Multiple-locus variable number tandem repeats analysis for genetic fingerprinting of pathogenic bacteria

Electrophoresis

Volumn 26, Issue 13, 2005, Pages 2567-2582

  Lindstedt, Bjørn Arne ^a  

^a NORWEGIAN INSTITUTE OF PUBLIC HEALTH   (Norway)

Author keywords

DNA fingerprinting; Multiple locus variable number tandem repeats analysis; Pathogenic bacteria; Review

Indexed keywords

BACTERIA; DNA; DNA SEQUENCES;

BACTERIAL SPECIES; DISCRIMINATIVE POWER; DNA FINGERPRINTING; GENETIC FINGERPRINTING; INFECTIOUS AGENTS; MULTIPLE-LOCUS VARIABLE-NUMBER TANDEM REPEAT ANALYSE; PATHOGENIC BACTERIUM; REPEAT ANALYSIS; TANDEM REPEATS; VARIABLE NUMBER;

CHROMOSOMES;

BACILLUS ANTHRACIS; BACTERIAL GENETICS; BACTERIAL GENOME; BACTERIUM IDENTIFICATION; BORDETELLA PERTUSSIS; BORRELIA; CHROMOSOME REPLICATION; DNA FINGERPRINTING; ENTEROCOCCUS FAECIUM; ESCHERICHIA COLI O157; FRANCISELLA TULARENSIS; GENE SEQUENCE; GENETIC POLYMORPHISM; HAEMOPHILUS INFLUENZAE; LEPTOSPIRA INTERROGANS; MYCOBACTERIUM AVIUM; MYCOBACTERIUM BOVIS; MYCOBACTERIUM LEPRAE; MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS; NEISSERIA MENINGITIDIS; NONHUMAN; PSEUDOMONAS AERUGINOSA; REPRODUCIBILITY; REVIEW; SALMONELLA TYPHI; SALMONELLA TYPHIMURIUM; STAPHYLOCOCCUS AUREUS; VARIABLE NUMBER OF TANDEM REPEAT; XYLELLA FASTIDIOSA; YERSINIA PESTIS;

EID: 22244459534     PISSN: 01730835     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/elps.200500096     Document Type: Review

References (154)

