Engineering proteins with novel mechanical properties by recombination of protein fragments

Angewandte Chemie - International Edition

Volumn 45, Issue 34, 2006, Pages 5633-5638

  Sharma, Deepak ^a   Cao, Yi ^a   Li, Hongbin ^a  

^a UNIVERSITY OF BRITISH COLUMBIA   (Canada)

Author keywords

Protein engineering; Protein structures; Scanning probe microscopy; Single molecule studies

Indexed keywords

PROTEIN ENGINEERING; PROTEIN STRUCTURES; SCANNING PROBE MICROSCOPY; SINGLE-MOLECULE STUDIES;

DNA; MECHANICAL PROPERTIES; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR STRUCTURE;

PROTEINS;

RECOMBINANT PROTEIN;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; BIOMECHANICS; CHEMISTRY; MOLECULAR GENETICS; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN ENGINEERING; PROTEIN FOLDING; SEQUENCE HOMOLOGY;

AMINO ACID SEQUENCE; BIOMECHANICS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN ENGINEERING; PROTEIN FOLDING; RECOMBINANT PROTEINS; SEQUENCE HOMOLOGY, AMINO ACID;

EID: 33748552058     PISSN: 14337851     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/anie.200600382     Document Type: Article

References (51)

1. G. Bao, S. Suresh, Nat. Mater. 2003, 2, 715.
2. A. S. Tatham, P. R. Shewry, Trends Biochem. Sci. 2000, 25, 567.
3. N. Becker, E. Oroudjev, S. Mutz, J. P. Cleveland, P. K. Hansma, C. Y. Hayashi, D. E. Makarov, H. G. Hansma, Nat. Mater. 2003, 2, 278.
4. J. C. van Hest, D. A. Tirrell, Chem. Commun. 2001, 1897.
5. T. E. Fisher, A. F. Oberhauser, M. Carrion-Vazquez, P. E. Marszalek, J. M. Fernandez, Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 379.
6. D. S. Goodsell, Bionanotechnology, Wiley-Liss, Hoboken, 2004.
7. M. Rief, M, Gautel, F. Oesterhelt, J. M. Fernandez, H. E. Gaub, Science 1997, 276, 1109.
8. M. S. Kellermayer, S. B. Smith, H. L. Granzier, C. Bustamante, Science 1997, 276, 1112.
9. L. Tskhovrebova, J. Trinick, J. A. Sleep, R. M. Simmons, Nature 1997, 387, 308.
10. A. F. Oberhauser, P. E. Marszalek, H. P. Erickson, J. M. Fernandez, Nature 1998, 393, 181.
11. M. Carrion-Vazquez, A. F. Oberhauser, S. B. Fowler, P. E. Marszalek, S. E. Broedel, J. Clarke, J. M. Fernandez, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 3694.
12. M. Carrion-Vazquez, A. F. Oberhauser, T. E. Fisher, P. E. Marszalek, H. B. Li, J. M. Fernandez, Prog. Biophys. Mol. Biol. 2000, 74, 63.
13. R. B. Best, D. J. Brockwell, J. L. Toca-Herrera, A. W. Blake, D. A. Smith, S. E. Radford, J. Clarke, Anal. Chim. Acta 2003, 479, 87.
14. X. Zhuang, M. Rief, Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 88.
15. B. Samori, G. Zuccheri, P. Baschieri, ChemPhysChem 2005, 6, 29.
16. H. Li, W. A. Linke, A. F. Oberhauser, M. Carrion-Vazquez, J. G. Kerkvliet, H. Lu, P. E. Marszalek, J. M. Fernandez, Nature 2002, 418, 998.
17. A. F. Oberhauser, C. Badilla-Fernandez, M. Carrion-Vazquez, J. M. Fernandez, J. Mol. Biol. 2002, 319, 433.
18. S. P. Ng, R. W. Rounsevell, A. Steward, C. D. Geierhaas, P. M. Williams, E. Paci, J. Clarke, J. Mol. Biol. 2005, 350, 776.
19. D. J. Brockwell, G. S. Beddard, J. Clarkson, R. C. Zinober, A. W. Blake, J. Trinick, P. D. Olmsted, D. A. Smith, S. E. Radford, Biophys. J. 2002, 83, 458.
