Designing proteins that work using recombinant technologies

Current Pharmaceutical Biotechnology

Volumn 3, Issue 4, 2002, Pages 285-297

  Graddis, T J ^a   Remmele Jr , R L ^a   McGrew, J T ^a  

^a AMGEN INC   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALDEHYDE DEHYDROGENASE; ALTEPLASE; CONSENSUS INTERFERON; DACLIZUMAB; DENILEUKIN DIFTITOX; EPIDERMAL GROWTH FACTOR; ETANERCEPT; GLYCERALDEHYDE 3 PHOSPHATE DEHYDROGENASE; HYBRID PROTEIN; HYDROLASE; IMMUNOGLOBULIN FC FRAGMENT; IMMUNOGLOBULIN G1; INSULIN ASPART; INSULIN GLARGINE; INSULIN LISPRO; INTERFERON BETA SERINE; ISOPROTEIN; MACROGOL; PALIVIZUMAB; PROTEIN G; PUROMYCIN; RECOMBINANT GRANULOCYTE MACROPHAGE COLONY STIMULATING FACTOR; RECOMBINANT HUMAN INSULIN; RECOMBINANT INTERLEUKIN 2; RECOMBINANT PROTEIN; RETEPLASE; RNA; TENECTEPLASE; TRASTUZUMAB; UNINDEXED DRUG; PROTEIN;

AMINO ACID SUBSTITUTION; ANTIGENICITY; BLEEDING; DIRECTED MOLECULAR EVOLUTION; DRUG ACTIVITY; DRUG DELIVERY SYSTEM; DRUG DESIGN; DRUG EFFICACY; DRUG HALF LIFE; DRUG STABILITY; EXPRESSION VECTOR; GENE EXPRESSION SYSTEM; HUMAN; IMMUNOGENICITY; NONVIRAL GENE DELIVERY SYSTEM; PHAGE DISPLAY; PROTEIN ENGINEERING; PROTEIN FUNCTION; PROTEIN GLYCOSYLATION; PROTEIN MODIFICATION; RECEPTOR AFFINITY; REVIEW; RIBOSOME; ANIMAL; METHODOLOGY; PHARMACEUTICS; SYNTHESIS;

VECTORS;

ANIMALS; HUMANS; PROTEIN ENGINEERING; PROTEINS; RECOMBINANT PROTEINS; TECHNOLOGY, PHARMACEUTICAL;

EID: 0036891385     PISSN: 13892010     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/1389201023378148     Document Type: Review

References (83)