1. Vergnaud, G., Denoeud, F., Genome Res. 2000, 10, 899-907.
2. Denoeud, F., Vergnaud, G., Benson, G., Genome Res. 2003, 13, 856-867.
3. Mayr, W. R., Transfus. Clin. Biol. 1995, 2, 325-328.
4. Everett, C. M., Wood, N. W., Brain 2004, 127, 2385-2405.
5. Tuntiwechapikul, W., Salazar, M., Biochemistry 2002, 41, 854-860.
6. Moxon, E. R., Rainey, P. B., Nowak, M. A., Lenski, R. E., Curr. Biol. 1994, 4, 24-33.
7. Martin, P., van, d., V, Mouchel, N., Jeffries, A. C., Hood, D. W., Moxon, E. R., Mol. Microbiol. 2003, 50, 245-257.
8. LeClerc, J. E., Li, B., Payne, W. L., Cebula, T. A., Science 1996, 274, 1208-1211.
9. Debrauwere, H., Buard, J., Tessier, J., Aubert, D., Vergnaud, G., Nicolas, A., Nat. Genet. 1999, 23, 367-371.
10. Lopes, J., Debrauwere, H., Buard, J., Nicolas, A., EMBO J. 2002, 21, 3201-3211.
11. Rocha, E. P., Danchin, A., Viari, A., Res. Microbiol. 1999, 150, 725-733.
12. van Belkum, A., Cell Mol. Life Sci. 1999, 56, 729-734.
13. van Belkum, A., Curr. Opin. Microbiol. 1999, 2, 306-311.
14. Enright, M. C., Spratt, B. G., Trends Microbiol. 1999, 7, 482-487.
15. Foucault, C., La Scola, B., Lindroos, H., Andersson, S. G., Raoult, D., J. Clin. Microbiol. 2005, 43, 41-48.
16. Fournier, P. E., Zhu, Y., Ogata, H., Raoult, D., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 5757-5766.
17. Brookes, A. J., Gene 1999, 234, 177-186.
18. Fakhrai-Rad, H., Pourmand, N., Ronaghi, M., Hum. Mutat. 2002, 19, 479-485.
19. Gut, I. G., Hum. Mutat. 2004, 23, 437-441.
20. Redmond, C., Pearce, M. J., Manchee, R. J., Berdal, B. P., Nature 1998, 393, 747-748.
21. Harrell, L. J., Andersen, G. L., Wilson, K. H., J. Clin. Microbiol. 1995, 33, 1847-1850.
22. Helgason, E., Okstad, O. A., Caugant, D. A., Johansen, H. A., Fouet, A., Mock, M., Hegna, I., Kolsto, A., Appl. Environ. Microbiol. 2000, 66, 2627-2630.
23. Henderson, I., Yu, D., Turnbull, P. C., FEMS Microbiol. Lett. 1995, 128, 113-118.
24. Keim, P., Kalif, A., Schupp, J., Hill, K., Travis, S. E., Richmond, K., Adair, D. M., Hugh-Jones, M., Kuske, C. R., Jackson, P., J. Bacteriol. 1997, 179, 818-824.
25. Andersen, G. L., Simchock, J. M., Wilson, K. H., J. Bacteriol. 1996, 178, 377-384.
26. Jackson, P. J., Walthers, E. A., Kalif, A. S., Richmond, K. L., Adair, D. M., Hill, K. K., Kuske, C. R., Andersen, G. L., Wilson, K. H., Hugh-Jones, M., Keim, P., Appl. Environ. Microbiol. 1997, 63, 1400-1405.
27. Keim, P., Klevytska, A. M., Price, L. B., Schupp, J. M., Zinser, G., Smith, K. L., Hugh-Jones, M. E., Okinaka, R., Hill, K. K., Jackson, P. J., J. Appl. Microbiol. 1999, 87, 215-217.
28. Schupp, J. M., Klevytska, A. M., Zinser, G., Price, L. B., Keim, P., J. Bacteriol. 2000, 182, 3989-3997.
29. Keim, P., Price, L. B., Klevytska, A. M., Smith, K. L., Schupp, J. M., Okinaka, R., Jackson, P. J., Hugh-Jones, M. E., J. Bacteriol. 2000, 182, 2928-2936.
30. Le Fleche, P., Hauck, Y., Onteniente, L., Prieur, A., Denoeud, F., Ramisse, V., Sylvestre, P., Benson, G., Ramisse, F., Vergnaud, G., BMC. Microbiol. 2001, 1, 2.
31. Smith, K. L., DeVos, V., Bryden, H., Price, L. B., Hugh-Jones, M. E., Keim, P., J. Clin. Microbiol. 2000, 38, 3780-3784.
