdhury, P.; Gai, F. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 4596.
31. Levinger, N. E. Science 2002, 29, 1722.
32. Barth, A.; Zscherp, C. Q. Rev. Biophys. 2002, 35, 369.
33. Favrin, G.; Irbäck, A.; Mohanty, S. Biophys. J. 2004, 87, 3657.
34. Ma, B.; Nussinov, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 14126.
35. Petty, S. A.; Decatur, S. M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 13488.
36. Nelson, R.; Sawaya, M. R.; Balbirnie, M.; Madsen, A. O.; Riekel, C.; Grothe, R.; Eisenberg, D. Nature (London) 2005, 435, 773.
37. Maitra, A. J. Phys. Chem. 1984, 88, 5122.
38. Mukherjee, S.; Chowdhury, P.; DeGrado, W. F.; Gai, F. Langmuir 2007, 23, 11174.
39. Zhou, H. X. J. Chem. Phys. 2007, 127, 245101 (1-4)
40. Wu, Y.; Vadrevu, R.; Kathuria, S.; Yang, X. Y.; Matthews, C. R. J. Mol. Biol. 2007, 366, 1624.
41. Lynn, D. G.; Meredith, S. C. J. Mol. Biol. 2000, 130, 153.
42. Strodel, B.; Whittleston, C. S.; Wales, D. J. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 16005.
43. Garcia, A. E.; Hummer, G.; Soumpasis, D. M. Proteins 1997, 27, 471.
44. Xue, W. F.; Homans, S. W.; Radford, S. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 8926.
45. Yip, C. M.; McLaurin, J. Biophys. J. 2001, 80, 1359.
46. Dante, S.; Hauss, T.; Dencher, N. A. Biophys. J. 2002, 83, 2610.
47. Murphy, R. M. Biochim. Biophys. Acta 2007, 1768, 1923.
48. Krone, M. G.; Hua, L.; Soto, P.; Zhou, R.; Berne, B. J.; Shea, J. E. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 11066.
49. Hummer, G.; Garde, S. Phys. Rev. Lett. 1998, 80, 4193.
50. Lum, K.; Chandler, D.; Weeks, J. D. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 4570.
51. Liu, P.; Huang, X. H.; Zhou, R. H.; Berne, B. J. Nature (London) 2005, 437, 159.
52. MacCallum, J. L.; Moghaddam, M. S.; Chan, H. S.; Tieleman, D. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 6206.
53. Lashuel, H. A.; Hartley, D.; Petre, B. M.; Walz, T.; Lansbury, P. T. Nature (London) 2002, 418, 291.
54. Zhu, M.; Han, S.; Zhou, F.; Carter, S. A.; Fink, A. L. J. Biol. Chem. 2004, 279, 24452.
55. Srinivasan, R.; Marchant, R. E.; Zagorski, M. G. Amyloid 2004, 11, 10.
56. Avidan-Shpalter, C.; Gazit, E. Amyloid 2006, 13, 216.
57. Zheng, J.; Jang, H.; Ma, B.; Nussinov, R. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 6856.
58. Tarus, B.; Straub, J. E.; Thirumalai, D. J. Mol. Biol. 2005, 345, 1141.
59. Fernández, A.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 113.
60. De Simone, A.; Dodson, G. G.; Verma, C. S.; Zagari, A.; Fraternali, F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 7535.
61. Dzwolak, W.; Ravindra, R.; Nicolini, C.; Jansen, R.; Winter, R. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 3762.
62. Yang, D. S.; Yip, C. M.; Huang, T. H.; Chakrabartty, A.; Fraser, P. E. J. Biol. Chem. 1999, 274, 32970.