1. Alexander, P. A.; Ruan, B.; Strausberg, S. L.; Bryan, P. N. (2001) Biochemistry, 40, 10640-4.
2. Mullis, K. B.; Faloona, F. A. (1987) Methods Enzymol, 155, 335-50.
3. Kurtzman, A. L.; Govindarajan, S.; Vahle, K.; Jones, J. T.; Heinrichs, V.; Patten, P. A. (2001) Curr. Opin. Biotechnol, 12, 361-70.
4. Stemmer, W. P. (1994) Nature, 370, 389-91.
5. Yano, T.; Kagamiyama, H. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 98, 903-7.
6. Schaffitzel, C.; Hanes, J.; Jermutus, L.; Pluckthun, A. (1999) J. Immunol. Methods, 231, 119-35.
7. Scott, J. K.; Smith, G. P. (1990) Science, 249, 386-90.
8. Mattheakis, L. C.; Bhatt, R. R.; Dower, W. J. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91, 9022-6.
9. Nemoto, N.; Miyamoto-Sato, E.; Husimi, Y.; Yanagawa, H. (1997) FEBS Lett., 414, 405-8.
10. Roberts, R. W.; Szostak, J. W. (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 94, 12297-302.
11. Fritze, C. E.; Anderson, T. R. (2000) Methods Enzymol., 327, 3-16.
12. Blundell, T. L.; Harren, J.; Abell, C. (2002) Nature Reviews Drug Discovery, 1, 45-54.
13. Baltzer, L.; Nilsson, J. (2001) Curr. Opin. Biotechnol., 12, 355-60.
14. Bonneau, R.; Baker, D. (2001) Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct., 30, 173-89.
15. Dall'Acqua, W.; Carter, P. (1998) Curr. Opin. Struct. Biol., 8, 443-50.
16. Makrides, S. C. (1999) Protein Expr. Purif., 17, 183-202.
17. Butler, D. (1999) Nature, 402, 705-6.
18. Baudys, M.; Uchio, T.; Mix, D.; Wilson, D.; Kim, S. W. (1995) J. Pharm. Sci., 84, 28-33.
19. Ghirlando, R.; Lund, J.; Goodall, M.; Jefferis, R. (1999) Immunol. Lett., 68, 47-52.
20. Wang, C.; Eufemi, M.; Turano, C.; Giartosio, A. (1996) Biochemistry, 35, 7299-307.
21. Williams, R. M.; Obradovi, Z.; Mathura, V.; Braun, W.; Garner, E. C.; Young, J.; Takayama, S.; Brown, C. J.; Dunker, A. K. (2001) Pac. Symp. Biocomput., 89-100.
22. Munson, M.; Balasubramanian, S.; Fleming, K. G.; Nagi, A. D.; O'Brien, R.; Sturtevant, J. M.; Regan, L. (1996) Protein Sci., 5, 1584-93.
23. Dahiyat, B. I.; Mayo, S. L. (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 94, 10172-7.
24. Barlow, D. J.; Poole, P. L. (1987) FEBS Lett., 213, 423-7.
25. Tanner, J. J.; Hecht, R. M.; Krause, K. L. (1996) Biochemistry, 35, 2597-609.
26. Russell, R. J.; Hough, D. W.; Danson, M. J.; Taylor, G. L. (1994) Structure, 2, 1157-67.
27. Spector, S.; Wang, M.; Carp, S. A.; Robblee, J.; Hendsch, Z. S.; Fairman, R.; Tidor, B.; Raleigh, D. P. (2000) Biochemistry, 39, 872-9.
28. Mansfeld, J.; Vriend, G.; Dijkstra, B. W.; Veltman, O, R.; Van den Burg, B.; Venema, G.; Ulbrich-Hofmann, R.; Eijsink, V. G. (1997) J. Biol. Chem., 272, 11152-6.
29. Perl, D.; Mueller, U.; Heinemann, U.; Schmid, F. X. (2000) Nat. Struct. Biol., 7, 380-3.
30. Van den Burg, B.; Vriend, G.; Veltman, O. R.; Venema, G.; Eijsink, V. G. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95, 2056-60.
31. Lehmann, M.; Wyss, M. (2001) Curr. Opin. Biotechnol., 12, 371-5.
32. Ohage, E. C.; Wirtz, P.; Barnikow, J.; Steipe, B. (1999) J. Mol. Biol., 291, 1129-34.
33. Wirtz, P.; Steipe, B. (1999) Protein Sci., 8, 2245-50.