20. G. Yang, C. Cecconi, W. A. Baase, I. R. Vetter, W. A. Breyer, J. A. Haack, B. W. Matthews, F. W. Dahlquist, C. Bustamante, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 139.
21. H. Dietz, M. Rief, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 16 192.
22. D. J. Brockwell, G. S. Beddard, E. Paci, D. K. West, P. D. Olmsted, D. A. Smith, S. E. Radford, Biophys. J. 2005, 89, 506.
23. R. B. Best, B. Li, A. Steward, V. Daggett, J. Clarke, Biophys. J. 2001, 81, 2344.
24. C. Cecconi, E. A. Shank, C. Bustamante, S. Marqusee, Science 2005, 309, 2057.
25. Y. Cao, C. Lam, M. Wang, H. Li, Angew. Chem. 2006, 45, 658;
26. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 642.
27. H. Li, M. Carrion-Vazquez, A. F. Oberhauser, P. E. Marszalek, J. M. Fernandez, Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 1117.
28. P. M. Williams, S. B. Fowler, R. B. Best, J. L. Toca-Herrera, K. A. Scott, A. Steward, J. Clarke, Nature 2003, 422, 446.
29. H. Li, J. M. Fernandez, J. Mol. Biol. 2003, 334, 75.
30. J. D. Bloom, M. M. Meyer, P. Meinhold, C. R. Otey, D. MacMillan, F. H. Arnold, Curr. Opin. Struct. Biol. 2005, 15, 447.
31. C. A. Voigt, C. Martinez, Z. G. Wang, S. L. Mayo, F. H. Arnold, Nat. Struct. Biol. 2002, 9, 553.
32. J. A. Bittker, B. V. Le, J. M. Liu, D. R. Liu, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 7011.
33. K. E. Griswold, Y. Kawarasaki, N. Ghoneim, S. J. Benkovic, B. L. Iverson, G. Georgiou, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 10 082.
34. S. Labeit, B. Kolmerer, Science 1995, 270, 293.
35. M. Carrion-Vazquez, P. E. Marszalek, A. F. Oberhauser, J. M. Fernandez, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 11 288.
36. S. B. Fowler, R. B. Best, J. L. Toca Herrera, T. J. Rutherford, A. Steward, E. Paci, M. Karplus, J. Clarke, J. Mol. Biol. 2002, 322, 841.
37. M. Gao, H. Lu, K. Schulten, J. Muscle Res. Cell Motil. 2002, 23, 513.
38. H. Lu, B. Isralewitz, A. Krammer, V. Vogel, K. Schulten, Biophys. J. 1998, 75, 662.
39. H. Lu, K. Schulten, Biophys. J. 2000, 79, 51.
40. E. Paci, M. Karplus, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 6521.
41. S. Improta, A. S. Politou, A. Pastore, Structure 1996, 4, 323.
42. H. Li, A. F. Oberhauser, S. D. Redick, M. Carrion-Vazquez, H. P. Erickson, J. M. Fernandez, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 10 682.
43. J. F. Marko, E. D. Siggia, Macromolecules 1995, 28, 8759.
44. H. Dietz, M. Rief, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006, 103, 1244.
45. A. S. Politou, D. J. Thomas, A. Pastore, Biophys. J. 1995, 69, 2601.
46. D. K. West, D. J. Brockwell, P. D. Olmsted, S. E. Radford, E. Paci, Biophys. J. 2006, 90, 287.
47. C. R. Otey, J. J. Silberg, C. A. Voigt, J. B. Endelman, G. Bandara, F. H. Arnold, Chem. Biol. 2004, 11, 309.
48. G. Sarkar, S. S. Sommer, Biotechniques 1990, 8, 404.
49. J. M. Fernandez, H. Li, Science 2004, 303, 1674.
50. E. L. Florin, M. Rief, H. Lehmann, M. Ludwig, C. Dornmair, V. T. Moy, H. E. Gaub, Biosens. Bioelectron. 1995, 10, 895.
51. J. L. Hutter, J. Bechhoefer, Rev. Sci. Instrum. 1993, 64, 3342.