32. Hoffmaster, A. R., Fitzgerald, C. C., Ribot, E., Mayer, L. W., Popovic, T., Emerg. Infect. Dis. 2002, 8, 1111-1116.
33. Fouet, A., Smith, K. L., Keys, C., Vaissaire, J., Le Doujet, C., Levy, M., Mock, M., Keim, P., J. Clin. Microbiol. 2002, 40, 4732-4734.
34. Gierczynski, R., Kaluzewski, S., Rakin, A., Jagielski, M., Zasada, A., Jakubczak, A., Borkowska-Opacka, B., Rastawicki, W., FEMS Microbiol. Lett. 2004, 239, 235-240.
35. Keim, P., Smith, K. L., Curr. Top. Microbiol. Immunol. 2002, 271, 21-32.
36. Perry, R. D., Fetherston, J. D., Clin. Microbiol. Rev. 1997, 10, 35-66.
37. Achtman, M., Morelli, G., Zhu, P., Wirth, T., Diehl, I., Kusecek, B., Vogler, A. J., Wagner, D. M., Allender, C. J., Easterday, W. R., Chenal-Francisque, V., Worsham, P., Thomson, N. R., Parkhill, J., Lindler, L. E., Carniel, E., Keim, P., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 17837-17842.
38. Inglesby, T. V., Dennis, D. T., Henderson, D. A., Bartlett, J. G., Ascher, M. S., Eitzen, E., Fine, A. D., Friedlander, A. M., Hauer, J., Koerner, J. F., Layton, M., McDade, J., Osterholm, M. T., O'Toole, T., Parker, G., Perl, T. M., Russell, P. K., Schoch-Spana, M., Tonat, K., JAMA 2000, 283, 2281-2290.
39. Rollins, S. E., Rollins, S. M., Ryan, E. T., Am. J. Clin. Pathol. 2003, 119 Suppl, S78-S85.
40. Achtman, M., Zurth, K., Morelli, G., Torrea, G., Guiyoule, A., Carniel, E., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 14043-14048.
41. Buchrieser, C., Rusniok, C., Frangeul, L., Couve, E., Billault, A., Kunst, F., Carniel, E., Glaser, P., Infect. Immun. 1999, 67, 4851-4861.
42. Adair, D. M., Worsham, P. L., Hill, K. K., Klevytska, A. M., Jackson, P. J., Friedlander, A. M., Keim, P., J. Clin. Microbiol. 2000, 38, 1516-1519.
43. Benson, G., Nucleic Acids Res. 1999, 27, 573-580.
44. Klevytska, A. M., Price, L. B., Schupp, J. M., Worsham, P. L., Wong, J., Keim, P., J. Clin. Microbiol. 2001, 39, 3179-3185.
45. Pourcel, C., Andre-Mazeaud, F., Neubauer, H., Ramisse, F., Vergnaud, G., BMC. Microbiol. 2004, 4, 22.
46. Lowell, J. L., Wagner, D. M., Atshabar, B., Antolin, M. F., Vogler, A. J., Keim, P., Chu, M. C., Gage, K. L., J. Clin. Microbiol. 2005, 43, 650-656.
47. Tarnvik, A., Berglund, L., Eur. Respir. J. 2003, 21, 361-373.
48. Titball, R. W., Johansson, A., Forsman, M., Trends Microbiol. 2003, 11, 118-123.
49. Gallagher-Smith, M., Kim, J., Al Bawardy, R., Josko, D., Clin. Lab. Sci. 2004, 17, 35-39.
50. Oyston, P. C., Sjostedt, A., Titball, R. W., Nat. Rev. Microbiol. 2004, 2, 967-978.
51. Johansson, A., Goransson, I., Larsson, P., Sjostedt, A., J. Clin. Microbiol. 2001, 39, 3140-3146.
52. Goethert, H. K., Shani, I., Telford, S. R., III., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 4968-4973.
53. Farlow, J., Smith, K. L., Wong, J., Abrams, M., Lytle, M., Keim, P., J. Clin. Microbiol. 2001, 39, 3186-3192.
54. Johansson, A., Farlow, J., Larsson, P., Dukerich, M., Chambers, E., Bystrom, M., Fox, J., Chu, M., Forsman, M., Sjostedt, A., Keim, P., J. Bacteriol. 2004, 186, 5808-5818.
55. Johansson, A., Forsman, M., Sjostedt, A., APMIS 2004, 112, 898-907.
56. Smith, K. C., Armitige, L., Wanger, A., Expert Rev. Anti. Infect Ther. 2003, 1, 483-491.