34. Jermutus, L.; Honegger, A.; Schwesinger, F.; Hanes, J.; Pluckthun, A. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 98, 75-80.
35. Vajo, Z.; Duckworth, W. C. (2000) Pharmacol. Rev., 52, 1-9.
36. Howey, D. C.; Bowsher, R. R.; Brunelle, R. L.; Woodworth, J. R. (1994) Diabetes, 43, 396-402.
37. Garg, S. K.; Anderson, J. H.; Perry, S. V.; Mackenzie, T.; Keith, P.; Jennings, M. K.; Hansen, M. M.; Chase, H. P. (1999) Diabet. Med., 16, 384-7.
38. Brange, J.; Ribel, U.; Hansen, J. F.; Dodson, G.; Hansen, M. T.; Havelund, S.; Melberg, S. G.; Norris, F.; Norris, K.; Snel, L. (1988) Nature, 333, 679-82.
39. Bolli, G. B.; Owens, D. R. (2000) Lancet, 356, 443-5.
40. Verstraete, M. (2000) Am. J. Med., 109, 52-8.
41. Keyt, B. A.; Paoni, N. F.; Refino, C. J.; Berleau, L.; Nguyen, H.; Chow, A.; Lai, J.; Pena, L.; Pater, C.; Ogez, J.; Etcheverry, T.; Botstein, D.; Bennett, W. F. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91, 3670-4.
42. Kohnert, U.; Rudolph, R.; Verheijen, J. H.; Weening-Verhoeff, E. J.; Stern, A.; Opitz, U.; Martin, U.; Lill, H.; Prinz, H.; Lechner, M. (1992) Protein Eng., 5, 93-100.
43. The Global Use of Strategies to Open Occluded Coronary Arteries (GUSTO III) Investigators. (1997) N. Engl. J. Med., 337, 1118-23.
44. Inada, Y.; Furukawa, M.; Sasaki, H.; Kodera, Y.; Hiroto, M.; Nishimura, H.; Matsushima, A. (1995) Trends Biotechnol., 13, 86-91.
45. Chapman, A. P.; Antoniw, P.; Spitali, M.; West, S.; Stephens, S.; King, D. J. (1999) Nat. Biotechnol., 17, 780-3.
46. Breedveld, F. C. (2000) Lancet, 355, 735-40.
47. Laroche, Y.; Heymans, S.; Capaert, S.; De Cock, F.; Demarsin, E.; Collen, D. (2000) Blood, 96, 1425-32.
48. Collen, D.; Sinnaeve, P.; Demarsin, E.; Moreau, H.; De Maeyer, M.; Jespers, L.; Laroche, Y.; Van de Werf, F. (2000) Circulation, 102, 1766-72.
49. Kempeni, J. (1999) Ann. Rheum. Dis., 58 Suppl. 1, I70-2.
50. Blatt, L. M.; Davis, J. M.; Klein, S. B.; Taylor, M. W. (1996) J. Interferon Cytokine Res., 16, 489-99.
51. Graddis, T. J.; Brasel, K.; Friend, D.; Srinivasan, S.; Wee, S.; Lyman, S. D.; March, C. J.; McGrew, J. T. (1998) J. Biol. Chem., 273, 17626-33.
52. Toniatti, C.; Cabibbo, A.; Sporena, E.; Salvati, A. L.; Cerretani, M.; Serafini, S.; Lahm, A.; Cortese, R.; Ciliberto, G. (1996) EMBO J., 15, 2726-37.
53. Pearce, K. H. Jr.; Cunningham, B. C.; Fuh, G.; Teeri, T.; Wells, J. A. (1999) Biochemistry, 38, 81-9.
54. Reddy, C. C.; Niyogi, S. K.; Wells, A.; Wiley, H. S.; Lauffenburger, D. A. (1996) Nat. Biotechnol., 14, 1696-9.
55. Chang, D. Z.; Wu, Z.; Ciardelli, T. L. (1996) J. Biol. Chem., 271, 13349-55.
56. Fallon, E. M.; Liparoto, S. F.; Lee, K. J.; Ciardelli, T. L.; Lauffenburger, D. A. (2000) J. Biol. Chem., 275, 6790-7.
57. Weiner, L. M.; Adams, G. P. (2000) Oncogene, 19, 6144-51.
58. Adams, G. P.; Schier, R.; McCall, A. M.; Simmons, H. H.; Horak, E. M.; Alpaugh, R. K.; Marks, J. D.; Weiner, L. M. (2001) Cancer Res., 61, 4750-5.
59. Nielsen, U. B.; Adams, G. P.; Weiner, L. M.; Marks, J. D. (2000) Cancer Res., 60, 6434-40.