57. Sharma, S. K., Mohan, A., Ind. J. Med. Res. 2004, 120, 354-376.
58. Hermans, P. W., van Soolingen, D., Bik, E. M., de Haas, P. E., Dale, J. W., van Embden, J. D., Infect. Immun. 1991, 59, 2695-2705.
59. Kamerbeek, J., Schouls, L., Kolk, A., van Agterveld, M., van Soolingen, D., Kuijper, S., Bunschoten, A., Molhuizen, H., Shaw, R., Goyal, M., van Embden, J., J. Clin. Microbiol. 1997, 35, 907-914.
60. van Embden, J. D., van Gorkom, T., Kremer, K., Jansen, R., Der Zeijst, B. A., Schouls, L. M., J. Bacteriol. 2000, 182, 2393-2401.
61. Ross, B. C., Raios, K., Jackson, K., Dwyer, B., J. Clin. Microbiol. 1992, 30, 942-946.
62. Wild, I. J., Werely, C., Beyers, N., Donald, P., Van Helden, P. D., J. Clin. Microbiol. 1994, 32, 1318-1321.
63. van Soolingen, D., de Haas, P. E., Hermans, P. W., Groenen, P. M., van Embden, J. D., J. Clin. Microbiol. 1993, 31, 1987-1995.
64. Hermans, P. W., van Soolingen, D., van Embden, J. D., J. Bacteriol. 1992, 174, 4157-4165.
65. Smittipat, N., Palittapongarnpim, P., Tuber. Lung Dis. 2000, 80, 69-74.
66. Frothingham, R., Meeker-O'Connell, W. A., Microbiology 1998, 144 (Pt 5), 1189-1196.
67. Kremer, K., van Soolingen, D., Frothingham, R., Haas, W. H., Hermans, P. W., Martin, C., Palittapongarnpim, P., Plikaytis, B. B., Riley, L. W., Yakrus, M. A., Musser, J. M., van Embden, J. D., J. Clin. Microbiol. 1999, 37, 2607-2618.
68. van Embden, J. D., Cave, M. D., Crawford, J. T., Dale, J. W., Eisenach, K. D., Gicquel, B., Hermans, P., Martin, C., McAdam, R., Shinnick, T. M., J. Clin. Microbiol. 1993, 31, 406-409.
69. van Soolingen, D., de Haas, P. E., Hermans, P. W., van Embden, J. D., Methods Enzymol. 1994, 235, 196-205.
70. Supply, P., Mazars, E., Lesjean, S., Vincent, V., Gicquel, B., Locht, C., Mol. Microbiol. 2000, 36, 762-771.
71. Supply, P., Lesjean, S., Savine, E., Kremer, K., van Soolingen, D., Locht, C., J. Clin. Microbiol. 2001, 39, 3563-3571.
72. Le Fleche, P., Fabre, M., Denoeud, F., Koeck, J. L., Vergnaud, G., BMC. Microbiol. 2002, 2, 37.
73. Spurgiesz, R. S., Quitugua, T. N., Smith, K. L., Schupp, J., Palmer, E. G., Cox, R. A., Keim, P., J. Clin. Microbiol. 2003, 41, 4224-4230.
74. Sun, Y. J., Lee, A. S., Ng, S. T., Ravindran, S., Kremer, K., Bellamy, R., Wong, S. Y., van Soolingen, D., Supply, P., Paton, N. I., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 5058-5064.
75. Warren, R. M., Victor, T. C., Streicher, E. M., Richardson, M., Van Der Spuy, G. D., Johnson, R., Chihota, V. N., Locht, C., Supply, P., Van Helden, P. D., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 5774-5782.
76. Scott, A. N., Menzies, D., Tannenbaum, T. N., Thibert, L., Kozak, R., Joseph, L., Schwartzman, K., Behr, M. A., J. Clin. Microbiol. 2005, 43, 89-94.
77. Haddad, N., Masselot, M., Durand, B., Res. Vet. Sci. 2004, 76, 1-18.
78. Harris, N. B., Barletta, R. G., Clin. Microbiol. Rev. 2001, 14, 489-512.
79. Bull, T. J., Sidi-Boumedine, K., McMinn, E. J., Stevenson, K., Pickup, R., Hermon-Taylor, J., Mol. Cell Probes 2003, 17, 157-164.
80. Overduin, P., Schouls, L., Roholl, P., van der, Z. A., Mahmmod, N., Herrewegh, A., van Soolingen, D., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 5022-5028.
81. Amonsin, A., Li, L. L., Zhang, Q., Bannantine, J. P., Motiwala, A. S., Sreevatsan, S., Kapur, V., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 1694-1702.
82. Moda, G., Daborn, C. J., Grange, J. M., Cosivi, O., Tuber. Lung Dis. 1996, 77, 103-108.
83. Neill, S. D., Pollock, J. M., Bryson, D. B., Hanna, J., Vet. Microbiol. 1994, 40, 41-52.
84. Cosivi, O., Grange, J. M., Daborn, C. J., Raviglione, M. C., Fujikura, T., Cousins, D., Robinson, R. A., Huchzermeyer, H. F., de, K., I, Meslin, F. X., Emerg. Infect. Dis. 1998, 4, 59-70.
85. Roring, S., Scott, A., Brittain, D., Walker, I., Hewinson, G., Neill, S., Skuce, R., J. Clin. Microbiol. 2002, 40, 2126-2133.
86. Roring, S., Scott, A. N., Glyn, H. R., Neill, S. D., Skuce, R. A., Vet. Microbiol. 2004, 101, 65-73.
87. Smith, N. H., Dale, J., Inwald, J., Palmer, S., Gordon, S. V., Hewinson, R. G., Smith, J. M., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 15271-15275.
88. Gibson, A. L., Hewinson, G., Goodchild, T., Watt, B., Story, A., Inwald, J., Drobniewski, F. A., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 431-434.
89. Purcell, A. H., Hopkins, D. L., Annu. Rev. Phytopathol. 1996, 34, 131-151.
90. Coletta-Filho, H. D., Takita, M. A., de Souza, A. A., Aguilar-Vildoso, C. I., Machado, M. A., Appl. Environ. Microbiol. 2001, 67, 4091-4095.
91. Della Coletta-Filho, H., Machado, M. A., Appl. Environ. Microbiol. 2002, 68, 3731-3736.
92. Liu, V. C., Smith, A. L., Antibiot. Chemother. 1992, 45, 30-51.
93. Hood, D. W., Deadman, M. E., Jennings, M. P., Bisercic, M., Fleischmann, R. D., Venter, J. C., Moxon, E. R., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 93, 11121-11125.
94. Karlin, S., Mrazek, J., Campbell, A. M., Nucleic Acids Res. 1996, 24, 4263-4272.
95. van Belkum, A., Scherer, S., van Leeuwen, W., Willemse, D., van Alphen, L., Verbrugh, H., Infect. Immun. 1997, 65, 5017-5027.
96. van Belkum, A., Melchers, W. J., IJsseldijk, C., Nohlmans, L., Verbrugh, H., Meis, J. F., J. Clin. Microbiol. 1997, 35, 1517-1520.
97. Renders, N., Licciardello, L., Ijsseldijk, C., Sijmons, M., van Alphen, L., Verbrugh, H., van Belkum, A., FEMS Microbiol. Lett. 1999, 173, 95-102.
98. Darwin, K. H., Miller, V. L., Clin. Microbiol. Rev. 1999, 12, 405-428.
99. Edwards, B. H., Clin. Lab Med. 1999, 19, 469-87.
100. Rabsch, W., Andrews, H. L., Kingsley, R. A., Prager, R., Tschape, H., Adams, L. G., Baumler, A. J., Infect. Immun. 2002, 70, 2249-2255.
101. Lindstedt, B. A., Heir, E., Gjernes, E., Kapperud, G., J. Clin. Microbiol. 2003, 41, 1469-1479.
102. Ribot, E. M., Wierzba, R. K., Angulo, F. J., Barrett, T. J., Emerg. Infect. Dis. 2002, 8, 387-391.
103. McClelland, M., Sanderson, K. E., Spieth, J., Clifton, S. W., Latreille, P., Courtney, L., Porwollik, S., Ali, J., Dante, M., Du, F., Hou, S., Layman, D., Leonard, S., Nguyen, C., Scott, K., Holmes, A., Grewal, N., Mulvaney, E., Ryan, E., Sun, H., Florea, L., Miller, W., Stoneking, T., Nhan, M., Waterston, R., Wilson, R. K., Nature 2001, 413, 852-856.
104. Lindstedt, B. A., Vardund, T., Aas, L., Kapperud, G., J. Microbiol. Methods 2004, 59, 163-172.