60. Jacobs, C. A.; Beckmann, M. P.; Mohler, K.; Maliszewski, C. R.; Fanslow, W. C.; Lynch, D. H. (1993) Int. Rev. Exp. Pathol., 34, 123-35.
61. Mohler, K. M.; Torrance, D. S.; Smith, C. A.; Goodwin, R. G.; Stremler, K. E.; Fung, V. P.; Madani, H.; Widmer, M. B. (1993) J. Immunol., 151, 1548-61.
62. Frankel, A. E.; Kreitman, R. J.; Sausville, E. A. (2000) Clin. Cancer Res., 6, 326-34.
63. Olsen, E.; Duvic, M.; Frankel, A.; Kim, Y.; Martin, A.; Vonderheid, E.; Jegasothy, B.; Wood, G.; Gordon, M.; Heald, P.; Oseroff, A.; Pinter-Brown, L.; Bowen, G.; Kuzel, T.; Fivenson, D.; Foss, F.; Glode, M.; Molina, A.; Knobler, E.; Stewart, S.; Cooper, K.; Stevens, S.; Craig, F.; Reuben, J.; Bacha, P.; Nichols, J. (2001) J. Clin. Oncol., 19, 376-88.
64. Williams, D. P.; Snider, C. E.; Strom, T. B.; Murphy, J. R. (1990) J. Biol. Chem., 265, 11885-9.
65. Shields, R. L.; Namenuk, A. K.; Hong, K.; Meng, Y. G.; Rae, J.; Briggs, J.; Xie, D.; Lai, J.; Stadlen, A.; Li, B.; Fox, J. A.; Presta, L. G. (2001) J. Biol. Chem., 276, 6591-604.
66. Willuda, J.; Kubetzko, S.; Waibel, R.; Schubiger, P. A.; Zangemeister-Wittke, U.; Pluckthun, A. (2001) J. Biol. Chem., 276, 14385-92.
67. Bagshawe, K. D.; Sharma, S. K.; Burke, P. J.; Melton, R. G.; Knox, R. J. (1999) Curr. Opin. Immunol., 11, 579-83.
68. Carter, P. (2001) J. Immunol. Methods, 248, 7-15.
69. Carter, P. (2001) Nature Rev. Cancer, 1, 119-129.
70. Merchant, A. M.; Zhu, Z.; Yuan, J. Q.; Goddard, A.; Adams, C. W.; Presta, L. G.; Carter, P. (1998) Nat. Biotechnol., 16, 677-81.
71. Wang, A.; Lu, S. D.; Mark, D. F. (1984) Science, 224, 1431-3.
72. Mark, D. F.; Lu, S. D.; Creasey, A. A.; Yamamoto, R.; Lin, L. S. (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81, 5662-6.
73. Lind, P.; Larsson, K.; Spira, J.; Sydow-Backman, M.; Almstedt, A.; Gray, E.; Sandberg, H. (1995) Eur. J. Biochem., 232, 19-27.
74. Toole, J. J.; Pittman, D. D.; Orr, E. C.; Murtha, P.; Wasley, L. C.; Kaufman, R. J. (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 83, 5939-42.
75. Charlebois, T. S.; O'Connell, B. D.; Adamson, S. R.; Brink-Nilsson, H.; Jernberg, M.; Eriksson, B.; Kelley, B. D. (2001) Semin. Hematol., 38, 32-9.
76. Gillis, S.; Urdal, D. L.; Clevenger, W.; Klinke, R.; Sassenfeld, H.; Price, V.; Cosman, D. (1988) Behring Inst. Mitt., 83, 1-7.
77. Rivera, V. M.; Wang, X.; Wardwell, S.; Courage, N. L.; Volchuk, A.; Keenan, T.; Holt, D. A.; Gilman, M.; Orci, L.; Cerasoli, F. Jr.; Rothman, J. E.; Clackson, T. (2000) Science, 287, 826-30.
78. Guo, Z.; Zhou, D.; Schultz, P. G. (2000) Science, 288, 2042-5.
79. LeVan, D.; Lynn, D.; Langer, R. (2002) Nature Reviews Drug Discovery, 1, 77-84.
80. Taton, T. A. (2001) Nature, 412, 491-2.
81. Carter, P.; Presta, L.; Gorman, C. M.; Ridgway, J. B.; Henner, D.; Wong, W. L.; Rowland, A. M.; Kotts, C.; Carver, M. E.; Shepard, H. M. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89, 4285-9.
82. Reichert, J. M. (2001) Nat. Biotechnol., 19, 819-22.
83. Sandberg, H.; Almstedt, A.; Brandt, J.; Gray, E.; Holmquist, L.; Oswaldsson, U.; Sebring, S.; Mikaelsson, M. (2001) Thromb. Haemost., 85, 93-100.