105. Ramisse, V., Houssu, P., Hernandez, E., Denoeud, F., Hilaire, V., Lisanti, O., Ramisse, F., Cavallo, J. D., Vergnaud, G., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 5722-5730.
106. Crum, N. F., Curr. Gastroenterol. Rep. 2003, 5, 279-286.
107. Liu, Y., Lee, M. A., Ooi, E. E., Mavis, Y., Tan, A. L., Quek, H. H., J. Clin. Microbiol. 2003, 41, 4388-4394.
108. Elkin, S., Geddes, D., Expert Rev. Anti. Infect. Ther. 2003, 1, 609-618.
109. Hoffken, G., Niederman, M. S., Chest 2002, 122, 2183-2196.
110. Morrison, A. J., Jr., Wenzel, R. P., Rev. Infect. Dis. 1984, 6 Suppl. 3, S627-S642.
111. Onteniente, L., Brisse, S., Tassios, P. T., Vergnaud, G., J. Clin. Microbiol. 2003, 41, 4991-4997.
112. Riley, L. W., Remis, R. S., Helgerson, S. D., McGee, H. B., Wells, J. G., Davis, B. R., Hebert, R. J., Olcott, E. S., Johnson, L. M., Hargrett, N. T., Blake, P. A., Cohen, M. L., N. Engl. J. Med. 1983, 308, 681-685.
113. Wells, J. G., Davis, B. R., Wachsmuth, I. K., Riley, L. W., Remis, R. S., Sokolow, R., Morris, G. K., J. Clin. Microbiol. 1983, 18, 512-520.
114. Paton, J. C., Paton, A. W., Clin. Microbiol. Rev. 1998, 11, 450-479.
115. Louise, C. B., Obrig, T. G., Infect. Immun. 1992, 60, 1536-1543.
116. Lindstedt, B. A., Heir, E., Gjernes, E., Vardund, T., Kapperud, G., Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob. 2003, 2, 12.
117. Noller, A. C., McEllistrem, M. C., Stine, O. C., Morris, J. G., Jr., Boxrud, D. J., Dixon, B., Harrison, L. H., J. Clin. Microbiol. 2003, 41, 675-679.
118. Noller, A. C., McEllistrem, M. C., Pacheco, A. G., Boxrud, D. J., Harrison, L. H., J. Clin. Microbiol. 2003, 41, 5389-5397.
119. Lindstedt, B. A., Vardund, T., Kapperud, G., J. Microbiol. Methods 2004, 58, 213-222.
120. Noller, A. C., McEllistrem, M. C., Harrison, L. H., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 3908.
121. Zuckert, W. R., Barbour, A. G., Infect. Immun. 2000, 68, 1727-1730.
122. Farlow, J., Postic, D., Smith, K. L., Jay, Z., Baranton, G., Keim, P., J. Clin. Microbiol. 2002, 40, 4612-4618.
123. Black, S., Pediatr. Infect. Dis. J. 1997, 16, S85-S89.
124. von Konig, C. H., Halperin, S., Riffelmann, M., Guiso, N., Lancet Infect. Dis. 2002, 2, 744-750.
125. van Loo, I. H., Heuvelman, K. J., King, A. J., Mooi, F. R., J. Clin. Microbiol. 2002, 40, 1994-2001.
126. Schouls, L. M., van der Heide, H. G., Vauterin, L., Vauterin, P., Mooi, F. R., J. Bacteriol. 2004, 186, 5496-5505.
127. Titze-de-Almeida, R., Willems, R. J., Top, J., Rodrigues, I. P., Ferreira, R. F., Boelens, H., Brandileone, M. C., Zanella, R. C., Felipe, M. S., van Belkum, A., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 4879-4881.
128. Top, J., Schouls, L. M., Bonten, M. J., Willems, R. J., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 4503-4511.
129. Nallapareddy, S. R., Singh, K. V., Duh, R. W., Weinstock, G. M., Murray, B. E., Infect. Immun. 2000, 68, 5210-5217.
130. Shankar, V., Baghdayan, A. S., Huycke, M. M., Lindahl, G., Gilmore, M. S., Infect. Immun. 1999, 67, 193-200.
131. Peacock, S. J., de, S., I, Lowy, F. D., Trends Microbiol. 2001, 9, 605-610.
132. von Eiff, C., Becker, K., Machka, K., Stammer, H., Peters, G., N. Engl. J. Med. 2001, 344, 11-16.
133. Foster, T. J., Hook, M., Trends Microbiol. 1998, 6, 484-488.
134. Harris, L. G., Foster, S. J., Richards, R. G., Eur. Cell Mater. 2002, 4, 39-60.
135. von Eiff, C., Friedrich, A. W., Peters, G., Becker, K., Diagn. Microbiol. Infect. Dis 2004, 49, 157-162.
136. Chambers, H. F., Emerg. Infect. Dis. 2001, 7, 178-182.
137. Feil, E. J., Cooper, J. E., Grundmann, H., Robinson, D. A., Enright, M. C., Berendt, T., Peacock, S. J., Smith, J. M., Murphy, M., Spratt, B. G., Moore, C. E., Day, N. P., J. Bacteriol. 2003, 185, 3307-3316.
138. Melles, D. C., Gorkink, R. F., Boelens, H. A., Snijders, S. V., Peeters, J. K., Moorhouse, M. J., van der Spek, P. J., van Leeuwen, W. B., Simons, G., Verbrugh, H. A., van Belkum, A., J. Clin. Invest 2004, 114, 1732-1740.
139. Sabat, A., Krzyszton-Russjan, J., Strzalka, W., Filipek, R., Kosowska, K., Hryniewicz, W., Travis, J., Potempa, J., J. Clin. Microbiol. 2003, 41, 1801-1804.
140. Kanemitsu, K., Yamamoto, H., Takemura, H., Kaku, M., Shimada, J., J. Infect. Chemother. 2001, 7, 22-27.
141. Tohda, S., Maruyama, M., Nara, N., Intern. Med. 1997, 36, 694-699.
142. Denoeud, F., Vergnaud, G., BMC. Bioinformatics 2004, 5, 4.
143. Hardy, K. J., Ussery, D. W., Oppenheim, B. A., Hawkey, P. M., Microbiology 2004, 150, 4045-4052.
144. Jacobson, R. R., Krahenbuhl, J. L., Lancet 1999, 353, 655-660.
145. Cole, S. T., Eiglmeier, K., Parkhill, J., James, K. D., Thomson, N. R., Wheeler, P. R., Honore, N., Garnier, T., Churcher, C., Harris, D., Mungall, K., Basham, D., Brown, D., Chillingworth, T., Connor, R., Davies, R. M., Devlin, K., Duthoy, S., Feltwell, T., Fraser, A., Hamlin, N., Holroyd, S., Hornsby, T., Jagels, K., Lacroix, C., Maclean, J., Moule, S., Murphy, L., Oliver, K., Quail, M. A., Rajandream, M. A., Rutherford, K. M., Rutter, S., Seeger, K., Simon, S., Simmonds, M., Skelton, J., Squares, R., Squares, S., Stevens, K., Taylor, K., Whitehead, S., Woodward, J. R., Barrell, B. G., Nature 2001, 409, 1007-1011.
146. Cole, S. T., Supply, P., Honore, N., Lepr. Rev. 2001, 72, 449-461.
147. Matsuoka, M., Maeda, S., Kai, M., Nakata, N., Chae, G. T., Gillis, T. P., Kobayashi, K., Izumi, S., Kashiwabara, Y., Int. J. Lepr. Other Mycobact. Dis 2000, 68, 121-128.
148. Shin, Y. C., Lee, H., Lee, H., Walsh, G. P., Kim, J. D., Cho, S. N., J. Clin. Microbiol. 2000, 38, 4535-4538.
149. Groathouse, N. A., Rivoire, B., Kim, H., Lee, H., Cho, S. N., Brennan, P. J., Vissa, V. D., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 1666-1672.
150. Truman, R., Fontes, A. B., De Miranda, A. B., Suffys, P., Gillis, T., J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 2558-2565.
151. Bharti, A. R., Nally, J. E., Ricaldi, J. N., Matthias, M. A., Diaz, M. M., Lovett, M. A., Levett, P. N., Gilman, R. H., Willig, M. R., Gotuzzo, E., Vinetz, J. M., Lancet Infect. Dis. 2003, 3, 757-771.
152. Majed, Z., Bellenger, E., Postic, D., Pourcel, C., Baranton, G., Picardeau, M., J. Clin. Microbiol. 2005, 43, 539-545.
153. Caugant, D. A., APMIS 1998, 106, 505-525.
154. Van Ert, M. N., Hofstadler, S. A., Jiang, Y., Busch, J. D., Wagner, D. M., Drader, J. J., Ecker, D. J., Hannis, J. C., Huynh, L. Y., Schupp, J. M., Simonson, T. S., Keim, P., BioTechniques 2004, 37, 642-644, 646, 648.